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基于DNA双链断裂损伤簇的相对生物效能模拟计算
编辑人员丨1天前
目的:从追溯辐射引起的DNA损伤机制出发,根据基本的生物物理原理获取DNA双链断裂(DSB)损伤簇表示的相对生物效能(RBE)值,探讨DNA损伤与染色体畸变、生殖细胞死亡生物效能的相似性。方法:以低能电子、质子、α粒子作为研究对象,通过辐射物理化学模型,模拟细胞核受粒子辐射的过程。在基于损伤点密度的含噪声密度聚类(DBSCAN)算法的基础上,改进DSB损伤簇分类方法,以减弱模拟过程中损伤点与能量沉积随机分布假设的联系,使得DSB损伤簇更接近于非随机分布。计算获得DSB损伤簇的产额,提出以DSB损伤簇计算RBE值的方法。结果:2 MeV α粒子的DSB损伤簇RBE值(12.29)与生物实验中染色体片段(15.3±5.9)、细胞存活(14.7±5.1)表示的RBE相近。结论:高传能线密度(LET)电离辐射后,不同于简单DSB,DSB损伤簇的RBE与染色体畸变、细胞存活生物效能存在一定的相似性。
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编辑人员丨1天前
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ICRP第148号出版物《参考动物和植物的辐射权重》内容简介及中国学者的贡献
编辑人员丨1天前
核聚变的推广应用是国家重要的能源战略。伴随着氚向环境中排放量的增加以及氚在众多领域中的广泛应用,人类受到低剂量氚照射的概率也随之增加。2021年国际放射防护委员会(ICRP)第148号出版物《参考动物和植物的辐射权重》正式发布。在其选用的资料中,均引用了中国学者的相关文献及氚相对生物效能(RBE)的研究结果。笔者以ICRP第148号出版物为基础,概述了低能氚β粒子对不同生物终点影响的RBE值,总结了我国学者对氚研究所做出的贡献,并对氚的进一步研究进行了展望,旨在推动对氚的纵深研究进展,为氚的辐射防护做出应有的贡献。
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编辑人员丨1天前
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血清外泌体 miR-218-5p在结直肠癌中的表达水平及临床应用价值
编辑人员丨1天前
目的:探讨外泌体miR-218-5p在结直肠癌(CRC)患者血清中的表达水平及其与患者临床病理特征的相关性,评价其在CRC中的诊断效能。方法:选择同济大学附属同济医院2016年10月至2018年10月确诊的结直肠癌病例组78例,术前采血并保存血清;选择同期健康体检者40例作为对照组。采用ExoQuick试剂盒提取血清外泌体,应用透射电镜、NTA、蛋白印迹对外泌体进行形态学和分子表型鉴定;利用miRNeasy试剂盒提取血清外泌体中总RNA,实时荧光定量PCR法(RT-qPCR)检测各组血清外泌体miR-218-5p的表达水平。以miR-218-5p相对表达水平的中位数为截断值,将CRC患者分为高表达与低表达组,用χ2检验判断其与临床病理特征的关系;受试者工作特征(ROC)曲线判断其在结直肠癌中的诊断效能。结果:试剂盒法成功提取到血清中的外泌体。结直肠癌组血清外泌体miR-218-5p的表达水平明显低于对照组[0.566(0.364,0.850)比1.054(0.781,1.709), P<0.001];其低表达程度与肿瘤大小、TNM分期、肿瘤淋巴结转移和浸润深度显著相关( P均<0.05);ROC分析表明血清外泌体miR-218-5p诊断结直肠癌的曲线下面积(AUC)为0.827(95% CI 0.754~0.900),明显优于常规的肿瘤标志物癌胚抗原CEA(AUC=0.718,95% CI 0.626~0.811)和糖类抗原CA199(AUC=0.661,95% CI 0.564~0.758)。 结论:结直肠癌患者血清外泌体中 miR-218-5p的表达下调与多个不良临床病理学因素相关,具有成为结直肠癌诊断生物标志物的潜力。
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编辑人员丨1天前
