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转化生长因子-β受体Ⅱ环状RNA通过调节核糖核酸结合蛋白2/胚胎致死性异常视觉样蛋白1促进前列腺癌发生发展
编辑人员丨5天前
目的:探讨前列腺癌细胞中转化生长因子-β受体Ⅱ环状RNA(circTGFBR2)调节核糖核酸结合蛋白2(PTBP2)/胚胎致死性异常视觉样蛋白1(ELAVL1)激活SMAD2信号途径促进前列腺癌发生发展。方法:利用生物信息学方法,寻找与circTGFBR2结合microRNA以及其他相关蛋白结合位点,以及与PTBP2存在相互作用的RNA结合蛋白。PC3转染pcDNA3.1-circTGFBR2后,实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)检测circTGFBR2的表达。PC3细胞过表达circTGFBR2同时敲低微小RNA(microRNA,miR)-29b,蛋白质印迹法(Western blot)检测ALK5、SMAD2及p-SMAD2表达。PC3分别转染pcDNA3.1-circTGFBR2及对照质粒后,利用circTGFBR2特异性探针进行pulldown,检测PTBP2与circTGFBR2的相互作用。过表达circTGFBR2与ELAVL1,检测细胞上皮-间充质转化(EMT)的标志基因E-钙黏蛋白(E-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)及ZMYM1表达,以及Transwell检测细胞迁移。组间比较应用单因素方差分析。结果:分析结果显示circTGFBR2存在多个miR-29b结合的位点,ALK5(又名TGFBR1)mRNA 3’端非编码区(3’UTR)同样存在miR-29b的结合位点,并证实PTBP2与另一个RNA结合蛋白ELAVL1存在相互作用。用转化生长因子-β1(TGF-β1)刺激PC3细胞发现,circTGFBR2的表达高于对照组(1.83±0.02比1.03±0.02, F=2 832.200, P<0.01)。PC3分别转染pcDNA3.1-circTGFBR2及对照质粒后,RT-qPCR检测circTGFBR2的表达,可见circTGFBR2组高于对照组(176.41±1.21比1.04±0.02, F=63 426.15, P<0.01)。应用miR-29b抑制剂或circTGFBR2处理细胞后ALK5的蛋白水平明显高于对照组,应用miR-29b抑制剂同时过表达circTGFBR2后进一步增加ALK5的表达(分别为0.15±0.01、0.48±0.02、0.55±0.01、0.74±0.01, F=1268.314, P<0.01),并且SMAD2(分别为1.14±0.02、1.28±0.02、1.42±0.01、1.5±0.25, F=4.852, P<0.01)和p-SMAD2(分别为0.18±0.02、0.36±0.01、0.65±0.01、0.94±0.02, F=1663.667, P<0.01)的磷酸化水平也呈相同趋势。Pulldown-MS实验,多个蛋白质能与circTGFBR2结合,并证实PTBP2与circTGFBR2相互作用。与对照组比较,敲低前列腺癌细胞PTBP2或过表达circTGFBR2时,间质标志基因Vimentin表达高于对照组,而上皮样标志基因E-cadherin表达低于对照组,当同时过表达circTGFBR2并敲低PTBP2会逆转上述结果(Vimentin分别为0.22±0.02、0.87±0.02、0.85±0.02、0.6±0.01, F=1319.52, P<0.01;E-cadherin分别为0.80±0.01、0.45±0.03、0.36±0.02、0.9±0.02, F=614.919, P<0.01)。当过表达circTGFBR2或高表达ELAVL1时,PTBP2与ELAVL1的相互作用减弱,细胞EMT的标志基因E-cadherin表达低于对照组,Vimentin及ZMYM1表达高于对照组,Transwell检测细胞迁移高于对照组,而当同时高表达ELAVL1及circTGFBR2时,上述趋势会进一步增强(Vimentin分别为0.22±0.02、0.87±0.02、0.85±0.02、0.6±0.01, F=1 319.52, P<0.01;E-cadherin分别为0.93±0.02、0.76±0.02、0.43±0.02、0.27±0.01, F=1 108.46, P<0.01;ZMYM1分别为0.24±0.01、0.53±0.02、0.32±0.01、1.04±0.02, F=2 023.794, P<0.01)。 结论:circTGFBR2通过调节PTBP2/ELAVL1激活SMAD2信号途径促进前列腺癌发生发展。
