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整合生物信息学分析鉴定SARS-CoV-2感染引起的心肌损伤机制中潜在的铁死亡关键基因
编辑人员丨1天前
目的 铁死亡在冠状病毒病2019(Coronavirus Disease 2019,COVID-19)相关的心血管疾病中起致病作用.本研究旨在鉴定严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)感染引起的心肌损伤机制中潜在的铁死亡相关的关键基因.方法 对感染SARS-CoV-2的人诱导的多能干细胞源性心肌细胞(human induced pluripotent stem cell-derived cardiomyocytes,hiPSC-CMs)转录组数据进行生物信息学研究,包括铁死亡相关的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)的鉴定、基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析、蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interactions,PPI)、关键基因鉴定以及转录因子-基因相互作用等,以探索铁死亡相关基因在COVID-19相关心肌损伤发病机制中的潜在作用.此外,针对关键基因的候选靶向药物进行了开发,为该疾病的诊疗提供理论依据.结果 通过比较感染或未感染SARS-CoV-2的hiPSC-CMs的转录谱数据,并与铁死亡数据库(FerrDb)基因取交集,筛选出80个铁死亡相关的DEGs.GO和KEGG通路富集分析表明,这些基因参与细胞对氧化应激和缺氧的反应、铁死亡、细胞坏死性凋亡、缺氧诱导因子1(hypoxia-inducible factor,HIF-1)信号通路、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路、白介素17(Interleukin 17,IL-17)信号通路、核因子-κB(Nuclear Factor-kappa B,NF-κB)信号通路等.使用PPI和cytoHubba鉴定的关键基因包括IL-6、JUN、PTGS2、TLR4、HIF1A、CAV1、HMOX1、SIRT1、EGFR和ATF3.转录因子RELA、NFKB1、EGR1、STAT3、JUN和SP1与大多数关键基因相互作用.筛选出针对关键基因的候选药物,包括去铁胺、氧气、辛伐他汀、乙酰半胱氨酸、姜黄素、醋酚酮、白藜芦醇、谷胱甘肽等.结论 分析感染SARS-CoV-2的hiPSC-CMs的转录谱数据,为理解SARS-CoV-2感染引起的心肌损伤的铁死亡相关病理机制的提供新视角.此外,探索铁死亡相关基因的候选靶向药物在未来对抗这种形式的心肌损伤方面具有巨大的潜力.
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编辑人员丨1天前
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白藜芦醇通过Wnt信号通路对乳腺癌他莫昔芬疗效的影响
编辑人员丨1天前
目的:观察白藜芦醇通过Wnt信号通路对乳腺癌他莫昔芬疗效的影响。方法:使用含有二甲基苯蒽的芝麻油成功构建60只SD乳腺癌大鼠模型(所有大鼠均购自中国医学科学院医学实验动物研究所),随机数字表法分为6组,每组各10只。A组为溶栓剂对照组,给予10 mg/kg二甲基亚砜;B组为白藜芦醇组,给予10 mg/kg白藜芦醇;C组为他莫昔芬组,给予0.1 ml的5 mg/ml他莫昔芬;D组为联合用药组,给予10 mg/kg白藜芦醇联合0.1 ml的5 mg/ml他莫昔芬;E组为Wnt信号通路抑制剂组,给予10 mg/kg白藜芦醇、0.1 ml的5 mg/ml他莫昔芬联合15 mg/kg的端锚聚合酶抑制剂(IWR)腹腔注射;F组为Wnt信号通路激动剂组,给予10 mg/kg白藜芦醇、0.1 ml的5 mg/ml他莫昔芬联合2 mg/kg氯化锂。对各组大鼠进行28 d的观察,比较不同时刻各组大鼠的肿瘤体积、造模后第28天各组大鼠的肿瘤细胞凋亡率及Wnt通路相关蛋白水平。多组间比较采用单因素方差分析。结果:成功造模后对各组大鼠进行4周观察,无1例死亡。造模后第14、21、28天时各组大鼠的肿瘤体积间比较差异有统计学意义( F=6.389、5.182、7.276, P<0.05);E组大鼠的肿瘤体积最小,A组大鼠的肿瘤体积最大,其中D组和E组大鼠造模后第14、21、28天时的肿瘤体积均小于C组,且E组小于D组,差异有统计学意义( F=8.427、6.791、7.921, P<0.05);且F组大鼠造模后第14、21、28天时的肿瘤体积均大于E组,差异有统计学意义( F=5.182、8.531、8.676, P<0.05)。各组大鼠的标本中均存在原位缺口末端标记法(TUNEL)阳性细胞,细胞核表现为深浅不同的棕黄色,且分布不均。A组[(1.32±0.16)%]和B组[(2.24±0.41)%]仅能够观察到少数散落的凋亡肿瘤细胞,两组间比较差异无统计学意义( F=1.759, P>0.05);C组[(19.09±4.53)%]和F组的肿瘤细胞凋亡率[(21.42±3.68)%]高于A组和B组( F=7.743、5.536, P<0.05),两组间比较差异无统计学意义( F=2.987、2.051, P>0.05);D组[(27.93±6.69)%]和E组的肿瘤细胞凋亡率[(39.69±6.89)%]明显高于其余4组,且E组高于D组,差异有统计学意义( F=6.883、7.037, P<0.05)。