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137Cs γ射线全身照射对小鼠骨髓细胞中circRNA m 6A修饰谱的影响
编辑人员丨5天前
目的:研究电离辐射对小鼠骨髓细胞中环状RNA(circular RNA,circRNA)的N 6-甲基腺嘌呤(N 6-methyladenine,m 6A)修饰谱的影响,为揭示RNA表观遗传修饰与放射性造血系统损伤之间的关系提供科学依据。 方法:将24只C57BL/6 J小鼠按随机数表法分为健康对照组和照射组,每组12只。照射组用4 Gy 137Cs γ射线对小鼠进行全身照射。照后将两组小鼠脱颈处死,收集股骨中的骨髓细胞。提取总RNA,通过m 6A RNA免疫沉淀-高通量测序(MeRIP-Seq)技术和生物信息学分析方法,探究小鼠受照后骨髓细胞中circRNA m 6A修饰谱的变化。运用MeRIP-qPCR实验对变化显著的m 6A修饰位点进行验证。 结果:健康对照组和照射组中各鉴定出325和455个(其中两组共有178个,健康对照组特有147个,照射组特有277个)circRNA的m 6A修饰位点。健康对照组和照射组中各鉴定出1 275和1 017个(其中两组共有767个,健康对照组特有508个,照射组特有250个)发生m 6A修饰circRNA的来源基因。与健康对照组相比,照射组中有414个m 6A位点的富集倍数显著上调,178个m 6A位点的富集倍数显著下调,差异具有统计学意义( P < 10 -10;倍数筛选阈值> 5)。基因本体论(GO)分析显示,电离辐射后小鼠骨髓细胞中m 6A修饰水平显著改变的circRNA来源基因涉及染色质相关调控、纤毛转换纤维和多聚(A)特异性核糖核酸酶活性等多种功能。京都基因与基因组百科数据库(KEGG)分析显示,电离辐射后小鼠骨髓细胞中m 6A修饰水平显著改变的circRNA来源基因涉及血小板激活、Fc γ R-介导的吞噬作用和B细胞受体信号通路等多种通路。 结论:电离辐射可引起小鼠骨髓细胞中circRNA的m 6A修饰谱的迅速改变,差异甲基化的circRNA的来源基因涉及多种造血系统放射生物学相关的功能通路。该研究为从表观遗传水平揭示造血系统辐射损伤的分子机制奠定基础。
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编辑人员丨5天前
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M6A修饰EGLN3、FOSL2参与鼻咽癌辐射抗拒
编辑人员丨5天前
目的:基于芯片数据并通过细胞实验验证鼻咽癌受m6A甲基化调控的关键放射抗拒基因。方法:从GEO数据库分别下载鼻咽癌放射抗拒基因与鼻咽癌m6A调控基因以及鼻咽癌基因mRNA表达谱芯片数据,使用R软件进行差异基因的筛选与统计学分析,采用生物信息学方法对这些基因进行生物学过程、信号通路及互作网络分析。分别通过敲低m6A调控因子、放射抵抗株构建,以实时反转录PCR(qRT-PCR)和蛋白质印迹法对上述鼻咽癌m6A差异放射抗拒基因进行筛选验证。甲基化RNA免疫共沉淀后实时定量PCR(MeRIP-qPCR)验证筛选基因的m6A修饰及与甲基转移酶3(METTL3)直接结合的能力。在鼻咽癌细胞中转染筛选基因的siRNA,电离辐射处理后,用CCK-8、EdU法检测细胞增殖,流式细胞术检测细胞凋亡和细胞周期,克隆形成实验检测放射敏感性。通过配对 t检验,比较电离辐射处理后对照组与EGLN3敲减组Fe 2+丰度及脂质过氧化程度的差异趋势。 结果:芯片数据GSE48501与GSE200792、GSE53819交集得到6个差异基因,分别是 EGLN3、 FOSL2、 ADM、 JUN、 VEGFA、 PRDM1。经TNMplot、KMplot等生信数据平台进一步筛选得到目标基因 EGLN3、 FOSL2。目标基因mRNA直接与METTL3结合并受到其介导的m6A修饰。目标基因在电离辐射后的亲代细胞中呈现剂量、时间梯度上调;在放射抵抗细胞中也显著上调。沉默 EGLN3/ FOSL2后的鼻咽癌细胞经照射处理后,细胞增殖活性下降更多,与未下调者的放射增敏比的差异有统计学意义。沉默 EGLN3后的鼻咽癌细胞经照射处理后,显著下调谷胱甘肽过氧化物酶4(GPX4)表达,并进一步增加Fe 2+丰度及脂质过氧化程度,通过诱发铁死亡发挥放疗增敏作用。 结论:EGLN3、FOSL2在鼻咽癌中通过METTL3介导的m6A甲基化修饰发挥放射抵抗作用;下调EGLN3并联合电离辐射可以增加鼻咽癌细胞内Fe 2+丰度、脂质过氧化程度并降低GPX4表达,以铁死亡途径增鼻咽癌放射敏感性。
