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增强CT灰度共生矩阵预测cN0期甲状腺乳头状癌中央区淋巴结转移
编辑人员丨1周前
目的 探讨增强CT灰度共生矩阵预测cN0期甲状腺乳头状癌中央区淋巴结转移的价值.资料与方法 回顾性分析2020年1月—2021年12月徐州市中心医院经临床、手术病理确诊的cN0期甲状腺乳头状癌患者55例,根据术后病理结果分为中央区淋巴结转移阳性组34例、阴性组21例,患者术前均行颈部CT双期增强检查.采用Image J软件分别提取动、静脉期肿瘤最大层面灰度共生矩阵参数(能量、对比、相关、逆差矩、熵)并比较两组各参数的差异,使用受试者工作特征曲线评估参数的预测效能.结果 两组间动脉期能量、熵及静脉期熵差异有统计学意义(t/Z=-2.140、2.753、2.736,P<0.05),其他参数差异均无统计学意义(P>0.05).动脉期能量、动脉期熵、静脉期熵、动脉期能量动脉期熵联合预测中央区淋巴结转移的曲线下面积分别为 0.672、0.706、0.686、0.734,动脉期能量动脉期熵联合预测效能最佳,敏感度和特异度分别为 76.47%、66.67%.结论 增强CT灰度共生矩阵有助于术前预测cN0期甲状腺乳头状癌患者中央区淋巴结转移,动脉期参数能量联合熵的预测效能最佳.
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编辑人员丨1周前
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立体定向放疗计划验证模体在脑转移瘤HyperArc技术中的应用研究
编辑人员丨1周前
目的:探究StereoPhan(SP)模体与SRS MapCHECK(SMC)半导体矩阵用于脑转移瘤患者HyperArc(HA)计划剂量验证的可行性。方法:选取16例在北京协和医院接受HA放射治疗的脑转移瘤患者为研究对象,分别将电离室和SMC半导体矩阵插入SP模体,测量患者的HA验证计划的点剂量与平面剂量,并与治疗计划系统(TPS)计算数据对比,平面剂量的γ分析标准取2 mm/3%、2 mm/2%、1 mm/3%和1 mm/2%。结果:16例患者的点剂量平均偏差是1.33%±0.84%,平面剂量γ通过率在2 mm/3%、2 mm/2%的标准下依次为99.72%±0.46%、98.93%±1.32%,在1 mm/3% 、1 mm/2%的标准下依次为98.85%±1.79%、97.13%±3.19%。结论:SP模体与SMC半导体矩阵适合用于开展脑转移瘤患者HA计划的剂量验证工作,在进行点剂量和平面剂量验证时,可以分别采用3%和1 mm/2%的分析标准。
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编辑人员丨1周前
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谷胱甘肽硫转移酶M1和谷胱甘肽硫转移酶M2在甲状腺滤泡癌中的表达及其意义
编辑人员丨1周前
目的:探讨谷胱甘肽硫转移酶M1(GSTM1)和谷胱甘肽硫转移酶M2(GSTM2)在甲状腺滤泡癌(FTC)中的表达及其临床意义。方法:收集基因表达综合(GEO)数据库中甲状腺滤泡性肿瘤基因芯片GSE82208数据,共52例样本,包括FTC 27例,甲状腺滤泡性腺瘤(FA)25例。提取基因矩阵数据并整理,利用R语言Limma包筛选出FTC和FA间差异表达基因。收集2000年1月至2020年12月辽宁省丹东市第一医院手术切除的FTC及FA标本各56例。采用免疫组织化学SABC法检测FTC和FA标本中GSTM1、GSTM2蛋白的表达水平,分析二者与FTC患者临床病理因素间的关系及二者间的相互关系。结果:基于GEO数据库数据,共获得40个FTC和FA间差异表达基因;其中FTC中表达上调9个,分别为GSTM1、GSTM2、COL6A2、CUX2、CLUH、TSC2、OGDHL、ACADVL、SDHA;表达下调31个。免疫组织化学法检测显示,在手术切除FTC标本中,GSTM1、GSTM2阳性率分别为71.4%(40/56)、80.4%(45/56),在FA中阳性率分别为23.2%(13/56)、14.3%(8/56),差异均有统计学意义( χ2值分别为26.11、49.03,均 P<0.01)。FTC中GSTM1和GSTM2蛋白表达与临床分期、浸润程度及远处转移均有关(均 P<0.05),与性别、年龄和肿瘤长径均无关(均 P>0.05)。FTC中GSTM1和GSTM2表达呈正相关( r=0.384, P=0.004)。 结论:FTC中GSTM1和GSTM2表达水平升高,二者可能相互作用,参与FTC的发生、发展。
