目的:探究2021年河南省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis, AFP)病例中非脊髓灰质炎肠道病毒(non-polio enterovirus，NPEV)的型别及流行特征。方法:收集2021年河南省报告的529例AFP病例的粪便标本，对其进行病毒分离，其中NPEV阳性毒株进行VP1区域序列测定，使用MEGA5.1软件对序列进行比对并构建遗传进化树。使用Excel2016和SPSS26软件对流行病学数据进行整理和统计学分析。结果:529例AFP病例粪便标本共分离出30株NPEV，分离率为5.67%(30/529)，其中A组和B组病毒各分离出15株，未分离出C组和D组病毒。A组包含6个血清型，以柯萨奇病毒A组(coxsackievirus A，CVA)2型和CVA6为主，B组包含3个血清型，以柯萨奇病毒B组(coxsackievirus B，CVB)3型为主。人群分布中，5岁以内的儿童NPEV的分离率最高，为76.67%(23/30)，男女比例为1.51∶1。地区分布中，A组病毒主要分布在河南省的中部、南部和西南部，以CVA2和CVA4分布最为广泛，B组病毒相对比较集中，主要分布在河南省的中部、北部和西南部，以CVB3为主。时间分布上全年除1~2月以外均能分离出NPEV，整体呈现春夏季高发，秋冬季低发的流行特征，其中A组病毒高峰期在5月份，B组病毒高峰期在6~7月。结论:2021年河南省分离的NPEV以B组CVB3为主要血清型，NPEV的病原谱以及地区分布相比2018—2019年发生了显著变化，后期应当密切关注当前NPEV的流行趋势，为AFP的诊断、监测以及维持河南省无脊髓灰质炎的状态提供理论依据。

目的:了解2019年河南省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis，AFP)病例中非脊髓灰质炎肠道病毒(non-polio enterovirus，NPEV)的型别及分布情况。方法:2019年河南省共报告AFP病例513例，每例病例采集双份粪便标本进行病毒分离，对NPEV阳性毒株进行VP1基因扩增和测序鉴定，序列的比对以及遗传进化树的构建通过MEGA5.1软件完成。使用Excel 2016和SPSS19软件对NPEV阳性毒株的流行病学数据进行统计分析。结果:从513例AFP病例中共分离出39株NPEV，分离率为7.60%(39/513)，其中18株为A组病毒，21株为B组病毒，A组和B组病毒均包含7个血清型，未分离到C组和D组病毒。A组中以柯萨奇A组病毒(coxsackievirus A，CVA)4型和CVA16为主，B组中以埃可病毒(echovirus，Echo)11型为主。NPEV阳性毒株之间的核苷酸一致性为67.4%~100.0%，与原型毒株核苷酸一致性为71.4%~85.6%。NPEV主要集中在7岁以下的散居儿童当中，分离率为84.62%(33/39)，男女性别比为2.07∶1，分离率在不同年龄组之间以及不同性别之间均无统计学差异( P>0.05)。A组病毒中CVA2、CVA4和CVA16分布比较广泛，B组病毒中Echo3、Echo11和Echo30分布比较广泛。时间上除1月份以外，全年均能分离出NPEV，其中A组病毒主要发生在4~7月，分离数占到全年的66.67%(12/18)，B组病毒主要发生在9月，分离数占到全年的28.57%(6/21)。 结论:2019年河南省分离的NPEV以B组Echo11为主要血清型，病原谱、地区分布以及不同年龄NPEV的分离率相比2018年发生了明显的变化。因此要加强监测，有针对性的进行防控，有效减少AFP的发生。

肠道病毒属于小核糖核酸病毒科,包括脊髓灰质炎病毒等多种重要人类病原体,已成为全球公共卫生安全的重大威胁之一.固有免疫是机体早期抵御病毒感染的重要防线.不同肠道病毒在进化中已经具备了多种途径躲避免疫识别或诱导固有免疫系统失活.本文重点对肠道病毒调控宿主固有免疫的相关分子机制进行综述,系统整理了肠道病毒逃避干扰素依赖与干扰素非依赖的抗病毒固有免疫防御的分子特征与作用规律,为肠道病毒致病机制的探究和抗病毒药物的研发提供参考.

