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海南黎族21个非DNA联合索引系统基因座的遗传多态性
编辑人员丨1周前
目的:调查海南黎族21个非DNA联合索引系统(combined DNA index system, CODIS)基因座的遗传多态性,探讨其在法医亲子鉴定、个体识别及群体遗传学研究中的意义。方法:采用荧光标记复合扩增和毛细管电泳技术,对339名海南黎族无关个体的21个非CODIS基因座进行基因分型,并计算遗传学参数。结果:21个非CODIS基因座在339例海南黎族无关个体中共检出173个等位基因,489种基因型,基因频率在0.0010~0.5434之间,基因型频率在0.0020~0.3274之间,杂合度分布在0.639~0.833之间,个人识别能力为0.803~0.948,三联体非父排除率为0.416~0.584,二联体非父排除率为0.140~0.238,多态信息含量为0.57~0.81,累积个人识别能力大于0.999 999 999 999 99,三联体累积非父排除率为0.999 999 883 211 752,二联体累积非父排除率为0.987 266。结论:D6S474的21个短串联重复序列基因座在海南黎族群体中具有良好的遗传多态性,在个体识别及亲子鉴定中是一个高效的检测系统,可作为补充基因座用于单亲、疑难、亲缘鉴定和突变亲子鉴定案件中。
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编辑人员丨1周前
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毛细管电泳用于高苯丙氨酸血症基因诊断的临床应用研究
编辑人员丨1周前
目的:评估一种基于毛细管电泳的高苯丙氨酸血症的快速基因诊断方法的临床价值。方法:前瞻性单中心研究。选取2021年2月至2023年2月于南京市妇幼保健院经液相串联质谱新生儿筛查检测疑似高苯丙氨酸血症的40例患儿。其中男22例,女18例;平均诊断年龄21.93 d。采用毛细管电泳技术对40例疑似高苯丙氨酸血症患儿苯丙氨酸羟化酶( PAH)基因中的85个变异位点进行检测,对未明确诊断患儿的 PAH基因进一步采用Sanger测序进行检测。评估毛细管电泳技术的检出率、敏感度和特异度。 结果:在40例疑似高苯丙氨酸血症患儿中,毛细管电泳技术共检出71个 PAH变异,32例患儿明确基因诊断,5例患儿仅发现1个致病变异,3例患儿未检出变异。毛细管电泳技术的检出率为80.00%,敏感度为88.75%,特异度为100%。 结论:毛细管电泳技术能够快速、高效、准确地检出 PAH基因变异,且成本较低,是一种极具临床应用前景的高苯丙氨酸血症基因检测方法。
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编辑人员丨1周前
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肝病无创诊断新策略:DSA-FACE技术的糖组学方法
编辑人员丨1周前
慢性肝病已经逐渐成为严重的全球性健康问题。肝活体组织检查是目前评价肝脏病变的金标准,但其属于有创操作且会造成严重并发症;因此,亟需一种可用于诊断的经济快速的无创检测方法应用于临床。近十几年来,蛋白质糖基化已成为研究热点;血清蛋白聚糖结构的变化是肝脏损伤的指征这一理念也逐渐得到众多研究者们的认可。同时,高效的糖谱分析技术(基于DNA测序仪的荧光毛细管电泳技术,DSA-FACE)也为各种慢性肝病带来了具有较高灵敏度和特异度的诊断模型(GlycoHepatoTest),是肝病无创诊断的新策略。
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编辑人员丨1周前
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杭州地区血红蛋白变异体的流行及其对糖化血红蛋白检测系统的影响
编辑人员丨1周前
