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APTR基因DNA甲基化及mRNA表达水平与HBV感染的相关性研究
编辑人员丨1周前
目的:探讨Alu介导的p21转录调节子(Alu-mediated p21 transcriptional regulator,APTR)基因的DNA甲基化及mRNA表达水平与HBV感染的相关性。方法:选择2019年1月至12月云南大学附属医院收治的100例HBV感染者为研究对象,其中慢性乙型肝炎(Chronic hepatitis B,CHB)组50例,乙型肝炎病毒无症状携带者(Asymptomatic carries of hepatitis B virus,ASC)组50例。另选同期体检者50名作为健康对照组。采用甲基化敏感的高分辨率熔解曲线(Methylation-sensitive high-resolution melting,MS-HRM)检测APTR基因的DNA甲基化程度;采用实时荧光定量聚合酶链反应(Real-time quantitative polymerase chain reaction, qRT-PCR)检测所有研究对象外周血白细胞内APTR基因的mRNA表达水平。相关性分析采用Pearson相关或Spearman秩相关。结果:CHB组、ASC组以及健康对照组的APTR基因甲基化水平分别为[12.02(9.30,23.32)]%、[10.02(8.46,17.44)]%和8.86[(7.82,11.57)]%,差异具有统计学意义( χ2=13.360, P<0.01),CHB组的APTR基因甲基化水平高于健康对照组( Z=31.480, P<0.01)。CHB组、ASC组以及健康对照组的APTR基因mRNA表达水平分别为(2.38±1.41)、(5.78±2.78)和(5.70±2.66),差异存在统计学意义( F=33.720, P<0.01),CHB组的APTR基因mRNA表达水平低于健康对照组和ASC组,差异有统计学意义( t=7.808和7.724, P值均<0.01)。相关性分析结果显示,所有研究对象中APTR基因的甲基化水平与mRNA表达量呈负相关( r=-0.305, P<0.01);HBV感染者中APTR基因的甲基化水平与HBsAg水平呈正相关( r=0.231, P<0.05),APTR基因mRNA表达量与HBsAg水平呈负相关( r=-0.245, P<0.05)。 结论:APTR基因DNA甲基化及mRNA表达水平在不同时期HBV感染者中存在差异,提示其可能参与了HBV感染的免疫调控。
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编辑人员丨1周前
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铜死亡相关lncRNA预测三阴性乳腺癌患者预后及与肿瘤免疫微环境的关系
编辑人员丨2024/2/3
目的 明确铜死亡相关长链非编码RNA(lncRNA)在三阴性乳腺癌(TNBC)中的预后价值及与肿瘤免疫微环境的关系.方法 收集肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中收录的TNBC患者临床信息和转录组测序数据,利用共表达分析筛选铜死亡相关lncRNA,通过Cox回归分析构建预后模型.基于所构建的预后模型,将TNBC患者分为不同风险分组,利用功能富集、免疫浸润分析,评估不同分组患者的肿瘤免疫微环境状态.结果 TCGA中筛选到TNBC铜死亡相关lncRNA 111个,Cox回归分析建立由MELTF-AS1、APTR、DHRS4-AS1、LINC02188和URB1-AS1等5个铜死亡相关lncRNA组成的TNBC预后模型.低风险组患者生存时间明显长于高风险组(P<0.05).高风险组患者肿瘤组织中免疫抑制性细胞浸润增加.结论 基于铜死亡相关lncRNA所建立的预后模型可有效预测TNBC患者预后及评估肿瘤免疫微环境.
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编辑人员丨2024/2/3
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益生菌辅助抗栓治疗脑梗死伴胃肠功能紊乱的效果及对凝血指标的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨肠道益生菌辅助抗栓治疗对急性脑梗死伴胃肠功能紊乱患者胃肠功能恢复及凝血指标的影响.方法 收集2015年3月至2017年2月我院收治的70例急性脑梗死伴胃肠功能紊乱患者为研究对象,随机分为对照组及实验组,各35例.对照组患者实施常规药物联合抗栓治疗,实验组实施肠道益生菌辅助抗栓治疗,观察治疗前后两组胃肠激素[降钙素基因相关肽(CGRP)、胃动素(MTL)]、凝血功能指标[活化部分凝血活酶时间(APTT)、纤维蛋白原(FIB)、血浆凝血酶时间(TT)]、胃肠道功能[D乳酸、前降钙素(PCT)]及预后效果[神经功能缺损评分(NIHSS)、日常生活能力量表(ADL)评分].结果 治疗前两组CGRP、MTL、APTT、FIB、TT、D乳酸、PCT、NIHSS评分、ADL评分相较无统计学意义(P>0.05);治疗后两组CGRP、FIB、TT、D乳酸、PCT、NIHSS评分较治疗前明显降低,MTL、APTr、ADL评分明显升高,并且治疗后实验组的各项指标变化较对照组明显,差异均有统计学意义(P< 0.05).结论 肠道益生菌辅助抗栓治疗急性脑梗死伴胃肠功能紊乱患者时,通过有效调节患者胃肠激素、凝血指标,继而达到促进患者胃肠功能恢复及改善患者预后效果的目的.
