目的:对3个遗传性多发性骨软骨瘤（HME）家系行致病基因检测，为优生、遗传咨询和产前诊断提供依据。方法:收集2018年1月至2020年11月就诊于河南省人民医院遗传与产前诊断中心的3个遗传性多发性骨软骨瘤家系，对家系进行详细的病史采集，签署知情同意书后，收集家系成员外周静脉血，对先证者行全外显子组测序（WES），发现可疑致病位点后，采用Sanger测序对家系成员候选致病变异进行验证及家系共分离分析，结合ACMG指南，对突变进行致病性判断。结果:全外显子组测序分别在3个家系先证者中检出 EXT1基因c.1056+2T>C突变、c.369dupA（p.G124fs）突变和 EXT2基因c.1171C>T（p.Q391*）突变。共分离验证后发现：3个家系中的患者均存在相应突变，而表型正常的家系成员未检测到突变，符合基因型-表型共分离。结合ACMG指南，上述3种突变可分类为致病性突变。 结论:EXT1基因c.1056+2T>C、c.369dupA突变和 EXT2基因c.1171C>T突变是导致3个家系罹患骨软骨瘤的病因。

极重症血小板增多症（extreme thrombocytosis, EXT）指外周血中的血小板计数（PLT）>1 000×10 9/L [1,2]。通常认为绝大多数EXT患者患有克隆性血液系统疾病，因炎症很少对血小板产生如此大的影响，但既往关于EXT的研究表明情况并非如此，尤其对于儿童患者 [3,4,5]。本研究探讨儿童EXT的可能病因并通过对血小板极度增高的患儿进行追踪随访和基因筛查，以发现隐匿的肿瘤性疾病的频率。

目的:对1个遗传性多发性骨软骨瘤家系进行基因变异检测，明确其可能的致病原因。方法:提取先证者及其家系成员的外周血基因组DNA，用二代测序技术(next generation sequencing，NGS)筛查先证者 EXT1/ EXT2编码区及邻近内含子序列，对疑似致病变异进行先证者及家系成员Sanger测序和酶切验证。 结果:NGS检测结果显示先证者 EXT1基因第10外显子存在c.1911C>A杂合无义变异，Sanger测序验证家系中先证者及父亲均检测到该变异，而先证者三姐及对照均未携带该变异。根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传变异分类标准与指南，判定 EXT1基因c.1911C>A变异为致病性变异(PVS1+PM2+PP1)。 结论:EXT1基因的c.1911C>A可能是该家系的致病原因，该变异的检出拓展了遗传性多发性骨软骨瘤的基因变异谱。

目的:对5个遗传性多发性骨软骨瘤(multiple osteochondromas，MO)家系进行 EXT1和 EXT2基因变异分析，明确其致病原因，为家系的遗传咨询和产前诊断提供依据。 方法:应用二代测序(next generation sequencing，NGS)对5个MO家系的先证者进行MO相关致病基因 EXT1、EXT2外显子检测，发现可疑致病位点后，应用Sanger双向测序对家系成员和200名正常个体进行变异位点的验证分析，应用多重连接探针扩增技术(multiple ligation-dependent probe amplification, MLPA)检测对家系成员和20名正常个体进行基因缺失变异验证分析，确定致病变异后，对其中2个家系的高危胎儿进行孕中期产前诊断。 结果:5个MO家系均检出 EXT基因变异，分别为 EXT1基因第2～3外显子缺失、 EXT1基因c.1468dupC (p.Leu490ProfsX31)、 EXT1基因c.2084delC (p.Pro695LeufsX11)、 EXT2基因c.187delT(p.Phe63SerfsX29)、 EXT2基因c.1362T>G(p.Tyr454X)，其中 EXT1基因第2～3外显子缺失、 EXT1基因c.2084delC (p.Pro695LeufsX11)、 EXT2基因c.187delT(p.Phe63SerfsX29)为尚未报道的新变异，在家系正常成员和正常对照中均未发现该变异。产前诊断结果显示家系1胎儿携带 EXT1基因第2～3外显子杂合缺失变异，家系5胎儿携带 EXT2基因c.1362T>G(p.Tyr454X)杂合变异。 结论:EXT1、EXT2基因变异是5个MO家系的致病病因，致病基因的检出为家系的产前基因诊断提供了依据。