目的:探究杭州地区血红蛋白(Hb)变异体的主要类型及其对毛细管电泳法和高效液相色谱法糖化血红蛋白(HnA1c)检测系统的影响情况。方法:收集2021年1—8月浙江大学医学院附属邵逸夫医院钱塘院区住院、门诊患者以及健康体检者血液样本5 068份,分别检测受试者Hb、平均红细胞体积(MCV)、平均Hb浓度(MCH)、空腹血糖(FPG)和毛细管电泳法HbA1c,并对仪器提示的变异体样本进行Hb电泳和基因测序,确认变异体类型。Hb变异体样本进行高效液相色谱法HbA1c复检,统计分析其差异性。结果:5 068份血液样本中共检出变异体20份,占总数的0.39%,变异体包括10份HbG-Taipei,3份HbG-Honolulu,2份HbE,2份HbQ-Thailand,1份HbG-Coushatta,1份HbUbe-2和1份HbNew York。10份HbG-Taipei变异体中,高效液相色谱法检测HbA1c偏倚率均>20%,其中5份HbA1c异常误判为正常,且该方法对HbA1c的检测结果为(4.66±0.86)%,低于毛细管电泳法的(6.19±0.88)%,差异有统计学意义( t=-9.37, P<0.001)。 结论:HbG-Taipei为杭州地区最流行的Hb变异体,对该变异体HbA1c的检测,毛细管电泳法较高效液相色谱法的结果更加真实可靠。
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编辑人员丨1周前
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天津及周边地区血红蛋白变异体分析
编辑人员丨1周前
探讨天津及周边地区常见血红蛋白变异体的种类和占比,分析两种常用糖化血红蛋白检测系统对这些血红蛋白变异体的识别能力和对糖化血红蛋白检测结果的影响,为天津地区糖化血红蛋白检测的一致性提供实验数据支持。采用病例对照研究,进行回顾性分析,从2020年6至12月期间在天津医科大学朱宪彝纪念医院就诊的天津及周边地区患者的5万多例标本中,收集毛细管电泳法检测糖化血红蛋白时出现异常电泳峰的标本156例。通过DNA测序确定其血红蛋白突变位点。比较高效液相色谱法和毛细管电泳法测得的变异体糖化血红蛋白值。利用SPSS 23计算变异体标本血常规结果,并与正常参考区间进行比较,分析血红蛋白变异体对红细胞相关参数的影响。结果显示,DNA测序发现了21种血红蛋白变异体,其中11种为α链变异体,10种为β链变异体。其中,1种为未曾报道的血红蛋白变异位点,Hb Headington( HBB:c.217A>C)。高效液相色谱法和毛细管电泳法测定结果比较发现,Hb G-Honolulu、Hb Queens、Hb Q-Thailand、Hb J-Broussais、Hb O-Indonesia、Hb G-Coushatta、Hb G-Taipei、Hb E、Hb Headington、Hb New York和Hb D-Los Angeles 11种变异体糖化血红蛋白结果偏移大于7%。血细胞分析发现,Hb Q-Thailand变异体患者和Hb E变异体患者平均血细胞比容(mean corpuscular volume,MCV)和平均红细胞血红蛋白含量(mean corpuscular hemoglobin,MCH)减低。综上,天津及周边地区患者存在新的血红蛋白变异位点突变体,Hb Q-Thailand变异体患者和Hb E变异体患者MCV和MCH减低,11种血红蛋白变异体会干扰离子高效液相色谱法对糖化血红蛋白检测的准确性。
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编辑人员丨1周前
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基于配对样本间的聚鸟嘌呤基因型差异构建结直肠癌系统进化树
编辑人员丨1周前
