目的 为分析云南省生食蔬菜中沙门菌、单核细胞增生李斯特菌、致泻性大肠埃希菌污染情况及菌株的耐药性和致病性,通过各污染菌的抗生素敏感性特征图谱及全基因组测序数据对菌株进行耐药和致病基因分析.方法 采用食品安全国家标准GB 4789.4-2016、GB 4789.30-2016、GB 4789.6-2016对180份生食蔬菜样品中的沙门菌、单核细胞增生李斯特菌、致泻大肠埃希菌进行检测和鉴定;采用肉汤稀释法对分离到的菌株进行药敏测定;同时对菌株进行全基因组测序,基因组序列经组装后通过相应的生物信息学流程进行数据分析.结果 180份生食蔬菜中共有12份样品检出了致病菌,包括生菜、香菜、折耳根等.共检出了致病菌13株,其中沙门菌7株,共7种血清型,4株存在多重耐药,耐药表型与耐药基因关联性良好,5株携带有与多重耐药相关的IncHI和IncF型质粒;单核细胞增生李斯特菌4株,1株存在多重耐药,2株携带毒力岛LIPI-3;肠聚集黏附性大肠埃希菌2株,1株存在多重耐药.结论 折耳根等具有地域特色的生食蔬菜种类致病菌检出率较高,应该持续关注,部分单核细胞增生李斯特菌菌株因含有更多的毒力基因,而具有更高的致病性;沙门菌和致泻大肠埃希氏菌多重耐药情况较为严重.

目的 使用孟德尔随机化分析(MR)方法探索谷氨酰胺(Gln)与骨密度(bone mineral density,BMD)、骨转换指标、wnt-7a蛋白之间的因果关系.方法 利用全基因组关联分析(genome-wide association studies,GWAS)研究数据,暴露因素选择Gln,结局变量包括股骨颈骨密度(FN-BMD)、前臂骨密度(FA-BMD)、腰椎骨密度(LS-BMD)、全身骨密度(TB-BMD)、骨转换指标包括血清 25-羟基维生素D水平[25(OH)D]、甲状旁腺素(PTH)、骨保护素(OPG)、骨钙素(BGP)、Wnt信号家族成员:wnt-7a.采用逆方差加权法、MR-Egger回归法、加权中位数方法、Simple Mode法和Weighted Mode法,并且进行异质性检验、敏感性分析和多效性分析.结果 MR结果显示Gln与wnt-7a蛋白之间差异具有统计学意义,且两者关系呈正相关;Gln与FN-BMD、FA-BMD、LS-BMD、TB-BMD、25(OH)D、PTH、OPG、BGP差异均无统计学意义.本次研究的异质性检验均无异常,敏感性分析结果均显示稳健,且未发现多效性.结论 该研究结果为Gln在维持骨稳态及参与成骨分化的作用及预防、治疗骨质疏松症提供了一定理论依据,说明通过摄入Gln预防和治疗骨质疏松症可能具有潜在临床意义.

目的 使用孟德尔随机化(Mendelian Randomization,MR)研究探索咖啡摄入与骨关节炎(osteoarthritis,OA)之间的因果关系.方法 使用公开发布的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)汇总数据进行了孟德尔随机化分析,采用逆方差加权法、加权中位数法、简单中位数法、加权中值方法和MR-Egger回归法估计咖啡摄入与OA风险的因果关系,并进行异质性检验、敏感性分析、多效性检验验证结果稳定性.使用不同种类咖啡摄入进一步验证其对OA风险的影响.结果 MR分析表明,咖啡摄入对OA产生不利影响,其中自我报告OA:OR(95%CI)为 2.16(1.65～2.82);髋关节或膝关节OA:OR(95%CI)为 2.22(1.74～2.84);髋关节OA:OR(95%CI)为 2.17(1.45～3.24);膝关节OA:OR(95%CI)为 2.37(1.83～3.07).敏感性分析显示结果比较稳定,多效性检验显示不存在水平多效性.进一步验证发现咖啡摄入确实会导致OA风险增加,但不同咖啡类型会对OA产生不同影响.结论 本研究结果表明,咖啡摄入增加了骨关节炎患病风险.

