目的:分析导管相关性血流感染草螺菌属的鉴定和药敏试验过程，提高临床医师和微生物检验工作者对罕见病原微生物关注和认知。方法:采集1例慢性肾衰竭血液透析患者经透析导管留取的血培养阳性标本，涂片、染色、镜检，并对分离到单个菌落，分别进行质谱分析、生化鉴定和药敏试验；提取细菌基因组DNA，扩增细菌16S rDNA并测序；细菌基因组高通量测序。结果:血培养瓶孵育20 h后阳性报警，涂片见革兰阴性杆菌。血琼脂上孵育16 h，见乳白色、凸起和无溶血菌落。VITEK2 Compact鉴定为洋葱伯克霍尔德菌，N335药敏卡检测药敏结果，发现该菌对氨曲南和多黏菌素耐药，其余抗生素均敏感。VITEK MS质谱仪临床数据库无法鉴定出种属，VITEK MS科研数据库鉴定为 Herbaspirillum huttiense/Herbaspirillum aquaticum。该菌16S rDNA与草螺菌属 Herbaspirillum huttiense、Herbaspirillum aquaticum一致性均>99%。细菌基因组高通量测序，发现本例临床分离株与Genbank数据库中 Herbaspirillum huttiense subsp putei IAM 15032同源性为100%，证实本例分离株为 Herbaspirillum huttiense。 结论:环境微生物演变成人类病原菌种类不断增多，草螺菌属因其生化特性与其他菌种相似，极易被误鉴定，需引起检验工作者的重视。

目的:通过检测pSS患者粪便中菌群种类及分布情况，探究肠道菌群变化及其代谢特征与患者淋巴细胞亚群的关系及其在pSS发生、发展中的潜在作用。方法:收集2019年1月至2020年1月在山西医科大学第二医院风湿免疫科住院治疗的101例pSS患者以及以及在山西省人民医院同期健康体检中心体检的101名年龄、性别匹配的健康对照（HC）的粪便样本，进行16s rDNA扩增子分析。采用R软件4.0.3进行统计学分析。Wilcoxon检验及相似性分析（ANOSIM）比较2组间Alpha多样性及Beta多样性。采用 t检验进行差异菌群分析。同时通过流式微球分析技术检测pSS患者外周血淋巴细胞亚群水平，并利用Pearson相关分析淋巴细胞亚群、ESR、CRP、唾液基础流率和刺激后流率等临床指标与特征菌群的关系。 结果:与HC相比，pSS患者的肠道菌群丰富度（Chao1指数、ACE指数）和多样性（Shannon指数、Simpson指数）受损，整体肠道微生物群组成差异有统计学意义（ANOSIM， r=0.09， P=0.001）。在门水平上，pSS患者厚壁菌门水平相对丰度减少，变形菌门的相对丰度增加。在属水平上，pSS中大肠杆菌-志贺菌属（ P<0.001）、乳酸杆菌（ P<0.001）、双歧杆菌（ P<0.001）、罕见小球菌（ P<0.001）、另枝菌属（ P<0.001）、产粪甾醇真杆菌（ P=0.002）比例增高；粪杆菌属（ P<0.001）、普氏菌属（ P<0.001）、罗氏菌属（ P<0.001）、巨单胞菌属（ P<0.001）、无杆菌属（ P<0.001）、毛螺菌属（ P<0.001）、毛螺菌属NK4A136（ P=0.006）、挑剔真杆菌（ P<0.001）比例明显降低。PICRUST分析显示pSS患者中氨基酸代谢如牛磺酸和亚牛磺酸代谢（ P<0.001）、脂肪酸代谢如丙酸代谢（ P<0.001）、谷胱甘肽代谢（ P=0.002）、硫辛酸代谢（ P=0.002）、脂多糖合成（ P=0.003）、非核糖体肽合成酶介导的铁载体生物合成（ P=0.005）、氨基苯甲酸酯降解（ P=0.002）等途径被富集。Pearson相关结果显示，HC和pSS 2组间具有不同丰度的关键菌群，这些关键菌与基础唾液流率、Th17细胞及Treg细胞的绝对数量密切相关。 结论:肠道微生物菌群的失调和代谢的改变会导致宿主免疫细胞的稳态发生变化，这可能与pSS的发生发展密切相关。

