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NTRK重排子宫肉瘤7例临床病理学分析
编辑人员丨1周前
目的:探讨NTRK重排子宫肉瘤临床病理及分子学特征。方法:收集2015年1月至2022年10月福建省立医院及会诊病例5例,福建医科大学附属第二医院病理科1例,福州台江医院病理科1例,共7例NTRK重排子宫肉瘤,行HE、免疫组织化学及基因检测,并进行文献复习。结果:7例女性患者,年龄16~82岁(平均47岁,中位50岁)。镜下观察,均呈梭形细胞肿瘤,束状、交织状排列,细胞丰富,细胞异型不等,核分裂象(2~15)个/10 HPF(平均5个/10 HPF,中位3个/10 HPF),少数有上皮样细胞,5例(5/7)呈腺肉瘤表现,可见血管外皮瘤结构;间质可黏液变性、淋巴细胞浸润、血管玻璃样变性。免疫表型,瘤细胞呈CD34(7/7)、S-100蛋白(7/7)及pan-TRK(7/7)阳性,CD10(2/7)、cyclin D1(1/7)及平滑肌肌动蛋白(2/7)灶性阳性,SMARCA4、FH、SDHB及H3K27me3蛋白无缺失表达。荧光原位杂交法检测7例均见NTRK1基因分离而NTRK3基因无分离;行DNA二代测序检测,2例为TPR-NTRK1融合亚型,各有1例检测到TRIM67-NTRK1及TPM3-NTRK1融合;3例检测失败。结论:NTRK重排子宫肉瘤属于一种罕见的子宫肉瘤,确诊依靠临床病理、免疫组织化学及基因检测。治疗以手术切除为主,并辅以化疗,靶向治疗可使患者获益。
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编辑人员丨1周前
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敲除trim47基因斑马鱼脑和脾的比较转录组学分析
编辑人员丨2023/8/5
用CRISPR/Cas9技术敲除斑马鱼(Danio Rerio)的trim47,收集TRIM47–/–(trim47基因敲除)和WT(野生型)斑马鱼的大脑和脾脏进行RNA-seq分析,以鉴定差异表达基因(DEGs).总共确定了271个DEGs,经过简要分析,将这些DEGs注释为KEGG途径和GO富集分析,与WT组相比,TRIM47-/-组的脑中DEGs集中在细胞黏附和谷氨酸能突触信号传导途径中.在脾脏中,与野生型组相比,TRIM47-/-组的DEGs在补体和凝血级联信号通路中发生了变化.使用qRT-PCR验证了脑和脾中与补体途径相关的基因,与转录组数据一致.这些结果表明,Trim47在脾脏和大脑中起着重要的生物学作用,尤其是通过补体途径参与先天免疫功能.体内感染实验表明,trim47基因敲除可提高斑马鱼中鲤春病毒血症病毒(SVCV)的感染率.总之,这些发现为TRIM成员在先天免疫中的功能提供了新线索.
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编辑人员丨2023/8/5
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基于生物信息学检测TRIM47基因在肝癌中的表达及意义
编辑人员丨2023/8/5
目的:探讨三结构域蛋白47(TRIM47)基因在肝癌中的表达及其临床意义。方法:通过生物信息学方法,利用UALCAN、HPA数据库分析TRIM47在肝癌中的基因表达和蛋白表达。利用Kaplan-Meier生存数据库分析肝癌患者总生存率,评估TRIM47在肝癌患者预后中的价值。利用cBioPortal数据库分析肝癌患者中TRIM47的基因突变频率,以及TRIM47基因突变对肝癌患者总生存率的影响。构建稳定表达TRIM47的肝癌细胞株Hep3B、Huh-7,采用qRT-PCR检测肝癌细胞TRIM47 mRNA,CCK-8法检测其细胞增殖能力。肝癌TRIM47 mRNA相对表达量和增殖能力比较采用秩和检验或t检验。结果:UALCAN数据库分析显示肝癌组织中TRIM47 mRNA相对表达量中位数为18.95(10.79,31.81),明显高于正常肝组织中的7.09(5.76,9.61) (P<0.05)。HPA数据库分析显示肝癌组织中TRIM47蛋白水平呈高表达,而在正常肝组织中呈低表达。UALCAN数据库分析显示随着肿瘤组织中TRIM47表达水平的升高,患者临床分期、肿瘤分级越差(P<0.05)。