A组大鼠的β-连环蛋白(1.25±0.14)、Wnt2水平(1.10±0.30)均高于其他各组,糖原合成酶激酶3β(GSK3β,0.20±0.05)、磷酸化GSK3β(p-GSK3β,0.25±0.07)、Lef1水平(0.17±0.03)均低于其他各组;E组大鼠的β-连环蛋白(0.40±0.06)、Wnt2水平(0.30±0.11)均低于其他各组,GSK3β(0.89±0.04)、p-GSK3β(0.97±0.06)、Lef1水平(0.82±0.06)均高于其他各组;且E组大鼠的β-连环蛋白、Wnt2水平均低于D组和F组,且D组低于F组,GSK3β、p-GSK3β、Lef1水平均高于D组和F组,且D组高于F组,差异有统计学意义( F=7.627, P<0.05)。 结论:白藜芦醇可降低β-连环蛋白、Wnt2的表达,提升GSK3β、p-GSK3β、Lef1的表达,抑制Wnt信号通路,提高他莫昔芬的抗肿瘤效果。
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编辑人员丨1天前
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白藜芦醇在创面愈合中的作用研究进展
编辑人员丨1天前
患者创面愈合困难是临床各科室医师均有可能遇到的难题,目前仍然没有很好的解决方案。白藜芦醇是一种天然活性物质,具有抗炎、抗氧化、抗菌及促进血管新生等作用,是潜在的促进创面愈合的药物。然而,白藜芦醇因生物利用度不高等原因,临床应用受限。该文对白藜芦醇促进创面愈合的分子机制及其在创面治疗中的给药方式进行综述,以期为该药的重新开发提供思路。
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编辑人员丨1天前
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冠状病毒所致心力衰竭的组学机制分析及药物预测
编辑人员丨1天前
目的:探讨冠状病毒感染所致心力衰竭(心衰)的机制,并预测对其可能有效的药物。方法:在基因表达数据库(GEO)检索冠状病毒和心衰,并筛选符合实验要求的组学数据。采用R语言Limma程序包进行差异表达基因分析,筛选差异表达基因。将两组差异基因导入R语言clusterProfiler包进行基因本体学(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,取两组结果的交集。采用STRING数据库对所有差异表达基因构建蛋白质互作网络并筛选核心基因。最后采用团队自主研发的表观精准治疗预测平台EpiMed预测冠状病毒所致心衰的治疗药物。结果:在GEO数据库检索并筛选得到GSE59185冠状病毒数据集,根据不同的亚型分为wt组、?E组、?3组、?5组、对照组5组样本,差异分析发现各亚组交集上调基因191?个,下调基因18?个。在GEO数据库检索并筛选得到GSE126062心衰数据集,共筛选差异表达基因495?个,其中上调165?个,下调330?个。冠状病毒与心衰差异表达基因富集分析,取交集处理共有GO条目20条,主要富集在病毒反应、病毒防御反应、Ⅰ型干扰素反应、γ干扰素调节、先天免疫反应调节、病毒生命周期负调控、病毒基因组复制调控等;共有5条KEGG通路,主要与肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、白细胞介素(IL)-17信号通路、细胞因子与受体相互作用、Toll样受体信号通路、人类巨细胞病毒感染有关。蛋白互作网络分析筛选出信号传导及转录激活蛋白3、IL-10、IL-17、TNF、干扰素调节因子9、2′, 5′-寡腺苷酸合成酶1、丝裂原活化蛋白激酶3、S-腺苷甲硫氨酸基区域蛋白2、CXC趋化因子配体10、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3共10?个核心基因。EpiMed平台预测可能对冠状病毒所致心衰有效的药物为TNF-α抑制剂、白藜醇、利托那韦、白芍、维甲酸、连翘、鱼腥草等。结论:多个炎症通路的异常活化可能是冠状病毒感染所致心衰的原因,白藜芦醇、利托那韦、维甲酸、白芍、连翘、鱼腥草可能对其具有治疗作用。
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编辑人员丨1天前
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靶向Wnt/β-catenin信号通路治疗宫颈癌的研究进展
编辑人员丨1天前
宫颈癌是一种发病率和转移率均较高的妇科癌症.尽管手术、放射、化学治疗在宫颈癌治疗中取得了显著的临床效果,但仍存在一定的局限性,因此亟需新的治疗药物.近年研究发现,Wnt/β-catenin 信号通路在宫颈癌发生发展、转移、耐药等过程中起关键性作用.Wnt/β-catenin信号途径参与宫颈癌的发生发展和远处转移及对化疗药物的耐受性;天然化合物如中药白藜芦醇和黄芩素等及合成化合物如伊曲康唑等均可通过此信号通路发挥抗宫颈癌的作用;非编码RNA和一些蛋白分子均可以通过此通路影响宫颈癌的发生发展.研究说明,Wnt/β-catenin信号途径是宫颈癌治疗的潜在靶点.本文归纳宫颈癌中Wnt/β-catenin信号途径的作用,以期为宫颈癌的临床研究与新药开发提供参考依据.
