目的:观察马血清破伤风抗毒素（TAT）和马破伤风免疫球蛋白F（ab′）2注射后引起的皮肤迟发型变态反应，总结患者的临床特征与处理方法。方法:回顾性分析2008—2020年门诊与住院治疗的181例注射TAT或马破伤风免疫球蛋白后出现皮肤迟发型变态反应者的临床资料。结果:所有患者注射TAT或马破伤风免疫球蛋白前均行皮试检查，阴性171例（94.47%），阳性10例（5.53%，行脱敏注射）。181例中男118例，女63例，年龄11~68岁，病程1~7 d，潜伏期4~14 d。注射TAT（130例）和马破伤风免疫球蛋白（51例）两组患者的临床表现无显著差异，以荨麻疹样皮疹为主，12例注射部位发生浸润性红斑，其中10例伴有全身荨麻疹。181例中皮疹泛发全身者163例（90.06%），伴有胸闷、发热等系统症状者56例（30.94%），其中15例（26.79%）既往有过敏史，6例症状较重的患者无过敏史。34例（18.78%）出现白细胞计数升高、C反应蛋白升高或尿隐血、尿糖等异常中的单一或多项。抗组胺药与糖皮质激素治疗有效，疗程3~10 d，转归良好。结论:TAT或破伤风免疫球蛋白皮试阴性或脱敏治疗的患者仍有可能出现皮肤迟发型变态反应，且以荨麻疹样皮疹为主。

目的:嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)的致病范围十分广泛,耐药现象日益普遍,危害鱼类、家畜和人类健康,有必要分离、鉴定烈性A.hydrophila噬菌体.方法:以A.hydrophila Ah2为指示菌,用双层平板法从污水中分离获得烈性噬菌体Yyong.对其进行了电镜观察、宿主范围检测、一步生长试验、全基因组测序、基因注释和系统进化分析.结果:Yyong呈肌尾病毒样,头部直径为(83±2)nm,尾部长度为(115±5)nm.基因组全长165 663 bp,G+C含量为40.90％,含有16个tRNA基因和242个开放阅读框(ORF),含有诸多辅助代谢基因(AMGs),主要涉及DNA合成和抗氧化应激.有2个ORF分别被预测为编码毒素-抗毒素(toxin-antitoxin,TA)防御系统的毒素(PAAR重复蛋白)和抗毒素DarG,这有利于Yyong在细菌细胞内生存.有3个ORF分别被预测为编码σ因子、抗σ70蛋白和σ70诱饵,这些因子可能修饰RNA聚合酶使之优先识别噬菌体基因的启动子区域.在系统进化树中,与Yyong进化距离最小的病毒是Tulanevirus属的气单胞菌噬菌体.Yyong与它们间分享的最高平均核苷酸一致性(ANI)值和DNA分子杂交(isDDH)值分别是94.51％和53.30％,均小于定义一个种的边界值,与它们间分享的最大成对序列相似度值(PASC值)和基因组间相似度(VIRIDIC)值分别是90.51％和90.20％,均大于属的边界值;Tulanevirus属与Straboviridae科的另一个属Biquartavirus聚成一个枝簇(clade),它们共享的核心基因(core genes)占比为68.53％,符合国际病毒分类委员会(ICTV)关于建立一个亚科的标准(27％～79％).结论:Yyong是一个新种,属于Tulanevirus属.建议在Straboviridae科下建立一个新亚科以包含Tulanevirus属和Biquartavirus属.Yyong携带数量和种类多样的AMGs和tRNA基因,使其有效地控制宿主细菌,高效合成噬菌体自身核酸和蛋白质.一些AMGs具有良好开发潜力.丰富了噬菌体基因数据库与噬菌体分类系统,为噬菌体功能基因研究和噬菌体研发奠定了基础.

