目的:了解我国食源性金黄色葡萄球菌（金葡菌）的种群结构。方法:通过全基因组测序方法对2006-2020年我国16个省份收集的763株食源性金葡菌进行多位点序列分型、葡萄球菌蛋白A编码基因（ spa）和葡萄球菌染色体 mec基因盒（SCC mec）分型，使用BioNumerics 7.5软件创建基于ST类型的最小生成树。国外进口食品分离到的金葡菌31株被纳入基因组系统发育树的构建。 结果:763株金葡菌共鉴定出90个ST型和160个 spa型别，其中20种为新ST型别。72个（72/90，80.0%）ST型属于22个克隆群，其中主要型别为CC7、CC1、CC5、CC398、CC188、CC59、CC6、CC88、CC15和CC25，占82.44%（629/763）。其中优势克隆群中ST型和 spa型别随着时间的变化呈多态性变化。耐甲氧西林金葡菌（MRSA）的阳性率为7.60%，共鉴定出7种SCC mec型别，以ST59-t437-Ⅳa（17.24%，10/58）、ST239-t030-Ⅲ（12.07%，7/58）、ST59-t437-Ⅴb（8.62%，5/58）、ST338-t437-Ⅴb（6.90%，4/58）和ST338-t441-Ⅴb（6.90%，4/58）为主。本研究分离株在系统发育树上被分为2个种群分支，命名为Clade1和Clade2，相同克隆群、ST型和 spa型别的菌株呈聚集分布。Clade1全部为CC7甲氧西林敏感菌株，Clade2中包括21种克隆群和所有MRSA菌株，MRSA菌株按照SCC mec和ST型呈聚集分布。CC398、CC7、CC30、CC12和CC188中的国外分离株与我国分离株进化关系较远。 结论:本研究中食源性菌株主要优势克隆群型别为CC7、CC1、CC5、CC398、CC188、CC59、CC6、CC88、CC15和CC25，与既往报道的我国医院、社区感染和食物中毒的克隆群存在重叠现象，这提示食品作为病原体社区传播和食物中毒的载体，需高度关注。

目的:分离提纯1株新型耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）的噬菌体，并对其基因组学信息和生物学特性进行分析。方法:采用实验研究方法。取分离自陆军军医大学（第三军医大学）第二附属医院收治的1例胸骨正中切口感染的63岁女性患者创面的MRSA（下称宿主菌）液，采用污水共培养法和双层琼脂平板法从该院污水中分离提纯得到噬菌体，并命名为噬菌体SAP23，观察噬菌斑形态。采用磷钨酸负染法将噬菌体SAP23染色，采用透射电子显微镜观察其形态。采用十二烷基磺酸钠/蛋白酶裂解方案制备噬菌体SAP23 DNA，在Illumina NovaSeq PE150平台下进行全基因组测序，并完成序列组装、注释、系统发生树等基因组学分析。将噬菌体SAP23液分别按10.000 0、1.000 0、0.100 0、0.010 0、0.001 0、0.000 1感染复数与宿主菌液共培养4 h后，采用点滴法测定噬菌体效价，筛选最佳感染复数，此处及以下样本数均为3。按测得的最佳感染复数取噬菌体SAP23液与宿主菌液分别共同孵育5、10、15 min后，同前测定噬菌体效价，筛选最佳吸附时间。按测得的最佳感染复数取噬菌体SAP23液与宿主菌液按最佳吸附时间孵育后，分别于培养0（即刻）、5、10、15、20、30、40、50、60、80、100、120 min，同前测定噬菌体效价，绘制一步生长曲线。取噬菌体SAP23液分别在温度为4、37、50、60、70、80 ℃下，在pH值为2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12下孵育1 h，测定稳定性。取陆军军医大学（第三军医大学）微生物教研室储存的41株MRSA，完成噬菌体SAP23的宿主谱范围检测。结果:噬菌体SAP23能在宿主菌双层琼脂板上形成透明噬菌斑。噬菌体SAP23头部是直径为（88±4）nm的多面体，其尾部长度为（279±21）nm、宽度为（22.6±2.6）nm。噬菌体SAP23基因组为全长151 618 bp的线状双链DNA，序列两端有11 681 bp的长末端重复序列，预测出220个开放阅读框，噬菌体可编码4个转运RNA，未预测出毒力因子或抗性基因，注释功能的噬菌体SAP23基因可分为5个组，GenBank登录号为MZ427930，噬菌体SAP23全基因组序列与共线性分析中的6个葡萄球菌噬菌体全基因组序列有5个局部共线区域，但在局部共线区域内部或外部存在差异。噬菌体SAP23属于 Herelleviridae科 Twortvirinae亚科 Kayvirus病毒属。噬菌体SAP23的最佳感染复数为0.010 0，最佳吸附时间为10 min，潜伏期约为20 min，裂解期约为80 min；在4~37 ℃温度条件及pH值为4~9的条件中，稳定性较好。噬菌体SAP23可裂解41株MRSA中的3株。 结论:噬菌体SAP23为 Herelleviridae科 Twortvirinae亚科 Kayvirus病毒属成员，潜伏期短，其对温度和酸碱耐受性好，可有效裂解MRSA，为不含毒力因子和抗性基因的新型烈性窄谱噬菌体。

