目的 探讨3型β微管蛋白(TUBB3)、含TCP-1的伴侣蛋白8(CCT8)在结直肠癌(CRC)组织中的表达及与上皮间质转化(EMT)和预后的相关性.方法 回顾性选取2018年1月—2020年1月新疆医科大学附属中医医院肛肠科诊治CRC患者112例.采用实时荧光定量PCR检测癌组织和癌旁组织TUBB3、CCT8 mRNA及EMT相关指标N-钙黏素(N-cad)、E-钙黏素(E-cad)、转录因子TWIST mRNA的表达;免疫组织化学法检测TUBB3、CCT8蛋白水平;比较不同临床病理特征CRC中TUBB3、CCT8蛋白差异;Kaplan-Meier曲线及Cox回归分析TUBB3、CCT8蛋白对CRC患者预后的影响.结果 CRC癌组织TUBB3、CCT8、N-cad、TWIST mRNA表达高于癌旁组织,而E-cad mRNA低于癌旁组织(t=35.030、38.353、32.172、32.405、18.928,P 均＜0.001);CRC 癌组织中 TUBB3、CCT8 蛋白阳性率为91.07％(102/112)、94.64％(106/112),高于癌旁组织 7.14％(8/112)、6.25％(7/112)(x2=157.836、175.032,P 均＜0.001);CRC 中 TUBB3 mRNA 与 CCT8 mRNA 表达呈正相关(r=0.647,P＜0.001),CRC 中 TUBB3、CCT8 mRNA 表达与 N-cad、TWIST mRNA 表达呈正相关(r=0.667、0.621、0.703、0.686,P 均＜0.001),与 E-cad mRNA 表达呈负相关(r=-0.641、-0.587,P均＜0.001);低分化、TNM分期Ⅲ期、淋巴结转移的CRC中TUBB3、CCT8 mRNA表达高于高中分化、Ⅰ～Ⅱ 期、无淋巴结转移(t=20.327、20.455、21.101,15.121、14.985、15.759,P 均＜0.001);CRC 患者 3 年OS TUBB3 mRNA 高表达组为 43.33％(26/60),低于低表达组的 70.97％(44/62)(Log-rankx2=8.792,P=0.003),CCT8 mRNA 高表达组患者 3 年 OS 为42.86％(27/63),低于低表达组的 72.88％(43/59)(Log-rankx2=10.970,P＜0.001);TUBB3、CCT8 mRNA升高及TNM分期Ⅲ期、有淋巴结转移、低分化是CRC预后的独立危险因素[HR(95％CI)=1.334(1.103～1.613),1.322(1.108～1.577),1.435(1.161～1.773),1.368(1.115～1.677),1.315(1.054～1.641)].结论 CRC中TUBB3、CCT8表达上调,两者可通过促进EMT,促进CRC的恶性进展,是新的CRC预后评估标志物.