目的 采用孟德尔随机化分析方法研究 1 400 种血液代谢物与骨质疏松症发病风险的因果关系.方法 获取 1 400种血液代谢物与骨质疏松症的全基因组关联研究数据,将单核苷酸多态性作为工具变量并选择敏感的SNPs进行分析.通过IVW、WM、MR-Egger回归法进行两样本孟德尔随机化分析,以OR值检验 1 400 种血液代谢物与骨质疏松症之间的因果关系,并完成敏感性和多效性检验.结果 6 种血液代谢物与骨质疏松症显著相关,GCST90199879、GCST90200092、GCST90200368、GCST90200656、GCST90200664、GCST90200973 与骨质疏松症的孟德尔随机化分析结果显示,IVW法的OR值分别为 0.973(95%CI:0.954～0.991,P=0.004)、0.883(95%CI:0.805～0.968,P=0.008)、1.111(95%CI:1.030～1.197,P=0.006)、1.147(95%CI:1.038～1.267,P=0.007)、1.069(95%CI:1.022～1.119,P=0.004)、0.741(95%CI:0.602～0.914,P=0.005),表明血液代谢物与骨质疏松症之间存在因果关系.IVW(P＞0.05)和 MR-Egger回归(P＞0.05)的 Cochran Q 检验表明 SNPs 并不存在异质性.MR-Egger法的egger_intercept和 0 差异没有统计学意义(P＞0.05),SNPs不存在水平多效性.结论 本研究提示了 6 种血液代谢物与骨质疏松症之间存在因果关系,这为探讨血液代谢物介导的骨质疏松症的发病机制提供了新的认知.

帕金森病是一种严重危害中老年人健康、以黑质-纹状体多巴胺能神经元退行性损伤为主要病理特征的神经退行性疾病。由于其影响因素众多、致病的生物学机制复杂，截至目前临床仍缺乏针对帕金森病的有效治疗手段，相关研究一直是该领域的热点。近年来，多数关于帕金森病的报道共同提示其发生发展与线粒体功能损伤有关，而线粒体功能损伤常常受到复杂基因调控的影响。全基因组关联研究证明，单基因帕金森病基因位点与线粒体功能损伤相关。关于帕金森病致病基因如何调控线粒体功能损伤，进而影响神经元生理功能，最终导致帕金森病发生，目前各类研究尚无统一认识。文中围绕帕金森病重要致病基因致线粒体功能损伤的生物学机制，对既往的相关研究进行综述，以求为帕金森病致病机制的研究提示方向，也为帕金森病的线粒体靶向治疗策略的开发提供理论基础。

目的:探讨肥胖与支气管哮喘(哮喘)的因果关联，为哮喘的防治提供参考。方法:本研究为双向孟德尔随机化研究。通过与体质量指数(BMI)、哮喘相关的2项全基因组关联研究，收集单核苷酸多态性(SNP)资料。采用逆方差加权法随机效应模型(IVW-RE)、孟德尔随机化Egger回归法(MR-Egger)、加权中位数法和加权众数法。以BMI相关的370个SNP作为工具变量，以哮喘作为研究结局进行正向孟德尔随机化(MR)分析。以哮喘相关的56个SNP作为工具变量，以BMI作为研究结局进行反向MR分析。结果:IVW-RE结果显示，BMI与哮喘具有显著的因果关联，BMI每增加1个标准差，哮喘发病风险约增加1.26倍( OR＝1.26，95% CI：1.19~1.33， P<0.001)，在MR-Egger( OR＝1.17，95% CI：1.01~1.36， P＝0.035)、加权中位数法( OR＝1.20，95% CI：1.11~1.29， P<0.001)和加权众数法( OR＝1.15，95% CI：1.03~1.29， P＝0.015)分析中同样发现BMI与哮喘具有正向因果关联。此外，使用IVW-RE进行反向MR分析，没有发现哮喘对BMI有影响的证据( OR＝0.99，95% CI：0.98~1.00， P＝0.193)。 结论:MR分析表明，成人BMI与哮喘的患病率存在因果关系，而哮喘对成人BMI的影响可能性很小。