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编辑人员丨5天前
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心肌梗死小鼠心肌组织的m6A甲基化分析
编辑人员丨5天前
目的:发现心肌梗死(MI)小鼠心肌组织中N6-腺苷酸甲基化(m6A)差异修饰的基因并探讨其在MI中可能参与的病理过程。方法:取8~10周龄的SPF级C57BL/6J雄性小鼠18只,按照随机数字表法将其分为MI组( n=9)和对照组( n=9)。应用RNA甲基化测序(MeRIP-seq)检测2组小鼠心肌组织的m6A修饰基因,通过生物信息学分析如主成分分析和GO富集分析探索MI小鼠心肌组织RNA甲基化修饰的特征并进行表达量、m6A修饰水平的验证及其功能预测。 结果:聚类热图分析显示相比于对照组,MI组m6A修饰水平上调和下调的基因分别有537个和364个。主成分分析显示对照组和MI组的m6A修饰差异可显著区分。m6A修饰的特征性序列为GGACU且主要集中在蛋白质编码区。RNA-seq和MeRIP-seq联合分析显示发生差异m6A修饰同时伴随mRNA差异表达的基因有119个。韦恩图显示不同基因m6A修饰差异和mRNA表达差异。GO富集分析显示MI组中发生m6A差异修饰的基因主要参与心脏发育等过程。qPCR验证得知Gbp6水平上升、Dnaja1和Dnajb1水平下降,MeRIP-qPCR验证可知Hspa1b的m6A修饰水平下调。结论:MI小鼠心肌组织中存在m6A差异修饰,发生m6A差异修饰的基因可能受甲基化相关酶的影响,进而通过调控凋亡和炎症影响心肌梗死的发生发展。
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编辑人员丨5天前
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激素性股骨头坏死中甲基转移酶3介导谷胱甘肽过氧化酶7的m 6A修饰促进骨髓间充质干细胞的增殖和成骨分化
编辑人员丨5天前
目的:探讨在激素性股骨头坏死中甲基转移酶3(METTL3)介导的m 6A修饰在骨髓间充质干细胞增殖和成骨分化中的作用及其机制。 方法:收集河南省人民医院2020年9月至2021年9月因激素性股骨头坏死或股骨颈骨折行髋关节置换患者的股骨骨髓液,满足纳入标准共23例,设激素性股骨头坏死患者为坏死组共12例,股骨颈骨折患者为对照组共11例,分离培养骨髓间充质干细胞(BMSC),利用聚合酶链反应(qRT-PCR)检测METTL3在两组BMSC中的表达水平;利用细胞计数试剂盒(CCK-8)检测两组BMSC在培养24、48、72 h后的增殖活性;利用茜素红染色检测两组BMSC的成骨分化能力。利用METTL3过表达质粒上调坏死组细胞中METTL3的水平,并验证METTL3水平对坏死组BMSC增殖及成骨活性的影响,进一步通过转录组测序和m6A免疫共沉淀寻找METTL3调控的靶基因。两组间比较采用两独立样本 t检验,多组间比较采用单因素方差分析(ANOVA),通过Pearson相关系数检验METTL3与谷胱甘肽过氧化酶7(GPX7)之间的线性关系。 结果:坏死组BMSC中m6A含量低于对照组细胞[(3.56±1.66)%比(14.94±2.48)%, t=12.150, P<0.01],差异有统计学意义。qRT-PCR的结果显示METTL3在对照组BMSC表达量高于坏死组BMSC(1.13±0.04比0.44±0.06, t=5.579, P<0.01),差异有统计学意义。