Kaplan-Meier生存数据库分析显示低表达TRIM47的肝癌患者总体生存期更长(HR=1.59,95%CI:1.12~2.26;P<0.05)。cBioPortal数据库分析显示TRIM47在肝癌患者中的基因突变率可达14%,且能明显影响患者总生存率(P=0.013 6)。Hep3B-TRIM47和Huh-7-TRIM47肝癌细胞TRIM47 mRNA平均相对表达量分别为(4.87±0.14)×10-3、(2.47±0.47)×10-3,明显高于对照组的(0.60±0.08)×10-3、(0.18±0.05)×10-3(t=26.560,4.856;P<0.05)。Hep3B-TRIM47和Huh-7-TRIM47肝癌细胞株增殖能力显著增强。结论:TRIM47基因可通过促进肝癌细胞增殖影响肝癌患者的预后,TRIM47可能成为预测肝癌患者预后的一种新型标记物。
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编辑人员丨2023/8/5
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TRIM47在肝癌中的表达及对肝癌细胞功能调控的影响
编辑人员丨2023/8/5
目的 检测三基序蛋白47(tripartite?motif protein47,TRIM47)与肝癌的关系及其对肝癌细胞增殖和迁移的调控作用.方法 通过TCGA、HPA和HCCDB数据库检测肝癌组织和癌旁组织中TRIM47的表达,进一步评估TRIM47与肝癌患者预后及临床病理参数的关系;通过基因集富集分析(GSEA)预测TRIM47基因在肝癌中的相关信号通路.利用慢病毒构建过表达TRIM47的HepG2肝癌细胞,Western blot检测mTOR和WNT信号通路中关键分子的激活及表达;CCK?8法和平板细胞克隆形成试验检测TRIM47对HepG2肝癌细胞增殖的影响;Transwell试验和细胞划痕愈合试验检测TRIM47对HepG2肝癌细胞迁移的影响.结果 与癌旁组织相比,TRIM47在肝癌组织中的表达水平显著上调(P<0.05);高表达的TRIM47与肝癌患者的不良预后密切相关(P<0.05);临床数据分析结果所示,在年龄>50岁、男性患者和非亚洲籍的肝癌患者中TRIM47的表达水平降低,在AFP>20 ng/mL、肿瘤组织学分级>G2、病理分级>Ⅱ级的肝癌患者中TRIM47的表达水平升高(P<0.05);GESA的预测结果显示,TRIM47基因在肝癌中与mTOR和WNT信号通路密切相关(P<0.05),Western blot结果表明,在过表达TRIM47的HepG2细胞中,mTOR信号通路中p?mTOR及WNT信号通路分子β?catenin的表达水平显著升高;过表达TRIM47的肝癌细胞增殖率和迁移率显著高于对照组.结论 TRIM47在肝癌中表达升高,并且可以作为肝癌临床预后的评估指标,TRIM47促进肝癌细胞的增殖和迁移,与mTOR和WNT信号通路的激活有关.
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编辑人员丨2023/8/5
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TRIM家族蛋白在胰腺癌发生发展中的作用研究进展
编辑人员丨2023/8/5
胰腺癌是一种具有高度侵袭性且预后极差的消化系统恶性肿瘤,其发病的分子机制及更为有效的治疗手段一直是研究的热点.三结构域(TRIM)蛋白是具有高度保守的RBCC三段结构域的蛋白家族,其中RING-finger结构域赋予了TRIM蛋白E3泛素连接酶活性,使其能够介导癌基因和肿瘤抑制因子的泛素化降解,从而在胰腺癌的发生发展中发挥重要作用.TRIM家族蛋白涉及诸多信号通路,同一个TRIM蛋白分子可能直接或间接参与多个信号通路.单独靶向TRIM家族蛋白(如TRIM2、TRIM14、TRIM15、TRIM21、TRIM29、TRIM47、TRIM59等),以及靶向TRIM11、TRIM31和TRIM37等与吉西他滨等化疗药物联合应用有望成为治疗胰腺癌的重要方法和新的策略.TRIM家族蛋白在胰腺癌组织中高表达且与预后密切相关,可能作为早期诊断和预测胰腺癌预后的生物标志物.研究TRIM家族蛋白在胰腺癌发生发展过程中的分子机制及其作用,有助于为胰腺癌患者的诊断和治疗提供新思路.
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编辑人员丨2023/8/5
