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基于全长16S rRNA测序的高尿酸血症人群肠道菌群特征
编辑人员丨1周前
目的:对高尿酸血症(hyperuricemia,HUA)患者和健康对照人群的肠道菌群特征进行差异性分析,探索肠道菌群与高尿酸之间的相关性。方法:在中国人民解放军战略支援部队特色医学中心2021年健康体检人群中招募63名成年志愿者,其中HUA患者25例,健康对照人群38例,采集他们的粪便样本,通过使用全长16S rRNA测序技术,对所有受试者粪便样本进行分析,研究不同尿酸水平人群的肠道菌群构成特征。结果:HUA组与健康对照组肠道菌群的整体组成存在差异,α多样性指数在HUA组明显降低,β多样性分析可以看出两组间存在明显差异。在菌群组成上,HUA组表现为拟杆菌门增多,厚壁菌门降低。通过LEfSe差异分析,发现HUA组具有独特的菌群结构,以普拉梭菌( Faecalibacterium prausnitzii)为代表的多种短链脂肪酸(SCFAs)产生菌明显降低;唾液链球菌( Streptococcus salivarius)、脆弱拟杆菌( Bacteroides fragilis)、 Fusobacterium hwasookii、 Flavonifractor plautii、黏液分枝杆菌( Mycobacterium mucogenicum B)、 Blautia sp003287895在HUA组明显升高。此外,通过PICRUSt2功能基因预测发现HUA组人群肠道菌群短链脂肪酸合成途径等相关代谢降低,与特有的菌群结构一致。 结论:HUA人群与健康对照人群比较,存在特有的肠道菌群构成和代谢特征。
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编辑人员丨1周前
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多基因检测在综合性医院分枝杆菌分型中的临床应用
编辑人员丨2023/8/6
目的:使用分枝杆菌种属特异性基因的核酸检测方法,对临床分离得到的分枝杆菌菌株进行菌种分型.方法:对实验室固体培养基分离得到的32株分枝杆菌的rpoB基因进行扩增,对PCR产物进行序列测定,在NCBI基因序列数据库中进行比对,根据与标准序列的相似度分析其菌型,并用hsp65基因进行复核.结果:32株分枝杆菌经rpoB基因与hsp65基因核酸分析,其中结核分枝杆菌22株,非结核分枝杆菌10株.NTM分离率为31.2%,包括脓肿/龟分枝杆菌5株,鸟分枝杆菌复合群3株,海分枝杆菌1株,产黏液分枝杆菌1株.结论:用分枝杆菌的菌型特异性基因rpoB与hsp65基因进行核酸扩增和序列分析,对临床菌株能有效区分结核分枝杆菌和非结核分枝杆菌.
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编辑人员丨2023/8/6
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快速生长分枝杆菌菌血症的菌种分布及临床研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 对5例快速生长分枝杆菌菌血症患者进行菌种鉴定和临床特征分析,提高该病诊疗水平.方法 对海南省人民医院2016-2017年收集的5株快速生长分枝杆菌采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术进行初步鉴定,16s rRNA确证,结合文献报道的15例快速生长分枝杆菌菌血症病例分析其临床特征.结果 MALDI-TOF MS鉴定结果为马德里分枝杆菌、脓肿分枝杆菌、产黏液分枝杆菌各一株,偶发分枝杆菌群2株.16s rRNA鉴定结果为马德里分枝杆菌、脓肿分枝杆菌、产黏液分枝杆菌、偶发分枝杆菌、猪分枝杆菌各1株.主要临床症状为发热,2例死亡,3例治疗后好转.结论 MALDI-TOF MS是一种简单、方便、快速的快速生长分枝杆菌鉴定方法,鉴定结果与16s rRNA序列分析的符合率高.快速生长分枝杆菌菌血症多发生于人工材料、导管植入患者,实验室和临床应重视该病的诊断.
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编辑人员丨2023/8/6
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两种菌落形态的金结核分枝杆菌引起导管相关血流感染1例并文献复习
编辑人员丨2023/8/5
金结核分枝杆菌(Mycobacterium aurum,M. aurum)是一种革兰阳性、抗酸染色阳性的细菌,属快速生长分枝杆菌(rapidly growing mycobacteri-um,RGM),常产生色素.M.aurum广泛存在于环境中,几乎不引起人体感染[1].研究[2-3]发现,M.aurum具有与结核分枝杆菌相似的形态和耐药性.由于M. aurum生长速度快,致病性低,许多抗结核药物的抗菌活性研究将其作为结核分枝杆菌的替代物[4-5].由RGM引起的导管相关血流感染(catheter-related bloodstream infection,CRBSI)在医疗保健机构并不少见[6],常见的 RGM有黏液分枝杆菌、fortuitum 分枝杆菌、脓肿分枝杆菌等[7].然而,由M.aurum引起的CRBSI相当罕见[8],国内未见相关文献报道.本文报告一例由M.aurum引起的 CRBSI 病例,并进行文献复习,以便临床及实验室人员了解该菌的菌落形态、鉴定方法、药物敏感性实验结果,以及在人体引起感染的特征,为类似患者的诊治提供依据.