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编辑人员丨5天前
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lncRNAs在小细胞肺癌中的研究进展
编辑人员丨5天前
肺癌是威胁人类生存的第一大恶性肿瘤。其中,小细胞肺癌(SCLC)因早期诊断困难、进展快和有效治疗手段少,5年生存率极低。长链非编码核糖核酸(lncRNAs)是一类包含200个以上碱基的非编码或仅有极低编码能力的非编码核糖核酸。它通过信号、诱饵、向导和支架4种作用形式参与染色质结构改变、基因修饰和转录、mRNA剪接和翻译等各个水平的生物学过程的调控。特定的lncRNAs在SCLC细胞中的异常表达能够通过影响细胞增殖、分化、凋亡、黏附等过程,促进SCLC的发生和进展,且部分临床研究已经证实其与SCLC的临床进展与预后相关。虽然目前lncRNAs在SCLC中的研究还不深入,但lncRNAs有望在将来为临床诊疗提供新的思路与方案。
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编辑人员丨5天前
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长基因间非蛋白质编码核糖核酸01638对胶质瘤细胞增殖和凋亡影响及其机制
编辑人员丨5天前
目的:探讨长基因间非蛋白质编码核糖核酸01638(LINC01638)调控胶质瘤细胞增殖和凋亡机制。方法:U251胶质瘤细胞购自中国科学院细胞库。选择2017年1月至2019年1月兰州大学第一医院诊治的颅脑胶质瘤患者及颅脑血肿清除术患者为研究对象。将U251细胞根据转染基因分为si-NC组、si-LINC01638组、pcDNA组、pcDNA-LINC01638组、miR-NC组、miR-647 mimics组、si-LINC01638+anti-miR-NC组和si-LINC01638+anti-miR-647组。实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测LINC01638和微小核糖核酸647(miR-647)表达;细胞计数试剂盒-8(CCK-8)检测48 h细胞吸光度;流式细胞术检测细胞凋亡;蛋白质印迹法检测细胞周期蛋白D1(Cyclin D1)、细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1A(p21)、B细胞淋巴瘤-2(bcl-2)及bcl-2相关X(bax)表达;双荧光素酶报告实验检测LINC01638和miR-647的靶向关系。两组间比较采用 t检验;多组间比较采用单因素方差分析(两组间比较用SNK- q检验)。 结果:胶质瘤组织中LINC01638表达显著高于正常脑组织(2.96±0.27比0.95±0.08),miR-647表达显著低于正常脑组织(0.54±0.05比1.02±0.06),差异有统计学意义( t=31.921、27.485, P<0.05)。si-LINC01638组U251细胞LINC01638表达(0.49±0.03比0.97±0.07)、48 h细胞吸光度值(0.41±0.03比0.72±0.04)、Cyclin D1表达(0.24±0.02比0.69±0.04)显著低于si-NC组,p21表达(0.58±0.03比0.19±0.02)、细胞凋亡率[(22.63±3.18)%比(6.95±0.86)%]及bax表达(0.91±0.06比0.26±0.03)显著高于si-NC组,差异有统计学意义( t=14.238、18.432、20.399、16.981、19.322、24.876, P<0.05)。miR-647与WT-LINC01638共转染后U251细胞荧光素酶活性显著降低,转染pcDNA-LINC01638后miR-647低表达,转染si-LINC01638后miR-647高表达( P<0.05)。miR-647 mimics组U251细胞miR-647表达(2.71±0.08比1.01±0.03)、细胞凋亡率[(20.60±2.14)%比(6.12±0.39)%]、p21(0.51±0.06比0.18±0.02)和bax(0.83±0.07比0.23±0.04)表达显著高于miR-NC组,48 h细胞吸光度值(0.45±0.07比0.63±0.09)、Cyclin D1(0.28±0.05比0.69±0.07)和bcl-2(0.29±0.03比0.81±0.08)表达显著低于miR-NC组,差异有统计学意义( t=20.254、16.133、15.541、12.689、17.431、21.356, P<0.05)。