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基于网络药理学、分子对接和分子动力学研究杜仲-淫羊藿药对治疗骨质疏松的作用机制
编辑人员丨3天前
目的:通过网络药理学、分子对接和分子动力学方法研究杜仲-淫羊藿药对治疗骨质疏松的作用机制。方法:查询中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和相关文献筛选杜仲-淫羊藿药对的活性成分,应用TargetNet、SwissTargetPrediction、STITCH数据库筛选活性成分的作用靶点,应用GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET数据库筛选骨质疏松的相关靶点,利用Venny 2.1.0在线工具获取交集靶点。应用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析。使用Cytoscape 3.8.2软件构建网络图并进行网络特征分析以确定核心成分和关键靶点。使用R 3.6.3软件进行基因本体(GO)功能注释及京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路分析。使用SYBYL-X 2.1.1软件将核心成分与关键靶点进行分子对接。使用GROMACS 2021.6软件进行分子动力学模拟。结果:筛选出杜仲-淫羊藿药对的活性成分47个,作用靶点329个,骨质疏松的相关靶点4 604个,交集靶点210个。网络特征分析表明木犀草素、槲皮素、山柰酚、咖啡酸、金圣草黄素、松脂素是核心成分,蛋白激酶B1(Akt1)、白细胞介素-6(IL-6)、类固醇受体辅激活因子(Src)、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶-3(CASP3)、表皮生长因子受体(EGFR)、雌激素受体1(ESR1)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、丝裂原激活蛋白激酶8(MAPK8)、转录因子JUN是关键靶点。GO分析显示生物过程(BP)主要涉及细胞激素代谢过程、细胞内受体信号通路、对氧化应激的反应、激素代谢过程等,细胞组分(CC)主要涉及膜筏、膜微结构域、膜区、转录因子复合体等,分子功能(MF)主要涉及核受体活性、转录因子活性、类固醇激素受体活性、激素结合等。KEGG分析表明"杜仲-淫羊藿"药对治疗骨质疏松的信号通路主要有破骨细胞分化相关通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-Akt信号通路和MAPK信号通路等。分子对接显示核心成分能够准确结合在关键靶点蛋白的活性位点上,分子动力学分析进一步验证了核心成分与关键靶点蛋白的结合稳定性。结论:杜仲-淫羊藿药对治疗骨质疏松具有多成分、多靶点、多通路的特点,为其临床用药奠定了理论基础。
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编辑人员丨3天前
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湿地松无性系松脂组分分析及评价
编辑人员丨2024/4/6
为从湿地松种子园现有的速生材用无性系中选择产脂力强、松脂品质高的优良无性系,并高效利用湿地松良种资源.该研究以湿地松第一代种子园内 36 个无性系为材料,测定其树脂质量流速以及胸径生长量,进一步采用GC-MS分析其松脂组分,并基于上述指标利用相关性分析、聚类分析对参试的 36 个无性系进行综合评价.结果表明:(1)共鉴别出了 21 种松脂成分,包括 8 种单萜成分和 13 种二萜成分.(2)相关性分析显示,树脂质量流速(RMR)与单萜含量显著正相关,与枞酸型树脂酸呈弱的负相关,与海松酸型树脂酸无明显关联.(3)从松节油含量、树脂质量流速、枞酸型树脂酸、海松酸型树脂酸 4 个维度对参试无性系进行聚类分析,可将 36 个无性系分为三大类,并且各类型间差异显著,第 1 类的表现要远好于其他两类.(4)在产脂力高的基础上,6-44、4-11-1、1-38、3-64 四个无性系单萜含量高,4-11-1、3-64、2-0420、3-468四个无性系海松酸型树脂酸含量高,而无性系 2-173 枞酸型树脂酸含量较高.该研究定性分析了湿地松的松脂组分,定量评估了 36 个无性系的产脂力与组分含量,为湿地松脂用无性系的选择奠定了基础.