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编辑人员丨1周前
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血清淀粉样蛋白A1通过抑制血小板反应蛋白4表达促进胰腺导管腺癌细胞的增殖和转移
编辑人员丨1周前
目的:探讨血清淀粉样蛋白A1(SAA1)调控胰腺导管腺癌(PDAC)细胞的增殖和转移能力及相应的机制研究。方法:通过从基因表达综合数据库(GEO)数据库下载GSE71729数据集中正常胰腺组织、原位PDAC和肝转移的PDAC组织的RNA表达矩阵数据并使用R软件筛选差异表达基因,设计构建SAA1的小干扰RNA(siRNA)在PDAC细胞中沉默SAA1的表达并通过实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)、细胞计数试剂盒(CCK-8)、Transwell和蛋白质印迹法(Western blot)等实验检测沉默SAA1对PDAC细胞增殖和转移能力的调控作用并探寻作用机制,构建转染沉默SAA1且包含荧光素酶的慢病毒(sh-SAA1)的PDAC细胞并对裸鼠进行皮下及尾静脉注射检测增殖和转移能力变化。两组间数据比较使用独立样本 t检验。 结果:在GSE71729数据集中,原位PDAC组织中SAA1表达量显著高于正常胰腺组织且在肝转移的PDAC组织中表达量进一步增高(logFC=3.08、4.62, P<0.05),在PDAC细胞系PANC-1和CFPAC-1中沉默SAA1,沉默SAA1组SAA1表达量低于对照组(0.584±0.038、0.529±0.032比1.045±0.092, t=6.555、7.499, P<0.01;0.470±0.032、0.501±0.048比1.010±0.086, t=8.334、7.339, P<0.01),沉默SAA1组细胞增殖低于对照组(2.254±0.158、1.959±0.144比3.214±0.127, t=8.192、11.330, P<0.01;1.303±0.092、1.591±0.115比2.293±0.116, t=11.600、7.456, P<0.01)、沉默SAA1组细胞迁移低于对照组[(137.667±11.441)、(231.000±11.518)个比(775.333±44.289)个, t=19.710、16.820, P<0.01;(241.667±24.851)、(140.000±21.649)个比(650.000±15.895)个, t=19.580、26.850, P<0.01],沉默SAA1组细胞侵袭低于对照组[(140.667±15.326)、(321.000±20.833)个比(735.000±23.930)个, t=15.640、14.950, P<0.01;(262.333±17.172)、(275.000±17.205)个比(556.667±20.336)个, t=29.580、18.450, P<0.01]。动物实验结果同样显示沉默SAA1组成瘤体积低于对照组[(828.800±66.110) mm 3比(1 345.000±46.904) mm 3, t=12.740, P<0.01],沉默SAA1组成瘤重量低于对照组[(0.656±0.154) g比(1.066±0.125) g, t=4.137, P<0.01]。使用GSEA分析SAA1发挥作用的机制,结果显示SAA1高表达与细胞外基质受体互作通路相关(NS=0.45, P<0.05)且沉默SAA1组血小板反应蛋白4(THBS4)表达量低于对照组(1.725±0.239比7.285±2.181, t=2.546, P<0.01),沉默SAA1组基质金属蛋白酶-2(MMP-2)和基质金属蛋白酶-9(MMP-9)表达低于对照组(1.681±0.584比2.741±1.052, t=4.148, P<0.01;5.645±0.647比7.116±1.375, t=3.764, P<0.01)。 结论:在PDAC细胞中,高表达的SAA1通过抑制THBS4促进MMP-2和MMP-9表达从而增强PDAC的增殖和转移能力。