目的:筛选泛素结合酶E2S(UBE2S)互作蛋白并构建肝细胞癌(HCC)基于UBE2S互作蛋白的预后模型(UIPM),分析 UIPM 评估 HCC患者预后的价值.方法:采用免疫共沉淀(Co-IP)技术筛选与Flag-UBE2S结合的蛋白复合体,经十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)和Western blotting法验证后,采用液相色谱-质谱联用仪(LC-MS)分析鉴定UBE2S互作蛋白,并对互作蛋白进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.采用R软件survival包筛选癌症基因组图谱(TGGA)中HCC预后相关蛋白与UBE2S互作蛋白取交集,通过LASSO回归分析从交集蛋白中获取关键蛋白构建UIPM,并建立预后模型风险评分公式,按照风险评分的中位值将TGGA中HCC患者分为高风险组和低风险组,通过受试者工作特征曲线(ROC)评估UIPM的预测准确性,并采用国际癌症基因组联盟(ICGC)数据库对UIPM预测准确性进行再次验证.采用单因素和多因素Cox回归分析评估UIPM风险评分是否为HCC的预后独立危险因素,并进一步构建列线图模型.结果:Co-IP联合LC-MS分析得到 97个UBE2S互作蛋白.GO功能和KEGG信号通路富集分析,互作蛋白主要与半胱氨酸型内肽酶活性、氧化应激和细胞死亡有密切关联.TCGA筛选出5 163个HCC预后相关蛋白,与UBE2S互作蛋白取交集,获得40个预后相关互作蛋白,LASSO回归分析得到 7个关键蛋白,包括UBE2S、热休克蛋白家族A成员 8(HSPA8)、异质性胞核核糖核蛋白H1(HNRNPH1)、含TCP1伴侣蛋白亚基3(CCT3)、真核翻译起始因子 2亚基 1(EIF2S1)、活化蛋白C激酶 1受体(RACK1)和肌动蛋白相关蛋白2/3复合体亚基 4(ARPC4),并构建了UIPM,高和低风险组HCC患者生存率存比较差异有统计学意义(P<0.05).ROC曲线,UIPM预测HCC患者 1、2和 3年UIPM风险评分的ROC曲线下面积(AUC)值均大于0.7,表明预测模型准确度较高.ICGC数据库数据也证实UIPM预测准确度较高.单因素和多因素Cox回归分析,UIPM风险评分是HCC患者的独立预后危险因素(P<0.05).列线图预测HCC患者生存率与实际生存率之间有较好的一致性.结论:97个互作蛋白与UBE2S相互作用,可能通过氧化应激和铁死亡相关通路的失调促进HCC发生发展.UIPM风险评分是HCC预后的独立危险因素,可以用于预测HCC患者预后.而UBE2S、HSPA8、HNRNPH1、CCT3、EIF2S1、RACK1和ARPC4有望成为HCC新的生物标志物和治疗靶点.

目的:通过挖掘生物信息数据库,探讨含TCP-1的伴侣蛋白(CCT)家族基因及CCT4基因在肺腺癌中的表达和预后分析.方法:从Linkedomics和UALCAN数据库收集肺腺癌中CCT家族基因的相关信息,分析其在肺腺癌及肺腺癌临床总分期和TNM分期中的表达情况,并分析其与肺腺癌预后的相关性;通过STRING数据库分析CCT4的相关蛋白,并对CCT4及其相关蛋白进行富集分析.结果:CCT2/3/4/5/6A/6P1/7/8的表达与肺腺癌预后呈相关关系(P＜0.05),CCT2/4/5/6A/6B/7/8的表达与肺腺癌临床总分期相关(P＜0.05),CCT2/3/4/5/6A/6B/6Pl/7/8的表达与肺腺癌T分期相关(P＜0.05),CCT2/4/5/6A/6Pl/7/8的表达与肺腺癌N分期相关(P＜0.05),CCT4的表达与肺腺癌M分期相关(P＜0.05).CCT2/3/4/5/6A/6P1/7/8在肺腺癌中均高表达(P＜0.05),CCT6B在肺腺癌组织和正常肺组织中的表达比较,差异无统计学意义(P＞0.05).CCT4在肺腺癌中高表达,尤其在有长期吸烟史、发生TP53基因突变或临床分期越晚的肺腺癌患者中高表达(P＜0.05).STRING数据库分析显示,CCT4主要有CCT2、CCT3等20个相关蛋白,富集在伴侣蛋白介导的蛋白质折叠、肌动蛋白的CCT/TRiC折叠、CCT/TRiC法形成微管蛋白折叠中间体和PDCL(PhLP1)与CCT/TRiC在G蛋白β折叠中的协同作用等通路.结论:CCT家族基因尤其是CCT4在肺腺癌的发生发展中起到重要作用,且对肺腺癌的预后有一定预测价值,CCT4可能是一种很有前途的肺腺癌生物标记物.