目的:探讨结直肠癌(CRC)原发灶和淋巴结转移灶的肿瘤内异质性空间分布及其与转移的关系。方法:2017年1—12月在天津医科大学总医院普通外科接受手术切除并伴有区域淋巴结转移的原发性CRC患者20例。对患者手术切除组织的蜡块进行连续切片,经Histogene染色后行显微切割,获取原发肿瘤组织样本、淋巴结转移组织样本和正常组织样本。提取DNA,采用多重PCR扩增及毛细管电泳检测配对样本的聚鸟嘌呤(Poly-G)基因型。分析临床病理特征与Poly-G突变频率的关系。基于配对样本间的Poly-G基因型差异计算距离矩阵,构建CRC系统进化树。结果:共检测20例患者的237个样本,其中134个原发肿瘤组织样本,66个淋巴结转移组织样本,37个正常组织样本,每例患者均检测出Poly-G突变。肿瘤低、未分化患者的Poly-G突变频率[(74.10±23.11)%]高于高、中分化患者[(31.36±12.04)%, P<0.001],微卫星不稳定患者的Poly-G突变频率[(68.19±24.80)%]高于微卫星稳定患者[(32.40±14.90)%, P=0.003)],Poly-G突变频率与患者的性别、年龄、病理分期无关(均 P>0.05)。基于配对样本的Poly-G基因型差异构建了20例患者的系统进化树,能明确显示患者肿瘤的进化过程和淋巴结转移的亚克隆来源。 结论:CRC原发灶和淋巴结转移灶的肿瘤内异质性普遍存在。Poly-G突变积累于CRC的发生发展过程中,并广泛存在于CRC的原发灶和淋巴结转移灶,可作为遗传标志物构建系统进化树,高效、便捷地展示CRC肿瘤内异质性的空间分布和转移途径。
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编辑人员丨1周前
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血红蛋白变异致糖化血红蛋白异常家系报道
编辑人员丨1周前
报道一血红蛋白变异使高效液相色谱法(HPLC)测得HbA 1c值与血糖监测结果不符家系。HPLC法测得先证者HbA 1c值为5.6%,与血糖监测结果不符,而毛细管电泳法测得HbA 1c值为7.8%,符合血糖监测结果。毛细管电泳法所得Hb图谱提示,先证者存在异常血红蛋白。Sanger法行HbA β-珠蛋白( HBB)基因序列测定,证实先证者 HBB基因存在杂合突变( HBB:c.68A>C),支持Hb G-Coushatta变异体存在。家系资料显示,先证者弟弟及妹妹的Hb含有与先证者相同变异体和 HBB基因序列。HPLC法难以将Hb G-Coushatta变异体完全分离,使HbA 1c值与血糖监测结果不一致,而毛细管电泳法可完全分离变异体,得出准确HbA 1c值。临床中,HbA 1c值与血糖监测不一致时,应考虑到血红蛋白病可能,采用不同方法检测HbA 1c,为糖尿病诊断和病情监测提供精准指导。
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编辑人员丨1周前
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重组抗淀粉样β肽单克隆抗体药物的质量控制研究
编辑人员丨2024/7/20
目的:研究并建立针对抗淀粉样肽(amyloid-β,Aβ)单克隆抗体的关键质量属性质量控制方法.方法:基于胰蛋白酶酶切和反相高效液相色谱法(RP-HPLC)进行肽指纹图谱分析,分子排阻色谱法(SE-HPLC)进行单体聚体纯度分析,采用还原/非还原十二烷基硫酸钠毛细管电泳法(CE-SDS)进行大小变异体纯度分析,采用阳离子色谱法(CEX-HPLC)进行电荷变异体纯度分析,采用HILIC-UPLC法进行寡糖分析,采用ELISA法测定Aβ抗原相对结合活性.其他各项指标均应符合《中华人民共和国药典》2020年版以及其他相关要求.结果:肽指纹图谱起到良好的鉴别作用;SE-HPLC法中单体相对百分含量为(99.40±0.00)%,聚体的相对百分含量为(0.55±0.00)%;还原CE-SDS法中轻重链之和的相对百分含量为(98.11±0.08)%,非还原CE-SDS法的主峰相对百分含量为(96.57±0.15)%,HHL峰相对百分含量为(1.91±0.10)%;CEX-HPLC法中主成分相对百分含量为(75.08±0.06)%,酸性变异体的相对百分含量为(16.12±0.05)%,碱性变异体的相对百分含量为(8.80±0.05)%;HILIC-UPLC寡糖图谱分析的(G0F+G1F+G2F),Man5,G0 相对百分含量分别为(91.56±0.04)%,(1.21±0.03)%,(2.60±0.01)%;ELISA 法中与 Aβ 抗原的相对结合活性为(101.40±0.53)%.结论:针对抗Aβ单抗的质量属性,研究建立质控方法并进行质量研究,确保产品安全有效和质量可控,为该类单抗产品的质量控制方法和策略提供参考依据.