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血浆白细胞介素9对生物制剂治疗后炎性肠病患者黏膜愈合的诊断及评估价值
编辑人员丨1天前
目的:探讨血浆白细胞介素9(IL9)对生物制剂治疗后的炎性肠病(IBD)患者黏膜愈合的诊断及评估价值。方法:随访研究。前瞻性选取2019年9月至2022年1月在南京医科大学附属苏州医院(苏州市立医院)就诊的137例IBD患者,分别使用生物制剂英夫利昔单抗(IFX,56例)、阿达木单抗(ADA,20例)、乌司奴单抗(UST,18例)和维得利珠单抗(VDZ,43例)治疗;根据治疗药物不同,分为IFX组、ADA组、UST组和VDZ组。每8周评估1次(包括临床症状、炎症指标、影像学检查等),第54周时行内镜评估黏膜愈合程度。ELISA法检测入组时(W 0)和生物制剂治疗8周(W 8)后血浆IL9的表达量。受试者工作特征(ROC)曲线评估IL9对黏膜愈合的诊断效能。根据约登指数的最高值选择最佳ROC曲线阈值的截止值。Spearman等级相关分析IL9与克罗恩病简化内镜评分(SES-CD评分)、梅奥内镜评分(MES评分)间的相关性,以评估W 0和W 8时IL9对生物制剂治疗54周时的IBD患者黏膜愈合的预测价值。结果:137例患者中,有97例克罗恩病(CD)患者,男53例,女44例,年龄(31.6±10.3)岁(18~60岁);有40例溃疡性结肠炎(UC)患者,男22例,女18例,年龄(37.5±14.7)岁(18~67岁)。CD患者中,42例患者(43.3%)第54周内镜检查提示黏膜愈合;60例(61.9%)获得临床缓解。UC患者中,22例(55.0%)达到黏膜愈合;30例(75.0%)获得临床缓解。W 0时,黏膜愈合的CD和UC患者的IL9相对表达量均低于未愈合的患者[ xˉ±s,分别为(127.42±34.43)比(146.82±45.64)ng/L,(113.01±44.88)比(146.12±48.66)ng/L,均 P<0.05]。W 8时,黏膜愈合的CD和UC患者的IL9相对表达量均低于未愈合的患者(均 P<0.05)。IFX治疗后黏膜愈合的患者的IL9相对表达量低于未达到黏膜愈合的患者( P<0.05);其他治疗组患者黏膜愈合与未愈合间的差异均无统计学意义(均 P>0.05)。W 8时IL9对预测IBD黏膜愈合具有较高的预测价值[CD患者:ROC曲线下面积(AUC)=0.716(95% CI:0.616~0.817, P<0.001),灵敏度和特异度分别为80.77%(95% CI:67.64%~88.45%)和48.89%(95% CI:35.53%~64.47%);UC患者:AUC=0.821,灵敏度和特异度分别为77.78%和72.73%],CD和UC患者的cut off值分别为IL9>80.77 ng/L、IL9>77.78 ng/L。W 8时,IL9与内镜下黏膜愈合参数[ M( Q1, Q3),SES-CD评分:3.0(8.5,18.5);MES评分:2.0(1.0,3.0)]均呈正相关(分别 r=0.55、0.72,均 P<0.001)。 结论:生物制剂治疗第8周时的血浆IL9可用于诊断和评估IBD患者的黏膜愈合情况。
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编辑人员丨1天前
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长链非编码RNA CCAT2在宫颈癌患者血清中的表达及其意义
编辑人员丨1天前
目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)结肠癌相关转录物2(CCAT2)在宫颈癌(CC)患者血清中的表达水平及辅助诊断价值。方法:收集2016年1月至2017年6月南通市肿瘤医院确诊的100例CC患者、60例宫颈上皮内瘤变(CIN)患者、80名健康者的血清标本。采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)的方法分别检测CC患者及对应的术后患者、CIN患者及健康对照者血清CCAT2的表达水平,分析其与临床病理特征和CC传统辅助诊断指标糖类抗原125(CA125)、鳞状上皮细胞癌抗原(SCC)之间的相关性,用受试者工作特征(ROC)曲线评价CCAT2对宫颈癌的辅助诊断价值。