目的:探讨多囊卵巢综合征（polycystic ovary syndrome，PCOS）患者月经异常对于日后合并代谢综合征（metabolic syndrome，MS）的预测意义，并比较合并MS患者与不合并者的肠道菌群结构差异。方法:采用病例对照研究的方法选取2021年2月至2023年12月期间于复旦大学附属金山医院妇产科门诊就诊的111例PCOS患者作为研究对象，根据其是否合并MS分为PCOS不合并MS组（ n=74，记为NMS组）和PCOS合并MS组（ n=37，记为MS组），收集所有病例的月经相关信息及粪便标本，分析两组月经特点以及其对PCOS合并MS的预测意义；通过16S rDNA高通量测序对两组患者的肠道菌群进行对比分析。 结果:NMS组月经初潮正常后异常者月经改变年龄［（23.47±4.73）岁］、月经改变发生于初潮后的时间［（9.85±5.11）年］、月经改变时长［（3.43±2.78）年］与MS组［（20.71±3.61）岁， P=0.020；（7.04±3.34）年， P=0.025；（7.63±3.47）年， P<0.001］比较，差异均有统计学意义。MS组月经异常率、月经稀发及闭经的比例均高于NMS组，两组间月经模式构成比差异有统计学意义（ P=0.036）。初潮8年以后两组月经异常率差异均有统计学意义（均 P<0.05），初潮后8~13年 OR值分别为2.76（95% CI：1.07~7.11）、3.68（95% CI：1.28~10.56）、3.27（95% CI：1.13~9.41）、3.07（95% CI：1.06~8.87）、4.02（95% CI：1.16~15.21）、11.57（95% CI：1.48~90.49）；月经改变病程4年以上两组月经异常率差异亦均有统计学意义（均 P<0.05），月经改变病程4~9年 OR值分别为8.89（95% CI：2.14~36.99）、11.88（95% CI：3.07~46.02）、16.56（95% CI：4.15~66.13）、11.25（95% CI：2.88~32.95）、7.80（95% CI：2.04~29.84）、10.00（95% CI：1.91~52.48）。MS组肠道菌群α多样性指数较NMS组降低，但差异无统计学意义（ P>0.05）；门水平下，两组肠道菌群丰度差异有统计学意义（ P<0.001），MS组拟杆菌丰度较NMS组低，两组厚壁菌门丰度相近；属水平下，两组肠道菌群丰度差异有统计学意义（ P<0.001），MS组较NMS组双歧杆菌属丰度降低，链球菌属及埃希氏菌属丰度增加。 结论:PCOS患者初潮8年以后月经异常对日后合并MS具有预测作用，且其预测效果随年龄上升而增加，但随月经异常改变病程增加无明显变化。PCOS合并MS患者肠道菌群结构与不合并MS者确实存在明显不同。

目的:利用16S rDNA全长高通量测序技术，探索妊娠期糖尿病（gestational diabetes mellitus，GDM）孕妇饮食干预前后肠道菌群的变化及与口服葡萄糖耐量试验（oral glucose tolerance test，OGTT）结果的相关性。方法:选取2022年7月至2023年3月在新疆医科大学第一附属医院定期产检的孕妇30例，根据24～28周OGTT结果，分为研究组（15例）和正常组（15例）。收集其一般资料和实验室相关检查指标，同时对研究组孕妇进行个体化饮食干预，对正常组孕妇给予常规饮食指导干预，干预时间均为2周，分别收集两组干预前、后的粪便，共收集到60份粪便样本。