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编辑人员丨2023/8/5
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结核分枝杆菌感染对痰液菌群结构的影响
编辑人员丨2023/8/5
目的 探索健康人、结核分枝杆菌潜伏感染者和活动性肺结核患者痰液菌群的差异.方法 搜集2016年11月至2017年12月深圳市慢性病防治中心健康体检者53名作为A组,登记确诊的结核分枝杆菌潜伏感染(LTBI)者41例作为B组,初治活动性肺结核患者54例作为C组.研究对象均于清晨空腹状态下收集下呼吸道痰液样本(以干酪痰和黏液痰为佳)3~5 ml,共148份.痰液样本提取总DNA,对16S rRNA V4~V5区基因进行高通量测序,并对测序结果进行生物信息学分析.结果 通过对148份痰液样本进行高通量测序分析,获得有效序列 14 136 502.0条,获得操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)21 712.00个.Alpha 多样性分析显示,A组 Pielou_e指数为0.85(0.82,0.88),明显高于 C组[0.83(0.78,0.86)],差异有统计学意义(H=4.462,P=0.035).Beta多样性分析发现,三组人群痰液菌群组成存在差异(H=2.027,P=0.002).菌群组间差异物种分析发现,三组人群在3个门(厚壁菌门、梭杆菌门、螺旋体门)、3个纲(黄杆菌纲、梭杆菌纲、螺旋体纲)、5个目(黄杆菌目、乳杆菌目、梭杆菌目、伯克霍尔德菌目、螺旋体目)、6个科(紫单胞菌科、黄杆菌科、梭杆菌科、纤毛菌科、伯克菌科、螺旋体科)、5个属(二氧化碳噬纤维菌属、卟啉单胞菌属、梭杆菌属、纤毛菌属、密螺旋体属)和2个种(Nanceiensis和Parvula)水平上均存在差异;其中,C组中伯克霍尔德菌目(Burkholderiales)[0.01(0.00,0.02)]和伯克菌科(Burkholderiaceae)[0.01(0.00,0.01)]的丰富度较 A 组[丰富度分别为0.00(0.00,0.01)和0.00(0.00,0.00)]和B组[丰富度分别为0.00(0.00,0.01)和0.00(0.00,0.00)]明显增加,差异均有统计学意义(C组与A组比较:H值分别为9.733和4.799,PP值分别为0.002和0.028;C组与B组比较:H值分别为12.134和8.152,P值均<0.01).结论 结核分枝杆菌感染未改变人痰液菌群的丰富度,但造成菌群结构组成上产生差异.
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编辑人员丨2023/8/5
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牙科综合治疗台水路系统污染微生物调查及其消毒方法
编辑人员丨2023/8/5
目的 分离鉴定牙科综合治疗台水路系统(DUWLs)中污染微生物,通过优势菌对不同消毒剂的抗性评价现行消毒与感染控制措施.方法 选取某三甲专科口腔医院DUWLs作为研究对象,采用菌落计数法对使用中的DUWLs进行微生物培养计数,采用质谱分析仪分离鉴定优势菌,通过最低抑菌浓度试验(MIC)和最小杀菌浓度试验(MBC)评价优势菌对不同消毒剂的抗性,通过悬液定量杀菌法比较产黏液分枝杆菌与标准菌株(龟分枝杆菌脓肿亚种)的抗力.结果 24台DUWLs的48个水标本菌落检出率100.00%,平均菌落数为(2.25±1.43)×105 CFU/mL,并分离出9种污染微生物,优势菌为产黏液分枝杆菌(35.72%),其次为真菌(21.43%).分离的产黏液分枝杆菌对醋酸氯己定、次氯酸钠、过氧乙酸、过氧化氢4种常用消毒剂的MIC分别为1.5、500、5、100 mg/L,MBC分别为3、500、10、200 mg/L,对次氯酸钠的抗力接近标准菌株;0.5%醋酸氯己定在30 min内无法有效杀灭分离的产黏液分枝杆菌和标准菌株龟分枝杆菌脓肿亚种,0.1%次氯酸钠、3%过氧化氢及0.1%过氧乙酸在30 min内均可有效杀灭分离的产黏液分枝杆菌和标准菌株龟分枝杆菌脓肿亚种.结论 对含氯消毒剂抗力更强的非结核分枝杆菌已取代铜绿假单胞菌与军团菌成为本研究所选医院DUWLs中优势菌群,DUWLs的消毒应选择合适的消毒剂种类、浓度,以及有效的作用时间和使用频率.
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编辑人员丨2023/8/5
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上海市29所医疗机构口腔综合治疗台用水非结核分枝杆菌检出情况及相关因素
编辑人员丨2023/8/5
目的 对上海市29所医疗机构口腔综合治疗台用水进行非结核分枝杆菌(NTM)检测,调查了解设备水路消毒现状.方法 现场采样治疗用水,经滤膜过滤法处理后,接种7H10平板,采用抗酸染色和基质辅助激光解析电离飞行时间质谱方法进行细菌鉴定.通过问卷调查收集相关资料.结果 共采集204份水样,包括超声用水40份、手机水53份、三用喷头水55份以及漱口水56份.NTM总检出率为15.19%(31/204),以产黏液分枝杆菌17株占比50.00%和龟分枝杆菌13株占比38.24%为主.不同部位NTM检出率存在统计学差异(P<0.05),三用喷头水最高,为25.45%;超声用水最低,为2.50%.管路使用年限与NTM检出率比较,无统计学差异.比较消毒频率,消毒时间间隔<3个月的水管路NTM检出率最低(P<0.05).结论 上海市29所医疗机构口腔综合治疗台用水NTM检出率为15.19%.消毒频率是重要影响因素.建议加强水源水使用要求和监测,采取有效的消毒处理.
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编辑人员丨2023/8/5