结果:宫颈癌患者、术后患者、CIN患者和健康对照者血清CCAT2的相对表达量分别为1.689(0.616,4.776)、1.018(0.227,3.328)、0.815(0.453,1.266)和0.740(0.271,1.670)。宫颈癌患者CCAT2的相对表达量显著高于术后患者、CIN患者和健康对照者,差异有统计学意义( t=6.999、8.193、9.345, P<0.001)。CIN患者与健康对照者CCAT2的相对表达量差异无统计学意义( t=0.327, P>0.05)。宫颈癌患者血清CCAT2相对表达量在不同年龄[1.636(1.000,2.370),1.705(1.095,2.243)(χ 2=0.137, P=0.712)]、绝经期与否[1.672(1.059,2.342),1.659(1.068,2.298)(χ 2=0.000, P=1.000)]差异无统计学意义,在不同肿瘤大小[1.189(0.916,1.725),2.019(1.537,2.497)(χ 2=17.508, P=0.000)]、国际妇产科联合会(FIGO)分期[0.993(0.779,1.266),2.056(1.547,2.549),3.987(3.699,4.275)(χ 2=36.075, P=0.000)]、淋巴结转移与否[1.434(1.007,2.251),2.019(1.731,3.098)(χ 2=8.634, P=0.003)]中的差异有统计学意义。宫颈癌患者血清CCAT2相对表达量与CA125之间无相关性( r2=0.003, P=0.563),与SCC之间有相关性( r2=0.128, P=0.000)。用ROC曲线分析血清CCAT2、CA125及SCC对宫颈癌患者的诊断效能,宫颈癌患者与CIN患者比较时,其曲线下面积分别为0.890、0.549、0.744;宫颈癌患者与健康者比较时,其曲线下面积分别为0.857、0.650、0.758。 结论:宫颈癌患者血清CCAT2含量显著高于宫颈癌术后患者、CIN患者和健康对照者,血清CCAT2可能成为宫颈癌的一个重要的诊断及预后标志物。
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编辑人员丨1天前
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环状RNA102958在胃癌组织中的表达及其临床意义
编辑人员丨1天前
目的:探讨环状RNA102958(circRNA_102958)在人胃癌组织中的表达情况及其临床意义。方法:收集2017年9月至2018年3月江苏省肿瘤医院30例胃癌患者肿瘤组织及其配对正常胃黏膜组织标本,采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测组织中circRNA_102958相对表达量。分析胃癌组织circRNA_102958表达水平与临床病理特征的关系。应用受试者工作特征曲线(ROC)判断circRNA_102958诊断胃癌的效能。结果:胃癌组织circRNA_102958相对表达量高于正常胃黏膜组织,差异有统计学意义(5.1±1.0比1.0±0.0, t=4.045, P<0.01)。Ⅲ~Ⅳ期患者胃癌组织circRNA_102958相对表达量高于Ⅰ~Ⅱ期患者,差异有统计学意义(9.3±2.6比2.0±0.5, t=2.302, P=0.029),不同性别、年龄、肿瘤长径、组织分化程度、淋巴结转移患者间circRNA_102958相对表达量差异均无统计学意义(均 P>0.05)。ROC分析显示,circRNA_102958诊断胃癌的敏感度和特异度分别为74%和61%,曲线下面积为0.74。 结论:circRNA_102958在胃癌组织中高表达,其表达水平与胃癌分期相关,可能与胃癌发生、发展具有相关性。circRNA_102958有望成为胃癌诊断的分子标志物。
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编辑人员丨1天前
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血浆外泌体miR-214-3p作为葡萄膜黑色素瘤诊断及预后评估生物标志物的研究
编辑人员丨1天前