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编辑人员丨1周前
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高校跨学科实体机构管理体制与运行机制的分析与探讨
编辑人员丨1周前
目的:本文旨在分析探讨合理有效的高校跨学科实体机构运行与管理机制。方法:采用案例分析法,研究国外高水平研究型大学建设成熟的跨学科实体研究机构的运行与管理机制,为国内高校跨学科研究机构的良好运行及科学管理提出参考性意见与建议。结果:国外高水平研究型大学跨学科实体机构多具有人才组织形式灵活、科研平台共享机制充分以及与产业界密切合作的特点,有效促进了跨学科知识的产生、传播及转化的全过程与良性循环,驱动跨学科实体机构的高效运转。同时,科学合理的管理办法与评估体系为管理体制提供了有力支撑。结论:国内高校跨学科实体机构应采取矩阵式、灵活的人才团队组建方式,真正实现多元化背景的人才流动,提升交叉学科发展的内在驱动力;建立实质性资源共享机制,促进跨学科研究共同体的建立;探索"外延式"知识转移机制,促进与企业的协同创新;在充分考虑交叉学科研究关键因素的前提下形成科学明确的机构管理办法与评价体系。
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编辑人员丨1周前
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90Y PET/CT显像技术初探:1例报告
编辑人员丨1周前
患者男,49岁,身高170 cm,体质量60 kg,2021年12月肠镜检查提示结肠癌,遂行结肠癌根治术,术后病理示结肠中分化腺癌淋巴结转移(3/46),术后行辅助化疗4次,后口服卡培他滨3个疗程。2022年5月本院复查CT示右肝门脉右支及腔静脉之间结节灶;MRI示下腔静脉前方占位,考虑为转移灶,诊断为结肠癌肝转移。入院行 90Y树脂微球治疗。为预测微球在肿瘤病灶和肺内的分流情况,治疗前行 99Tc m-聚合白蛋白(macroaggregated albumin, MAA;上海欣科医药有限公司提供)SPECT/CT(美国GE Discovery 670型)显像,结果显示右肝肿瘤高度摄取,平均靶/本底比值为17.47;两肺弥漫轻度摄取,提示存在肺分流,肺分流分数为6%;余脏器未见异常摄取(图1),表明可以行经动脉内 90Y树脂微球放射治疗转移性肝癌。该治疗方法经浙江省肿瘤医院医学伦理委员会审批[批件号:IRB-2022-17号(医)]。经动脉内 90Y树脂微球(0.4 GBq;Sirtex Singapore Manufacturing Pte Ltd.提供)放射治疗后3 h,行PET/CT(美国GE Discovery 710型)显像:患者取仰卧位,头先进,视野包括肺和肝脏3个检查床位;先行螺旋CT扫描(管电压120 kV、自动管电流150~250 mA、螺距0.984∶1,采用迭代法重建,窗位40、窗宽400、扫描视野50 cm、层厚3.75 mm),再行三维PET显像[步进式扫描,每个床位采集20 min,床位重叠(overlap) 11 mm、扫描视野70 cm,采用迭代法重建,重建算法为VUE Point,2次迭代、12个子集、矩阵192×192、截止频率7.0 mm],利用CT数据对PET图像进行衰减校正、同机融合得到融合图像。PET/CT融合图像示肝右叶下腔静脉前方软组织肿块内见显像剂明显浓聚,周围肝组织可见极少量显像剂分布,余肝脏及两肺未见明显显像剂浓聚(图2)。
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编辑人员丨1周前
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甲状腺乳头状癌伴颈部淋巴结转移的免疫细胞浸润模式及预后分析
编辑人员丨1周前