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编辑人员丨2024/4/6
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基于LC-MS代谢组学技术的丽豆-大豆差异代谢物比较研究
编辑人员丨2024/2/3
丽豆(Calophaca sinica)是我国华北地区特有的一种珍稀野生植物.为探明丽豆的营养价值,该文以大豆(Glycine max)为参照组,利用液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术对其种子进行了比较代谢组学研究.结果表明:(1)丽豆和大豆中共检测到1 857种代谢产物,二者成分相同且含量相似的代谢物有 1 698 种(>90%),差异代谢物有 159 种(<10%).(2)在差异代谢物中,成分差异的有 9 种,其中有 5 种为丽豆特有,剩余150 种均为含量差异,其中48 种(约30%)在丽豆中的含量高于大豆.(3)KEGG注释到8 条差异代谢物显著富集(P<0.1)的通路,主要包括初生代谢物的各类氨基酸生物合成途径和次生代谢物的罗汉松脂素、花生四烯酸以及二萜类等生物合成途径.(4)丽豆比大豆含量低的化学组分主要是初生代谢产物,比大豆含量高的化学组分主要是次生代谢物,而这些次生代谢物在调节血糖、骨坏损修复、增强免疫以及消炎抗癌等生理过程中有着积极的作用.综上所述,该研究认为丽豆与大豆具有相近的营养价值,并且对改善人类亚健康状况有积极的影响;此外,该文使我们对丽豆的营养价值和代谢组成分都有了较为全面的了解,同时也为我们对丽豆资源的深度开发和高效利用提供了必要的数据基础.
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编辑人员丨2024/2/3
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利用半制备型HPLC分离捆仙七中的非生物碱成分
编辑人员丨2023/8/6
目的 采用半制备型高效液相色谱法(Semi-preparative HPLC)从捆仙七中分离纯化非生物碱成分.方法 捆仙七经乙醇提取和20 mL·L -1的盐酸酸解后得到非生物碱粗提物,用石油醚、乙酸乙酯和正丁醇萃取后得到不同的极性部位.取乙酸乙酯部位,用硅胶色谱柱进行分离,用石油醚-乙酸乙酯进行洗脱,得到极性不同的馏分,最后用Semi-preparative HPLC 分离纯化制备化合物.采用1H-NMR和13C-NMR对化合物进行结构鉴定.结果 最终从捆仙七乙酸乙酯非生物碱部位共得到5个化合物,分别为东莨菪亭、异秦皮定、松脂醇、原儿茶酸和槲皮素.结论 所建立的Semi-preparative HPLC 法具有高效、重复性好且分离组分纯度高等特点,适用于从捆仙七中快速制备非生物碱成分.
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编辑人员丨2023/8/6
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桂枝化学成分的分离鉴定
编辑人员丨2023/8/6
目的:明确桂枝的活性组分,对75%乙醇提浸膏进行系统化学成分分离与纯化,以期找到抑制necroptosis的目标小分子化合物.方法:取干燥桂枝20 kg,粉碎后用75%乙醇冷浸提取,提取4次,7d1次,减压回收溶剂得到总浸膏.将所得总浸膏,运用D101大孔吸附树脂柱色谱进行分离,依次用水,30%乙醇,50%乙醇,70%乙醇,90%乙醇洗脱,减压回收溶剂得水部分,30%乙醇部分,50%乙醇部分,70%乙醇部分,90%乙醇部分.对30%乙醇部分,50%乙醇部分联合采用常压硅胶柱色谱,LH-20型羟丙基葡聚糖凝胶(Sephadex LH-20)柱色谱,高压制备色谱,重结晶等方法进行分离纯化,并根据单体化合物理化性质与波谱学数据(1H-NMR,13C-NMR,MS)等进行结构鉴定.结果 和结论:从桂枝中分离得到13个化合物,分别鉴定为(+)-丁香脂素(1),(+)-南烛木树脂酚(2),山橘脂酸(3),裂异落叶松脂醇(4),ovafolinin B(5),原儿茶醛(6),原儿茶酸(7),丁香醛(8),香草酸(9),原儿茶酸乙酯(10),丁香酸(11),没食子酸乙酯(12),2-(3',4'-二羟苯基)-1,3-胡椒环-5-醛(13).其中1~5,10~13为首次从该植物中分离得到.
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编辑人员丨2023/8/6