CCK-8实验结果显示对照组BMSC培养24、48、72 h后的吸光度值高于坏死组BMSC(0.41±0.03比0.26±0.02, t=6.759, P<0.01,0.75±0.05比0.44±0.08, t=7.334, P<0.01、1.38±0.07比0.51±0.02, t=9.206, P<0.01),差异有统计学意义。茜素红染色显示对照组BMSC阳性染色面积/总面积高于坏死组BMSC(0.68±0.06比0.18±0.03, t=7.908, P<0.01),差异有统计学意义。上调坏死组中METTL3表达水平后,CCK-8实验结果显示坏死组BMSC培养24、48、72 h后的吸光度值高于上调前坏死组细胞(0.61±0.04比0.23±0.02, t=6.433, P<0.01、1.03±0.08比0.39±0.03, t=8.090, P<0.01,1.62±0.11比0.55±0.06, t=9.387, P<0.01),差异有统计学意义。同样地,茜素红染色显示坏死组过表达METTL3后的阳性染色面积/总面积高于过表达前(0.83±0.09比0.21±0.04, t=14.630, P<0.01),差异有统计学意义。通过转录组测序发现,在BMSC中上调METTL3的表达水平后,GPX7的表达显著增高,m6A免疫共沉淀验证METTL3上调后GPX7 mRNA的m6A修饰水平高于坏死组细胞GPX7 mRNA的m6A修饰水平(2.85±0.85比0.97±0.18, t=10.260, P<0.01),差异有统计学意义。 结论:METTL3通过m 6A修饰正向调控GPX7的表达水平,促进激素性股骨头坏死中BMSC的增殖和成骨分化。
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编辑人员丨5天前
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脂肪酸合成酶基因的N6-甲基腺苷异常修饰与2型糖尿病的关联性研究
编辑人员丨5天前
目的:探讨脂肪酸合成酶( FASN)mRNA的N6-甲基腺苷(m 6A)异常修饰与2型糖尿病(T2DM)之间是否存在关联。 方法:选择2021年12月至2022年12月期间在首都医科大学宣武医院神经介入科行颈动脉内膜剥脱术的40例T2DM患者及50例健康对照作为研究对象。应用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)和RNA甲基化免疫沉淀定量聚合酶链反应(MeRIP-qPCR)技术检测研究对象脂肪组织中 FASN mRNA表达水平和 FASN mRNA的m 6A修饰水平。随后在首都医科大学宣武医院健康管理中心2018至2023年“功能社区队列”中应用巢式病例对照研究设计,以2018年为基线,以5年后的新发T2DM者为新发T2DM组(87例),按1∶1个体匹配方法匹配健康对照者作为对照组,在外周血中对结果进行验证。采用 t检验比较不同组别间 FASN mRNA表达水平和 FASN mRNA的m 6A修饰水平的差异,并采用Spearman相关分析法分析两者的相关性。使用多因素二元logistic回归模型评估 FASN mRNA的m 6A修饰水平与T2DM的关联强度。构建受试者工作特征(ROC)曲线,评价 FASN mRNA的m 6A修饰水平预测T2DM的能力。 结果:无论在脂肪组织还是外周血中,与对照组比较,T2DM组患者的 FASN mRNA均高表达(脂肪组织分别为1.30±0.38和0.70±0.30, P<0.001;外周血分别为1.25±0.76和1.02±0.45, P<0.01),而 FASN mRNA的m 6A修饰水平较低(脂肪组织分别为0.53±0.24和0.84±0.53, P<0.001;外周血分别为0.67±0.55和1.54±0.87, P<0.001),且两者呈负相关(脂肪组织 r=-0.360, P<0.001;外周血 r=-0.192, P<0.05)。基线外周血 FASN mRNA的低m 6A修饰水平是T2DM发病的危险因素(OR=5.71,95%CI 1.73~18.85)。ROC曲线结果显示, FASN mRNA的m 6A修饰水平对T2DM的预测效果较好(曲线下面积0.817,95%CI 0.753~0.888)。 结论:FASN mRNA的m 6A异常修饰与T2DM存在关联,且 FASN mRNA的m 6A修饰水平对T2DM有较好的预测价值。
