目的:利用生物信息学分析方法，筛选出原位肝癌和转移灶中的差异基因及其参与的代谢通路，寻找肝癌转移治疗新的代谢靶点。方法:从基因表达汇编数据库(GEO)中下载编号为GSE40367的肝癌原发和转移基因表达谱数据。筛选出差异基因后，对差异基因进行基因本体论(GO)功能富集和京都百科全书基因和基因组(KEGG)通路分析。利用STRING数据库和cytoscape软件分析差异基因间的蛋白相互作用。通过文献检索获得肝癌转移中代谢组的变化，对差异基因和代谢物用MetaboAnalyst 4.0进行联合分析。利用Kaplan-Meier生存曲线在线对关键基因进行生存分析。结果:从GSE40367中共筛选出564个差异基因，相比于原位肿瘤，转移癌中上调基因287个，下调基因277个。差异基因GO功能富集在一元羧酸代谢、脂肪酸代谢和脂质转运等过程。KEGG主要富集在胆汁分泌、ABC转运蛋白、半胱氨酸和甲硫氨酸代谢以及糖异生等通路。联合分析表明，主要相关代谢通路是烟酸和烟酰胺代谢、苯丙氨酸代谢、精氨酸生物合成和糖酵解或糖异生等。对关键基因的生存分析发现， CTH基因低表达可能与肝癌不良预后相关， PCK1、 AOX1基因的高表达可能与肝癌不良预后相关。 结论:利用生物信息学分析揭示了与肝癌转移相关的代谢通路及通路中基因和代谢物的变化，提示了肝癌转移发生的分子机制，为肝癌转移治疗提供了新的代谢靶点。

目的:考察白头翁五环三萜皂苷B3,BD,B7,B10,B11在十二指肠、空肠、回肠中的膜通透性,并研究小肠上皮MCTs对5种五环三萜皂苷吸收的影响.方法:采用大鼠外翻肠囊实验,建立超高效液相色谱-三重四级-线性离子肼-质谱(UPLC/Q-TRAP-MS)法,通过一元羧酸转运体(MCTs)抑制剂阿魏酸、苯甲酸和布洛芬实验进行考察.结果:5种白头翁皂苷类成分在十二指肠段中的表观渗透率(Papp)最高(P＜0.05或P＜0.01),空肠段次之,回肠段最小;阿魏酸、苯甲酸、布洛芬在十二指肠、空肠、回肠中对白头翁皂苷均有抑制作用(P＜0.05,P＜0.01).结论:十二指肠可能为该类皂苷吸收的主要部位;白头翁皂苷可能为MCTs的底物.

目的 肝细胞癌(HCC)是世界上最常见的肝恶性肿瘤之一.HCC的病因和潜在的分子事件尚不清楚.我们应用综合生物信息学技术识别与HCC相关的关键致病基因细胞分裂周期20(CDC20),并揭示其潜在的分子机制.方法 从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载GSE36376基因表达谱,共433个样本,其中HCC组织240例,正常肝组织193例,用综合生物信息学方法进行深入分析.应用RStudio中的R软件筛选HCC和正常肝组织差异表达基因(DEG),从STRING数据库中构建DEG的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,应用Metascape在线工具进行富集分析,采用MCODE法对Hub基因进行鉴定.结果 筛选GSE36376数据集得到706个DEG,其中共鉴定出554个下调基因和152个上调基因;从PPI网络中鉴定出DEG关系基因,显著上调基因是UBE2C、CDC20、COL4A1、NUSAP1、HSP90AB1和CD-KN3;Metascape富集分析表明,在GO生物过程中,主要集中在小分子分解代谢过程、一元羧酸代谢过程、类固醇代谢过程、辅因子代谢过程、药物分解代谢过程、初级酒精代谢过程、对有毒物质的反应、有机阴离子转运、单糖代谢过程、芳香族氨基酸家族代谢过程、解毒作用、伯醇分解代谢过程和有机环状化合物分解代谢过程等;在KEGG信号通路中,主要集中在碳代谢、脂肪酸降解、补体和凝血级联、色氨酸代谢和过氧物酶体等过程;MCODE分析显示Hub基因是UBE2C、CDC20和HSP90AB1.结论 应用综合生物信息学方法筛选出的CDC20基因是HCC发生发展的关键基因,对HCC的早期诊断和预防具有临床意义,为HCC的防治提供了有效的靶点.

炎症性肠病(IBD)是肠道慢性炎症性疾病,主要包括溃疡性结肠炎(UC)和克罗恩病(CD),其确切病因和发病机制至今不明.SCFAs是一种羧酸,是一类对宿主免疫和能量状态具有多重影响的细菌代谢物.一元羧酸转运蛋白1(MCT1)和钠偶联的一元羧酸转运蛋白1(SMCT1)在肠上皮细胞吸收SCFAs中发挥关键作用.肠道稳态失衡是IBD的重要发病机制,SCFAs可通过激活GPCRs或抑制HDACs途径在调节肠道免疫细胞、维持黏膜完整性、调控细胞因子、提供细胞能量等维持肠道稳态方面发挥重要作用.本文就SCFAs在IBD中的作用研究进展进行综述.