通过PacBio测序平台，利用单分子实时测序对受试者粪便DNA进行第三代微生物16S rDNA全长多样性测序，比较两组干预前、后肠道菌群的结构、丰度及多样性。结果:两组孕妇的菌群丰度有显著差异的物种共有74种，其中54种在研究组中富集。纳入OGTT结果作为环境因子进行相关性分析显示，毛螺菌（ P=0.002）和未分类的细菌（ P=0.035）与OGTT 0 h血糖呈正相关，差异有统计学意义（ P<0.05）；厚壁菌（ P=0.018）、颤螺菌（ P=0.045）与OGTT 0 h血糖呈负相关，差异有统计学意义（ P<0.05）；毛螺菌（ P=0.027）、未分类的细菌（ P=0.028）与OGTT 1 h血糖呈正相关，差异有统计学意义（ P<0.05），颤螺菌与OGTT 1 h血糖呈负相关（ P=0.025），差异有统计学意义（ P<0.05）；毛螺菌（ P=0.027）与OGTT 2 h血糖呈正相关，差异有统计学意义（ P<0.05）。 结论:GDM孕妇经过个体化饮食干预后，肠道菌群中的优势菌发生了改变，GDM孕妇空腹血糖较干预前降低，由此可推断GDM孕妇可通过个体化饮食干预调节紊乱的肠道菌群，这一发现为饮食干预治疗妊娠期糖尿病提供有力的支持。

目的:探讨老龄雄性C57BL/6J小鼠剖腹探查术后认知功能障碍与肠道菌群及其代谢物失调改变的关系。方法:采用随机数字表法将48只老龄（16~17月龄）无特定病原体（SPF）雄性C57BL/6J小鼠分为对照组（ n=24）和手术组（ n=24）。手术组采用1.4%异氟醚诱导麻醉15 min后，继续用1.4%异氟醚+100%氧气维持麻醉行剖腹探查术，手术时间持续10 min，术后继续麻醉2 h；对照组不予手术及麻醉，置于含100%氧气的透明箱中2 h。术后48 h同时采集两组小鼠的粪便和外周血。采用16S rDNA基因测序检测肠道菌群的丰度、多样性和差异性，采用液相色谱-串联质谱（LC/MS）代谢组技术检测粪便代谢谱的改变，并分析差异代谢物功能，采用ELISA检测血清白细胞介素（IL）-6、IL-1β和肿瘤坏死因子-α（TNF-α）含量。在术后3 d行Morris水迷宫实验，检测小鼠认知功能。 结果:对照组与手术组小鼠术后逃避潜伏期分别为（22.0±4.9）、（35.0±5.1）s，目标象限停留时间分别为（26.0±3.7）、（16.0±2.9）s；与对照组比较，手术组小鼠术后逃避潜伏期延长（ P=0.035），目标象限停留时间减少（ P=0.006）。两组小鼠肠道菌群差异变化具有可比性，手术组大肠埃希菌、志贺菌和梭杆菌的菌群表达水平上调，瘤胃菌和丁酸菌的菌群表达水平下调。LC/MS获得对照组和手术组小鼠粪便代谢谱，在正、负离子模式分别筛选出14种和21种差异代谢物，正离子模式差异代谢物为谷氨酸、2-吲哚甲酸、犬尿酸、甘油醛等，负离子模式差异代谢物为甲硫氨酸、天冬氨酸、L-苏氨酸、酪氨酰-苏氨酸、5-羟基吲哚-3-乙酸等。鉴定出的差异代谢物的路径主要涉及氨基酸、脂肪酸和色氨酸代谢以及核苷酸合成。两组小鼠血清IL-1β、IL-6和TNF-α表达水平差异均无统计学意义（均 P>0.05）。 结论:肠道菌群及其代谢物失调与老龄雄性C57BL/6J小鼠术后认知功能障碍的发生相关。麻醉手术不仅改变了小鼠肠道微生物菌群的组成，而且改变了代谢稳态和粪便代谢表型。

