现报道1例急性肾盂肾炎伴黑尔嗜胨菌菌血症患者，黑尔嗜胨菌是一种革兰阳性厌氧性球菌。该菌广泛分布于人类皮肤、口腔、上呼吸道、消化道和泌尿生殖道，是临床上易被忽视的条件致病菌，其对营养和培养条件要求较高。急性肾盂肾炎伴黑尔嗜胨菌菌血症的报道罕见，本例患者血培养一级报告为厌养瓶生长革兰阳性球菌，基质辅助激光解吸飞行时间质谱鉴定及测序结果均为黑尔嗜胨菌，抗菌治疗后病情好转。临床应提高对黑尔嗜胨菌感染相关疾病的认识，以早期诊断与采取针对性治疗。

目的:探讨不同宫颈病变女性阴道菌群的特征变化及菌群间的相互关系。方法:选取2018年1—6月于山西医科大学第二医院就诊、经病理学确诊宫颈病变的女性，其中正常宫颈(NC)41例，低度宫颈上皮内瘤样变(CIN 1)39例，高度宫颈上皮内瘤样变(CIN 2/3)37例，宫颈鳞状细胞癌(SCC)15例。应用16S rDNA测序技术对阴道分泌物中的阴道菌群进行检测，采用共生网络分析菌群间的Spearman相关关系。结果:NC、CIN 1和CIN 2/3患者优势菌均为乳酸杆菌属[构成比分别为79.4%(1 869 598/2 354 098)、63.6%(1 536 466/2 415 100)和58.3%(1 342 896/2 301 536)]，嗜胨菌属[20.4%(246 072/1 205 154)]为SCC患者的优势菌。随着宫颈病变的加重，阴道菌群多样性呈升高趋势(Shannon指数 F＝6.39， P＝0.001；Simpson指数 F＝3.95， P＝0.012)，乳酸杆菌属构成比逐渐降低，嗜胨菌属、纤毛菌属、普雷沃菌属等厌氧菌构成比逐渐增加，特征菌(LDA分值>3.5)由乳酸杆菌属演变为以嗜胨菌属、拟杆菌属、卟啉单胞菌属等为代表的厌氧菌。选取相对丰度居前10位、Spearman相关系数>0.4且 P<0.05的菌属经共生网络分析，结果显示，在不同阶段宫颈病变组中，普雷沃菌属、嗜胨菌属、卟啉单胞菌属、厌氧球菌属、纤毛菌属、奇异菌属、加德纳菌属、链球菌属等厌氧菌属之间呈正相关，而乳酸杆菌属与多种厌氧菌属呈负相关，尤其在CIN 1患者中阴道菌群间关系最为复杂，在SCC患者中仅嗜胨菌属与乳酸杆菌呈负相关。 结论:阴道菌群多样性增加、菌群间相互关系改变与宫颈病变密切相关，嗜胨菌属对宫颈病变的诊断及预测预警具有重要意义。

目的:探讨宫颈上皮内瘤变(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)恶性转归的危险因素,构建风险预警模型并探讨其临床应用价值.方法:选取2017年01月至2019年10月在本院收治的112例CIN患者为研究对象,分为CIN恶性转归组(n=56)和CIN组(n=56).通过Illumina MiSeq平台分析阴道菌群分布特征;采用多因素Logistic回归分析CIN恶性转归的危险因素,构建风险预警模型并转化为风险评分系统;采用Hosmer-Lemeshow拟合优度检验和受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估模型的拟合程度和风险预测效能;采用10-折交叉法对模型进行内部和外部验证.结果:CIN恶性转归组加德纳菌属、普雷沃菌属、嗜胨菌属、解脲脲原体及纤毛菌属的菌群丰度显著高于CIN组,其特征菌群为解脲脲原体和普雷沃菌属;两组研究对象高危HPV持续感染、病变面积/宫颈面积比值、腺体受累情况、解脲脲原体以及普雷沃菌群分布情况进行比较,差异具有统计学意义(x2=22.501、9.190、17.308、4.356、4.323,均P＜0.05);高危HPV持续感染、病变面积/宫颈面积比值≥2/3、腺体受累、解脲脲原体以及普雷沃菌属感染是CIN恶性转归的风险因素(均P＜0.05);模型组ROC曲线下面积为0.809[95％CI(0.724～0.877),P＜0.001],验证组 ROC 曲线下面积为 0.820[95％CI(0.736～0.886),P＜0.001];Hosmer-Lemeshow拟合优度检验数据显示模型组拟合度较好(x2=4.328 3,P=0.228 1),验证组拟合度较好(x2=6.330 7,P=0.175 8).结论:基于阴道菌群构成变化构建的CIN恶性转归风险预警模型具有较好的预测效果,可为宫颈癌的预防及干预提供针对性的指导价值.