目的 分析学龄前儿童下呼吸道感染危险因素及与单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1)基因多态性的关联.方法 选取山东第一医科大学附属人民医院2021年3月-2023年3月治疗的下呼吸道感染学龄前患儿126例为研究组,152名同期健康体检学龄前儿童为对照组.分析下呼吸道感染病原菌分布,多因素分析学龄前儿童下呼吸道感染的危险因素,比较两组MCP-1基因2518位点A/G基因分布.结果 感染患儿共分离出128株病原菌,革兰阴性菌(88株占68.75％),革兰阳性菌(40株占31.25％);哮喘、早产、每周零食摄入≥7次、家长吸烟、低出生体质量、外周血MCP-1表达水平较高均为学龄前下呼吸道感染的独立危险因素(P＜0.05);两组研究对象MCP-1基因2518位点A/G基因型及等位基因频率比较差异无统计学意义.结论 学龄前儿童下呼吸道感染病原菌以流感嗜血杆菌、金黄色葡萄球菌为主,与哮喘、早产、每周零食摄入≥7次、家长吸烟、低出生体质量、外周血MCP-1表达水平密切相关,与MCP-1基因分布无相关性.

目的 了解猩红热样病例中金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的感染情况,为非 A组溶血性链球菌感染导致的咽峡炎提供病因线索.方法 采集 2019-2022 年北京市某区猩红热监测病例的咽拭子样本 373 份并进行金黄色葡萄球菌分离,对分离菌株进行金黄色葡萄球菌 A 蛋白基因多态性(spa)分型和对 12 种抗生素的耐药表型检测,分析其分子特征和耐药特征.结果 373 份咽拭子样本中 SA检出率为 6.97%(26/373),男性和女性检出率分别为7.43%(15/202)和 6.43%(11/171),检出率比较差异无统计学意义(χ2 = 0.141,P= 0.839);金黄色葡萄球菌的检出病例主要在 20 岁以下人群,<6 岁、6～<11 岁、11～<16 岁、≥16 岁 4 个年龄组金黄色葡萄球菌检出率分别为 5.24%(13/248)、11.65%(12/103)、6.25%(1/16)和 0(0/6).分离到的 26 株金黄色葡萄球菌共分布 10 个spa型别,构成比前 3 位为 t652(26.92%,7/26)、t309(15.38%,4/26)、t693(11.54%,3/26)和 t571(11.54%,3/26).26 株金黄色葡萄球菌对PEN、TET、ERY、OXA、CFX耐药率分别为 92.31%(24/26)、23.08%(6/26)、19.23%(5/26)、7.69%(2/26)和 7.69%(2/26),分布 9 种耐药谱,优势耐药谱为 PEN 单独耐药(50.00%,13/26),其次为 PEN+TET 联合耐药(19.23%,5/26)和PEN+ERY联合耐药(7.69%,2/26).多重耐药率为 11.54%(3/26).结论 北京市某区猩红热监测病例中金黄色葡萄球菌检出率较高,分离株 spa分型分布多样但在短期内呈现一定聚集分布特征,且不同年份具有不同的优势型别.金黄色葡萄球菌分离株对 PEN处于高耐药水平而对 OXA和 CFX处于较低耐药水平.