目的:探讨氧化苦参碱对结直肠癌小鼠肠道菌群的影响及其对小鼠结直肠癌作用的相关微生物机制。方法:将16只5周龄BALB/c雄性小鼠通过氧化偶氮甲烷（AOM）-葡聚糖硫酸钠（DSS）法建立小鼠原位结直肠肿瘤模型，采用分层抽样的方法分为对照组和氧化苦参碱干预组，每组8只；其中氧化苦参碱干预组于造模第5周开始接受10 mg/kg氧化苦参碱溶液隔日腹腔注射，对照组接受等量0.9% NaCl注射液腹腔注射，至造模第81天实验结束。自开始造模，每3 d测量1次小鼠体质量。于处死前收集小鼠粪便，进行微生物及16S核糖体DNA（rDNA）高通量测序。观察结直肠肿瘤数，取肿瘤组织，采用苏木精-伊红（HE）染色判断肿瘤分化程度，计算各分化级别肿瘤组织灶占总肿瘤组织灶的比例；免疫组织化学法检测Ki-67表达情况。结果:实验后期（造模第49天至第81天），对照组小鼠体质量低于氧化苦参碱干预组[造模第81天体质量：（22.9±0.5）g比（24.0±0.5）g， t=2.187， P<0.05]，实验结束时，氧化苦参碱干预组肠道肿瘤数少于对照组[（8.5±1.2）个比（12.0±1.2）个， t=2.824， P<0.05]；氧化苦参碱干预组小鼠肠道高分化肿瘤灶占比高于对照组[（62.5±3.7）%比（25.0±2.6）%]，Ki-67表达评分低于对照组[（3.2±1.0）分比（6.0±1.0）分， t=2.668， P<0.05]。在门水平，氧化苦参碱干预组小鼠肠道中厚壁菌门、变形菌门丰度高于对照组（均 P<0.05），拟杆菌门丰度低于对照组（ P=0.037）。在属水平，氧化苦参碱干预组norank_f__桑科菌丰度高于对照组（ P=0.001），拟杆菌属、臭气杆菌属、副细菌属、异波菌属丰度低于对照组（均 P<0.05）。 结论:氧化苦参碱可能通过调节小鼠肠道菌群维持肠道菌群稳定，从而降低肠道肿瘤的发生率，延缓肿瘤进展。

目的:研究多重耐药霍氏肠杆菌霍夫曼亚种临床分离株C37携带 blaNDM-1基因质粒的遗传特征，并对目前可公开获得的66个霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的核心基因组进行系统发育分析，以研究霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的全球流行情况。 方法:收集2014年8月至2021年8月中山大学附属第一医院分离的耐碳青霉烯阴沟肠杆菌复合物（CRECC）。采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术（MALDI-TOF MS）和16S rRNA Sanger测序对C37进行菌种鉴定。使用微量肉汤稀释法进行抗菌药物敏感性试验。采用聚合酶链反应（PCR）检测C37菌株携带的β内酰胺酶耐药基因和质粒介导的喹诺酮类耐药（PMQR）基因。使用接合试验确认C37菌株抗性基因的接合转移性。对C37菌株进行全基因组测序，提取霍氏肠杆菌霍夫曼亚种的核心基因组，对目前可公开获得的66个霍氏肠杆菌霍夫曼亚种进行系统发育分析。结果:霍氏肠杆菌霍夫曼亚种C37菌株对三代头孢、碳青霉烯类、氨基糖苷类及喹诺酮类抗菌药物耐药，携带 blaACT-5、 blaNDM-1、 qnrA1、 aac（ 6′） -Ib-cr、 oqxAB、 fosA、 dfrA15等多种抗性基因及IncX3、IncX4、IncFIB和IncFII质粒。多位点序列分型（MLST）分析显示其属于阴沟肠杆菌复合体（ECC）ST78型。系统发育分析显示ST78型霍氏肠杆菌霍夫曼亚种与碳青霉烯耐药基因传播密切相关。 结论:ST78型霍氏肠杆菌霍夫曼亚种与碳青霉烯耐药基因传播密切相关，是传播碳青霉烯耐药基因的高风险克隆，需密切监测其流行情况。

