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LncRNA-HAGLROS调控miR-26b/JAK2/STAT3通路对肝癌细胞上皮间质转化的影响
编辑人员丨2024/3/16
目的 探讨长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)HAGLR互补链LncRNA(HAGLROS)调控微小RNA((miRNA,miR)-26b/非受体型酪氨酸蛋白激酶(janus kinase 2,JAK2)/信号传导和转录激活因子 3(signal trans-ducer and activator of transcription3,STAT3)通路对肝癌细胞上皮间质转化的影响.方法 获取正常肝细胞系及肝癌细胞系,依据转染情况分组,即si-NC组、si-HAGLROS组、miR-26 inhibitor组、si-HAGLROS + miR-26 inhibitor组.MTT实验检测各组细胞增殖活性,细胞划痕实验检测各组细胞迁移情况,细胞侵袭实验检测各组细胞侵袭能力,qPCR法检测HA-GLROS、miR-26b、上皮钙粘蛋白(E-cadherin,E-cad)、N-钙黏素(N-cadherin)、纤维粘连蛋白(fibronectin,FN)、抗凋亡蛋白(Bcl-2)表达,双荧光素酶报告基因实验验证LncRNA-HAGLROS与miR-26b的靶向关系.结果 肝癌细胞系Hep3B、MHCC-LM3、Huh7、SMMC-7721 中HAGLROS表达均显著高于LO2 细胞(P<0.05),miR-26b表达与之相反.生物信息学软件显示,HAGLROS可与miR-26b靶向结合.肝癌细胞功能实验显示,与si-NC组比较,si-HAGLROS组细胞增殖活性、细胞划痕愈合率、细胞穿膜数目、N-cadherin、FN、Bcl-2、p-JAK2、p-STAT3 表达均更低,E-Cadherin表达更高;而miR-26b inhibitor组细胞增殖活性、细胞划痕愈合率、细胞穿膜数目、N-cadherin、FN、Bcl-2、p-JAK2、p-STAT3 表达均更高,E-Cadher-in表达更低;si-NC组与si-HAGLROS +miR-26b inhibitor组比较,差异均无统计学意义(P>0.05).结论 LncRNA-HA-GLROS可通过靶向下调miR-26b促进肝癌细胞生物行为,如迁移、侵袭及EMT过程,同时可调控JAK2/STAT3 通路活性,LncRNA-HAGLROS可作为肝癌治疗靶点.
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编辑人员丨2024/3/16
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lncRNA在细胞自噬调控中作用的研究进展
编辑人员丨2023/8/6
细胞自噬是细胞在应激条件下降解胞内受损成分的过程,涉及多信号分子参与.在疾病发生、发展过程中,细胞自噬既可抑制或延缓疾病发展,还可使病情恶化,故寻找在不同阶段调控细胞自噬作用的因子具有重要意义.长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸序列的非编码RNA,可通过碱基配对或三维结构与下游分子结合,发挥不同的生理调控功能.近期研究发现,部分lncRNA还能通过影响多种细胞自噬相关DNA、RNA或蛋白质的生物学效应,在复杂的细胞自噬调控网络中发挥抑制、促进或双向调控细胞自噬作用.目前已发现抑制细胞自噬的lncRNA有尿路上皮癌胚抗原、心肌自噬抑制因子、HAGLROS等,促进细胞自噬的lncRNA有转移相关肺腺癌转录本1、肝癌高表达转录本、HOX转录反义RNA、SOX2OT变体7,双向调控细胞自噬的lncRNA有lncRNA H19、母系表达基因3等.
