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SF3B1、UBE2V2和SETD2的表达与老年骨质疏松性椎体骨折的相关性研究
编辑人员丨6天前
目的:探究剪切因子3B亚基1(subunit 1 of splicing factor 3b,SF3B1)、泛素结合酶E2变体2(ubiquitin conjugating enzyme E2 V2,UBE2V2)和组蛋白甲基转移酶(SET domain-containing protein 2,SETD2)的表达与老年骨质疏松性椎体骨折(osteoporotic vertebral fracture,OVF)的相关性。方法:收集2020年8月至2021年8月烟台市烟台山医院31例骨质疏松性椎体骨折(vertebral fracture,VF)(VF组)和16例骨质疏松非椎体骨折(non vertebral fracture,NVF)(NVF组)的老年患者(年龄>60岁)的外周血样本,提取RNA进行转录组测序筛选差异表达基因。通过基因本体论(gene ontology,GO)分析、蛋白相互作用(protein protein interaction,PPI)网络分析、ROC曲线分析筛选VF相关基因。采用qRT-PCR检测基因的表达水平。结果:相对于NVF组,VF中有822个差异表达基因,691个上调,131个下调。qRT-PCR结果显示,相对于NVF患者(1.55±0.33)(1.70±0.33)(1.64±0.33),VF患者外周血中SF3B1(1.83±0.23)( t=2.84, P=0.008)、UBE2V2(2.24±0.43)( t=3.91, P<0.001)的表达增强,SETD2(1.18±0.46)( t=3.25, P=0.003)表达降低。ROC曲线分析显示,SF3B1、UBE2V2和SETD2在VF中的AUC分别为0.803 4( P=0.007)、0.814 5( P=0.005)和0.786 3( P=0.001 4)。 结论:SF3B1、UBE2V2和SETD2与老年OVF高度相关,对OVF的诊断和预测具有重要价值。
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编辑人员丨6天前
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泛素结合酶E2变体1与恶性肿瘤发生及转移的研究进展
编辑人员丨2024/3/16
泛素结合酶E2变体1(ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1,Ube2v1)属于泛素结合酶E2的一种变体蛋白(Ube2v),Ube2v1主要参与调控炎症及癌症的发生.目前有关Ube2v1的研究涉及多种肿瘤,多与肿瘤预后相关.有望成为肿瘤治疗的潜在靶点.在此就近年来Ube2v1在恶性肿瘤方面的研究进展作一综述.
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编辑人员丨2024/3/16
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大豆E2泛素结合酶基因GmUBC1的克隆及在拟南芥中的异源表达
编辑人员丨2023/8/5
E2泛素结合酶(ubiquitin-conjugating enzyme)参与植物的抗逆、生长发育等多种生物途径的调控,其功能研究在拟南芥(Arabidopsis thaliana)中的报道较多,但在重要经济作物大豆(Glycine max)中鲜有报道.本研究从大豆"南农94-16"中克隆了1个与大豆子叶折叠突变体可能相关的基因Glyma.12G161200,序列分析结果表明该基因编码一个E2泛素结合酶,因此将其命名为GmUBC1.该基因编码区全长为462 bp,编码一个含153个氨基酸的蛋白,预测其分子量为17.25 kDa,等电点为6.74.利用qRT-PCR技术对GmUBC1在大豆不同组织中的表达模式及其对不同非生物胁迫和激素处理的响应模式进行分析,发现该基因在开花后40 d种子中表达量最高,在PEG、低温、JA和ABA处理下表达下调.亚细胞定位分析发现GmUBC1蛋白在整个细胞内都有表达.进一步在拟南芥中异源表达GmUBC1,发现转基因株系的千粒重和总氨基酸含量显著提高,表明异源过表达GmUBC1可以调控种子重量和氨基酸含量,为大豆品质改良提供了基因资源.