目的 分析云南省2015年从急性弛缓性麻痹(AFP)病例中分离到的3株柯萨奇病毒B5(CVB5) VP1区核苷酸基因特征.方法 采集RD细胞和L20B细胞对AFP标本进行病毒分离,应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒VP1基因,目的基因送至基因公司进行序列测定;应用MEGA 6软件对分离到的病毒与基因库代表株进行进化树分析.结果 213例AFP标本中分离到23株非脊髓灰质炎肠道病毒(NPEV),包括3株CVB5;3株CVB5与原型株VP1区之间核苷酸(nt)相似性为80.7％～81.9％,氨基酸(aa)相似性为95.1％～96.5％;系统进化树结果显示,本研究分离的CVB5与山东分离株(JN712675)的nt相似性为91.7％ ～ 92％,与安徽分离株(KF751191)的nt相似性为92％～93％.结论 云南省2015年从AFP病例中分离到的3株CVB5与山东代表株(JN712675)和安徽代表株(KF751191)相似性较高.

目的 了解非脊髓灰质炎(脊灰)肠道病毒(Non-polio enterovirus,NPEV)的型别分布及分子进化特征.方法 对2011-2014年从云南省急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例中分离到的148株NPEV进行VP1完整编码区核苷酸的扩增与序列测定.所获得的云南地方株基因序列与各基因型原型株进行核苷酸与氨基酸同源性比较,并与GenBank中选取的代表株构建系统进化树.结果 在148株NPEV分离株中,肠道病毒(Enterovirus,EV)A组(EV-A)、EV-B、EV-C分别占31.1％(46株,8个血清型)、64.9％(96株,27个血清型)、4.1％(6株,3个血清型);基因进化树显示,各种血清型病毒株与对应原型株及代表株聚集;除埃可病毒10型(E-10)和EV-C96型外,云南地方株与原型株位于不同分支.在4年的流行过程中,同一个型别的分离株之间的遗传变异程度最高的是EV-C96、E-18和E-5,分别达到21.5％、21.3％和20.4％.结论 云南省存在EV多个型别的循环,需持续性监测和探索EV分子流行病学和进化规律.

目的 对2016年菏泽市15岁以下非脊髓灰质炎(脊灰)急性弛缓性麻痹(AFP)监测结果进行分析研究,评价我市非脊灰AFP诊断、治疗与保持无脊灰状态进展,为非脊灰AFP诊断、治疗与保持无脊灰状态提供科学依据.方法 根据AFP专病管理系统资料、个案调查资料、临床诊断资料和脊灰实验室病毒检测结果分析研究.结果 2016年菏泽市共报告各类AFP病例24例,无脊灰野病毒病例、脊灰疫苗衍生病毒病例和脊灰疫苗高变异病毒病例,确诊1例脊灰疫苗相关病例,均为非脊灰AFP;15岁以下儿童非脊灰AFP报告发病率为1.29/10万;分布在全市的8县区,呈高度散发状态;非脊灰AFP48小时及时调查率为100.00％;双份合格大便标本采集率87.50％;未检测到脊灰野病毒、脊灰疫苗衍生病毒和脊灰疫苗高变异病毒;分离到1株Ⅲ型脊灰疫苗变异病毒(有2个碱基对变异);脊灰疫苗病毒分离率为4.17％;COX.ECHO、EV71等非脊灰肠道病毒分离率为12.50％;引起非脊灰AFP的疾病有多种,脊髓炎、脑脊髓炎、格林巴利综合征、脑炎、其他非脊灰麻痹病例,分别占33.33％、20.83％、20.83％、8.33％、12.50％.结论 菏泽市市非脊灰AFP诊断、治疗、监测与保持无脊灰取得了较大进展,但仍有不足之处.非脊灰AFP诊断、治疗、监测与消灭脊灰工作仍需努力.仍要加强非脊灰AFP诊断、治疗和监测,进一步做好脊灰疫苗免疫策略转换,完善消灭脊灰免疫策略,严格把握Ⅰ+Ⅲ型脊灰减毒活疫苗接种禁忌症,不断提高脊灰疫苗全程接种率.

