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目的:通过生物信息学方法,筛选可能与卵巢癌诊断、预后及免疫浸润相关的基因.方法:从GEO数据库中下载数据集,并筛选出卵巢癌差异基因,通过STRING数据库和Cytoscape软件筛选出核心基因BIRC5.通过GEPIA和UALCAN数据库分析BIRC5表达水平与预后关系以及其表达与卵巢癌患者临床特征之间的关系.TIMER数据库分析BIRC5与卵巢肿瘤免疫细胞浸润的相关性.LinkedOmics和DAVID数据库分析BIRC5基因的正相关基因和KEGG通路.结果:筛选出卵巢癌相关的核心基因18个,包括BIRC5.BIRC5在卵巢癌中的表达均高于正常组织(均P<0.05),且在分期和淋巴结转移方面比较,差异均具有统计学意义(均P<0.05).BIRC5高表达组患者5年生存率高于低表达组(P<0.05).BIRC5基因参与卵巢癌肿瘤细胞的免疫浸润.KEGG通路显示BIRC5主要参与细胞周期、人类T细胞白血病病毒1型感染、卵母细胞减数分裂、细胞衰老、p53信号通路、孕酮介导的卵母细胞成熟、细胞外基质受体互作、蛋白消化和吸收等信号通路.结论:BIRC5为卵巢癌诊断及预后相关基因,参与多种分子调控通路,可作为卵巢癌潜在的生物标志物.

作者:武福文;洪莉

来源:武汉大学学报(医学版) 2024 年 45卷 3期

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作者:
武福文;洪莉
来源:
武汉大学学报(医学版) 2024 年 45卷 3期
标签:
卵巢癌 生物信息学 差异表达基因 预后 免疫浸润 BIRC5 Ovarian Cancer Bioinformatics Differentially Expressed Genes Prognosis Im-mune Infiltration BIRC5
目的:通过生物信息学方法,筛选可能与卵巢癌诊断、预后及免疫浸润相关的基因.方法:从GEO数据库中下载数据集,并筛选出卵巢癌差异基因,通过STRING数据库和Cytoscape软件筛选出核心基因BIRC5.通过GEPIA和UALCAN数据库分析BIRC5表达水平与预后关系以及其表达与卵巢癌患者临床特征之间的关系.TIMER数据库分析BIRC5与卵巢肿瘤免疫细胞浸润的相关性.LinkedOmics和DAVID数据库分析BIRC5基因的正相关基因和KEGG通路.结果:筛选出卵巢癌相关的核心基因18个,包括BIRC5.BIRC5在卵巢癌中的表达均高于正常组织(均P<0.05),且在分期和淋巴结转移方面比较,差异均具有统计学意义(均P<0.05).BIRC5高表达组患者5年生存率高于低表达组(P<0.05).BIRC5基因参与卵巢癌肿瘤细胞的免疫浸润.KEGG通路显示BIRC5主要参与细胞周期、人类T细胞白血病病毒1型感染、卵母细胞减数分裂、细胞衰老、p53信号通路、孕酮介导的卵母细胞成熟、细胞外基质受体互作、蛋白消化和吸收等信号通路.结论:BIRC5为卵巢癌诊断及预后相关基因,参与多种分子调控通路,可作为卵巢癌潜在的生物标志物.

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