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染色体微阵列分析技术对智力障碍或全面发育迟缓患儿遗传学病因的诊断价值
编辑人员丨5天前
目的:探讨染色体微阵列分析(CMA)技术在表现为发育迟缓、智力障碍、孤独症谱系障碍(ASD)、癫痫和多发性先天性异常(MCA)等患儿中的诊断价值。方法:收集2014至2019年在北京大学第一医院收治的1 320例发育迟缓/智力障碍,孤独症、伴或不伴癫痫和MCA患儿,提取外周血DNA,用比较基因组杂交(array-CGH)和单核苷酸多态性(SNP-array)方法分析基因拷贝数变异(CNV),总结CMA技术在智力障碍或全面发育迟缓患儿遗传学病因检测的结果。结果:1 320例患儿中,染色体非整倍体异常10例,单亲二体6例,嵌合体1例。致病性拷贝数变异320例,可能致病性拷贝数变异23例,两者相加检出率为26%(343/1 320)。临床意义不明确CNV 107例,占比8.1%(107/1 320)。可能良性CNV 25例,占比2%(25/1 320)。良性CNV 20例,占比1.5%(20/1 320)。发育迟缓/智力障碍合并MCA的患儿检出率为39.8% (130/327)。结论:CMA具有分辨率高、覆盖全基因组的优势。可以检出显微镜下可见的染色体异常以及染色体微小缺失和重复,从而对智力障碍或全面发育迟缓患儿进行遗传病因学诊断。
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编辑人员丨5天前
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性染色体嵌合胎儿的产前诊断与遗传咨询
编辑人员丨5天前
目的:探讨联合应用产前细胞与分子遗传学方法在胎儿性染色体嵌合诊断中的临床意义。方法:回顾性收集2017年5月1日至2020年1月31日来郑州大学第一附属医院遗传与产前诊断中心进行胎儿羊水染色体G显带核型分析的14 034例孕妇资料,其年龄为20~46(27±3)岁,孕17~32周,无近亲婚配。筛选出诊断为性染色体嵌合者,分析其产前诊断指征。比较全基因组拷贝数变异分析(CNV-seq)/单核苷酸多态性微阵列检测(SNP-array)/荧光原位杂交技术(FISH)结果,结合超声表现,并查阅本院电子病历记录系统或电话随访所有孕妇的妊娠结局。结果:共检出胎儿性染色体嵌合46例,两种核型嵌合体43例(93.48%),3种核型的嵌合3例(6.52%)。核型与CNV-seq/SNP-array/FISH结果对比发现,4例结果一致,9例结果一致嵌合比例不一致,10例结果不一致。综合其细胞/分子遗传学分析和/或超声结果,孕妇将决定继续或终止妊娠。结论:产前细胞与分子遗传学方法联合应用有助于快速诊断胎儿性染色体嵌合,为孕妇妊娠选择提供科学的依据。
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编辑人员丨5天前
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分子诊断技术在人类辅助生殖中的应用和发展
编辑人员丨5天前
近年来,随着DNA测序技术的突破性发展,胚胎植入前遗传学检测(PGT)作为辅助生殖技术(ART)的一部分已经被广泛应用。下一代测序(NGS)技术的进步和分辨率的提高,分子诊断技术的综合应用,能够同时进行染色体筛查及小的基因片段缺失和重复检测,对于提高妊娠率、降低流产率、降低多胎率和畸形率等方面具有重要意义。常用PGT分子诊断技术包括荧光原位杂交(FISH)、单核苷酸多态性微阵列(SNP-array)、比较基因组杂交阵列(aCGH)、定量聚合酶链反应(qPCR)和下一代测序技术(NGS),在临床应用中各有侧重,存在诸多难以控制的不确定因素,还要关注技术进步带来的伦理问题。
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编辑人员丨5天前
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遗传性耳聋胚胎植入前遗传学检测的研究及临床应用进展
编辑人员丨5天前
遗传性耳聋一级预防的手段包括胚胎植入前遗传学检测(PGT)。目前,遗传性耳聋PGT使用全基因组扩增技术扩增滋养外胚层细胞中的遗传物质,通过微阵列比较基因组杂交(aCGH)技术、微阵列单核苷酸多态性(SNP-array)和二代测序技术进行非整倍体的检测,并结合连锁分析确定是否存在致病性耳聋基因突变。近年来随着无创筛查技术的发展,利用胚胎培养液的组学和游离DNA检测来对胚胎的质量、发育潜能及非整倍体的评估方法出现。本文主要对PGT在遗传性耳聋防控领域的技术流程、临床应用和无创筛查等方面进行综述。