si-LINC01638+anti-miR-647组U251细胞miR-647表达(0.62±0.05比1.01±0.06)、细胞凋亡率[(11.37±2.33)%比(22.43±3.41)%]、p21(0.28±0.06比0.59±0.08)和bax(0.39±0.05比0.87±0.09)表达显著低于si-LINC01638+anti-miR-NC组,48 h细胞吸光度值(0.58±0.06比0.32±0.03)、Cyclin D1(0.58±0.06比0.21±0.03)和bcl-2(0.63±0.07比0.25±0.04)表达显著高于si-LINC01638+anti-miR-NC组,差异有统计学意义( t=13.133、12.087、19.287、11.303、16.765、18.433, P<0.05)。 结论:抑制LINC01638表达可抑制U251细胞增殖并促进凋亡,其机制可能与LINC01638上调miR-647有关。
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编辑人员丨5天前
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长基因间非蛋白质编码核糖核酸174调控骨质疏松分子机制研究
编辑人员丨5天前
目的:探讨长基因间非蛋白质编码核糖核酸174(LINC00174)调控骨质疏松分子机制。方法:选择烟台山医院47例骨质疏松症患者和47例正常健康人为研究对象。人骨髓间充质干细胞(hBMSCs)购自美国ScienCell公司。过表达LINC00174质粒(pcDNA-LINC00174)、过表达阴性对照(pcDNA-NC)、LINC00174小干扰RNA(si-LINC00174)、小干扰RNA阴性对照(si-NC)转染至hBMSCs。实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测基因信使核糖核酸(mRNA)表达;噻唑蓝(MTT)检测细胞增殖活性;流式细胞仪检测细胞凋亡率;蛋白质印迹法检测蛋白表达;酶联免疫吸附法检测丙二醛(MDA)、超氧化物歧化酶(SOD)及过氧化氢酶(CAT)水平。两组间比较行 t检验,多组间比较采用单因素方差分析,组间两两比较采用LSD- t检验。 结果:骨质疏松症患者血清中LINC00174表达水平显著高于健康对照(2.38±0.21比1.00±0.11),差异有统计学意义( t=39.908, P<0.05)。pcDNA-LINC00174组hBMSCs细胞LINC00174表达(3.01±0.25比1.00±0.08)、凋亡率[(23.25±1.42)%比(12.46±1.07)%]和活化的天冬氨酸蛋白水解酶3(cleaved Caspase-3)表达(0.75±0.05比0.39±0.03)显著高于pcDNA-NC组,增殖活性(0.53±0.04比0.91±0.06)、细胞周期蛋白D1(Cyclin D1)、(0.42±0.05比0.86±0.06)、碱性磷酸酶(ALP)(0.37±0.03比0.65±0.05)、Runt相关转录因子2(RUNX2)(0.41±0.04比0.83±0.06)和骨钙蛋白(OCN)(0.27±0.03比0.72±0.05)蛋白表达显著低于pcDNA-NC组,差异有统计学意义( t=15.671、20.877、9.564、12.431、17.498、21.652、18.932、21.774, P<0.05)。si-LINC00174组hBMSCs细胞LINC00174表达(0.38±0.04比1.01±0.09)、凋亡率[(8.46±0.78)%比(13.73±1.43)%]和cleaved Caspase-3(0.26±0.02比0.45±0.04)表达显著低于si-NC组,增殖活性(1.21±0.08比0.78±0.05)、Cyclin D1(0.78±0.06比0.54±0.04)、ALP(0.75±0.06比0.49±0.04)、RUNX2(0.89±0.06比0.53±0.05)和OCN(0.92±0.06比0.68±0.05)蛋白表达显著高于si-NC组,差异有统计学意义( t=13.032、16.541、10.125、19.356、15.238、18.981、9.237、11.343, P<0.05)。