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编辑人员丨2023/8/6
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利用TCGA公共数据库挖掘乳腺癌预后相关长链非编码RNA生物标志物
编辑人员丨2023/8/5
目的 通过数据挖掘的方式分析美籍非裔乳腺导管癌/小叶癌女性患者的乳腺癌及癌旁组织中差异表达的长链非编码RNA(lncRNA),筛选出与乳腺癌生存期相关的lncRNA,并探讨其潜在的生物学意义.方法 利用TCGA数据库获取美籍非裔女性150例乳腺导管癌/小叶癌的癌组织和5例正常组织的转录组数据,采用Perl和R软件对数据进行提取、整理和分析,通过对差异表达的lncRNA进行单因素Cox回归分析,再将筛选得到的有显著性差异的基因进行多因素Cox比例风险回归模型分析,得到可将乳腺癌患者区分为高、低风险组的基因组合.采用lnCAR在线生存分析的方式验证筛选得到的基因.利用Pearson相关系数法筛选这些lncRNA的共表达基因,并将筛选得到的基因映射到metascape网站进行功能富集分析,探寻其潜在的调控网络.结果 通过生物信息学分析筛选出在乳腺癌组织和正常组织中的表达差异具有显著性意义的差异表达lncRNA:lnc00640、PCAT6、HAGLROS和lnc00506.根据这4个lncRNA的表达模式将患者分为高、低风险组,其生存时间存在显著性差异(P<0.01).这4个因素构建的模型,其一致性指数(C-index)为0.77(95% 置信区间:0.67~0.87);其受试者工作特征曲线下面积为0.82,模型具有较好的准确性.结论lnc00640、PCAT6、HAGLROS、lnc00506这4个lncRNA的表达可能对乳腺癌患者预后起重要作用,值得在大量临床样本中进行验证和后续的机制探讨.利用数据挖掘的方式筛选乳腺癌相关lncRN A是一种高效而经济的研究方式.
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编辑人员丨2023/8/5
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长链非编码RNA HAGLROS对非小细胞肺癌A549细胞迁移和侵袭能力的影响
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨长链非编码RNA HAGLROS(lncRNA HAGLROS)对非小细胞肺癌A549细胞系迁移和侵袭能力的影响.方法 采用siRNA(小RNA干扰技术)对细胞进行转染;同时采用实时荧光定量PCR技术(qPCR)检测相关目的 基因的表达水平;应用细胞划痕实验检测细胞的迁移能力;应用Transwell实验检测细胞的侵袭能力.结果 qPCR结果显示:对A459细胞进行转染后,siRNA-lncRNA HAGLROS-homo-435敲减效率最高,差异具有统计学意义(P<0.05);划痕实验和Transwell实验结果表明:实验组与对照组比较,细胞迁移能力、细胞侵袭能力均下降,差异具有统计学意义(P<0.05).结论 lncRNA HAGLROS在肺癌细胞系A549中作为促癌基因发挥作用,可为肺癌的诊断及治疗提供临床参考.
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编辑人员丨2023/8/5
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HAGLROS靶向miR-20a-5p调控高糖诱导的心肌细胞增殖和凋亡
编辑人员丨2023/8/5
