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人源R-spondin 2蛋白的生物信息学分析、表达、纯化及活性检测
编辑人员丨2天前
目的 构建人源R-spondin 2(roof plate-specific spondin 2,RSPO2)的真核表达载体,表达、纯化融合蛋白RSPO2-Fu-Fc,用3C蛋白酶切除Fc结构域后,检测RSPO2-Fu的生物学活性.方法 基于生物信息学方法分析人源RSPO2蛋白的理化性质和结构,筛选获得可在溶液中稳定存在的RSPO2截短蛋白RSPO2-Fu.将编码RSPO2-Fu蛋白的基因亚克隆至pCMV-Fc载体后,将质粒pCMV-RSPO2-Fu-Fc瞬时转染入HEK293F细胞中表达72 h,通过Protein A层析柱纯化融合蛋白RSPO2-Fu-Fc,用3C蛋白酶切去Fc结构域,分子筛进一步提纯获得RSPO2-Fu蛋白.最后,通过M50 Super 8 × TOPFlash检测RSPO2-Fu蛋白的生物学活性.结果 生物信息学分析结果显示,RSPO2全长有243个氨基酸,相对分子质量为28 300,等电点为9.42,为亲水性不稳定蛋白,RSPO2-Fu截短蛋白在溶液中的稳定性得到了极大提高;重组表达质粒pCMV-RSPO2-Fu-Fc经菌落PCR及测序证明构建正确;获得了纯度达95%的RSPO2-Fu蛋白;生物学活性检测结果显示,RSPO2-Fu的EC5.值为1.5× 10-12 mol/L.结论 对RSPO2蛋白适当截短后,可获得稳定表达的RSPO2-Fu蛋白,其对Wnt信号通路有明显激活作用,为Wnt信号通路中RSPO2相关生物学研究提供了更好的参考.
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编辑人员丨2天前
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2012-2020年广东省深圳市某区非正常死亡监测分析
编辑人员丨2天前
目的 了解2012-2020年广东省深圳市某区居民非正常死亡的分布特征,为制定相关防控措施提供参考依据.方法 死亡资料来源于深圳市死因监测系统,常住人口数据来自于深圳市某区统计年鉴.死亡数据参照疾病和有关健康问题的国际统计分类第10次修订本(ICD-10),编码V00-Y34被认定为非正常死亡,选取非正常死亡人口数计算非正常死亡率.应用Joinpoint回归分析经年龄调整的标化非正常死亡率的年度变化趋势,采用x2检验比较非正常死亡率在不同性别和年龄段间的差异.统计非正常死亡的死因构成及顺位,并采用潜在减寿年数(PYLL)和平均潜在减寿年数(APYLL)衡量非正常死亡带来的寿命损失人年数.结果 2012-2020年深圳市某区居民非正常死亡累计2 806人,标化非正常死亡率为9.81/10万人;2012-2020年深圳市某区居民标化非正常死亡率呈现缓慢上升趋势,年度变化百分比与平均年度变化百分比均为5.60%(95%置信区间:-5.90%~18.60%).男性非正常死亡率为12.84/10万人,大于女性的6.10/10万,差异有统计学意义(x2=321.392,P<0.001).≥65岁年龄组的非正常死亡率最高,达10.13/10万人,其次是15~64岁年龄组(9.95/10万),0~14岁年龄组非正常死亡率最低(8.95/10万),各年龄组的非正常死亡率比较差异无统计学意义(x2=2.616,P=0.270).深圳市某区居民5种主要死因中非正常死亡的PYLL和APYLL均为最高,恶性肿瘤次之.意外损伤的其他外因排在非正常死亡死因顺位第1位.非正常死亡PYLL最高为故意自害,其次为意外损伤的其他外因;而非正常死亡APYLL前3位分别是加害、意图不确定的事件造成的损伤、故意自害.结论 应进一步构建安全的作业环境,加强对男性、老年人以及工人重点人群的安全保护,提高个人防范意识,大力建设健康养老体系和非正常死亡的危机干预机制.