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编辑人员丨5天前
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蕈样肉芽肿分子遗传学致病机制的研究进展
编辑人员丨5天前
蕈样肉芽肿是原发皮肤T细胞淋巴瘤中最常见的类型,其发病机制仍然不清楚。研究显示,蕈样肉芽肿存在高频染色体片段拷贝数变异,如染色体7q、1q、17q的扩增和9p21、10q、17p的缺失,导致相应区域上原癌基因扩增和抑癌基因丢失,从而促进肿瘤的发生发展。同时蕈样肉芽肿中存在低频单核苷酸变异,这些变异基因主要集中在细胞周期调控、细胞凋亡、染色质重塑以及T细胞活化相关的通路上。蕈样肉芽肿很少有发生基因融合变异的报道。另外,部分蕈样肉芽肿病例会发生大细胞转化,往往预示疾病进展及药物抵抗等不良预后。总之,蕈样肉芽肿是一种具有高度分子遗传学异质性的复杂疾病,未来还需要更广泛深入的机制研究。
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编辑人员丨5天前
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染色体微阵列分析技术亲缘分析对判定拷贝数变异临床意义的影响
编辑人员丨5天前
目的:探讨染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)技术中的亲缘分析在判断基因组拷贝数变异(copy number variations,CNVs)临床意义中的作用。方法:本研究为回顾性研究。收集2017年11月至2019年12月在北京大学第一医院实验中心行产前诊断的73例核心家系的临床资料。检测指征包括超声异常54例(其中伴颈部透明层厚度≥2.5 mm 12例,胎儿生长受限4例,既往不良孕产史7例,单纯超声异常31例),无创产前基因检测高风险4例,高龄妊娠9例,单纯既往不良孕产史3例,胎死宫内2例,孕妇智力障碍1例。使用基因组DNA提取试剂盒提取羊水细胞、绒毛、脐血、胎儿组织和胎心血DNA。采用基于微阵列的比较基因组杂交技术和单核苷酸多态性微阵列技术分析73例产前样本CNVs。取孕妇及其丈夫(必要时相关亲属)外周血DNA做相同检测。总结CMA亲缘检测结果。采用描述性统计分析。结果:73例样本共检出76个CNVs,其中检出9个致病性CNVs,经过亲缘检测分析后6个为新发变异,2个母源,1个父源;检出6个可能致病性CNVs,3个为新发变异,2个母源,1个父源;检出20个临床意义不明的CNVs,5个父源,3个母源,其余12个为新发变异;41个可能良性CNVs,其中38个来自表型正常的父母。结论:产前诊断时亲缘分析对胎儿CNVs的临床意义解读有重要意义,可以帮助判断CNVs的临床意义和再生育风险。
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编辑人员丨5天前
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山东滨州地区汉族造血干细胞捐献志愿者 HLA- A、- B、- DRB1高分辨等位基因及其单体型多态性分析
编辑人员丨5天前
目的:探讨山东滨州地区汉族造血干细胞(HSC)捐献志愿者中人类白细胞抗原( HLA)- A、- B、- DRB1高分辨等位基因及其单体型的多态性分布特征。 方法:选择2010年1月至2018年12月,于滨州市中心血站行 HLA- A、- B、- DRB1高分辨基因分型的2 620例无亲缘关系健康汉族HSC捐献志愿者为研究对象。HSC捐献志愿者年龄为18~45岁;男性志愿者为1 482例,女性为1 138例。采用PCR-序列特异的寡核苷酸探针杂交(SSOP)法,对HSC捐献志愿者全血基因组DNA标本的 HLA- A、- B、- DRB1位点进行高分辨基因分型。采用直接计数法计算HSC捐献者 HLA- A、- B、- DRB1的基因频率和基因型频率。采用Arlerquin 3.5统计学软件计算 HLA- A、- B、- DRB1等位基因单倍型频率,并对 HLA- A、- B、- DRB1的基因分布进行Hardy-Weinberg平衡检验。滨州地区汉族HSC捐献志愿者与文献报道的中国其他地区汉族人群的 HLA- A、- B、- DRB1等位基因频率比较,采用 χ2检验。本研究遵循的程序符合2013年修订版《世界医学协会赫尔辛基宣言》要求,并且与所有受试者签署《中国造血干细胞捐献者资料库志愿捐献者同意书》。 结果:①本组2 620例HSC志愿捐献者的 HLA- A、- B、- DRB1基因分布的Hardy-Weinberg平衡检验结果显示,各基因位点基因频率的观察值与期望值分别比较,差异均无统计学意义( P>0.05),即本组HSC捐献志愿者 HLA- A、- B、- DRB1基因分布,符合Hardy-Weinberg平衡定律。