[目的]枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)是在自然界中广泛存在的革兰氏阳性菌,其抗逆性极强,能抑制大多数有害菌的繁殖,是常用的产酶菌,用其生产的蛋白酶、淀粉酶占全球工业酶产量的50％.原噬菌体(prophage)整合在宿主基因组中,可为宿主提供基因和生物学功能,非常具有研究价值.以往,有关B.subtilis原噬菌体的报道主要集中于缺陷型原噬菌体(defective prophage),本研究对一株非缺陷型活性原噬菌体(active prophage)的基因组进行解析,以扩充对非缺陷型原噬菌体的认知.[方法]使用丝裂霉素C从枯草芽孢杆菌中诱导一株噬菌体,命名为Bacillus phage Bsu-yongl(简称 Bsu-yongl).对 Bsu-yongl 进行负染、透射电镜(transmission electron microscopy,TEM)观察,用Illumina MiSeq测定其基因组序列、综合运用生物信息学工具对其进行基因功能注释和系统进化分析.[结果]Bsu-yong1与PBSX类缺陷型原噬菌体在形态上相似,但Bsu-yong1具有完整的噬菌体基因组,这与缺陷型原噬菌体不同,后者在包装过程中不能正确包裹自身的基因组,而是随机包裹一段宿主染色体.Bsu-yong1基因组全长为43 590 bp,G+C含量为41％,含有62个开放阅读框(open reading frame,ORF),呈模块化分布.Bsu-yong1拥有基因编码 T7SS 效应器 LXG 多态性毒素(T7SS effector LXG polymorphic toxin)、ImmA/IrrE 蛋白和SMI1/KNR4蛋白.前二者为细菌毒素(toxin),后者为抗毒素(antitoxin),toxin-antitoxin是细菌免疫系统重要成员,参与菌间竞争与环境适应.此前,尚未有编码LXG polymorphic toxin的基因在噬菌体中被发现和报道.在基于全基因组比对构建的蛋白谱进化树(proteomic tree)中,Bsu-yong1与噬菌体sv105、rho14、vB_BteM-A9Y聚集形成一个独立的进化支(clade),基因组比对显示它们基因组的复制与调控模块具有高度保守性,它们共享29个核心基因(core gene),均具有PBSX样形态特征.Bsu-yong1与其他噬菌体的进化距离较远.将Bsu-yong1与所有噬菌体进行比对,得到的成对序列比较(pairwise sequence comparison,PASC)最大值为46.72％,小于属边界值(70％).[结论]vB_Bsu-yong1在有尾纲中代表一个新的未知的属;建议构建一个新的科(family),该科由Bsu-yong1与噬菌体sv105、rho14、vB_BteM-A9Y组成.vB_Bsu-yong携带免疫相关基因,它可能有利于宿主在菌间竞争中获胜和适应环境.本研究丰富了噬菌体基因数据库,拓展了对芽孢杆菌活性原噬菌体的认知.

目的:基于生物信息学和分子对接技术,探讨苦参治疗溃疡性结肠炎(UC)的药理作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台及相关文献获取苦参的成分靶点信息,应用GEO数据库中的数据集(GSE206285)获取UC差异表达基因,通过免疫相关基因(IRGs)数据库收集IRGs,再利用STRING平台进行蛋白质-蛋白质相互作用分析,筛选苦参通过调节IRGs的表达治疗UC的核心靶点.通过Metascape平台对相关基因进行富集分析,最后将苦参中主要活性成分与核心靶点进行分子对接验证.结果:苦参通过调节免疫相关蛋白治疗UC的潜在活性成分为槲皮素、木犀草素、刺芒柄花素、8-异戊烯基-山柰酚、菜豆素、怀特酮、大豆抗毒素、高丽槐素、苦参素和苦参碱;核心靶点为基质金属蛋白酶(MMP)9、白细胞介素(IL)1β、CXC趋化因子配体 8(CXCL8)、过氧化物酶体增生激活受体γ(PPARG)、前列腺素内过氧化物合成酶 2(PTGS2)和IL-6;参与的信号通路为癌症相关通路、脂质与动脉粥样硬化通路、AGE-RAGE信号通路、IL-17 信号通路以及肿瘤坏死因子信号通路等;MMP9 与怀特酮的结合能为-42.7 kJ/mol;PPARG与菜豆素的结合能为-41.9 kJ/mol;MMP9 与木犀草素、PTGS2 与木犀草素、PTGS2 与菜豆素、PTGS2 与大豆抗毒素的结合能均为-40.6 kJ/mol.结论:本研究探讨了苦参通过调节IRGs治疗UC的潜在机制,为苦参临床应用的拓展及UC新的治疗策略提供理论基础.