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编辑人员丨2天前
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CD147调控MAPK信号通路对结肠癌细胞增殖和凋亡的影响及机制研究
编辑人员丨2天前
目的:探讨CD147表达对结肠癌细胞增殖、凋亡的影响和潜在的分子机制。方法:分析UCSC数据库中基因BSG(编码CD147蛋白)在结肠癌中的表达,利用Kaplan-Meier Plotter数据库评估BSG的表达与生存结局之间的关系。应用Western blot检测CD147在HCT116和HCoEPiC细胞中的表达,通过慢病毒转染HCT116细胞下调CD147表达进一步验证其转染效率。应用CCK-8、平板克隆和Hoechst 33342染色实验检测细胞增殖和凋亡能力。Western blot检测各组细胞内MAPK、p-MAPK、C-MYC、BAX和BCL-2的表达;同时应用TIMER 2.0数据库对结肠癌组织中的BSG表达和MAPK1、MYC、BAX、BCL-2进行相关性分析。结果:UCSC数据库观察到CD147在结肠癌组织中表达高于正常组织(P<0.01);过表达CD147患者的预后不良。Western blot结果显示,与HCoEPiC细胞比较,HCT116细胞中CD147蛋白表达增高(P<0.001)。荧光显微镜下shCD147低表达组与sh-NON空载组细胞的荧光表达丰度均可达90%;Western blot结果显示,与HCT116细胞比较,shCD147组细胞中CD147蛋白表达降低(P<0.001)。下调CD147后,与HCT116组比较,sh-CD147组细胞增殖和细胞集落形成能力降低;Hoechst 33342染色结果显示,与HCT116组相比,shCD147组凋亡的细胞核染色增强,荧光更为明亮(P<0.001)。与HCT116相比,sh-CD147组细胞内p-MAPK、C-MYC和BCL-2表达降低,但BAX表达升高;TIMER 2.0数据库相关性分析,结肠癌组织中BSG表达水平与MAPK1、MYC、BCL-2表达呈现正相关,但与BAX表达呈现负相关(P<0.001)。结论:下调CD147表达降低结肠癌细胞增殖能力,促进凋亡发生,该过程可能与抑制MAPK信号通路有关。
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编辑人员丨2天前
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二代测序技术在Sabin株脊髓灰质炎灭活疫苗(Vero细胞)生产质量控制中的应用
编辑人员丨2天前
目的 将二代测序(next generation sequencing,NGS)技术应用至Sabin株脊髓灰质炎灭活疫苗(Vero细胞)(Sabin strain inactivated poliomyelitis vaccine,sIPV)生产质量监控中,以期确保疫苗的安全性和批间一致性.方法 将脊髓灰质炎病毒(poliovirus,PV)Sabin株Ⅰ型、Ⅱ型和Pfizer株Ⅲ型工作种子批分别接种至生物反应器微载体培养的单层Vero细胞上,33 ℃培养3~4d,获得疫苗代次病毒液,每个型别制备3批.提取各型别工作种子批毒种和疫苗代次病毒液RNA,用NGS技术分析基因突变频率、神经毒力决定位点、突变热点及批间一致性.结果 3种型别PV工作种子批毒种经培养后,Sabin株Ⅱ型和Pfizer株Ⅲ型比Sabin株Ⅰ型更易发生突变,非编码区神经毒力决定位点突变频率明显上升(t=3.21~5.83,P均<0.05),编码区神经毒力决定位点突变频率变化较小(t=1.29~2.34,P均>0.05)或明显下降(t=6.01~9.62,P均<0.05);Sabin株Ⅱ型毒株的nt869位点及Pfizer株Ⅲ型毒株的nt2 493位点各发生1个突变热点,突变方式均为C→T,其中nt2493既是神经毒力决定位点,也是突变热点.3种型别各3批疫苗代次病毒液均具有良好的批间一致性,基因组VP1区域各核酸位点突变频率批间拟合R2为0.947~0.995.结论 NGS技术可高效检测sIPV生产过程中PV基因组的突变,且稳定可靠,可用于该疫苗的质量控制.