目的:探讨甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma, PTC)伴淋巴结转移(lymph node metastasis, LNM)的免疫细胞浸润模式,并分析其与临床特征及预后的相关性。方法:从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas, TCGA)数据库获取PTC患者的RNA-seq数据及临床病例资料,据纳入排除标准,PTC伴颈部LNM组85例,对照组23例;从CIBERSORT下载22种免疫细胞基因表达矩阵,利用CIBERSORT反积卷法计算免疫细胞在PTC LNM患者甲状腺癌组织及正常甲状腺组织中的浸润情况,比较免疫细胞在PTC LNM患者的甲状腺癌组织与正常甲状腺组织的差异,评估在PTC LNM患者中甲状腺癌组织的免疫细胞浸润模式与临床特征(年龄、性别、腺外浸润、TNM分期)间的相关性,通过Kaplan-Meier分析评估与PTC LNM患者预后相关的免疫细胞。结果:免疫细胞浸润分析结果显示,幼稚B细胞、记忆B细胞、CD8 +T细胞、M1巨噬细胞、活化的肥大细胞及嗜酸性粒细胞在PTC LNM患者的甲状腺癌组织中浸润下调;M0巨噬细胞、M2巨噬细胞、静息状态树突状细胞、活化树突状细胞及静息状态肥大细胞在PTC LNM患者的甲状腺癌组织中浸润上调。其中,M0巨噬细胞,M2巨噬细胞,静息状态树突状细胞浸润丰度与PTC LNM患者的甲状腺癌腺外浸润,TNM分期呈正相关,且浸润丰度高的患者无进展生存率较浸润丰度低的患者差。而幼稚B细胞,CD8 +T细胞与患者的腺外浸润、TNM分期呈负相关,且浸润丰度高的患者预后较浸润丰度低的患者好。 结论:PTC LNM患者的免疫细胞浸润模式具有一定的特异性,并与患者的临床特征和预后相关。本研究为免疫细胞微环境在PTC LNM中的作用提供理论基础和新的见解。
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编辑人员丨1周前
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基于术前增强CT影像特征的胆囊癌神经浸润随机森林预测模型的构建
编辑人员丨1周前
目的:基于术前增强CT影像特征构建胆囊癌患者神经浸润无创识别的随机森林预测模型。方法:回顾性分析2022年1月至2023年12月于西安交通大学第一附属医院行意向性根治性切除术的180例胆囊癌患者的临床资料,其中男性61例,女性119例,年龄(65.3±10.2)岁。将180例患者分为训练集( n=126)和测试集( n=54),依据神经浸润情况,126例训练集患者分为神经浸润组( n=33)和非神经浸润组( n=93),54例测试集患者中神经浸润者15例,非神经浸润者39例。收集患者的性别、年龄、神经浸润、肿瘤糖类抗原19-9(CA19-9)水平、肿瘤分期等临床资料。多因素logistic回归模型分析胆囊癌神经浸润的危险因素。使用Python软件中的"feature_importance"包对临床变量与神经浸润的相关性进行重要度排序。建立胆囊癌神经浸润的随机森林预测模型,并采用受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)及混淆矩阵评估模型的预测能力。 结果:多因素logistic回归模型分析显示,CA19-9>39.0 U/ml( OR=5.165,95% CI:1.650~16.174)、T3分期( OR=6.037,95% CI:1.571~23.197)、T4分期( OR=9.996,95% CI:2.177~45.898)及淋巴结转移( OR=7.829,95% CI:2.705~22.627)的胆囊癌患者,神经浸润发生的风险高(均 P<0.05)。重要度排序中排名前3位的因素依次为:CA19-9、淋巴结转移、T分期。结合多因素分析及重要度排序结果,选择CA19-9、淋巴结转移及T分期建立胆囊癌神经浸润的随机森林预测模型。ROC曲线分析结果显示,随机森林模型在训练集和测试集中的AUC分别为0.8250和0.7667。混淆矩阵结果显示,随机森林模型在训练集和测试集中的灵敏度分别为75.76%和73.33%,特异度分别为80.65%和76.92%,准确度分别为79.36%和75.93%。 结论:基于术前增强CT影像特征建立的随机森林预测模型可作为胆囊癌患者神经浸润的无创识别手段。