pcDNA-LINC00174组hBMSCs细胞Nrf2(0.39±0.03比0.88±0.06)和Kelch样环氧氯丙烷相关蛋白1(Keap1)(0.24±0.02比0.59±0.05)蛋白表达显著低于pcDNA-NC组,差异有统计学意义( t=17.238、14.045, P<0.05)。si-LINC00174组hBMSCs细胞核因子红系2相关因子2(Nrf2)(0.94±0.05比0.72±0.04)和Keap1(0.86±0.05比0.47±0.04)蛋白表达显著高于si-NC组,差异有统计学意义( t=13.032、16.541, P<0.05)。 结论:LINC00174可调控骨质疏松,其机制可能与通过Nrf2/Keap1信号通路调控hBMSCs增殖、成骨细胞分化、凋亡及氧化应激有关。
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编辑人员丨5天前
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胶质瘤组织中lncRNA NR2F2-AS1、miR-129-5p的表达及临床意义
编辑人员丨5天前
目的:检测胶质瘤组织中长链非编码RNA(lncRNA)核受体亚家族2组F成员2反义核糖核酸1(NR2F2-AS1)和微小RNA-129-5p(miR-129-5p)的表达,并探讨其临床意义。方法:选取2015年1月至2016年9月山西省人民医院神经外科接受手术治疗的103例胶质瘤患者的胶质瘤组织及同期因颅脑手术切除的50例正常脑组织为研究对象。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测组织样本中lncRNA NR2F2-AS1和miR-129-5p的表达水平,分析两者的相关性,分析两者的表达变化与胶质瘤患者临床病理参数的关系,用Kaplan-Meier曲线分析lncRNA NR2F2-AS1、miR-129-5p表达水平与胶质瘤患者术后5年累积生存率的关系,Cox回归分析法分析影响胶质瘤患者预后的因素。结果:胶质瘤组织中lncRNA NR2F2-AS1相对表达量高于正常脑组织,而miR-129-5p相对表达量低于正常脑组织(均 P<0.05)。胶质瘤组织中lncRNA NR2F2-AS1与miR-129-5p的表达呈负相关( r=-0.756, P<0.05)。胶质瘤组织中lncRNA NR2F2-AS1与miR-129-5p的表达与肿瘤WHO分级及肿瘤长径有关(均 P<0.05)。LncRNA NR2F2-AS1<2.89组患者术后5年累积生存率高于lncRNA NR2F2-AS1≥2.89组患者( P<0.05),miR-129-5p<0.55组患者术后5年累积生存率低于miR-129-5p≥0.55组患者( P<0.05)。LncRNA NR2F2-AS1高表达、miR-129-5p低表达、WHO分级Ⅲ~Ⅳ级及肿瘤长径是影响胶质瘤患者术后预后的危险因素(均 P<0.05)。 结论:胶质瘤组织中lncRNA NR2F2-AS1表达升高、miR-129-5p表达降低,两者参与脑胶质瘤临床生物学进展,并与患者预后密切相关。
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编辑人员丨5天前
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长链非编码RNA在瘢痕疙瘩形成机制中的研究进展
编辑人员丨5天前
瘢痕疙瘩是一种良性但又具有一定侵袭性的病变,其发病机制目前仍未被彻底揭示,表观遗传、炎症反应、机械力作用等诸多因素对其均有影响。近年来,随着表观遗传学的发展,越来越多长链非编码核糖核酸(lncRNA)的相关研究证实,它与瘢痕疙瘩的发生也密切相关。该文综述了lncRNA和瘢痕疙瘩形成的表观遗传学的各项关系,lncRNA与成纤维细胞异常增殖、胶原过量形成、细胞微环境、细胞迁移等过程的关系,瘢痕疙瘩形成、增殖、侵袭性等方面的研究进展。
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编辑人员丨5天前
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长链非编码RNA Lnc-CYS1-1在脑胶质瘤恶性进展中的作用机制研究
编辑人员丨5天前