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编辑人员丨2023/8/6
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与肝纤维化相关的长链非编码RNA的研究进展
编辑人员丨2023/8/6
长链非编码RNA(lncRNA)调控大量的人类蛋白编码基因,广泛参与机体生理病理过程.近年来发现, lncRNA在肝纤维化发生发展中发挥重要作用.目前已经明确的促肝纤维化lncRNA主要包括Alu介导的p21转录调节因子( APTR)、由 TGF-β激活的 lncRNA ( lncRNA-ATB)、 HOX 转录反义 RNA ( Hotair)、肝癌细胞中上调的lncRNA(HULC),抗肝纤维化lncRNA主要包括人母系表达基因3(MEG3)、生长停滞特异性转录本5(GAS5)、基因间长链非编码RNA-p21(lincRNA-p21).随着对lncRNA生理作用及其在肝纤维化发病中的作用机制的深入研究,通过调节肝纤维化患者体内lncRNA活性治疗肝纤维化有可能成为现实.
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编辑人员丨2023/8/6
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APTR基因扩增在胶质瘤患者预后评估中的潜在价值
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨长链非编码RNA基因APTR扩增在胶质瘤细胞增殖和侵袭中的作用及其对胶质瘤患者预后评估的潜在价值.方法 采用实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测本院共30例WHOⅡ~Ⅳ级胶质瘤组织中APTR基因扩增及表达水平,并收集肿瘤基因组学图谱计划(TCGA)数据库中1119例WHOⅡ~Ⅳ级胶质瘤组织中APTR基因扩增及表达数据,分析两组病例APTR基因扩增阳性率与胶质瘤WHO分级、APTR LncRNA表达水平及患者预后的关系,噻唑蓝(MTT)法及Transwell侵袭实验检测APTR基因对胶质瘤细胞增殖活性和侵袭能力的影响.结果 TCGA数据库组APTR基因扩增阳性率与胶质瘤分级呈同步递增且差异有统计学意义(x2=53.901,P=0.000;x2=267.832,P=0.000;x2=118.412,P=0.000).Spearman秩相关分析显示,APTR基因拷贝数扩增程度与APTR LncRNA表达水平呈正相关(本院病例组:rs=0.917,P=0.000;TCGA数据库病例组:rs=0.591,P=0.000).单因素和多因素逐步法Cox回归分析显示,APTR基因扩增及由此引起的APTR LncRNA过表达均是患者预后不良的危险因素(均P< 0.05).敲低胶质瘤细胞APTR基因表达可显著抑制其增殖及侵袭.结论 胶质瘤细胞中APTR基因扩增及由此引起的APTR LncRNA过表达均可作为评估胶质瘤患者预后的新预测因素,也是促进胶质瘤细胞增殖和侵袭的重要因素.
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编辑人员丨2023/8/5
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长链非编码RNA APTR、HEIH、FAS-ASA1、FAM83H-AS1、DICER1-AS1、PR-IncRNA在肺癌中的表达
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨长链非编码RNA(Long non-coding RNA,IncRNA)APTR、HEIH、FAS-ASA1、FAM83H-AS1、DICER1-AS1、PR-lncRNA在肺癌患者中的表达.方法 收集昆明医科大学第三附属医院肺癌手术患者的癌组织,癌旁正常组织及肺癌淋巴结转移组织,利用TRI z o l提取总 RNA,再用SYBR Green实时荧光定量PCR检测每种基因的RNA相对表达量.结果 APTR在淋巴组织中表达升高(P < 0.05),HEIH在淋巴组织中表达下降(P < 0.05),FAM83H-AS1和、PR-lncRNA在肺癌组织中表达升高(P < 0.05).结论 APTR在淋巴组织中高表达,可能有促进肺癌淋巴结转移的作用;FAM83H-AS1及PR-lncRNA癌组织中表达上调,可能会促进肺癌的发生发展.
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编辑人员丨2023/8/5