目的:观察小檗碱对高脂饮食诱导的非酒精性脂肪肝大鼠治疗效果并探讨其可能的机制。方法:将26只Sprague-Dawley大鼠（120～160 g）随机分为3组，分别为对照组( n = 8)、模型组（ n = 10）和治疗组（ n = 8）。对照组大鼠给予普通饲料喂养，模型组及治疗组给予高脂饮食饲养。第12周，处死模型组2只大鼠，确认造模成功。随后治疗组大鼠给予150 mg·kg -1·d -1小檗碱灌胃4周，对照组及模型组给予相同剂量等渗盐水灌胃。第16周处死大鼠。HE染色观察大鼠小肠黏膜上皮绒毛变化；苏丹黑B染色观察肝脏脂肪变情况；免疫组织化学染色观察小肠上皮occludin蛋白表达；16S rDNA实时荧光定量PCR法测量大鼠粪便中大肠杆菌、拟杆菌及普拉梭菌的数量。 结果:模型组大鼠血清内毒素（0.288±0.045）和肿瘤坏死因子（TNF）-α（1.07±0.11）水平均高于对照组（0.192±0.049，0.94±0.07）（ P < 0.05）,小檗碱干预可显著降低内毒素（0.213±0.025）和TNF-α水平（0.93±0.07）（ P < 0.05）。模型组大鼠肠黏膜上皮occludin蛋白表达（0.05±0.012）明显低于对照组（0.166±0.014）,小檗碱对肠黏膜occludin蛋白表达有促进作用（0.055±0.009），但差异无统计学意义（ P > 0.05）。同时,与模型组（7.29±0.47）相比,对照组（9.49±0.59）拟杆菌数量降低，治疗组拟杆菌的数量增加（9.77±0.87）；与对照组（5.42±0.63，9.49±0.59）相比，模型组大肠杆菌（6.92±0.77）、普拉梭菌（8.70±0.62）数量增加，小檗碱干预减少了大肠杆菌（6.34±0.71）、普拉梭菌（9.77±0.87）的数量（ P < 0.05）。 结论:小檗碱有效地保护了非酒精性脂肪肝大鼠的肠屏障功能，其作用机制可能是对肠道菌群的调节。

目的:探讨幽门螺杆菌(Hp)阳性十二指肠溃疡患儿Hp根除治疗前后肠道菌群变化特征及临床意义。方法:回顾性分析2018年1月至2020年12月济南市第二妇幼保健院收治的98例十二指肠溃疡患儿的临床资料，根据是否感染Hp分为Hp感染组与Hp未感染组，留取Hp感染组治疗前及治疗7 d、治疗14 d、治疗结束后30 d的粪便行16S rDNA测序，应用独立样本 t检验比较Hp感染组与Hp未感染组肠道菌群检出情况，配对 t检验比较Hp感染组治疗前后的肠道菌群检出情况，以非参数检验比较Hp感染组与Hp未感染组的菌群多样性[多样性(Shannon、Simpson)指数和丰富度(Chao 1)指数]和Hp感染组治疗前后的菌群多样性。 结果:治疗前Hp感染组与Hp未感染组的双歧杆菌[(5.92±1.85) lg copies/g粪便比(6.58±2.01)lg copies/g粪便]、乳杆菌[(4.89±1.35) lg copies/g粪便比(4.47±1.59)lg copies/g粪便]、类杆菌[(8.42±2.12) lg copies/g粪便比(8.01±2.20) lg copies/g粪便]、产气荚膜梭菌[(5.90±1.90) lg copies/g粪便比(5.88±2.01) lg copies/g粪便]、肠球菌[(5.41±1.27) lg copies/g粪便比(5.02±1.48) lg copies/g粪便]、肠杆菌[(5.01±1.80) lg copies/g粪便比(5.37±1.47) lg copies/g粪便]、酵母菌[(5.90±1.85) lg copies/g粪便比(5.88±2.01) lg copies/g粪便]检出数量比较，差异均无统计学意义(均 P>0.05)。Hp感染组与Hp未感染组的肠道菌落多样性Shannon指数(3.84±0.52比3.90±0.45)、Simpson指数(0.16±0.04比0.15±0.05)、Chao 1指数(178.52±40.22比185.32±42.47)比较，差异均无统计学意义(均 P>0.05)。