无义介导的mRNA降解(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)是一种重要的mRNA质量监测机制,可以识别和降解含有提前终止密码子(premature termination codons,PTCs)的异常转录本,但其详细的分子机制还没有完全阐释清楚.纤毛虫是真核生物进化最早的一个分支,对其NMD途径的研究有助于阐明高等生物基因表达调控的进化与分子机制.该研究从纤毛虫八肋游仆虫(Euplotes octocarinatus)基因组中鉴定并克隆得到NMD因子EuUPF1、EuUPF2、Eu Y14a、EuY14b和EuMA GO的基因.酵母双杂交和体外pull-down实验分析证实了各因子间的相互作用关系:EuUPF1的CH结构域与EuUPF2的C-端结构域相互作用;Y14的两个同源体(paralogs)EuY14a和EuY 14b,作为mRNA结合蛋白,均与EuMAGO发生相互作用,形成真核生物mRNA外显子连接复合体(exon-exon junction complex,EJC)的核心.一方面,EuUPF1的CH结构域与EuY14a直接相互作用,结合到异常mRNA上;另一方面,EuUPF1可以通过EuUPF2与EuMAGO相互作用,后者再与EuY 14a和EuY 14b相互作用,把EuUPF1锚定到异常mRNA上.总之,EuUPF1通过两种方式结合在mRNA上,招募各种核酸酶,降解异常的mRNA.因为游仆虫基因组中内含子含量低于高等真核生物,而又远高于酵母真菌,因此研究者认为,依赖EJC和不依赖EJC的两种NMD途径可能共存于游仆虫细胞中,但这两种NMD途径具体的分子机制有待深入研究.

细胞内泛素化调控是一个由泛素化和去泛素化协同调控的动态平衡可逆过程.去泛素酶(DUBs)是介导蛋白质去泛素化过程的蛋白质家族,它在许多复杂的细胞过程中发挥着关键作用,但其生物学特征尚未完全阐明.作为去泛素化酶的一种,USP 10在许多生物过程和癌症中都发挥重要的作用.为了进一步探索USP10在细胞中的功能,采用免疫沉淀与质谱联用(IP-MS)的方法鉴定USP10的相互作用蛋白质.通过Flag柱子的富集方式(Flag-USP10 IP-MS)共鉴定出165个与USP 10相互作用蛋白质.通过USP10内源抗体的富集方式(USP10 antibody IP-MS)鉴定出192个USP10相互作用蛋白质.基因本体(GO)分析表明,USP10的互作蛋白质中存在一组与无义介导的mRNA降解(NMD)相关蛋白质,包括无NMD的核心因子UPF1(Up-frameshift 1).进一步验证了USP10和UPF1在细胞质中共定位.此外,还确定了UPF1通过其HD结构域与全长的USP10相互作用.本研究提供了新的USP10相互作用蛋白质,为探索其在RNA调控和NMD通路中的重要性提供线索.

神经母细胞瘤扩增序列基因(NBAS基因)缺陷可导致常染色体隐性遗传病,是一种罕见的基因缺陷.该基因缺陷可累及全身多个系统.临床主要表现有身材矮小、视神经萎缩、Pelger-Hu?t细胞畸形及与发热相关的肝功能衰竭.本文主要从NBAS基因缺陷可能的发病机制、基因缺陷与表型的关系、临床表现、治疗、诊断和预后作一综述.

目的 基于中医药整合药理学和转录组学探究丹栀逍遥散防治焦虑肝郁化火证的作用机制.方法 采用中医药整合药理学研究平台v2.0,检索并获取丹栀逍遥散的活性成分及靶标、焦虑肝郁化火证靶标信息,构建中药-成分-靶点-通路网络.将交集基因导入String数据库,构建交集靶点的蛋白互作网络,以确定最终需要验证的靶标.利用GEO数据库转录组学验证整合网络药理学结果,同时采用动物实验进行验证.结果 共筛选出与焦虑肝郁化火证相关的靶标13个,丹栀逍遥散活性成分430种.整合药理学结果显示,丹栀逍遥散防治焦虑肝郁化火证主要通过调控α-氨基-3-羟基-5-甲基-4-异噁唑丙酸受体(α-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazole propionic acid receptor,AMPAR)、蛋白激酶 A(protein kinase A,PKA)、N-甲基-D-天冬氨酸(N-methyl-D-aspartic acid,NMD A)受体的激活及磷脂酰肌醇 3-激酶(phosphatidylinositide 3-kinases,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)等信号通路.GEO微阵列芯片GSE4035数据集转录组学关键靶标雌激素受体α(estrogen receptor 1,ESR1)、腺苷酸环化酶 5(adenylate cyclase 5,ADCY5)、谷氨酸离子型受体 NMDA 型亚基 2A(glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A,GRIN2A)基因为差异表达基因(differential gene expression,DEGs).实时荧光定量聚合酶链反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)结果显示,ADCY5 mRNA 表达上调和 GRIN2A mRNA表达下调.结论 丹栀逍遥散可能是通过上调ADCY5 mRNA表达和下调GRIN2A mRNA表达进而调节脑源性神经营养因子(brain-derived neurotrophic factor,BDNF)与其受体的结合和谷氨酸神经传递介导,进一步改善神经元生长、突触传导与突触的可塑性,从而发挥其生物学效应.