目的:探讨微小RNA(miR)-214-3p在不同类型葡萄膜黑色素瘤(UM)患者血浆外泌体中的差异性表达,评估其是否可作为UM诊疗的新型分子生物标志物。方法:收集2015年12月至2019年10月于北京同仁医院行眼球摘除术并确诊为UM的患者25例,其中原位梭形细胞型UM组和原位类上皮细胞型UM组各10例,转移型UM组5例(包括1例梭形细胞型UM患者和4例类上皮细胞型UM患者);同期收集10例健康对照者作为健康对照组,抽取所有受试者血液样本,提取血浆外泌体,透射电子显微镜下观察外泌体形态,分析外泌体粒径,Western blot法鉴定外泌体标记蛋白,采用实时荧光定量PCR法测定各组患者血浆外泌体miR-214-3p表达水平。采用差异性检验比较UM患者与健康对照者和不同类型UM患者间的血浆外泌体miR-214-3p的差异表达;通过受试者工作特征(ROC)曲线评价血浆外泌体miR-214-3p对UM的诊断及分型效能。结果:透射电子显微镜下可见,所提取外泌体呈一侧凹陷的半球形结构,直径约100 nm。囊泡粒径大小为(82.0±2.7)nm。Western blot结果显示外泌体特异性标记蛋白TSG101条带均为阳性,阴性标记蛋白Calnexin均呈阴性。健康对照组、原位UM组和转移型UM组血浆外泌体miR-214-3p相对表达量分别为0.86(0.57,1.49)、0.24(0.10,0.67)和0.43(0.23,0.56),原位UM组血浆外泌体miR-214-3p相对表达量较健康对照组明显降低,差异有统计学意义( Z=2.62, P<0.01);ROC曲线对血浆外泌体中miR-214-3p的诊断效能分析显示,血浆外泌体miR-214-3p的AUC为0.795。转移型UM组血浆外泌体miR-214-3p相对表达量较健康对照组明显降低,差异有统计学意义( Z=2.08, P<0.05);原位梭形细胞型UM组和原位类上皮细胞型UM组血浆外泌体miR-214-3p相对表达量分别为0.11(0.07,0.64)和0.46(0.14,0.91),2个组间以及转移型UM组与原位类上皮型UM组间患者血浆外泌体miR-214-3p相对表达量比较差异均无统计学意义(均 P>0.05)。 结论:血浆外泌体miR-214-3p在原位UM患者及转移型UM患者中均显著下降,循环miR-214-3p具有作为UM诊断生物标志物的潜力,但血浆外泌体miR-214-3p缺乏对UM分型的评估能力。
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编辑人员丨1天前
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基于乳腺动态增强MRI的delta影像组学预测乳腺癌新辅助治疗后病理完全缓解的价值
编辑人员丨1天前
目的:探讨基于乳腺动态增强MRI(DCE-MRI)纵向变化的delta影像组学在预测乳腺癌新辅助治疗(NAT)后病理完全缓解(pCR)的价值。方法:回顾性分析2019年4月至2021年11月江西省肿瘤医院经手术病理证实为原发性浸润性乳腺癌患者117例的临床及影像资料。患者均为女性,年龄23~74(48±10)岁,按照软件中的随机种子数以7∶3比例分成训练集(81例)与测试集(36例)。所有患者均在NAT前、NAT早期(2个疗程)后接受乳腺DCE-MRI,计算肿瘤NAT前、后最大径相对退缩值(D%),并构建传统影像模型。基于NAT前、早期DCE-MRI提取delta影像组学特征,通过冗余性分析、最小绝对收缩与选择算子算法筛选最优特征参数,以10折交叉验证法构建delta影像组学模型并计算影像组学分数(Radscore)。根据NAT后手术病理结果将117例患者分为pCR组与非pCR(non-pCR)组,单因素分析两组差异有统计学意义的临床病理指标并通过逐步回归法筛选最终的指标,并联合D%、Radscore构建联合模型及列线图。采用受试者操作特征曲线及曲线下面积(AUC)评价模型预测乳腺癌NAT后pCR的效能,利用临床决策曲线对比模型的临床效用。结果:联合模型预测乳腺癌NAT后pCR的效能最好,AUC在训练集及测试集中分别为0.90和0.87;其列线图显示Radscore权重最大。训练集中,联合模型、delta影像组学模型预测乳腺癌NAT后pCR显著高于传统影像模型( Z值分别为-3.48、2.54, P值分别为0.001、0.011)。临床决策曲线显示联合模型的临床获益整体高于传统影像模型、delta影像组学模型。 结论:在传统影像模型的基础上,加入有意义的临床病理指标及代表肿瘤异质性纵向变化的delta影像组学得分,能改善对pCR的预测能力;delta影像组学可能成为早期无创性预测NAT结果的生物标记物。