目的 分析河北省2016年脊髓灰质炎(脊灰)实验室运转情况,为维持河北省无脊灰状态提供实验室依据.方法 对河北省各市通过急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例监测信息报告管理系统报告的AFP病例及河北省脊灰实验室监测数据进行分析,对WHO要求的各项监测指标进行评价.结果 2016年河北省AFP病例监测信息报告管理系统共报告AFP病例365例,实验室收到362例AFP病例粪便标本719份,5例分离到脊灰病毒(Poliovirus,PV),分离率为1.38％;49例分离到非脊灰肠道病毒(NPEV),分离率为13.54％.分离的PV分离成单血清型共计10株,VP1区编码区核苷酸均发生了不同程度变异,但都以低个数变异为主,均为疫苗相似株(SabinLike,SL).2016年接受WHO一次病毒分离和两次型内鉴定(Intra-typic differentiation,ITD)盲样标本能力考核,实验室各项监测指标均远远超过WHO的认证标准.按WHO要求,细胞支原体检测结果均为阴性,没有受到支原体污染,细胞敏感性的评价两种细胞都对PV敏感、有效.结论 河北省脊灰实验室运转正常,没有发现脊灰野病毒(Wildpoliovirus,WPV)和疫苗衍生脊灰病毒(Vaccine-derived poliovirus,VDPV)及VDPV病例,为河北省维持无脊灰状态提供了准确、可靠的病毒学依据.

目的 研究2013年贵州省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例中非脊髓灰质炎肠道病毒(non-polio enterovirus,NPEV)的基因型别,并对分离的柯萨奇病毒A4型(coxsackievirus,CVA4)进行基因特征分析.方法 2013年贵州省共报告15岁以下AFP病例235例,采用RD细胞和L20B细胞对235例AFP病例粪便标本进行病毒分离,对分离到的NPEV进行VP1基因序列测定分型.通过MEGA7.0软件采用邻位相接法(neighbor joining method)构建遗传进化树进行基因特征分析,可靠性通过1000 bootstrap值评估.结果 235例AFP病例中共检测到24株NPEV(10.2％),有2株无法定型,另外22株共包括12个血清型,其中人类肠道病毒(human enterovirus,HEV)A组包括4个血清型6株,其中3株为CVA4,均属于C2基因亚型;HEV-B组包括7个血清型15株,1株为HEV-C组,未分离到HEV-D组病毒.结论 2013年贵州省AFP病例病原谱包括多种型别的NPEV,其中CVA4基因特征分析表明2013年贵州地区流行的CVA4毒株为C2基因亚型.

目的 分析2015-2016年河北省急性弛缓性麻痹(AFP)病例的脊髓灰质炎(脊灰)病毒检测状况,为河北省继续维持无脊灰状态提供依据.方法 收集2015-2016年河北省AFP病例粪便标本进行病毒分离和鉴定,对脊灰病毒分离株采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增VP1区基因片段,进行核苷酸序列测定和分析.结果 从665份AFP病例粪便标本中分离到脊灰病毒12株(1.80％)、非脊灰肠道病毒(NPEV) 112株(16.84％).与Sabin株相比,脊灰病毒VP1区核苷酸发生0个变异3株、1个变异6株、2个变异4株、3个变异2株、4个变异1株;在NPEV分离株中,7-8月份分离株数占47.2％.结论 2015-2016年河北省脊灰病毒分离株均为疫苗相关株,病毒核苷酸变异以低变异为主.

RIVEM是一款通过球面投射的方式在平面上绘制二十面体病毒衣壳结构的软件工具,因为开发时间较早,目前无法直接识别RCSB PDB数据库中绝大多数肠道病毒的三维结构文件.为此本研究发展了将RCSB PDB坐标体系转换到RIVEM PDB坐标体系的算法,开发了基于RIVEM的人肠道病毒衣壳表面结构绘制流程,并将该流程应用到PSGL-1和SCARB2这两个重要的肠道病毒受体的研究中.结果显示:构建的流程成功的绘制了RCSBPDB数据库中人肠道病毒的衣壳表面结构.与PyMol相比,RIVEM绘制的衣壳表面结构具有信息量更大,更便于研究衣壳与受体和抗体之间的相互作用关系等优点.对于广大非结构生物学专业的病毒学研究者来说,该流程能够促进RIVEM在衣壳与受体、抗体和抗病毒药物的相互作用、抗原表位、结构蛋白变异的监测以及肠道病毒致病机制等研究领域中的应用.该流程也能直接推广到包括脊髓灰质炎病毒、甲肝病毒和口蹄疫病毒在内的其他小RNA病毒的研究中.