目的 基于数据库挖掘分析胃癌预后预测和胃癌靶向治疗的潜在关键基因(Hub基因).方法 本研究选取基因表达综合数据库(GEO)的GSE33651和GSE118916数据集(研究时间为2011年11月—2019年8月).GEO2R进行胃癌差异表达基因(DEGs)分析.DAVID数据库对DEGs进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.采用STRING数据库和Cytoscape软件构建DEGs的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,其中Degree＞10的DEGs被认为是Hub基因.基于癌症基因组图谱(TCGA)的胃腺癌数据,使用OncoLnc和UALCAN数据库对Hub基因进行生存分析和表达分析.TIMER数据库对Hub基因进行免疫浸润分析.结果 GSE33651和GSE118916中鉴定出80个共有上调和34个共有下调DEGs.DEGs富集在69个GO条目和7个KEGG信号通路.从PPI网络中筛选出14个Hub基因.FN1、COL4A2和COL4A1基因在胃癌组织的表达水平均显著高于胃正常组织,且在胃癌中具有良好的预后预测价值.FN1、COL4A2和COL4A1与免疫浸润密切相关,提示其可能参与胃癌的免疫反应.结论 FN1、COL4A2、COL4A1是胃癌的Hub基因,可能是潜在的胃癌预后生物学标志物和治疗靶点.
作者：雷昕奕；宋丹军；戴丐国；张云利；杨立涛
来源：中华全科医学 2023 年 21卷 11期