毒素-抗毒素(toxin-antitoxin,TA)系统是由抗毒素及其同源毒素组成的小遗传元件,毒素可以抑制细胞生长或诱导细胞死亡,抗毒素则可以中和毒素的毒性.根据TA系统的组成和抗毒素的作用方式,TA系统可分为Ⅰ～Ⅷ型共八类,其中Ⅱ型TA系统存在最广泛,调控机制研究得最清楚.TA系统可以维持质粒等遗传元件的稳定性,同时在压力应激、促进生物膜形成、维持细菌致病力、抗噬菌体等方面都扮演着重要角色.研究TA系统的调控与生理功能能丰富人们对于生物多样性的认知,对于微生物资源的开发和利用具有重要的科学意义与应用价值.基于毒素和抗毒素的特点,TA系统被应用于生物医学领域和生物技术领域.本文综述了TA系统的分类、调控机制、生理功能和应用并简单描述了 TA系统目前研究面临的问题和未来展望.

结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)是引起结核病的病原菌.其处于持续生存的休眠状态时,可导致长期无症状感染,称为结核潜伏感染.研究显示,结核分枝杆菌染色体中存在大量"毒素-抗毒素系统"(toxin-antitoxin system,TAS),某些TAS在潜伏感染中发挥作用,可调节细菌生长和诱导细菌进入休眠状态;某些TAS参与生物膜形成和应激反应,但其影响生物膜形成的机制尚未阐明.生物膜中的结核分枝杆菌对多种抗结核药物耐药,且能抵抗宿主免疫系统防御;休眠状态的结核分枝杆菌对抗结核药物通常也是耐受的,给结核病治疗带来了巨大挑战.本文就近年来结核分枝杆菌TAS与生物膜的研究及抗结核药物对生物膜形成的影响进行综述.

杀白细胞素ED(leukocidin ED,LukED)是金黄色葡萄球菌产生的双组分成孔杀白细胞素之一,由共转录于一条mRNA的lukE和lukD两个基因编码.LukED可与趋化因子受体CCR5结合以杀伤巨噬细胞、T细胞和树突细胞,或与中性粒细胞、单核细胞和自然杀伤(natural kiler,NK)细胞上的表面受体CXCR1/2结合以促进金黄色葡萄球菌的致病性及系统性感染宿主的死亡.此外,LukED还可结合Duffy抗原趋化因子受体,使裂解红细胞释放血红蛋白,促进细菌的铁吸收和生长繁殖.LukED的表达受双组分信号转导系统附属基因调节子——毒素抑制子(Agr-Rot)通路和转录调节子RpiRc、SpoVG的调控.lukED基因在金黄色葡萄球菌中广泛流行,与金黄色葡萄球菌所致血流感染、脓疱病及抗生素相关性腹泻密切相关.这些进展对了解LukED的表达调控机制、临床意义及其在细菌致病机制中的作用,开发新的金黄色葡萄球菌感染抗毒素治疗药物具有重要意义.