②本组2 620例HSC捐献者DNA标本中,检出的 HLA- A、- B、- DRB1等位基因分别为52、89和52种,多态性最高基因组分别为 A*02组(11种), B*15组(20种)和 DRB1*14组(11种)。2 620例志愿者的血样DNA标本中,检出 HLA- A- B- DRB1单倍型为2 604种,其中频率>0.10%的单倍型为133种,频率>1.00%的单倍型为 A*30:01- B*13:02- DRB1*07:01(1.77%)和 A*02:01- B*13:02- DRB1*07:01(1.13%)。③本组2 620例志愿者的血样DNA标本中,检出等位基因频率>1.00%的 HLA- A、- B、- DRB1等位基因共计65个,并且在文献报道的广西、上海、江苏、河南、黑龙江、陕西等地区人群中亦均被检出,但是各地区 HLA基因高频基因型(基因频率>5.00%)的分布比较,差异均有统计学意义( P<0.05)。 结论:滨州地区HSC捐献汉族志愿者的 HLA- A,- B,- DRB1基因单体型分布具有高度的遗传多态性和地域分布特点。阐明滨州地区HSC捐献汉族志愿者的 HLA- A,- B,- DRB1高分辨等位基因及其单体型多态性,有助于寻找HLA相合的HSC捐献者,并且可对进一步进行本地区人群的人类学及免疫遗传学研究提供参考。
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编辑人员丨5天前
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一例重度智力障碍患儿的 LINS1基因变异分析
编辑人员丨5天前
目的:对1例不明原因智力障碍患儿进行遗传学分析,明确导致常染色体隐性智力障碍-27(mental retardation, non-syndromic, autosomal recessive, MRT27)的遗传学病因。方法:应用单核苷酸多态-微阵列比较基因组杂交技术以及目标基因捕获测序法对患儿进行智力障碍/发育迟缓相关基因外显子检测。结果:排除患儿基因组微缺失/微重复。目标基因捕获测序法检测到患儿的 LINS1基因c.722delA(p.Asp241fs)纯合变异,父母均携带c.722delA(p.Asp241fs)杂合变异,符合常染色体隐性遗传方式。 结论:LINS1基因c.722delA(p.Asp241fs)变异导致了患儿MRT27的发生。
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编辑人员丨5天前
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遗传性耳聋胚胎植入前遗传学检测的研究及临床应用进展
编辑人员丨2024/3/16
遗传性耳聋一级预防的手段包括胚胎植入前遗传学检测(PGT).目前,遗传性耳聋PGT使用全基因组扩增技术扩增滋养外胚层细胞中的遗传物质,通过微阵列比较基因组杂交(aCGH)技术、微阵列单核苷酸多态性(SNP-array)和二代测序技术进行非整倍体的检测,并结合连锁分析确定是否存在致病性耳聋基因突变.近年来随着无创筛查技术的发展,利用胚胎培养液的组学和游离DNA检测来对胚胎的质量、发育潜能及非整倍体的评估方法出现.本文主要对PGT在遗传性耳聋防控领域的技术流程、临床应用和无创筛查等方面进行综述.
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编辑人员丨2024/3/16
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一例双着丝粒染色体患儿的临床病因分析并文献复习
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨基因拷贝数变异与临床表型的关系,同时探讨微阵列比较基因组杂交技术在细胞分子遗传学诊断中的优越性.方法 对一例智力障碍、语言发育障碍的患儿行G显带染色体核型分析和拷贝数变异的检测,同时行家系的相关研究,并对已报道的相关综合征进行文献复习.结果 患儿父母的染色体未见明显异常,患儿的染色体核型为:45,XY,psu dic(9;12) (p24;p13) dn,拷贝数检测结果为:arr9p24.3p23 (244,457-10,315,723)×3,12p13.3(191,619-1,429,503)× 1.结论 该患儿的临床袁型与其基因拷贝数的变异相关联,微阵列分析技术能够快速诊断出基因组的微失衡,具有高分辨率和高准确性的优点,是不明原因智力障碍患儿遗传学诊断的重要技术.
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编辑人员丨2023/8/6