目的:探讨Lnc-CYS1-1在脑胶质瘤恶性进展中的作用及其机制。方法:2020年10月至2021年2月浙江大学医学院附属邵逸夫医院神经外科收集11例脑胶质瘤患者的手术标本(胶质瘤组织和瘤旁组织)。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测Lnc-CYS1-1在脑胶质瘤组织和细胞株(U251、A172、LN229、SNB19和U87)中的表达及在细胞核与细胞质中的分布。在U251细胞株中应用RNA荧光原位杂交确定Lnc-CYS1-1的空间表达信息。在U251和SNB19细胞株中,转染Lnc-CYS1-1 siRNA作为Lnc-CYS1-1 siRNA组,转染NC siRNA作为对照组;分别应用CCK-8增殖实验、流式细胞术和Transwell实验检测两组胶质瘤细胞的增殖活性、细胞周期、凋亡及侵袭力。采用RNA沉降实验及蛋白质谱分析鉴定筛选与Lnc-CYS1-1结合的差异蛋白,并由蛋白质免疫印迹法(WB)和免疫组织化学染色验证。采用RNA结合蛋白免疫沉淀(RIP)实验验证Lnc-CYS1-1与原肌球蛋白3(TPM3)的相互作用。分析中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)数据库及临床标本中世界卫生组织(WHO)不同级别脑胶质瘤组织中TPM3的表达情况;对不同TPM3表达组脑胶质瘤患者进行生存分析。结果:在5例胶质瘤组织中,Lnc-CYS1-1的表达水平较相应瘤旁组织中升高( P<0.001)。5种胶质瘤细胞株中Lnc-CYS1-1的表达均较HEB正常胶质细胞上调( P<0.001)。U251细胞中,Lnc-CYS1-1主要分布于细胞质(70%),细胞核中比例约为30%。U251和SNB19细胞中,qRT-PCR结果显示,Lnc-CYS1-1 siRNA组Lnc-CYS1-1的相对表达水平均较对照组下降(均 P<0.05);CCK-8增殖实验结果显示,Lnc-CYS1-1 siRNA组的细胞存活率在48 h和72 h均较对照组下降(均 P<0.05);流式细胞术检测结果显示,Lnc-CYS1-1 siRNA组的G 0/G 1比值和胶质瘤细胞凋亡率均较对照组升高(均 P<0.05);Transwell实验结果显示,Lnc-CYS1-1 siRNA组通过基质凝胶侵袭的细胞数量均比对照组减少(均 P<0.05)。RNA沉降实验及蛋白质谱鉴定的结果显示,TPM3可能为Lnc-CYS1-1的作用靶点。RIP实验结果显示,与IgG组比较,TPM3免疫沉淀样品组的Lnc-CYS1-1表达水平升高( P<0.001),Lnc-CYS1-1与TPM3存在相互作用关系。CGGA数据库分析及临床标本免疫组织化学染色验证结果显示,TPM3的表达水平随WHO级别升高而升高;TPM3高表达组(110例)较低表达组(110例)患者的中位生存期短( P<0.001)。 结论:Lnc-CYS1-1在脑胶质瘤组织及细胞中表达上调,敲低Lnc-CYS1-1可明显抑制胶质瘤的增殖、侵袭,诱导细胞凋亡。Lnc-CYS1-1可能通过TPM3在胶质瘤恶性进展中发挥作用。
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编辑人员丨5天前
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竞争性内源性RNA在创面愈合中作用的研究进展
编辑人员丨5天前
创面愈合作为重要的公共卫生问题之一,一直是世界性难题。由于独特的生物创面环境,创面愈合是一个非常复杂的过程,目前治疗周期长、疗效欠佳,患者经济负担重。越来越多的研究表明,非编码RNA(ncRNA)在创面愈合过程中扮演着重要角色。竞争性内源性RNA(ceRNA)假说是近些年新提出的一种RNA相互调控假说,该假说提出了不同RNA之间的一种“交流方式”。ceRNA调控网络(ceRNET)将蛋白质编码mRNA的功能与ncRNA(如微小RNA、长链非编码RNA、假基因和环状RNA)的功能联系起来。最新的研究表明,ceRNA在创面愈合过程中发挥重要作用,这可能为创面愈合提供新的有效治疗靶标。本文从ceRNET着手,系统综述各种ceRNA在创面愈合中的作用研究进展及未来研究的挑战,旨在深入探究ceRNA在创面愈合过程中的分子机制及临床意义。
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编辑人员丨5天前
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长链非编码核糖核酸锌指蛋白反义链1与食管癌放疗反应性及预后的相关性
编辑人员丨5天前