阿尔茨海默病（AD）仍然是人类社会面临的重大挑战之一，其发病机制仍存在争议。现有的人类遗传学证据表明大脑中重要的免疫细胞-小胶质细胞能保护其他脑细胞免受侵袭，并能清除大脑中积聚的代谢垃圾，进而延缓神经元的退化，其功能状态与AD密切相关。对散发性晚发性AD的全基因组关联研究发现，髓样细胞触发受体2（Trem2）这一基因在小胶质细胞检测和处理神经变性过程发挥重要作用，Trem2变异是AD最强的遗传风险因素之一，而激活Trem2信号通路可以激活小胶质细胞对Aβ的相应，减少Aβ沉积。因此恢复或增强小胶质细胞内有缺陷的Trem2功能可能是对抗AD神经元损伤和变性的方法。

妊娠期糖尿病严重危害母亲和子代的近远期健康。既往通过全基因组关联研究和候选基因研究策略识别了若干妊娠期糖尿病的遗传危险因素，这些遗传变异大多也与2型糖尿病、糖代谢相关症状和胰岛素分泌与抵抗存在关联。本文旨在综述近年来妊娠期糖尿病遗传流行病学的研究进展。

目的:通过对1个家族性血尿家系进行遗传变异筛查，为家族性血尿病变提供遗传线索和证据。方法:本研究纳入的研究对象为1个4代含20名成员的家族性血尿家系。对该家系进行临床资料和实验室检查结果的收集和整理，留取家系中11名成员的外周血并用盐析法提取DNA用于遗传分析。首先选取包括先证者在内的3名家系成员进行全外显子组测序，根据2015年美国医学遗传学与基因组学学会发布的序列变异解读指南进行遗传变异筛选。继而在家系成员中对筛选出的遗传变异位点进行实时荧光定量PCR和Sanger测序验证。结果:该家系中6名女性患者有持续性血尿，2人因肾衰竭去世，2人因肾脏以外疾病去世，2人维持肾功能稳定。肾功能稳定2人中1人肾活检病理诊断为IgA肾病，电镜提示弥漫性基底膜病变，不除外Alport综合征。基因检测在家系中发现 COL4A4基因（RefSeq NM_000092）的两个点突变，7号外显子c.G446T:p.G149V的变异，以及20号外显子c.G1249A:p.G417R的变异。 结论:通过对1个家族性血尿家系开展基因检测，发现 COL4A4基因的两个新突变（7号外显子c.G446T:p.G149V和20号外显子c.G1249A:p.G417R的变异）与家族性血尿表型相关联。

目的:利用两样本孟德尔随机化探究体质量指数（BMI）与妊娠期高血压的关系。方法:利用BMI与妊娠期高血压的全基因组关联研究汇总数据（数据纳入截止时间为2023年10月31日），通过逆方差加权法、MR-Egger回归法、加权中位数法、简单模型和加权模型进行两样本孟德尔随机化分析。采用Cochrane Q检验评估结果的异质性，MR-Egger回归截距和漏斗图检验结果的水平多效性。 结果:固定效应和随机效应模型下的逆方差加权结果显示，随着BMI的升高妊娠期高血压的风险也增加（ OR = 1.62和1.62，95% CI 1.39～1.88和1.39～1.88， P<0.01）。敏感性分析结果显示，MR-Egger回归法、加权中位数法和加权模型提示随着BMI的增加妊娠期高血压风险增加（ OR = 1.51、1.56和1.71，95% CI 1.01～2.26、1.23～1.99和1.09～2.69， P<0.05或<0.01）。尽管Cochrane Q检验结果显示存在异质性（ P = 0.04），但随机模型下的逆方差加权结果依然提示BMI会增加妊娠期高血压的风险，且未观察到水平多效性（ P = 0.73）。 结论:肥胖会增加妊娠期高血压的风险，孕妇要注意控制体质量以降低妊娠期高血压的风险。