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编辑人员丨5天前
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m 6A修饰调控 RP11-426A6.5在喉鳞状细胞癌中的作用及机制研究
编辑人员丨5天前
目的:探究N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m 6A)修饰调控 RP11-426A6.5在喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)发生与发展过程中的作用机制。 方法:收集2017年1月至9月哈尔滨医科大学附属第二医院耳鼻咽喉头颈外科收治的48例LSCC患者的癌及癌旁组织,选取其中3例LSCC样本利用长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)m 6A甲基化芯片及表达谱芯片技术检测lncRNAs的甲基化和表达水平并筛选关键lncRNA。通过甲基化RNA免疫共沉淀-定量PCR(methylated RNA immunoprecipitation-quantitative PCR,MeRIP-qPCR)及实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)在其余45例LSCC样本中验证 RP11-426A6.5的m 6A修饰和表达水平,并分析 RP11-426A6.5与肿瘤恶性程度、预后等临床因素间的相关性。在体外,运用RNA干扰(RNA interference,RNAi)技术构建低表达 RP11-426A6.5喉癌细胞系,以EdU细胞增殖检测实验、伤口愈合实验、Transwell侵袭实验分别观察LSCC细胞的增殖、迁移、侵袭等生物学功能变化,以裸鼠成瘤实验验证 RP11-426A6.5下调后对体内移植瘤生长的影响。应用TCGA数据库及SRAMP网站预测介导 RP11-426A6.5 m 6A修饰的相关酶及相应甲基化位点,选用MazF酶切法对结合位点验证。运用RNAi技术在细胞水平干扰修饰酶相应基因表达后观察细胞功能的改变并利用MeRIP-qPCR检测 RP11-426A6.5 m 6A水平变化,以放射线菌素D处理细胞系观察 RP11-426A6.5稳定性改变。 结果:LSCC组织中 RP11-426A6.5甲基化及表达水平明显高于癌旁组织[ RP11-426A6.5甲基化水平:癌组织(23.828±4.975)比癌旁组织(20.280±3.607), RP11-426A6.5表达水平:癌组织(1.197±0.314)比癌旁组织(1.015±0.170), P值均<0.05],且 RP11-426A6.5表达水平与肿瘤大小(T期)密切相关[T1-2期(1.081±0.298)比T3-4期(1.306±0.292),χ 2=5.35, P<0.05]。 RP11-426A6.5高表达患者的术后生存期明显低于低表达组患者,差异有统计学意义( P=0.046)。体内外试验结果显示下调 RP11-426A6.5后LSCC细胞增殖、迁移、侵袭能力显著下降且移植瘤生长受到明显抑制。m 6A修饰酶中甲基化转移酶样蛋白3(methyltransferase-like 3,METTL3)与 RP11-426A6.5相应甲基化位点结合增强其稳定性并介导其对LSCC细胞恶性行为的调控。 结论:RP11-426A6.5能够调控LSCC细胞的恶性行为并受到甲基转移酶METTL3所参与的m 6A修饰过程调控。
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编辑人员丨5天前