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编辑人员丨2天前
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广东省某医院2020-2022住院病案首页填写质量分析及对策
编辑人员丨2天前
目的 通过分析广东省某医院近3年住院病案首页填报数据,针对住院病案首页诊断及手术操作填报缺陷原因,提出持续改进措施,以期提高住院病案首页填报正确率.方法 根据住院病案首页数据填写质量规范(暂行)、住院病案首页数据质量评分标准(2016版)填写规范,对广东省某医院2020年1月1日-2022年12月31日期间出院的55 705份住院病案首页进行质量监控,分析住院病案首页填写问题.采用描述性统计方法对数据进行分析.结果 2492份住院病案首页填写存在缺陷,总体住院病案首页缺陷率为4.47%.填写缺陷2626例次,按照不同类型归类为26项,全部为患者基本信息、住院过程信息、诊疗信息类缺陷问题.占比较高的前4类问题为主要诊断信息缺陷(占比40.63%)、主要手术或操作信息缺陷(占比17.44%)、其他手术或操作缺陷(占比14.28%)、其他诊断信息缺陷(占比14.17%).结论 住院病案首页主要诊断填写选择不准确情况、其他诊断漏填情况较为突出、手术或操作漏填情况占比较大.应强化对临床医师和编码员的ICD编码及住院病案首页填写规则相关知识培训,搭建住院病案首页质控信息系统,推进住院病案首页信息化建设,充分利用住院病案首页智能审核系统等持续改进措施,提高住院病案首页填写的正确率.
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编辑人员丨2天前
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后期实践教学模式在国际疾病分类教学中的应用效果
编辑人员丨2天前
目的 探讨后期实践教学模式在国际疾病分类教学中的可行性及应用效果,以提高教学质量.方法 选取2020年1月1日-2022年12月31日期间在某院病案室实习6个月的信息技术与信息管理专业本科生50名,应用对比分析法将学生随机分成传统教学模式组与实践教教学模式组进行带教.并通过课堂观测、出科考试、学生满意度问卷调查方式对2组教学效果进行对比.结果 课堂观测显示实践教学模式组在学生课堂氛围活跃度方面高于传统教学模式组;实践教学模式组学生平均成绩(86.6±7.45)分,传统教学模式组学生平均成绩(67.92±8.16)分,2组成绩相比差异有统计学意义;调查问卷结果显示实践教学模式组在自我学习能力、理论知识掌握程度等5个方面学生满意度均高于传统教学模式.结论 病案信息学后期实践教学模式在提高学生学习积极性、国际疾病分类编码技能、病例分析能力等方面具有明显优势,值得推广应用.
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编辑人员丨2天前
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住院病案首页结肠息肉术后并发肠出血填写分析
编辑人员丨2天前
目的 分析消化内科住院病案首页结肠息肉治疗术后并发肠出血填写情况,提高住院病案首页填写的正确率.方法 从广东省医疗机构病案统计管理系统导出某三级综合医院2017年1月1日-2022年12月31日消化内科主要诊断或其他诊断中含有结肠息肉治疗术后并发肠出血(T81.0)的28份住院病案首页或诊断中含有下消化道出血(K92.209)且本次住院期间或近期曾行结肠息肉治疗术的14份住院病案首页.由编码员与质控医师逐份核查病案,共同判断符合结肠息肉治疗术后并发肠出血情况,其中编码为T81.0的病案中有23份符合条件,而编码为K92.209的病案中有8份符合条件,共计31份.采用描述性分析,计数资料用频数、百分比、正确率表示.结果 31份病案中医师填写正确且编码员编码正确有9份,占29.0%;医师填错而编码员编码正确有14份,占45.2%,医师填错且编码员随错有8份,占25.8%;对应入院病情医师填写正确有20份,占64.5%,填写错误的有11份,占35.5%.核对发现入院病情应归类为1(有)的8份,占25.8%;应归类为2(临床未确定)的2份,占6.5%;应归类为4(无)的21份,占67.7%.结论 消化内科住院病案首页结肠息肉治疗术后并发肠出血填写问题较突出,医师填写错误是主要因素,其次是编码员编码错误,因此医院主管部门和临床科室要高度重视,加强医师和编码员对结肠息肉治疗术后并发肠出血的学习与培训,提高住院病案首页填写的正确率.