目的 研究2009-2015年深圳市不同来源样本中金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)携带毒力、耐药基因、耐药表型情况和分子型别研究. 方法2009-2015年期间,86株SA分离自医院病人、医院环境涂抹样、食物中毒等样品.PCR方法检测毒力基因、而药基因以及耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)的SC-Cmec基因型,进行蛋白A基因多态性(single locus DNA-sequencing of the repeat region of the Staphylococcus protein A gene, Spa)以及多位点序列分型(multilocus sequencing typing,MLST)研究.按照美国临床和实验室标准协会(Clinical and Labo-ratory Standards Institute,CLSI)方法,对抗菌药物进行药敏试验. 结果检出21种毒力基因,55株(64.0％)携带mecA基因.SCCmec分型结果,Ⅲ型为优势型别(60.0％,33/55).86株SA分为24种Spa型,MRSA菌株Spa优势型别为t030与t437,甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌菌株(methicillin sensitive Staphylococcus aureus,MSSA)的优势型别为t091与t127.86株SA分为23种MLST型,形成3个克隆复合体CC239(27.9％)、CCnew3(27.9％)与CC188(11.6％). 结论优势型别为ST239(Spa-t030)、STnew3(Spa-t437)具有多药耐药的特征,且携带多种毒力基因.MRSA流行株、非流行株与MSSA在携带毒力与耐药基因之间均存在差异.需要加强监测SA中的优势型别及MRSA菌株.关注其耐药的动态变化.

目的 了解分离 自临床皮肤和软组织感染(SSTIs)患者携带杀白细胞素基因(pvl)社区获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(pvl+-CA-MRSA)的分子特征.方法 从SSTIs患者中分离出92株CA-MRSA.采用聚合酶链反应(PCR)和测序检测pvl基因及其突变.pvl+-CA-MRSA菌株进行序列类型(STs)与克隆复合物(CCs)、葡萄球菌盒式染色体mec(SCCmec)、葡萄球菌蛋白基因(spa)多态性、辅助基因调控子(agr)位点、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型和多位点序列分型(MLST).采用VITEK-2 Compact全自动微生物鉴定系统进行CA-MRSA药物敏感试验.结果 92株CA-MRSA中,24株(26.1％)为 pvl+-CA-MRSA,其中 91.7％(22/24)为 pvl 的 H 亚型,68 株(73.9％)为未携带 pvl基因 CA-MRSA(pvl--CA-MRSA).24 株pvl+-CA-MRSA 中,共有 8 种 STs 和 7 种 CCs,其中以 ST59(62.5％,15/24)和 CC59(70.8％,17/24)为主.pvl+-CA-MRSA菌株中,SCCmec Ⅲ和Ⅳa型分别为54.2％和33.3％,agrⅠ(87.5％,21/24)为最常见的agr等位基因,其余为agr Ⅲ;检出8种spa型,其中以t437型最为常见(66.7％,16/24).pvl+-CA-MRSA菌株对红霉素、克林霉素、四环素耐药率较高(均＞50％),对复方新诺明、环丙沙星、庆大霉素的耐药率较低(8.3％～16.7％),未发现万古霉素、利福平、莫西沙星和利奈唑啶耐药菌株.与pvl+-CA-MRSA相比,pvl--CA-MRSA对四环素耐药率较低(P＜0.05),对其它抗菌药物耐药率差异无统计学意义(P＞0.05).结论 引起SSTIs的CA-MRSA中有较高的pvl基因阳性率,pvlH2、ST59/CC59、SCCmec Ⅲ/Iva、agrⅠ 和 t437 是引起 SSTIs CA-MRSA 的优势克隆.