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编辑人员丨1天前
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呼和浩特市4区5旗县气传致敏花粉调查分析
编辑人员丨1天前
目的:探讨呼和浩特市4区5旗县气传主要致敏花粉的种类、数量及飘散规律。方法:采用横断面研究,2021年8月1日至2022年7月31日,首都医科大学附属北京世纪坛医院变态反应科在呼和浩特市4区(玉泉区、新城区、回民区和赛罕区)5旗县(托克托县、和林格尔县、土默特左旗、武川县、清水河县)采用重力法监测气传主要致敏花粉,在光学显微镜下鉴定花粉的种类和计数,并对花粉数据进行统计。结果:呼和浩特市4区5旗县全年每个月均有气传致敏花粉飘散,年花粉量是24 850~50 154粒/1 000 mm 2,主要致敏花粉月分布呈现双峰,春季(3~5月份)以树木花粉为主,主要包括杨属(18.29%)、榆属(8.36%)、松属(6.20%)、柏科(5.23%)、桦木科(2.73%)、柳属(1.80%)、栎属(1.16%);夏秋季(7~9月份)以杂草花粉为主,主要包括蒿属(42.73%)、藜科/苋科(7.46%)、禾本科(2.26%)、葎草属/大麻属(0.60%)。 结论:呼和浩特市4区5旗县气传主要致敏花粉呈现春季和夏秋季两个高峰,春季以树木花粉为主,秋季以杂草花粉为主,蒿属花粉为呼和浩特市最主要致敏花粉。
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编辑人员丨1天前
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基于网络药理学预测中药在抗卡波西肉瘤血管生成治疗中的潜在有效成分及分子作用机制
编辑人员丨1天前
目的:基于网络药理学方法分析中药抗卡波西肉瘤血管生成的潜在有效成分及分子作用机制,预测中药在抗卡波西肉瘤血管生成中的关键靶点和信号通路。方法:根据既往网络药理学研究结果,利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取虎杖、桑白皮、土茯苓、紫苏子的主要化学成分和靶点;通过GeneCard、OMIM、DrugBank、TTD数据库检索获取血管生成及卡波西肉瘤治疗靶点,构建韦恩图,得到卡波西肉瘤与抗血管生成药物成分相互作用的靶点;利用STRING 11.5平台构建蛋白质互作模型;应用Cytoscape3.6.0软件构建成分-靶点网络,并进行可视化。同时利用Metascape平台对核心靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。最后将得到的主要活性成分和核心靶点进行分子对接验证。结果:抗卡波西肉瘤血管生成药物的核心成分为白藜芦醇[连接度(degree)142]、槲皮素(degree:141)、山柰酚(degree:56)、木樨草素(degree:56)、β谷甾醇(degree:37)、花生四烯酸(degree:36)、柚皮素(degree:36)等,核心靶点是前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)。利用KEGG分析筛选出抗卡波西肉瘤血管生成相关的重要通路为癌症信号通路;GO分析显示在生物学过程中靶点主要集中在细胞迁移的正调控。分子对接结果显示白藜芦醇、槲皮素、山柰酚和木樨草素与PTGS2均有较好的亲和力,其中槲皮素和木樨草素与PTGS2结合能力最高,结合能分别为-9.4、-9.5 kcal/mol。结论:本研究表明中医药百科全书数据库所录入的4种中药可能通过调控癌症信号通路,作用于PTGS2等靶点发挥抗血管生成作用,从而预测了中药抗卡波西肉瘤血管生成的可能作用机制。
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编辑人员丨1天前
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南昌市某医院变应性鼻炎季节性花粉变应原初步分析
编辑人员丨1天前