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编辑人员丨1天前
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基于Geant4-DNA模拟质子辐照线虫DNA链损伤的生物效应研究
编辑人员丨1天前
目的:使用Geant4-DNA工具包计算质子致线虫生殖细胞的DNA损伤产额及相对生物效能(RBE)值,探究质子辐照线虫的生物效应。方法:使用Geant4-DNA工具包中希尔伯特曲线构建直径为20 μm的线虫生殖细胞DNA模型;模拟100、50、20、5和2 MeV的质子辐射造成的DNA损伤,获得不同的物理构造函数、能量阈值(ET)模型和自由基清除距离与DNA双链断裂产额(YDSBs)的关系,并与生物学实验数据(20 MeV质子)进行对比验证。计算不同能量质子诱导DNA损伤的具体类型以及基于RBE DSB数学模型的质子RBE DSB值。 结果:在不同的物理构造函数、ET模型以及自由基清除距离3个参数下,质子诱导的DNA损伤分析结果表明,当选取构造函数2时,质子诱导的YDSBs最低,构造函数4和构造函数6诱导的YDSBs相差不大;随着单能ET的增加,质子诱导的YDSBs在逐渐降低;当自由基清除距离越长时,质子诱导的YDSBs越高。与生物实验数据对比结果表明,选取构造函数4、21.25 eV的单能ET模型以及9 nm的自由基清除距离时,其模拟结果与相关实验数据最接近,两者相差约8.3%。质子的RBE DSB计算结果表明,其值在1.02~1.85范围内变化,质子能量越低,RBE DSB越高。 结论:基于Geant4-DNA模拟质子诱导线虫的YDSBs与相关分子生物学检测结果吻合较好,为理解和预测质子辐射诱导的生物效应提供了重要手段。
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编辑人员丨1天前
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PDGFRA基因突变型胃肠间质瘤生物学行为再研究
编辑人员丨1天前
目的:探讨血小板源生长因子α受体(PDGFRA)基因突变型胃肠间质瘤(gastrointestinal stromal tumor,GIST)的生物学行为谱系,比较复旦大学附属中山医院良恶性评估方法与改良版美国国立卫生研究院(NIH)危险度分级的临床应用效能。方法:收集复旦大学附属中山医院2009—2020年手术切除PDGFRA基因突变型GIST 119例,复习其临床病理资料、随访记录后续治疗并进行统计学分析。结果:在119例PDGFRA基因突变型GIST中,男性79例,女性40例;年龄25~80岁,中位年龄60岁,此组病例均来源于胃。其中115例患者术后获得随访,随访时间1~154个月,13例疾病进展。总体5年无瘤生存率为90.1%,总生存率94.1%。参考改良版NIH危险度分级,极低危、低危、中危、高危组分别8、32、38和35例,其中5年无瘤生存率分别为100.0%、95.6%、94.3%、80.5%,非高危3组预后差异无统计学意义,仅高危与非高危组差异有统计学意义( P=0.029),而5年总生存率分别为100.0%、100.0%、95.0%、89.0%,差异均无统计学意义( P=0.221)。按照复旦大学附属中山医院良恶性评估方法,非恶性43例(37.4%),低度恶性56例(48.7%),中度恶性9例(7.8%),高度恶性7例(6.1%),5年无瘤生存率分别为100.0%、91.7%、77.8%、38.1%,差异有统计学意义( P<0.001),5年总生存率分别为100.0%、97.5%、77.8%、66.7%,差异有统计学意义( P<0.001)。 结论:PDGFRA基因突变型GIST包含良性到高度恶性广谱生物学行为谱系,按照复旦大学附属中山医院良恶性评估方法,非恶性和低度恶性多见,术后预后好,少部分为中~高度恶性,单纯手术切除预后差。此型GIST总体上表现为相对惰性的生物学行为是源于中~高度恶性构成比低。改良版NIH方案不能有效地对PDGFRA突变型GIST进行危险度分层。
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编辑人员丨1天前