与治疗前比较，Hp感染组治疗后不同时间双歧杆菌、乳杆菌、类杆菌检出数量均下降(均 P<0.05)；与治疗7 d及治疗14 d比较，治疗结束后30 d双歧杆菌[(4.54±1.78) lg copies/g粪便比(4.20±1.22) lg copies/g粪便比(5.21±1.55) lg copies/g粪便]、乳杆菌[(4.01±1.20) lg copies/g粪便比(3.89±1.32) lg copies/g粪便比(4.43±1.10) lg copies/g粪便]、类杆菌检出数量[(6.78±1.88) lg copies/g粪便比(6.55±1.90) lg copies/g粪便比(7.68±2.00) lg copies/g粪便]均有所升高(均 P<0.05)；Hp感染组治疗前后不同时间的产气荚膜梭菌、肠球菌、肠杆菌、酵母菌检出数量比较，差异均无统计学意义(均 P>0.05)。与治疗前比较，Hp感染组治疗后不同时间的Shannon指数与Chao 1指数均降低，Simpson指数均增加(均 P<0.05)；与治疗7 d及治疗14 d比较，治疗结束后30 d的Shannon指数(2.85±0.45比2.57±0.48比3.20±0.50)与Chao 1指数(148.45±32.33比140.32±30.47比160.42±38.42)均增加，Simpson指数(0.25±0.06比0.27±0.08比0.19±0.05)降低(均 P<0.05)。 结论:Hp感染对十二指肠溃疡患儿肠道菌群无明显影响，抗Hp治疗可导致肠道菌群失衡及肠道菌群多样性下降，在抗Hp治疗时应考虑大量抗生素对肠道菌群的影响。

目的:明确宣白承气汤对脓毒症小鼠肺和肠道损伤以及肠道功能的作用，分析其对脓毒症小鼠肠道菌群的影响。方法:健康清洁级C57雄性小鼠36只，随机（随机数字法）分为三组，每组12只，分别为对照组、模型组和宣白承气汤治疗组。通过腹腔注射细菌脂多糖（lipopolysaccharide，LPS）5 mg/kg制备脓毒症模型，造模前24 h、造模后0.5 h及造模后12 h宣白承气汤灌胃给药，造模后24 h采集肺脏、肠道以及血液标本。采用实时荧光定量PCR测定肺部和肠道组织炎症因子白介素1β（interleukin-1β, IL-1β）、IL-6、肿瘤坏死因子α（tumor necrosis factor-α, TNF-α）和单核细胞趋化蛋白1（monocyte chemoattractant protein-1, MCP-1）含量，通过组织学染色评估肺部和肠道结构损伤和改变，通过特殊染色评价肠道黏蛋白表达，分别采用免疫组化和Western Blot分析肠道上皮紧密连接蛋白的表达，最后使用鲎试剂盒检测各组小鼠血浆中内毒素含量，并提取小鼠粪便DNA，通过菌群16S rDNA荧光定量PCR方法检测脓毒症小鼠肠道菌群变化。三组间的计量资料比较，采用单因素方差分析。结果:（1）宣白承气汤能够降低脓毒症小鼠肺部炎症因子IL-1β、IL-6、TNF-α和MCP-1的表达（均 P<0.05），减轻肺部炎症损伤；（2）与模型组相比，宣白承气汤治疗组小鼠肠道炎性损伤有所缓解，肠道炎症因子表达明显下调（均 P<0.05），肠道黏蛋白和上皮紧密连接蛋白表达增加，肠道屏障功能改善；（3）宣白承气汤减轻脓毒症小鼠循环血液中内毒素的含量（ P<0.05），并促进脓毒症小鼠肠道中有益菌阿克曼菌的生长，减少肠球菌属的表达（均 P<0.05）。 结论:宣白承气汤可显著改善脓毒症小鼠肺部和肠道炎症损伤，调节肠道上皮屏障和肠道菌群，改善肠道功能。