分析南昌市变应性鼻炎(allergic rhinitis,AR)患者季节性花粉变应原谱,为完善季节性AR的临床诊治、预防及流行病学研究提供依据。采用回顾性分析2020年9月至2021年8月就诊于南昌大学第一附属医院耳鼻喉科门诊AR患者(共1 752人,其中男性1 069人,女性683人,年龄范围2~84岁)的变应原皮肤点刺试验(skin prick test,SPT)结果,应用SPSS 22.0软件对比分析患者主要变应原阳性率及其在性别、年龄、不同就诊月份之间的差异,组间差异采用student t检验、Wilcox秩和检验或 χ2检验方法比较。结果显示,1 752例 SPT阳性结果患者中,单纯季节性AR、常年性合并季节性AR人数分别为102(5.82%)和281(16.04%);单纯季节性花粉变应原阳性在男、女性之间差异无统计学意义( χ 2=2.181, P>0.05),但男性常年性室内合并季节性花粉变应原阳性率高于女性( χ 2=7.901, P<0.05)。季节性花粉变应原阳性率前5位依次为柳树(6.62%,116/1 752)、葎草(5.71%,100/1 752)、油菜(5.54%,97/1 752)、灰藜(4.62%,81/1 752)和桦树(3.60%,63/1 752)。常年性室内和季节性花粉变应原阳性率在不同年龄组中均呈现先增高后下降趋势,其中季节性花粉变应原阳性率最高的年龄段为31~40岁,与其他组比较差异均有统计学意义( χ 2=61.269, P<0.05)。季节性过敏原阳性率在时间上呈现两个高峰:3—5月份和9—11月份。单一花粉过敏者,春季花粉阳性率为60.27%(132/219),显著高于秋季花粉阳性率39.73%(87/219)( χ2=9.247, P<0.05);多种花粉过敏者,春秋两季花粉组合阳性率为68.29%(112/164),显著高于单纯春季花粉阳性率18.9%(31/164)和单纯秋季花粉阳性率12.8%(21/164)( χ2=14.731, P<0.05)。综上,南昌市地区的花粉过敏状况不容忽视,占AR总人数的20%以上。南昌市地区季节性AR发病呈现出2个高峰(3—5月份与9—11月份)。南昌市地区季节性AR以柳树、葎草、油菜、灰藜、桦树等为常见变应原。
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编辑人员丨1天前
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营养对炎症因子或氧化应激等人体免疫相关生物标记物的影响
编辑人员丨1天前
目的:系统回顾有关营养素、食物和膳食模式对机体炎症因子或氧化应激标记物水平的影响。方法:以营养素、食物、膳食、膳食结构、膳食模式、蛋白质、脂肪、维生素、膳食纤维、炎症、炎性、氧化应激、免疫力、免疫等作为中文检索词,以nutrients、nutrition、food、diet、dietary structure、dietary patterns、protein、fat、vitamin、dietary fiber、immune、immunity、inflammatory、inflammation、oxidative stress等作为英文检索词,分别对万方数据库、中国知网、PubMed和Web of Science等数据库从建库至2020年1月10日收录文献进行系统检索,对符合要求的文献进行系统综述。结果:共纳入3篇中文文献和46篇英文文献。β-胡萝卜素、维生素C、维生素D、多不饱和脂肪酸、部分氨基酸、膳食纤维、异黄酮、胆碱、甜菜碱和白藜芦醇等营养素可降低血浆炎症因子或氧化应激标记物水平,而胆固醇、反式脂肪酸等营养素则可升高其水平。鱼类、精瘦肉、水果、大豆、十字花科蔬菜和坚果等食物可降低血浆炎症因子或氧化应激标记物水平,而牛奶、含糖饮料等食物可提高其水平。地中海膳食模式和其他健康化膳食模式均可降低血浆炎症因子或氧化应激标记物水平,而西方膳食模式可升高其水平。结论:营养素、食物和膳食模式均可对血浆炎症因子或氧化应激标记物水平产生影响。
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编辑人员丨1天前
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白藜芦醇对卵巢颗粒细胞损伤的保护作用及机制
编辑人员丨3周前
卵巢储备功能减退(diminished ovarian reserve,DOR)是指女性卵巢内可募集卵母细胞数量减少,并见质量下降的一种病理状态(AMH<1 mg·L-1;AFC<10 个;FSH≥ 10 IU·L-1),发病率约为10%,并呈现年轻化趋势[1].DOR最终会导致各种激素的异常,女性生育能力降低,不孕等[2].现今对于DOR患者最有效的方法仍是辅助生殖技术.但事实上仍有一些患者排斥包括辅助生殖技术在内的外科手术方式而选择保守治疗,现今对DOR的治疗并不能满足所有患者的需求,临床上常用的治疗DOR的药物有潜在的副作用,而辅助生殖技术由于成本高,并非大多数患者的首选.因此,探索DOR的作用机制,开发健康无害的治疗方法具有重要的科学意义和社会意义.
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编辑人员丨3周前
