目的 探讨新型冠状病毒感染后肺纤维化的发病机制,并基于逆向网络药理学思维进行中药组方预测.方法 获取COVID-19和PF靶点取交集得出二者共有靶点后进行蛋白互作网络,确定关键靶点,进行GO和KEGG富集分析明确发病机制与通路.由关键靶点逆向收集中药成分,进行分子对接验证,再由成分收集中药,整理其性、味、归经.结果 获取142个COVID-19与PF的共有靶点,筛选后有18个关键靶点匹配到31种中药成分,进行28次分子对接验证,结果稳定.逆向收集287种中药,以寒性药、苦味药、肝、肺经居多,高度值中药为苦参、连翘、木蝴蝶、山豆根.结论 本研究运用逆向网络药理学思维及分子对接对COVID-19后PF进行靶点、通路、成分和中药预测,为今后临床中药组方拓宽思路.

目的 运用网络药理学和分子对接技术,探讨黄芪桂枝五物汤治疗强直性脊柱炎(AS)的分子机制.方法 按照黄芪桂枝五物汤的组成,在TCMSP数据库上搜索其化学成分和作用靶点,并对药物靶点进行基因注释;分别从Gene Cards、OMIM、PharmGkb、TTD和DrugBank五个数据库中搜索AS疾病相关靶点.然后利用Cytoscape 3.8.0软件将药物、活性化学成分、药物与疾病交集靶点三者构建"中药-活性有效成分-交集靶点"可视化网络;将可视化网络数据导入String数据库,构建蛋白互作网络;利用R语言软件和R包对结果进行GO和KEGG富集分析;最后对核心有效成分和核心靶点进行分子对接.结果 共获取黄芪桂枝五物汤活性化合物74个,根据疾病-中药汤剂共有的靶标逆向筛选中药汤剂活性成分后,剩余32个,预测出对应靶点997个;AS疾病相关靶点2234个,交集靶点78个;利用CytoNCA插件二次打分后,共筛选得到8个核心靶点.GO富集分析共获得1990条结果,KEGG富集分析共获得135个结果;分子对接结果表明,核心有效成分与核心基因的靶点能够稳定对接.结论 黄芪桂枝五物汤治疗AS是通过槲皮素、芍药苷、山奈酚等多种成分作用于PTGS2、IL6、TNF、VEGFA、IL1B、ICAM1、STAT1、CXCL8等多个基因靶点,从而影响"脂质和动脉粥样硬化""AGE-RAGE信号通路""IL-17信号通路""TNF信号通路""NF-kappa B信号通路"等多条相关通路发挥作用.

目的 探讨芪参益气滴丸对ApoE基因敲除小鼠动脉粥样硬化中Th17细胞的作用及基于网络药理学的靶点分析.方法 选择芪参益气滴丸有效成分作为目标化学成分,输入其化学结构至MetaDrug预测软件,按照口服利用度、类药性为筛选条件对化合物进行筛选,通过逆向分子对接,进而找到相对应的靶标,构建芪参益气滴丸有效成分—Th17细胞靶标网络.将ApoE-/-小鼠分为三组,给予高脂喂养和不同剂量芪参益气滴丸干预,8周后比较动脉粥样硬化损伤面积,并检测芪参益气滴丸有效成分—Th17细胞靶标蛋白的表达.结果 芪参益气滴丸有效成分包括黄芪甲苷、三七皂苷R1、丹酚酸B、丹酚酸A、丹参素、原儿茶醛、迷迭香酸、人参皂苷Rg1、人参皂苷Rb1、毛蕊异黄酮、刺芒柄花素7-羟基-4′-甲氧基异黄酮,各成分最终靶点数量分别为114、29、28、25、17、13、29、35、31、14、21.25个与Th17细胞分化相关蛋白被确认为靶点蛋白,多条信号通路参与了芪参益气滴丸干预Th17细胞分化过程.组织病理学分析证实芪参益气滴丸可显著减少动脉粥样硬化损伤面积.蛋白印迹实验验证了芪参益气滴丸可以调节TGF-β信号通路、JAK/STAT信号通路中的关键蛋白.结论 芪参益气滴丸可通过干预TGFβ信号通路和JAK/STAT信号通路、减少Th17细胞分化、抑制动脉粥样硬化.

目的 通过网络药理学和动物模型验证的方法逆向研究泻白散对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在治疗 作用.方法 首先在中药系统药理数据库分析平台筛选泻白散的活性成分;然后使用STITCH和Swiss Target Prediction数据库筛选活性成分的作用靶点;再通过GeneCards、CTD和OMIM数据库筛选COVID-19的疾病靶点;将药物靶点与疾病靶点映射后筛选出交集靶点,再将交集靶点构建PPI网络与活性成分-共同靶点网络,并对其进行GO和KEGG富集分析.最后使用Autodock Vina对核心成分与关键靶点进行分子对接验证,并使用急性肺损伤大鼠模型对泻白散的免疫调节作用进行动物试验验证.结果 泻白散的核心活性成分为槲皮素,山奈酚,柚皮苷和异鼠李素;其作用于COVID-19的潜核心作用靶点为IL-8、IL-10、MAPK3、MAPK8和TNF-α,候选靶点富集的通路包括TNF-α、Toll样受体和NOD样受体信号通路等免疫相关代谢途径;泻白散可降低急性肺损伤大鼠模型血中免疫蛋白IgA、IgM、IgG以及细胞因子IL-8、IL-10、MAPK3、MAPK8和TNF-α的含量.结论 泻白散可能通过调控TNF信号通路、NOD样受体和Toll样受体等免疫信号通路来治疗COVID-19引起的免疫因子风暴.本研究结果为开发治疗新型冠状病毒肺炎的中药新药提供了新的思路和理论基础.