目的:探讨长链非编码核糖核酸(lncRNA)锌指蛋白反义链1(ZFAS1)与食管癌放疗反应性以及预后的相关性。方法:回顾性选择2016年3月至2018年3月山东省立第三医院收治的127例食管癌患者(食管癌组)和86例体检志愿者(对照组),食管癌患者接受三维适形放疗,放疗前(对照组体检当日)采集静脉血,实时荧光定量聚合链反应(qRT-PCR)检测血清lncRNA ZFAS1表达。分析lncRNA ZFAS1表达与食管癌临床病理参数、放疗反应性以及预后的关系。结果:食管癌组血清LncRNA ZFAS1相对表达量高于对照组(3.41±0.81 vs 1.05±0.27, t=26.04, P<0.05),放疗抗拒组血清LncRNA ZFAS1相对表达量高于放疗敏感组(3.91±0.26 vs 3.07±0.27, t=17.44, P<0.05)。低中度分化、Ⅲ~Ⅳ期、淋巴结转移患者血清LncRNA ZFAS1表达高于高度分化、Ⅰ~Ⅱ期、无淋巴结转移患者( P<0.05)。Kaplan-Meier生存分析示lncRNA ZFAS1≥3.41食管癌患者3年总生存(OS)率,低于lncRNA ZFAS1<3.41食管癌患者(38.81% vs 65.00%,Log-Rank χ2=8.30, P<0.05)。多因素Cox比例风险回归分析结果显示淋巴结转移、放疗抗拒、lncRNA ZFAS1≥3.41是食管癌患者不良预后的危险因素( P<0.05)。 结论:食管癌患者血清LncRNA ZFAS1表达增加,且与食管癌临床病理参数、放疗反应性以及不良预后有关。
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编辑人员丨5天前
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长链非编码RNA AFAP1-AS1靶向miR-195-5p对肝癌细胞生物学行为的影响
编辑人员丨2024/7/27
目的 探讨长链非编码核糖核酸(lncRNA)AFAP1-AS1及微小核糖核酸-195-5p(miR-195-5p)对肝细胞癌(HCC)细胞生物学行为的影响.方法 常规培养人HCC细胞系(HepG2、Hep3B、SMMC-7721、Bel7402、SK-hep1细胞)和正常人肝细胞(HL-7702细胞),用实时荧光定量PCR法检测AFAP1-AS1、miR-195-5p并筛选实验细胞.将对数生长期实验细胞随机分为si-AFAP1-AS1组、si-NC组,miR-195-5p mimics组、mimics-NC组,miR-195-5pinhibitor+si-NC组、miR-195-5p inhibitor+si-AFAP1-AS1 组、inhibitor-NC+si-AFAP1-AS1 组、inhibitor-NC+si-NC组,用Lipofectamine 2000试剂将相应质粒按照分组转染入细胞.用CCK-8实验、菌落形成实验检测细胞增殖能力,用流式细胞术检测细胞凋亡及细胞周期,用Transwell实验检测细胞迁移及侵袭能力,用双荧光素酶报告基因实验验证AFAP1-AS1与miR-195-5p的靶向关系.结果 HCC细胞中AFAP1-AS1表达高于正常人肝细胞(P均<0.05),HCC细胞中miR-195-5p表达低于正常人肝细胞(P均<0.05).由于SK-hep1细胞中AFAP1-AS1表达最高、miR-195-5p表达最低,因此,后续研究均采用SK-hep1细胞进行实验.与si-NC组比较,si-AFAP1-AS1组中AFAP1-AS1表达低、细胞增殖能力低、迁移和侵袭细胞少、G0/G1期细胞比例高、细胞凋亡率高(P均<0.05).通过Starbase v3.0在线数据库预测发现,AFAP1-AS1与miR-195-5p有互补的结合位点.双荧光素酶报告基因实验结果显示,miR-NC组、miR-195-5p组共转染WT-AFAP1-AS1后相对荧光素酶活性比较差异有统计学意义(P<0.05),共转染MUT-AFAP1-AS1后相对荧光素酶活性比较差异无统计学意义(P>0.05).与inhibitor-NC+si-NC组比较,si-NC+miR-195-5p inhibitor组细胞增殖能力高、迁移和侵袭细胞多、G0/G1 期细胞比例低、细胞凋亡率低(P均<0.05),而si-AFAP1-AS1+miR-195-5p inhibitor组上述细胞生物学行为则相反.结论 lncRNA AFAP1-AS1可能通过竞争性结合miR-195-5p参与调控HCC细胞增殖、迁移、侵袭、凋亡等生物学行为.
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编辑人员丨2024/7/27