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低氧上调甲基转移酶RNA结合蛋白15通过AGAP2-AS1促乳腺癌侵袭的机制
编辑人员丨5天前
目的:探索低氧诱导乳腺癌细胞RNA结合蛋白15(RBM15)表达上调促进癌侵袭的作用及机制。方法:分析基因型-组织表达(GTEx)和癌症基因图谱(TCGA)数据库中乳腺癌组织甲基转移酶RBM15和低氧诱导因子-1α(HIF-1α)表达水平及患者预后。使用实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)、Western blot比较常氧(20%O 2)和低氧(1%O 2)培养乳腺癌细胞MCF7、MDA-MB-231、BT20和HCC1143的RBM15、AGAP2反义RNA 1(AGAP2-AS1)表达,采用甲基化转录组RNA免疫共沉淀结合qPCR(MeRIP-qPCR)检测AGAP2-AS1的RNA甲基化修饰;采用Transwell实验检测细胞侵袭能力。后用小干扰RNA(siRNA)或质粒敲低或过表达RBM15,在敲低RBM15的细胞中同时过表达AGAP2-AS1,检测AGAP2-AS1甲基化修饰水平和表达水平变化,采用Transwell检测各组细胞侵袭能力变化。两样本间的比较采用 t检验。 结果:GTEx和TCGA数据库乳腺癌组织RBM15呈过表达( P<0.05),且与不良预后——无病生存期(DFS)降低相关[风险比( HR)=0.91],RBM15和HIF-1α的表达水平呈正相关( R=0.3)。低氧组MCF7、MDA-MB-231、BT20和HCC1143细胞中RBM15的mRNA和蛋白表达水平均高于对应常氧组细胞( t=3.042、7.103、4.977、3.227, P<0.05),低氧组AGAP2-AS1的表达水平均升高( t=9.830、3.497、22.780、7.140, P<0.05);低氧组BT20细胞AGAP2-AS1的m6A甲基化修饰水平升高( t=10.460, P<0.05)。低氧培养促进了MDA-MB-231、BT20细胞的侵袭,敲低MDA-MB-231、BT20细胞RBM15表达后细胞侵袭能力下降,在敲低RBM15的BT20细胞中同时过表达AGAP2-AS1后细胞侵袭能力恢复。在低氧培养的BT20细胞中敲低RBM15表达后AGAP2-AS1的m6A甲基化修饰水平(si-RBM15#1组 t=6.815,si-RBM15#2组 t=34.350)和表达水平(si-RBM15#1组 t=16.660,si-RBM15#2组 t=7.323)均显著下调( P<0.05)。在常氧培养的BT20细胞中过表达RBM15后AGAP2-AS1甲基化水平(Lv-RBM15#1组 t=16.270,Lv-RBM15#2组 t=9.340)和表达水平(Lv-RBM15#1组 t=14.040,Lv-RBM15#2组 t=9.949)均上调( P<0.05)。 结论:乳腺癌的低氧压力诱导RBM15上调,通过调控AGAP2-AS1的m6A甲基化修饰和表达水平,促进细胞侵袭。
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编辑人员丨5天前
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METTL3 N6-甲基腺嘌呤修饰circSAFB2调控骨肉瘤细胞侵袭和凋亡
编辑人员丨5天前
目的:观察甲基转移酶(METTL3)介导N6-甲基腺嘌呤(m6A)修饰修饰circSAFB2对骨肉瘤细胞侵袭和凋亡的影响。方法:选取经病理确诊的骨肉瘤标本16例及骨肉瘤细胞株MG63,qRT-PCR检测骨肉瘤组织与MG63细胞中METTL3 mRNA和circSAFB2的表达水平。使用SRAMP prediction server在线预测软件对circSAFB2中m6A甲基化位点进行预测,并通过m6A MeRIP-qPCR对骨肉瘤组织和MG63细胞中circSAFB2存在m6A甲基化修饰进行验证。应用MeRIP-qPCR检测骨肉瘤组织和MG63细胞中circSAFB2 m6A甲基化修饰水平。