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编辑人员丨1周前
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FOLFOX方案一线治疗转移性结直肠癌的人工神经网络疗效预测模型构建
编辑人员丨1周前
目的:构建预测FOLFOX方案(奥沙利铂+亚叶酸钙+氟尿嘧啶)一线治疗转移性结直肠癌(mCRC)疗效的人工神经网络模型。方法:从美国国家生物信息中心的基因表达汇编(GEO)数据库获取1组FOLFOX方案一线治疗mCRC的数据(GSE104645)作为训练集,其中FOLFOX方案疗效敏感组(完全缓解和部分缓解患者)31例,耐药组(疾病稳定和疾病进展患者)23例。将训练集样本按7∶3分为内部训练样本和内部测试样本。以福建医科大学附属协和医院结直肠外科采用FOLFOX方案一线治疗的30例mCRC患者的芯片数据集(GSE69657)作为外部验证样本,其中敏感组13例,耐药组17例。运用R 3.5.1软件Combat包对两套矩阵的表达值进行批间差校正。运用GEO2R平台对GSE104645中敏感组和耐药组的基因表达进行差异分析,以 P<0.05且|log 2FC|>0.33(FC为差异倍数)为阈值,筛选FOLFOX方案的耐药基因和敏感基因。采用多层感知器方法对GSE104645数据集进行FOLFOX方案疗效的人工神经网络模型构建。然后,以外部验证样本进行回代验证。采用受试者工作特征(ROC)曲线对所建模型的预测能力进行评价。 结果:基于GSE104645数据集,共筛选出2 076个差异基因,其中822个基因在耐药组上调,1 254个基因下调,下调基因为敏感基因。基因本体论(GO)分析显示,差异基因主要富集在物质代谢的调控过程中。所构建的人工神经网络模型共纳入39个基因,包含2个隐藏层。其在训练集中预测训练样本和测试样本的准确度分别为75.7%和76.5%,ROC曲线下面积为0.875。回代验证显示,外部验证样本的ROC曲线下面积为0.778。结论:基于芯片数据成功建立了人工神经网络预测模型,模型稳定性好,预测FOLFOX方案一线治疗mCRC疗效的效能强。与奥沙利铂耐药相关的基因功能主要富集在物质代谢的调控过程中。
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编辑人员丨1周前
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基于配对样本间的聚鸟嘌呤基因型差异构建结直肠癌系统进化树
编辑人员丨1周前
目的:探讨结直肠癌(CRC)原发灶和淋巴结转移灶的肿瘤内异质性空间分布及其与转移的关系。方法:2017年1—12月在天津医科大学总医院普通外科接受手术切除并伴有区域淋巴结转移的原发性CRC患者20例。对患者手术切除组织的蜡块进行连续切片,经Histogene染色后行显微切割,获取原发肿瘤组织样本、淋巴结转移组织样本和正常组织样本。提取DNA,采用多重PCR扩增及毛细管电泳检测配对样本的聚鸟嘌呤(Poly-G)基因型。分析临床病理特征与Poly-G突变频率的关系。基于配对样本间的Poly-G基因型差异计算距离矩阵,构建CRC系统进化树。结果:共检测20例患者的237个样本,其中134个原发肿瘤组织样本,66个淋巴结转移组织样本,37个正常组织样本,每例患者均检测出Poly-G突变。肿瘤低、未分化患者的Poly-G突变频率[(74.10±23.11)%]高于高、中分化患者[(31.36±12.04)%, P<0.001],微卫星不稳定患者的Poly-G突变频率[(68.19±24.80)%]高于微卫星稳定患者[(32.40±14.90)%, P=0.003)],Poly-G突变频率与患者的性别、年龄、病理分期无关(均 P>0.05)。基于配对样本的Poly-G基因型差异构建了20例患者的系统进化树,能明确显示患者肿瘤的进化过程和淋巴结转移的亚克隆来源。 结论:CRC原发灶和淋巴结转移灶的肿瘤内异质性普遍存在。Poly-G突变积累于CRC的发生发展过程中,并广泛存在于CRC的原发灶和淋巴结转移灶,可作为遗传标志物构建系统进化树,高效、便捷地展示CRC肿瘤内异质性的空间分布和转移途径。
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编辑人员丨1周前