目的 目前克罗恩病(CD)的具体病理机制仍不清楚,肠道菌群在CD的发生与进展过程中发挥了重要的作用.我们旨在通过比较CD患者肠道正常和炎症粘膜微生物群的组成来阐明肠道微生物群如何影响CD患者的粘膜愈合.方法 使用"Crohn's disease"作为关键词检索GEO与AE数据库并下载GSE162844与GSE198329数据集,使用R4.2.3软件对两个数据集的微生物数据进行多样性分析和线性判别分析效应量以探讨不同肠道黏膜微生物的组成差异.结果 CD患者肠道炎症部位黏膜菌群Shannon多样性指数和Simpson多样性指数较肠道正常部位有所下降,并且两个部位菌群组成有一定差异.在门水平上,变形菌门为肠道的主要优势菌群,软壁菌门在肠道炎症黏膜中的相对丰度升高(P＜0.05);在属水平上,假单胞菌属为肠道的主要优势菌群,中间原体属和支原体属在肠道黏膜炎症部位中的相对丰度明显升高(P＜0.05).LEfSe分析结果进一步揭示了海洋芽孢杆菌属、嗜胨菌科等在CD患者肠道黏膜正常部位中富集,而假单胞菌属、Candidatus Saccharibacteria等在炎症部位出现富集.结论 CD患者肠道黏膜炎症部位与正常部位菌群组成不同.

目的 探索过敏性鼻炎患者鼻前庭微生物组成与过敏性鼻炎的关系, 为过敏性鼻炎的诊疗提供新思路.方法 提取细菌基因组DNA, 通过16SrRNA高通量测序法分析 (Illumina测序) , 将测序结果与greengenes database进行比对, 通过生物信息学、医学统计学分析过敏性鼻炎患者鼻前庭微生物组成与正常人的差异.结果 在门水平的相对丰度上, 试验组与对照组放线菌和梭杆菌差异显著.在菌群属的研究水平上, 试验组与对照组之间有明显差异的菌属有13种, 包括黄单胞菌科中的一个未注释的菌属、棒状杆菌属、嗜胨菌属、厌氧球菌属、大芬戈尔德菌属、丙酸杆菌属、短杆菌属、希瓦菌属、微小单胞菌属、考克菌属、鞘脂单胞菌科中的一个未注释的菌属、嗜盐单胞菌属和叶瘤菌属.结论 过敏性鼻炎患者与健康正常人鼻前庭微生物组成存在明显的差异, 进一步可深入研究鼻腔内微生物组成影响鼻炎发病的机制.

[目的]为了获得能够在高盐环境下脱色偶氮染料的嗜盐菌群及其降解机理.[方法]采用富集驯化的方法获得一个嗜盐菌群,采用Illumina HiSeq2500测序平台对其群落结构进行测定;采用分光光度法测定了其降解特性;采用GC-MS和红外图谱分析了其降解机理;采用微核实验的方法比较了偶氮染料降解前后的毒性.[结果]该菌群在10％的盐度下,使100 mg/L的酸性金黄G在8h内脱色.菌群主要由Zobellella、Rheinheimera、Exiguobacterium和Marinobacterium组成.最适宜的脱色条件是:pH=6,酵母粉为碳源,蛋白胨或硝酸钾作为氮源,盐度为1％-10％.酸性金黄G降解产物的毒性比降解前降低.酸性金黄G主要的降解产物是对氨基二苯胺和二苯胺.此外,该菌群还能使酸性大红GR和直接湖蓝5B等多种偶氮染料脱色,具有较好的脱色广谱性.[结论]获得了快速降解偶氮染料的嗜盐菌群及降解机理,为该嗜盐菌群应用于高盐印染废水的处理提供菌种资源和理论支持.