目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)HAGLROS对高糖(HG)诱导的心肌细胞H9c2增殖和凋亡的影响及作用机制.方法:H9c2细胞分为对照组(NC组,细胞正常培养)、HG组(33mmol/L葡萄糖作用细胞24h)、HG+si-NC组(33mmol/L葡萄糖作用转染si-NC的细胞24 h)、HG+si-HAGLROS组(33 mmol/L葡萄糖作用转染si-HAGLROS的细胞24 h)、HG+miR-NC组(33mmol/L葡萄糖作用转染miR-NC的细胞24h)、HG+miR-20a-5p组(33mmol/L葡萄糖作用转染miR-20a-5p mimics的细胞24 h)、HG+si-HAGLROS+anti-miR-NC组(33 mmol/L葡萄糖作用于共转染si-HAGLROS与anti-miR-NC 的细胞24 h)和HG+si-HAGLROS+anti-miR-20a-5p组(33 mmol/L葡萄糖作用于共转染si-HAGLROS与anti-miR-20a-5p的细胞24 h),实时荧光定量PCR(qPCR)检测细胞中HAGLROS和miR-20a-5p表达,四甲基噻唑蓝染色法(MTT)、流式细胞术和蛋白印迹(Western blot-ting)分别检测细胞存活率、凋亡率及细胞周期蛋白Dl(CyclinDl)、活化的半胱天冬酶-3(cleaved-caspase-3)、磷酸化磷脂酰肌醇3激酶(p-PI3K)和磷酸化蛋白激酶B(p-AKT)的蛋白表达的影响.双荧光素酶报告基因实验验证HAGLROS与miR-20a-5p调控关系.结果:与NC组比较,HG组HAGLROS水平升高(P<0.05),miR-20a-5p水平降低(P<0.05),H9c2细胞存活率和CyclinDl蛋白水平降低(P<0.05),而细胞凋亡率和cleaved-caspase-3蛋白水平升高(P<0.05).与HG+si-NC组比较,HG+si-HAGLROS组H9c2细胞存活率和CyclinD1、p-PI3K和p-AKT蛋白水平升高(P<0.05),而细胞凋亡率和cleaved-caspase-3蛋白水平降低(P<0.05).与HG+miR-NC组,HG+miR-20a-5p组H9c2细胞存活率和CyclinD1蛋白表达升高(P<0.05),而细胞凋亡率和cleaved-caspase-3蛋白表达降低(P<0.05).与HG+si-HAGLROS+anti-miR-NC组比较,HG+si-HAGLROS+anti-miR-20a-5p组H9c2细胞存活率和CyclinD1、p-PI3K和p-AKT蛋白表达降低(P<0.05),而细胞凋亡率和cleaved-caspase-3蛋白表达升高(P<0.05).HAGLROS在H9c2细胞中靶向负调控miR-20a-5p表达.结论:低表达HAGLROS可促进HG诱导的心肌细胞增殖且抑制细胞凋亡,其作用机制与上调miR-20a-5p表达和激活PI3K/AKT信号通路有关.
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编辑人员丨2023/8/5
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长链非编码RNA在帕金森病中的研究进展
编辑人员丨2023/8/5
帕金森病(Parkinson's disease,PD)是一种以运动和非运动为特征的慢性、进行性神经退行性疾病,主要是由于大脑黑质中多巴胺能神经元(Dopaminergic neuron、DAN)的逐渐丧失,表现出静止性震颤、强直、姿势不稳定和运动迟缓等主要特征.长链非编码RNA(Long non-coding RNA,LncRNA)是长度超过200个核苷酸,无蛋白质编码能力的RNA,但可参与调控细胞的各种生物过程.LncRNA通过参与α-突触核蛋白(α-Synuclein,α-Syn)、线粒体功能障碍、氧化应激、钙稳定、轴突传输和神经炎症等不同的生理过程在RNA的转录水平、表观遗传调控或转录后水平参与PD的病理进程,对PD的发病机制和疾病进展的有重要的影响.在这里,我们回顾了与PD相关的常见LncRNA(Malat1、SNHG1、LncRNA-p21、NEAT1、AS UCHL1、HOTAIR、HAGLROS)相关研究,为基于lncRNA的PD的诊断、治疗及预后提供新的思路.