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编辑人员丨2天前
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西方蜜蜂AKHR基因的生物信息学及表达模式分析
编辑人员丨2天前
本研究对西方蜜蜂Apis mellifera脂动激素受体(Adipokinetic hormone receptor,AKHR)基因AmAKHR CDS区进行RT-PCR扩增和生物信息学分析,并测定了AmAKHR在工蜂不同组织和不同发育阶段的表达模式,旨在为进一步的功能研究提供参考和基础.通过PCR扩增AmAKHR的CDS,使用相关软件预测AmAKHR蛋白的理化性质、分子特征及蛋白互作网络.采用RT-qPCR技术检测AmAKHR在工蜂不同组织和不同发育阶段的相对表达量.结果表明,AmAKHR基因CDS长度为1 050 bp,编码349个氨基酸;AmAKHR的相对分子量约为40.63 kDa,分子式为C1873H2939N471O484S26,含39个磷酸化位点,7个α-跨膜螺旋结构及8个保守基序,不含信号肽,主要分布于质膜;AmAKHR与小蜜蜂Apis florea的AKHR在进化树上聚为一支;AmAKHR的二级结构包含127个无规则卷曲,124 个α-螺旋,87 条延伸链和11 个β-转角;AmAKHR与卵黄原蛋白和神经肽Corazonin等10个蛋白构成1个互作网络;AmAKHR在西方蜜蜂工蜂的毒腺、中肠、咽下腺、脂肪体、脑和触角等6个组织中差异表达,在脂肪体中的表达量最高,而在中肠中的表达量最低;AmAKHR在西方蜜蜂工蜂 1 日龄幼虫、3 日龄幼虫、5 日龄幼虫、2日龄预蛹、1日龄蛹中均有表达,且表达量随着日龄的增长而持续上调.研究结果揭示AmAKHR为疏水性蛋白和膜蛋白,并与卵黄原蛋白和神经肽等10个蛋白潜在互作,AmAKHR可能在西方蜜蜂工蜂的能量代谢、脂类分解和变态发育中发挥作用.
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编辑人员丨2天前
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基于转录组测序数据的许兰毛癣菌热应激相关信号通路及候选基因的筛选
编辑人员丨2天前
目的 为了筛选和鉴定许兰毛癣菌热应激相关差异表达基因,进一步探索许兰毛癣菌差异表达基因的分子机制.方法 本研究采用Illumina平台PE150测序策略,对热应激(42 ℃)、生理温度(37 ℃)处理30 min和常温生长(27 ℃)条件下的许兰毛癣菌转录组测序和差异表达基因,通过生物信息学工具进行功能注释、分类和分析相关信号通路等.结果 常温组、37 ℃和42 ℃热处理样品的RNA中30076菌株分别获得146 351 442、142 326 366和134 764 862条原始reads.对30079菌株分别获得143 815 046、134 081 574和117 121 246条原始reads.对于差异表达基因进行分析结果示,差异表达基因主要富集在"细胞酰胺代谢过程"(13个上调基因和3个下调基因)、"肽生物合成过程"(12个上调基因和3个下调基因)、"核糖体"(11个上调基因)亚类(校正P<0.05).KEGG数据库富集分析显示,参与蛋白质和碳水化合物代谢的基因以及热休克蛋白编码基因发生了显著变化,表明热应激对这些通路的影响很大.结论 本研究中获得的差异表达基因,特别是与碳代谢、氨基酸的生物合成、内质网中的蛋白质加工、次生代谢物的生物合成等代谢途径相关的基因尤其是编码热休克蛋白的相关基因可能参与了许兰毛癣菌在热应激条件下的致病机制,其具体调控机制有待进一步研究.
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编辑人员丨2天前
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德阳市129家医疗机构病案管理现状调查分析
编辑人员丨2天前
目的 了解德阳市辖区内各医疗机构病案管理科工作现状,为推进全市病案管理科室科学化建设提供客观依据.方法 2023年4月26日-5月21日采用问卷调查方法收集129家医疗机构病案科基本情况、人员配置、业务开展、信息化建设等内容,由各医疗机构实名填写病案管理专业基线调查表.建立数据库,进行描述性分析.结果 129家医疗机构中72家医院病案科室隶属于医务科,占55.81%;30~39岁年龄段病案工作人员占38.18%,本科人员占54.13%,医学相关专业人员占51.00%;实际开放床位数与病案人员比为86.9∶1,开展住院病案首页质控医院占89.15%,主要诊断编码正确率大于90%医院占79.84%;开展线上病案复印预约服务占5.43%,采用数字化扫描的医院仅占7.75%.结论 德阳市部分医疗机构病案管理科室设置不合理,病案管理人员不足,专职人员学历、专业配备不合理,需进一步完善科室隶属,加强人员队伍建设,优化科室人员结构,提升业务能力,同时加强信息化建设,为现代化病案管理提供支撑.
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编辑人员丨2天前