目的:探讨Potocki-Shaffer综合征(PSS)的临床诊断特点和遗传学特征。方法:对2021年2月中山大学附属第六医院儿科确诊的1例PSS患儿的临床表现、生化检查及基因检测等临床资料进行回顾性分析，并以"Potocki-Shaffer syndrome"、" ALX4 gene"" EXT2 gene"" PHF21A gene"为关键词，检索万方数据、中国知网、PubMed数据库自建库至2021年12月收录的文献，并对在线人类孟德尔遗传数据库收录的基因进行检索，总结PSS患者的临床特点和遗传学特征。 结果:本例患儿，男，5个月21 d，因"发现体重增长过快3月余"入院。患儿表现为智力障碍、运动发育迟缓、过度生长、隐匿性阴茎、听力障碍及肌张力低等。全外显子碱基序列测序发现患儿Chr11：44069455－48188946区域存在杂合缺失变异，其包含常染色体显性遗传基因 EXT2、ALX4和 PHF21A杂合缺失，临床诊断为PSS。文献检索共收集14篇文献(均为英文)，包括本例患儿共36例，其中14例为碱基变异，22例为大片段缺失。涉及 PHF21A基因23例(智力障碍22例，运动发育障碍21例，语言发育迟缓18例)，涉及 EXT2基因22例(外生骨疣13例)，涉及 ALX4基因19例(双顶骨孔15例)；36例中颅面异常27例。 结论:PSS临床表型与3个常染色体显性遗传基因 ALX4、EXT2和 PHF21A密切相关，主要表现为智力障碍、颅面异常、语言运动发育障碍、外生骨疣及双顶骨孔等；基因检测有助于PSS的临床确诊，其变异类型以单碱基变异和大片段缺失为主。

目的:基于二代测序技术探究一个均为男性发病的Lynch综合征家系的具体突变方式，并寻找针对我国Lynch综合征患者的其他潜在致病突变。方法:观察该家系中发病患者的临床特征、病理形态学及免疫表型，利用二代测序技术探究该家系是否为Lynch综合征，确定其具体突变方式，并寻找其他潜在致病突变。结果:（1）该家系结直肠癌患者肿瘤组织免疫组织化学及外周血二代测序检测均表现为高度微卫星不稳定（MSI-H）；（2）该家系以MSH2突变为首要特点，具体表现为：MSH2基因第2号外显子上的缺失突变可能会导致转录提前终止，形成功能异常或失活蛋白（MSH2 EX2 Del）；（3）NTRK1、POLE、EXT2在6例进行外周血二代测序的Lynch综合征患者中重复出现，提示其可能协同参与结直肠癌的发生。结论:Lynch综合征是常染色体显性遗传疾病，但Lynch综合征可表现为不完全外显，可能对本研究中Lynch综合征只有男性发病作出一定解释；当然，对于意义未明的突变及性别是否是导致不完全外显的潜在因素，进一步探究NTRK1、POLE、EXT2及性染色体在Lynch综合征中的意义将为其提供新的理论支撑。

目的:探讨MassARRAY核酸质谱在结核分枝杆菌(MTB)检测中的应用价值。方法:采用MassARRAY检测参考菌株MTB特定基因IS6110和ext-rd9，测定MassARRAY的最低检出限。本研究为诊断性研究。采用非随机抽样法，收集西安市胸科医院2022年9月至12月疑似结核病患者呼吸道标本和其他体液或组织标本，收集经抗酸染色阳性而分枝杆菌菌种鉴定排除MTB的培养阳性物。对患者样本采用MGIT960液体培养法(简称培养法)、实时荧光定量聚合酶链反应(qPCR)法、Gene Xpert/RIF和MassARRAY检测MTB，比较各方法阳性率。以Gene Xpert/RIF为标准，对比各方法敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、符合率、Kappa值和受试者工作特征(ROC)曲线下面积。将等量的H37Rv分别与金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌和肺炎链球菌混合，采用MassARRAY法检测MTB。对经抗酸染色阳性而分枝杆菌菌种鉴定排除MTB的84例培养阳性物进行qPCR和MassARRAY检测。结果:共收集肺源性标本126例，肺外标本92例。MassARRAY检测IS6110基因的最低检出限为10 CFU/ml，检测ext-rd9基因的最低检出限为10~10 3 CFU/ml。在218例临床标本中，MassARRAY法阳性率高于qPCR法和Xpert法，在肺源标本和肺外标本中，以及培养阳性标本和培养阴性标本中，MassARRAY法阳性率均分别高于qPCR法和Xpert法。在肺源标本中，以Xpert为标准，MassARRAY法检测MTB敏感度(98.39%)、阴性预测值(98.28%)、符合率(93.65%)和一致性(0.873)高于qPCR法和培养法，一致性与Xpert法几乎一致，其ROC曲线下面积(0.937)高于qPCR法和培养法。在肺外标本中，以Xpert为标准，MassARRAY法检测MTB敏感度(83.78%)和阴性预测值(88.00%)高于qPCR法和培养法，符合率(81.52%)高于培养法，一致性(0.624)高于培养法，与Xpert法高度一致，其ROC曲线下面积(0.819)高于培养法。H37Rv与细菌混合后，各组均可检出IS6110和ext-rd9基因。与单独H37Rv组相比，混合细菌组IS6110和ext-rd9基因检出峰值差异无统计学意义。在84株抗酸染色阳性分离菌株中，有4例堪萨斯分枝杆菌和1例巴西诺卡菌中检测到了IS6110基因。 结论:MassARRAY核酸质谱具有灵敏、准确等特点，适合对结核病患者进行早期、快速诊断，在结核病诊断中具有良好的应用前景。