缓冲蛋白胨水 (Buffered peptone water, BPW) 是常用于微生物分离培养的增菌液, 为了解BPW增菌对微生物结构的影响, 以冷鲜鸡污染微生物为研究对象, 在杭州超市采集20只冷鲜鸡样品, 分别用BPW增菌0、2、6、12、24 h, 检测菌落总数的变化, 分析不同增菌时间对沙门氏菌检出率的影响.并选择2只冷鲜鸡不同增菌时间的BPW增菌液, 提取细菌基因组DNA, 分别用DGGE分析和高通量测序分析其菌群结构变化.结果显示, 菌落总数随增菌时间增加而增加, 增菌6 h后极显著增加 (P＜0.01), 增菌24 h与其他时间差异极显著 (P＜0.01);沙门氏菌检出率在BPW增菌的前0～12 h增加, 随着增菌时间的延长而增加, 其中增菌12 h阶段检出率最高, 为40％, 而在24 h时下降, 为15％.DGGE结果显示, 增菌0～12 h条带丰富, 24 h条带减少, 与增菌0～12 h的菌群结构有显著不同的聚类.高通量测序显示在门的水平上, 变形菌门 (Proteobacteria) 和厚壁菌门 (Firmicutes) 是冷鲜鸡表面优势菌门, 占85％以上;在BPW增菌24 h后, 菌群结构发生较大变化, 变形菌门相对丰度降低, 厚壁菌门 (Firmicutes) 、梭杆菌门 (Fusobacteria) 、拟杆菌门 (Bacteroidetes) 丰度增加.在属水平上, BPW增菌12 h以内, 优势菌主要为不动杆菌属 (Acinetobacter) 、希尔氏菌属 (Shewanella) 、假单胞菌属 (Pseudomonas) 、嗜冷杆菌属 (Psychrobacter), 而BPW增菌24 h后, 在未增菌前, 相对丰度较低消化链球菌属 (Peptostreptococcus) 、梭杆菌属 (Fusobacterium) 、变形杆菌属 (Proteus) 、漫游球菌属 (Vagococcus) 、拟杆菌属 (Bacteroides) 和摩根氏菌属 (Morganella) 成为主要的优势菌.由此说明BPW增菌时间对沙门氏菌的检出率、微生物数量和菌群结构有显著的影响, 在前增菌时应选择合适的增菌时间.

目的:探索不明原因反复着床失败(RIF)与第一周期IVF成功妊娠患者的阴道微生物组的差异.方法:不明原因RIF患者15例为实验组(RIF组),以同期第一周期IVF成功妊娠患者15例为对照组.取卵日采集阴道分泌物,提取总基因组DNA,对16 S rDNA V3～V4区基因扩增,经Illumina Miseq测序后,比较两组阴道微生物组的丰度和结构.定义阴道乳杆菌丰度>90％为乳杆菌主导(LD)患者,乳杆菌丰度≤90％为非乳杆菌主导(NLD),比较两者临床妊娠率的差异.结果:对照组乳杆菌占(91.60±19.73)％.RIF组阴道微生物多样性显著增加(P<0.01),乳杆菌丰度显著降至(71.10±31.12)％(P<0.05),13个菌属丰度显著增加(P<0.05),包括1个需氧菌丛毛单胞菌,普氏菌、厌氧链球菌、吲哚嗜胨菌和韦荣球菌等12个厌氧菌.LD和NLD患者的临床妊娠率分别为68.42％及18.18％,差异有统计学意义(P<0.05).结论:RIF组阴道微生物多样性增加,厌氧菌和需氧菌丰度升高,乳杆菌丰度降低.阴道乳杆菌丰度与IVF临床妊娠率相关,乳杆菌主导者具有较高的临床妊娠率.

革兰阳性厌氧球菌是广泛分布于人类口腔、上呼吸道、胃肠道、女性泌尿生殖系统和皮肤的机会性致病菌.嗜胨菌、大芬戈尔德菌均为革兰阳性厌氧球菌,对营养要求苛刻,是一类被临床忽视的致病菌.随着分子生物学技术和质谱技术的临床应用,临床上对革兰阳性厌氧球菌的认识有所提高,但国内相关报道相对较少.本文报道了1例左足软组织金黄色葡萄球菌感染伴嗜胨菌、大芬戈尔德菌混合菌血症病例,并对病例进行分析和文献综述.

目的 探讨产妇阴道微生物群与早产风险的相关性.方法 选取2017年6月-2018年6月在大连市妇幼保健院产科出生并在新生儿科住院治疗的早产孕妇133例作为早产组.在早产孕妇分娩后42 d收集产妇阴道分泌物,通过实时荧光定量PCR法检测样本菌群数量.同时,选取同期生产足月新生儿的孕妇130例为足月组.结果 早产孕妇阴道菌群中,普雷沃菌、吲哚嗜胨菌和阴道加德纳菌的数量要明显高于足月生产孕妇,乳杆菌数量低于足月生产孕妇.相关性检验显示,早产组中普雷沃菌、吲哚嗜胨菌、阴道加德纳菌的阳性数要明显大于足月组,具有明显的相关性(均P＜0.05);早产组中乳杆菌的阳性数要明显小于足月组,具有明显的相关性(P＜0.05).结论 阴道菌群失调与早产存在相关性.