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编辑人员丨2023/8/5
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乳腺癌组织中UEV1A、UBE2N表达与上皮间质转化的关系及临床预后价值
编辑人员丨2023/8/5
目的 分析乳腺癌组织中泛素结合酶变体1A(UEV1A)、泛素连接酶E2N(UBE2N)的表达与上皮间质转化(EMT)基因表达的相关性及临床预后意义.方法 选取2016年2月—2017年2月琼海市人民医院/海南省东部区域医疗中心乳腺甲状腺外科诊治的乳腺癌患者124例为研究对象.采用实时荧光定量PCR法检测乳腺癌组织和癌旁组织中UEV1A、UBE2N及EMT通路基因E-钙黏蛋白(E-cad)、N-钙黏蛋白(N-cad)、波形蛋白(Vim)、Snail mRNA的表达;免疫组化法检测组织中UEV1A、UBE2N蛋白水平.比较不同临床病理特征乳腺癌患者癌组织中UEV1A、UBE2N蛋白水平差异.采用Pearson相关分析和Spearman秩相关分析乳腺癌组织中UEV1A、UBE2N mRNA与EMT相关基因表达的相关性,以及癌组织UEV1A与UBE2N蛋白水平的相关性.Kaplan-Meier生存分析UEV1A、UBE2N蛋白水平对乳腺癌患者生存预后的影响.多因素Cox回归分析影响乳腺癌患者生存预后的因素.结果 乳腺癌组织UEV1A、UBE2N及N-cad、Vim、Snail mRNA表达高于癌旁组织,E-cad mRNA表达低于癌旁组织(t/P=28.803/<0.001、48.654/<0.001、54.411/<0.001、46.213/<0.001、27.273/<0.001、22.228/<0.001).癌组织中UEV1A、UBE2N mRNA表达与N-cad、Vim、Snail mRNA呈正相关(UEV1A:r=0.694、0.702、0.806,P均<0.001;UBE2N:r=0.717、0.756、0.803,P均<0.001),与E-cad呈负相关(r=-0.741、-0.756,P均<0.001).乳腺癌组织UEV1A、UBE2N蛋白表达阳性率高于癌旁组织(χ2/P=68.896/<0.001、64.851/<0.001);癌组织中UEV1A与UBE2N蛋白表达呈显著正相关(r/P=0.785/<0.001).肿瘤T2~T4期、有淋巴结转移乳腺癌患者癌组织中UEV1A、UBE2N蛋白表达阳性率分别高于T1期、无淋巴结转移患者(UEV1A:χ2/P=29.803/<0.001、4.015/0.045;UBE2N:χ2/P=7.038/0.008、8.572/0.003).UEV1A阳性表达患者5年总体生存率低于阴性表达患者(χ2/P=5.085/0.024),UBE2N阳性表达患者5年总体生存率低于阴性表达患者(χ2/P=8.391/0.004).肿瘤T2~T4期、合并淋巴结转移、UEV1A阳性、UBE2N阳性是影响乳腺癌患者生存预后的独立危险因素[OR(95%CI)=1.777(1.299~2.432)、1.613(1.193~2.181)、1.838(1.302~2.596)、1.735(1.224~2.459),P均<0.001].结论 乳腺癌组织UEV1A、UBE2N表达升高,二者与肿瘤分期及淋巴结转移有关,是影响乳腺癌患者预后的独立危险因素.
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编辑人员丨2023/8/5
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去泛素化酶OTUD3调控PTEN肿瘤相关突变体蛋白稳定性的研究
编辑人员丨2023/8/5
目的 探索去泛素化酶含OTU结构域蛋白3(OTUD3)在乳腺癌中对抑癌蛋白PTEN肿瘤相关突变体蛋白稳定性的调控.方法 收集50例乳腺癌患者样本,提取癌与癌旁组织的RNA后进行逆转录,对PTEN C2结构域进行PCR扩增后测序分析,鉴定乳腺癌PTEN C2结构域的肿瘤相关突变.结合现有数据库中PTEN基因的突变位点信息,将PTEN突变体的编码序列扩增后插入哺乳动物表达载体pCMV?Myc中,构建含有PTEN C2结构域肿瘤相关突变体基因的质粒载体.将上述含PTEN点突变体或截短体基因的质粒载体分别与含OTUD3基因的质粒载体共转染MCF?7细胞,通过免疫共沉淀实验、半衰期实验、泛素化实验及Western印迹实验分别检测PTEN所有突变体与OTUD3结合能力、OTUD3对部分PTEN突变体蛋白稳定性的维持能力及去泛素化修饰能力.结果 从50例乳腺癌病例中鉴定出PTEN C2结构域有3种突变,即I224M、E307K与F341V,其中F341V是本研究在乳腺癌病例中首次鉴定出的PTEN突变体.△M199、F341V以及1-319丧失了与OTUD3结合的能力,从而失去了OTUD3对其的稳定作用.结论 在乳腺癌中,PTEN的一些突变体丧失了与OTUD3结合的能力,不能对其去泛素化修饰,使得蛋白稳定性降低.
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编辑人员丨2023/8/5