精准医疗概念的提出开启了一个医学新时代,其实质包括精准诊断和精准治疗.张文宏课题组围绕结核病治疗中的精准医疗进行了阐述 ,涉及结核病的精准诊断 ,包括结核病的临床诊断及结核分枝杆菌的检测(分子检测及耐药检测技术等)、特殊人群的药理学参数与药物代谢相关的分子标记、针对病原体生命周期分子靶点的直接作用药物研发、通过正向调控或负向调控药物的使用实现宿主导向抗结核精准治疗.本期刊登了3篇关于结核病耐药的综述.鉴于耐药结核分枝杆菌的补偿性进化是其传播与流行的基础 ,高谦课题组从结核分枝杆菌的耐药分子机制、耐药突变的适应性代价与补偿性进化 ,以及补偿性进化如何影响耐药结核病传播等方面进行了综述.袁莉课题组就近年来结核分枝杆菌"毒素-抗毒素系统"(TAS)与生物膜的研究及抗结核药物对生物膜形成的影响进行综述.T AS参与调节细菌生长、诱导细菌休眠状态、生物膜形成或应激反应 ,可能与潜伏感染有关.王菲菲和张文宏课题组对绿茶中的儿茶素类化合物的抗结核活性进行了综述.儿茶素类化合物可抑制结核分枝杆菌二氢叶酸还原酶活性 ,影响分枝菌酸及细胞壁的合成 ,并降低氧化应激水平 ,下调宿主肿瘤坏死因子α表达 ,从而改善炎症水平.

毒素-抗毒素系统广泛存在于细菌及古细菌基因组,毒素与抗毒素共表达形成稳定的复合物,毒素蛋白稳定而抗毒素不稳定.在压力条件下,被激活的毒素蛋白通过作用于旋转酶、mRNA、细胞膜等靶标,导致细菌生长持留或细胞死亡.大量关于毒素-抗毒素系统的报道,试图阐述病原菌本身的作用与毒素-抗毒素系统之间的关系.通过构建不同的试验模型及实验方法,探索所研究的毒素-抗毒素系统可能发挥的生理作用.目前研究已初步形成了一些理论模型,但是仍然存在许多的疑问.其中,以毒素-抗毒素系统为靶点,通过人工激活毒素-抗毒素系统,释放游离的毒素蛋白杀死病原菌或病毒,被认为是一种潜在的新型抗菌或抗病毒策略.研究毒素-抗毒素系统特征及其生物学功能,尤其是毒素-抗毒素参与的细菌持留模型和细菌程序性细胞死亡模型,有助于开发抗菌药及抗病毒药.

破伤风是一种由专性厌氧菌感染引起的急性特异性感染,目前仍是一个严重的公共卫生问题.破伤风杆菌为专性厌氧菌,在自然界分布广泛,可存在于灰尘、土壤、人或动物粪便等,主要通过皮肤或黏膜伤口侵入人体,常见于外伤和烧烫伤患者、不洁接生的新生儿及手术器械消毒不严等情况.破伤风杆菌在化脓菌感染的伤口中繁殖产生外毒素引起中枢神经系统暂时性功能改变,表现为全身骨骼肌持续性强直和阵发性痉挛,重症患者可发生喉痉挛、窒息、肺部感染和器官功能衰竭,是一种极为严重的潜在致命性疾病.本文是关于破伤风免疫预防的专家共识,目的是预防开放性外伤后的破伤风并协助制定临床决策.根据国内外破伤风的流行病学调查结果、受伤人群的类型、伤口的暴露情况和免疫预防误区等的研究显示,预防破伤风至关重要的措施是良好的伤口处理和免疫接种.本共识描述了破伤风免疫预防过程的时间表,包括婴幼儿的破伤风免疫接种程序、妊娠期妇女的破伤风免疫接种程序、潜在高危人群的破伤风免疫接种程序、免疫缺陷患者的破伤风免疫接种程序和HIV感染母亲所生儿童的破伤风免疫接种流程.本共识仅提供学术性指导意见,具体实施时必须依据患者的医疗条件而定.