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云南草果种质资源DNA条形码序列分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 筛选与评价适用于云南草果居群的DNA条形码.方法 以云南省草果种质资源为样本对ITS、psbA-tmH、marK、rbcL和ycf1 5条DNA条形码常用序列进行筛选与评价,并对草果居群进行扩增,测序,测序序列用Genestar进行拼接,然后用Mega进行数据处理,并对草果多样性及其鉴定进行分析.结果 引物ITS5和ITS4对草果的扩增片段长度大约为520 bp;rbcLa-F和rbcLa-R对草果的扩增片段长度大约为498 bp;引物ycf1-bF和ycf1-bR对草果的扩增片段长度大约为800 bp;引物psbA-tmH-1F和psbA-tmH-1R对草果的扩增片段长度大约为400 bp;引物matK-2F和matK-2R对草果的扩增片段长度大约为470 bp.扩增及测序的成功率均较高,结果大多可用.通过对草果ITS、psbA-tmH、matK和ycfl序列的扩增结果进行分析,草果与其他豆蔻属植物都可以被清晰地区分开;ITS序列所有样本分为MG5白花草果居群和其他居群;psbA-trnH序列所有样本分为MG5白花草果居群,MG6黄花草果居群和其他居群;matK序列所有样本分为MG6黄花草果居群和其他居群,MG5白花草果样本扩增失败;ycf1序列所有样本分为MG6黄花草果居群和其他居群,MG5白花草果居群与其他22个草果居群聚为一支;rbcL序列对所有样本的扩增均一致.结论 ITS、marK、psbA-trnH及ycf1序列均能将草果与其他同属植物进行准确区分;MG6的matK、psbA-trnH及ycf1序列发现了序列位点的变异,为草果品种的选育做出贡献.ITS和psbA-trnH序列可将黄花和白花草果序列区分开;草果白花黄花所有样本rbcL序列无任何变异,且用rbcL序列无法鉴别草果与其他同属植物,可将其舍去.
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编辑人员丨2023/8/6
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基于植物DNA条形码rbcLa序列的日本条螽食谱分析
编辑人员丨2023/8/5
日本条螽Ducetia japonica广泛分布于我国绝大部分区域,并在城区绿地大量发生.据此假设其食物谱可能具有较高的物种多样性,但目前对其在自然环境下取食的植物种类仍缺乏了解.本研究对来自河北保定城区绿地和城郊荒地两种生境共计75头日本条螽肠道内容物进行DNA提取、rbcLa基因片段扩增及测序,并利用BOLD和NCBI数据库进行分类鉴定.结果显示:日本条螽在野外至少取食10科、13种植物.在城区绿地和城郊荒地两种生境中,取食频率最高的植物分别是卫矛科冬青卫矛Euonymus japonicus(47.37％)和大麻科葎草Humulus scandens(81.08％).只有1条rbcLa基因序列未鉴定至种级水平,表明利用植物DNA条形码rbcLa基因序列可对植食性昆虫取食的植物种类进行快速鉴定.同时,研究结果也初步证实日本条螽的食物谱包含较高的物种多样性,为城市绿地螽斯类鸣虫保护和繁育提供依据.
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编辑人员丨2023/8/5