分别将METTL3 siRNA重组慢病毒、METTL3 NC重组慢病毒感染骨肉瘤细胞后,通过放线菌素D、Transwell和流式细胞仪分别检测各组细胞RNA稳定性、侵袭和凋亡,两样本两组间比较用 t检验;多组间比较采用单因素方差分析、组间比较采用LSD法。 结果:METTL3 mRNA(2.354±0.224)和circSAFB2(2.072±0.264)在骨肉瘤组织中的表达量高于癌旁组织(1.000±0.089、1.000±0.104, P<0.05)。骨肉瘤细胞系MG63中METTL3(2.429±0.211)和circSAFB2 mRNA(2.271±0.214)表达量高于正常人成骨细胞(1.000±0.100、1.000±0.136, P<0.05)。SRAMP在线m6A甲基化位点预测结果显示,circSAFB2的115和234位存在m6A甲基化修饰位点;骨肉瘤组织和MG63细胞中,m6A抗体免疫共沉淀的circSAFB2丰度(18.397±1.627、23.338±2.225)均显著高于IgG抗体(1.000±0.130、1.000±0.060, P<0.01),证实circSAFB2上存在m6A甲基化修饰。MeRIP-qPCR检测结果显示,骨肉瘤组织circSAFB2 m6A RNA甲基化修饰水平(3.264±0.217)高于癌旁组织(1.000±0.070, P<0.05);MG63细胞中circSAFB2 m6A RNA甲基化修饰水平(3.379±0.205)高于正常人成骨细胞(1.000±0.064, P<0.05)。转染METTL3 siRNA重组慢病毒的MG63细胞(si-METTL3组),放线菌素D处理6 h和12 h,circSAFB2表达水平(72.570±4.809、52.195±3.081)低于转染METTL3 NC重组慢病毒组(si-NC组)(87.540±5.539、71.131±4.320, P<0.05)。si-METTL3组侵袭数量(54.333±6.429)低于si-NC组(124.667±13.577, P<0.05);凋亡率[(25.105±1.638)%]高于si-NC组[(7.241±0.533)%, P<0.05]。 结论:骨肉瘤组织细胞中METTL3可通过m6A修饰circSAFB2调控骨肉瘤细胞的侵袭和凋亡。
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编辑人员丨5天前
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METTL3/DUXAP8轴促进涎腺腺样囊性癌细胞的增殖、迁移和侵袭
编辑人员丨2024/7/6
目的:研究甲基转移酶样3(METTL3)介导的m6A修饰调控双同源盒A假基因8(DUXAP8)对涎腺腺样囊性癌细胞SACC-LM的增殖、迁移和侵袭能力的影响及其潜在的分子机制.方法:通过肿瘤组织和癌旁组织全转录组测序筛选出差异基因DUXAP8并进行qRT-PCR验证;采用m6A修饰位点预测网站SRAMP预测DUXAP8上的m6A修饰位点;qRT-PCR、Western blot检测m6A修饰和上皮-间质转化(EMT)相关基因mRNA及蛋白水平.干扰或过表达METTL3和DUXAP8,通过CCK-8、划痕、侵袭实验检测各组细胞的增殖、迁移和侵袭能力;结合MeRIP-qPCR检测METTL3和DUXAP8的相关性.结果:DUXAP8在SACC肿瘤组织的表达显著高于癌旁组织(P<0.05);干扰DUXAP8可以显著抑制SACC-LM细胞的增殖、迁移和侵袭能力以及EMT相关基因表达水平(P<0.05);DUXAP8上存在多个可信度较高的m6A修饰位点;METTL3在肿瘤组织高表达且较其他相关基因差异最为显著(P<0.05);METTL3作为甲基转移酶调控DUXAP8的表达;下调METTL3可以显著抑制SACC-LM细胞的增殖、迁移和侵袭能力,并可部分逆转DUXAP8过表达对这些能力的促进作用(P<0.05).结论:METTL3介导的m6A修饰上调DUXAP8的表达,从而促进了 SACC细胞的增殖、迁移和侵袭能力.