目的 旨在建立一种基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)平台鉴定结核分枝杆菌及检测结核耐药突变位点的方法,并对其用于临床耐药结核病检测的应用价值进行评估.方法 采用MALDI-TOF-MS检测 3 株国家参考品菌株,测定其对于结核鉴定位点和耐药位点的最低检出限.以非随机抽样法,收集昆明市第三人民医院结核科 2023 年 1 月至9 月疑似结核病患者呼吸道样本,包括痰液样本 120 例,肺泡灌洗液样本 100 例,每例样本含量 3～5 mL.供试样本均提取核酸,先用结核荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)试剂盒筛选出Ct值≤32 的结核阳性样本,然后用MALDI-TOF-MS检测与利福平(rifampicin,RIF)、异烟肼(isoniazide,INH)、乙胺丁醇(ethambutol,EMB)、莫西沙星(moxifloxacin,MXF)、链霉素(streptomycin,SM)和吡嗪酰胺(pyrazinamide,PZA)相关的耐药基因位点.同时采用表型药敏法和三代测序(Nanopore平台)对结核阳性样本进行检测并与MALDI-TOF-MS结果进行对比分析,验证其检测耐药结核的准确性.结果 对于结核鉴定位点IS6110 和ext_RD9,MALDI-TOF-MS的最低检出限为 60～100 CFU/mL;对于结核耐药位点,MALDI-TOF-MS的最低检出限为100～1000 CFU/mL.经qPCR法鉴定Ct值≤32 的结核阳性标本共 132 例.对比表型药敏结果,MALDI-TOF-MS检测耐药的敏感度、特异度和kappa值分别是:RIF为 93.75%、100%和 0.96;INH为 98.33%、90.28%和 0.88;EMB为 83.33%、97.50%和0.78;MXF为 95.45%、100%和 0.97.与三代测序结果相比,MALDI-TOF-MS检测耐药的敏感度、特异度和kappa值分别是:RIF 为 90.91%、100%和 0.94;INH 为 92.96%、100%和 0.92;EMB 为 92.86%、100%和 0.96;MXF 为95.45%、100%和 0.97;SM为 95.74%、100%和 0.97;PZA为 66.67%、100%和 0.80.结论 MALDI-TOF-MS针对抗结核药物的耐药检测结果与表型药敏和三代测序检测结果对比高度一致,可作为快速检测结核耐药的一种有效方法.

遗传性多发性骨软骨瘤 ( hereditary multiple exostoses,HME ),又叫骨干续连症、遗传性多发性外生骨疣等,是一种以长骨干骺端出现多个良性软骨帽肿瘤为特征的常染色体显性遗传病 [1].目前认为 HME 主要是由于 ETX1 和EXT2 基因发生突变引起 [2].

目的 分析以多发骨性突起、骨密度下降为主要表现的一例罕见遗传性多发性骨软骨瘤(hereditary multiple exostoses,HME)患者的临床特点及致病基因突变.方法 评估临床特点,测量骨转换生化指标、骨密度、骨骼X线.采用二代靶向测序及Sanger测序技术检测并确定致病基因突变.通过文献复习,总结我国HME基因突变研究及HME合并骨质疏松症的国内外研究.结果 本例主要表现为多发骨性突起,X线检查提示长骨干骺端及右肩胛骨多发外生骨疣,骨转换生化指标正常,腰椎及全髋骨密度为0.973 g/cm2(Z值-1.2)、0.613 g/cm2(Z值-2.7),予阿仑膦酸钠、钙剂和维生素D治疗2 年,骨密度明显增加.患者存在EXT1 基因第 3 外显子c.1162C＞T杂合无义突变,导致蛋白糖基转移酶活性结构域缺失.文献显示,我国HME患者主要病因为EXT1 或EXT2 杂合失活性突变,无明确热点突变,尚未见HME合并骨质疏松症的报道.结论 HME是罕见的常染色体显性遗传骨病,表型主要包括多发骨性突起、肢体畸形、疼痛等,主要病因为EXT1 或EXT2 突变,EXT1 基因失活突变可能为本例患者HME合并骨质疏松症的原因,本研究丰富了HME致病基因突变谱和表型谱.