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编辑人员丨2023/8/5
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长链非编码RNA HAGLROS调控miR-26b/JAK2/STAT3通路对肝癌细胞上皮间质转化的影响
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)HAGLR互补链lncRNA(HAGLROS)能否通过微小RNA-26b(miR-26b)/Janus激酶2(JAK2)/转录激活因子3(STAT3)轴来调控肝癌增殖、迁移、侵袭和上皮间质转化(EMT).方法 通过实时荧光定量PCR(qPCR)检测正常肝细胞系LO2和肝癌细胞(Hep3B、MHCC-LM3、Huh7、SMMC-7721)的HAGLROS和miR-26b水平.用双荧光素酶报告实验鉴定HAGLROS与miR-26b的相互作用.分别转染HAGLROS干扰序列si-HAGLROS和miR-26b抑制剂(inhibitor)至SMMC-7721细胞.挽救实验通过转染miR-26b inhibitor同时干扰HAGLROS表达.将SMMC-7721细胞分为si-NC组、si-HAGLROS组、miR-26b inhibitor组和si-HAGLROS+miR-26b inhibitor组.分别利用MTT法、划痕实验和Tr-answell实验检测SMMC-7721细胞增殖、迁移和侵袭情况.通过检测E-钙黏蛋白(E-cad)、N-钙黏蛋白(N-cad)和纤维粘连蛋白(FN)水平以评估EMT过程.qPCR和Western blotting检测B细胞淋巴瘤2(Bcl-2)、磷酸化JAK2(p-JAK2)和磷酸化STAT3(p-STAT3)的水平.结果 与LO2细胞相比,肝癌细胞的HAGLROS水平升高,而miR-26b水平降低(P<0.05);在线生物信息学预测和荧光素酶报告分析证实miR-26b能够与HAGLROS靶向结合.细胞功能丧失实验表明,与si-NC组相比,SMMC-7721细胞的增殖、迁移和侵袭能力及N-cad、FN、Bcl-2、p-JAK2和p-STAT3水平在si-HAGLROS组中降低而在miR-26b inhibitor组中增加,E-cad水平则在si-HAGLROS组中升高而在miR-26b inhibitor组中降低,上述差异均有统计学意义(P<0.05);挽救实验表明,与si-HAGLROS组相比,si-HAGLROS+miR-26b inhibitor组SMMC-7721细胞的增殖、迁移和侵袭能力及N-cad、FN、Bcl-2、p-JAK2和p-STAT3水平增加,而E-cad水平降低,上述差异均有统计学意义(P<0.05).结论 HAGLROS通过靶向miR-26b促进肝癌细胞迁移、侵袭和EMT过程并调控JAK2/STAT3信号通路活性,为HAGLROS作为肝癌的干预治疗的新靶点提供新思路.
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编辑人员丨2023/8/5
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肿瘤中HAGLR反义长链非编码RNA的表达与机制研究
编辑人员丨2023/8/5
长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA.随着研究不断深入,越来越多的证据表明lncRNA广泛参与调控机体病理生理过程,影响着人类疾病与肿瘤的发生发展.HAGLR反义长链非编码RNA(HAGLR opposite strand long non-coding RNA,lncRNA HAGLROS)在诸多肿瘤中呈异常高表达,对肿瘤的恶性生物学行为起重要的调控作用.本文就lncRNA HAGLROS在肿瘤中的表达与调控机制做一简要综述.
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编辑人员丨2023/8/5
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长链非编码RNA HAGLROS在胃癌中的生物信息学分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 利用生物信息学方法分析长链非编码RNA HAGLROS在胃癌中的意义,对HAGLROS的靶基因及相关生物学过程和通路进行预测,并建立HAGLROS-miRNA-mRNA网络.方法 运用UCSC Xena、UALCAN、GEPIA数据库进行基因在胃癌中的差异表达分析;癌症基因组图谱(TCGA)数据库结合R语言分析HAGLROS的共表达基因;STRING数据库结合Cytoscape软件进行蛋白质互作网络(PPI)分析及关键基因的筛选;miRDB、LncBase、RNAhybrid数据库预测与HAGLROS相互作用的微小RNA(miRNA);miRDB、miRTarBase、TargetScan数据库结合R语言进行miRNA下游靶基因的预测;R语言及WebGestalt、Metascape在线数据库进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析;运用R软件对结果进行绘图.结果 HAGLROS在胃癌中高表达,与胃癌患者的总生存期相关.HAGLROS在胃癌中的共表达基因有301个,可能与胚胎器官生长发育、神经生长等生物学过程以及Wnt、Notch、干细胞多能性调控等信号通路有关,其关键基因与胚胎生长发育及神经生长密切相关.NES、FGF8、FGF3可能是与HAGLROS联系最为密切的3个基因.HAGLROS-miR-1976-ORAI2轴可能参与调控胃癌发生发展的过程.结论 HAGLROS在胃癌中高表达,可能与胚胎生长发育和神经生长生物学过程以及Wnt、Notch、干细胞多能性调控等信号通路有关,其可能是通过调控关键基因NES、FGF8、FGF3以及HAGLROS-miR-1976-ORAI2轴促进胃癌的发生发展,影响胃癌患者的预后.
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编辑人员丨2023/8/5