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编辑人员丨2024/7/6
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长链非编码RNA THAP7-AS1通过调控METTL3介导的m6A修饰影响胃癌细胞的糖酵解
编辑人员丨2024/4/27
目的:探究长链非编码 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)THAP7-AS1 通过影响甲基转移酶样 3(methyltransferase like protein 3,METTL3)介导的N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)修饰调控胃癌(gastric cancer,GC)细胞糖酵解的机制.方法:利用 Gene Expression Profiling Interactive Analysis(GEPIA)数据库分析THAP7-AS1和METTL3 mRNA在GC组织中的表达水平及其与患者预后的关系;对遵义医科大学附属第三医院(遵义市第一人民医院)肿瘤科收集的80例GC患者的肿瘤组织及癌旁组织标本进行实时荧光定量PCR和蛋白印迹检测以验证GC组织中THAP7-AS1、METTL3 mRNA、GLUT1 mRNA和METTL3蛋白的表达水平,并分析THAP7-AS1的表达水平与患者临床病理特征间的关系;采用实时荧光定量PCR和蛋白印迹法在GES-1、BGC-823和SGC-7901细胞中验证THAP7-AS1、METTL3 mRNA、GLUT1 mRNA和METTL3蛋白的表达水平.通过慢病毒转染法敲减THAP7-AS1或过表达METTL3,并采用实时荧光定量PCR和蛋白印迹法检测不同处理对GC细胞METTL3 mRNA、GLUT1 mRNA和METTL3蛋白表达水平的影响;采用比色法和RNA甲基化免疫共沉淀(methylated RNA immunoprecipitation,MeRIP)-定量 PCR(quantitative PCR,qPCR)法分别检测不同处理对GC细胞总RNA的m6A修饰水平和GLUT1的m6A修饰水平的影响;用糖酵解压力测试试剂盒检测不同处理对GC细胞的细胞外酸化率(extracellular acidification rate,ECAR)、葡萄糖摄取量和乳酸产量的影响;采用蛋白印迹法检测不同处理对GC细胞中METTL3、GLUT1、PKM2和LDHA蛋白表达水平的影响;采用EdU染色、细胞划痕实验和Transwell小室实验检测不同处理对GC细胞的增殖、迁移和侵袭能力的影响.最后构建裸鼠GC皮下移植瘤模型,通过检测移植瘤的体积、质量、肿瘤组织中THAP7-AS1及METTL3和GLUT1蛋白的表达水平来分析敲减THAP7-AS1表达对GC移植瘤生长的影响.结果:GEPIA数据库分析结果显示GC组织中THAP7-AS1和METTL3的表达水平高于正常胃组织,且THAP7-AS1和METTL3表达水平与患者的总生存期呈负相关(P<0.05);与癌旁组织(或正常胃粘膜上皮细胞)相比,GC组织(或GC细胞)中THAP7-AS1、METTL3 mRNA、GLUT1 mRNA和METTL3蛋白的表达水平显著升高,且THAP7-AS1的表达水平越高,GC患者的TNM分期越高、肿瘤分化程度越低、微血管越容易浸润且越容易发生淋巴结转移(P<0.05).降低 THAP7-AS1 表达后,GC 细胞中的 METTL3 mRNA、GLUT1 mRNA和METTL3蛋白表达水平降低;总RNA和GLUT1的m6A修饰水平降低;ECAR水平、葡萄糖摄取量及乳酸生成量降低;细胞EdU阳性率及划痕愈合率降低且侵袭细胞数减少;糖酵解相关蛋白(METTL3、GLUT1、PKM2和LDHA)的表达水平降低;而过表达METTL3可部分逆转低表达THAP7-AS1对GC细胞产生的这些影响(P<0.05).在体内模型中,降低THAP7-AS1表达能显著抑制小鼠移植瘤的生长(P<0.05).结论:lncRNA THAP7-AS1通过影响METTL3介导的m6A修饰来调控GC细胞的糖酵解水平,进而影响GC细胞的增殖、迁移及侵袭.
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编辑人员丨2024/4/27