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编辑人员丨2024/7/20
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适于多物种的通用尾巴序列设计及通用体系的建立
编辑人员丨2024/7/6
[目的]荧光毛细管电泳由于其检测通量高、分辨率高等优点,被广泛应用于个体鉴定、品种鉴定、物种鉴定等多种应用场景中.尾巴序列为荧光毛细管电泳平台的广泛应用提供了高效的解决方案.为解决已有尾巴序列无法满足多物种使用需求,本研究基于编码转译技术开发高效的通用尾巴序列(universal tailed-sequence,UTS)设计工具.基于此工具设计通用尾巴序列,构建适合多作物的通用型PCR体系和程序,提高荧光电泳通量和灵活性.[方法]基于编码转译技术开发高效的通用尾巴序列设计工具,并对 3 755 个常用汉字进行编码转译,并设置序列GC含量、发卡结构及同源引物二聚体退火温度等筛选条件得到符合条件的UTS.使用BLAST工具对通用尾巴序列设计工具生成的UTS在多种生物基因组上进行同源性评估,并在玉米、番茄、辣椒、西瓜等作物上进行实验评估,构建物种通用型实验体系及程序.[结果]通过设计工具编码转译并筛选共得到 7 436 833 个高质量的候选UTS,占所有字组的 52.74%.挑选 6 个UTS在 20 个作物基因组上的BLAST结果显示其与M13 相比具有更好的特异性.通过对通用引物扩增程序进行优化,使通用引物在多个物种上的扩增成功率达到或超过 95%,并具有较强的稳定性.[结论]利用编码转译技术开发通用尾巴序列,并为其搭配物种通用型扩增体系和程序,提供一种通量高、成本低的荧光电泳通用检测方法.
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编辑人员丨2024/7/6
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茯苓佐剂多糖PCP-Ⅱ酸水解条件优化、产物分离及理化性质分析
编辑人员丨2024/7/6
目的:研究3个最佳酸水解条件对茯苓佐剂多糖PCP-Ⅱ进行水解,以期获得3个不同相对分子质量的多糖片段产物[重均分子量(Mw)接近1.0 ×104,5.0 × 103和2.5 × 103],并进行理化性质测定.方法:首先进行不同三氟乙酸(TFA)浓度、不同水解温度和不同水解时间的单因素考察.采用L9(34)正交设计进行三因素和三水平的实验和综合分析,最终确定3个最合适的酸水解条件.采用Sephadex凝胶柱色谱对水解产物进行分离和纯化,获得3个相对分子质量均一多糖片段(PCP-Ⅱ-hy-1,PCP-Ⅱ-hy-2和PCP-Ⅱ-hy-3);采用薄层色谱法分析水解产物中的单糖组成变化.采用高效凝胶渗透色谱法得到多糖相对分子质量及相对分子质量分布.采用1-苯基-3-甲基-5-吡唑啉酮(PMP)衍生和毛细管电泳法测定3个多糖片段的单糖组成.结果:3 种酸水解条件(0.25 mol·L-1 TFA,80 ℃,2 h,0.25 mol·L-1 TFA,80℃,3 h 和 0.25 mol·L-1 TFA,80℃,6h)可用于3种目标水解产物的制备;多糖片段PCP-Ⅱ-hy-1的Mw为9.51 × 103,单糖组成摩尔比为岩藻糖∶甘露糖∶半乳糖=1.00∶1.54∶9.05;PCP-Ⅱ-hy-2的Mw为6.39 × 103,单糖组成摩尔比为岩藻糖∶甘露糖∶半乳糖=1.00∶2.04∶14.36;PCP-Ⅱ-hy-3的Mw为1.80×103,单糖组成摩尔比为岩藻糖∶甘露糖∶半乳糖=1.00∶4.55∶27.59.结论:3种酸水解条件适合目标多糖片段的产生.3个多糖水解片段随着相对分子质量的减少甘露糖和半乳糖比例逐渐增大,特别是PCP-Ⅱ-hy-3主要由半乳糖组成,推测PCP-Ⅱ骨架结构可能是半乳聚糖.
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编辑人员丨2024/7/6
