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Pax2基因异常参与孤独症谱系障碍发病的生物信息学分析
编辑人员丨6天前
目的:对配对盒2( Pax2)相关孤独症谱系障碍(ASD)易感基因进行生物信息学分析,探讨 Pax2基因参与ASD发病的可能机制。 方法:(1)将Pathway Commons数据库中与 Pax2基因相关的基因(606个)和Simons基金会孤独症研究计划(SFARI)数据库中ASD易感基因(1 023个)取交集得到65个 Pax2基因相关ASD易感基因。在基因功能分析网站Metascape对 Pax2基因相关ASD易感基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组数据库(KEGG)通路富集分析。使用Cytoscape软件cytoHubba插件的最大团中心度(MCC)算法,筛选前10个核心 Pax2基因相关ASD易感基因。(2)取3只13周龄雄性Pax2-nestin小鼠(实验组)及3只同龄雄性C57 BL/6J小鼠(对照组),采用Western blotting实验检测2组小鼠海马组织中谷氨酸受体2B亚基(GluN2B)蛋白的表达。 结果:(1)GO分析显示 Pax2基因相关ASD易感基因在生物学过程(BP)本体主要富集于跨突触信号、行为、脑发育、化学突触传递的调节、胶质细胞再生、小脑形态发育、谷氨酸能突触传递、记忆等子集,在细胞组分(CC)本体主要富集于突触后、树突、β连环蛋白-T细胞因子(TCF)复合物、树突分支等子集,在分子功能(MF)本体主要富集于突触后密度蛋白95/果蝇圆盘大肿瘤抑制蛋白/紧密连接带-1蛋白(PDZ)结合结构域、转录因子结合、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性、谷氨酸受体活性、微管蛋白结合等子集。KEGG通路富集分析显示 Pax2基因相关ASD易感基因主要分布在丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、长时程抑制、谷氨酸能突触等通路。核心 Pax2基因相关ASD易感基因为 Gria1、 Dlg2、 Ntrk2、 Grid2、 Igf1、 Jmjd1c、 Ldb1、 Tcf4、 Tcf7l2、 Adrb2。(2)Western blotting实验显示,对照组、实验组小鼠海马组织中GluN2B蛋白的相对表达量分别为2.36±0.60、0.85±0.44,差异有统计学意义( P<0.05)。 结论:Pax2基因异常可能导致 Pax2基因相关ASD易感基因的表达或功能异常,并通过多种机制参与ASD的发病。
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编辑人员丨6天前
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基于裸鼠模型研究HI-TOPK-032对卵巢癌细胞增殖能力的调控作用
编辑人员丨1个月前
目的 探讨T-LAK细胞源蛋白激酶/PDZ连接激酶(T-LAK cell-originated protein kinase/PDZ-binding-kinase,TOPK/PBK)在卵巢癌中的表达情况以及TOPK/PBK抑制剂HI-TOPK-032对卵巢癌细胞增殖的影响.方法 利用基于基因表达水平值的交互式分析(gene expression profiling interactive analysis,GEPIA)数据库分析TOPK/PBK在卵巢癌与正常卵巢组织中的表达差异.噻唑蓝法(methyl thiazolyl tetrazolium,MTT)细胞活力和增殖检测实验及平板克隆实验分析HI-TOPK-032对OVCAR3及SKOV3细胞增殖能力的影响,构建卵巢癌裸鼠皮下瘤模型验证HI-TOPK-032对卵巢癌瘤体生长能力的影响.结果 与正常卵巢组织相比,卵巢癌中TOPK/PBK的表达显著升高(P<0.05).同时,小分子抑制剂HI-TOPK-032可抑制TOPK/PBK表达,致OVCAR3 及SKOV3 细胞的增殖能力明显下降(P<0.0001),裸鼠皮下成瘤实验也表明 HI-TOPK-032 处理组瘤体质量[(0.670±0.450)g vs(1.514±0.358)g]和体积[(0.418±0.171)cm3 vs(0.973±0.262)cm3]均显著小于对照组.结论 TOPK/PBK在卵巢癌中高表达,TOPK/PBK抑制剂HI-TOPK-032 可抑制卵巢癌细胞增殖.这一发现提示TOPK/PBK可能成为卵巢癌的一个新的治疗靶点.
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编辑人员丨1个月前
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PBK和基质金属蛋白酶9在宫颈癌中的表达及对同步放化疗疗效的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨DNA损伤修复因子PBK(PDZ连接激酶)和基质金属蛋白酶9(MMP-9)在宫颈癌中的表达及对同步放化疗疗效的影响.方法 收集2014年1月至2016年7月共65例宫颈鳞癌根治性同步放化疗患者的病理标本,通过免疫组织化学法检测PBK和MMP-9的表达情况.体外照射采用调强放射治疗,剂量为50 Gy/25次;外照射18次后予以高剂量率后装治疗,30~36 Gy/5~6次,3~4周.外照射开始后给予每周化疗,采用单药顺铂方案,顺铂(DDP)40 mg/m2静脉滴注,连续2~6周.定期随访所有患者,分析患者临床特征、 预后与PBK和MMP-9之间的关系.结果 PBK在宫颈癌标本中的阳性表达率为92.3%,MMP-9为69.2%.PBK高表达组的宫颈癌患者总生存率(OS)和疾病无进展生存率(PFS)均明显低于PBK表达低的患者(χ2=4.324、8.068,P<0.05),MMP-9高表达组患者的PFS明显低于低表达组(χ2=5.134,P<0.05),PBK和MMP-9联合高表达组的OS和PFS比联合低表达组低(χ2=5.382、9.364,P<0.05).结论 PBK和MMP-9在宫颈癌组织中的表达存在差异与宫颈癌的预后相关,联合检测PBK和MMP-9的表达水平可能有助于预测宫颈癌同步放化疗后的疗效.
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编辑人员丨2023/8/6
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PBK/TOPK表达对膀胱癌BIU-87细胞增殖及迁移能力的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨PDZ连接激酶/T-LAK细胞源蛋白激酶(PDZ-binding kinase/T-LAK cell-originated protein kinase,PBK/TOPK)在膀胱癌中的表达及其表达对BIU-87细胞增殖及迁移能力的影响.方法 采用实时定量PCR及免疫印迹试验检测40例配对膀胱癌及癌旁正常组织中PBK/TOPK的表达,随后,分别干扰及过表达PBK/TOPK在BIU-87细胞中的表达,检测PBK/TOPK表达对细胞增殖及迁移能力的影响.结果实时定量PCR及免疫印迹试验检测结果一致表明PBK/TOPK在膀胱癌中的表达明显高于癌旁正常组织(P<0.05).干扰PBK/TOPK表达后,BIU-87细胞的增殖及迁移能力明显下降(P<0.05);而PBK/TOPK过表达后,BIU-87细胞的增殖及迁移能力明显增强(P<0.05).结论 PBK/TOPK在膀胱癌组织中, 其表达有助于膀胱癌细胞的增殖及迁移.
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编辑人员丨2023/8/6
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神经干细胞在缺氧后的分化情况及相关信号通路初探
编辑人员丨2023/8/5
目的 观察缺氧缺糖后神经干细胞在不同时间点的分化趋势,以及与信号通路促红细胞生成素受体(EPOR和βCR)和PDZ连接激酶(PBK)的相关性.方法 分离小鼠原代神经干细胞,制备氧糖剥夺(OGD)模型,缺氧3 h,复氧1 h、2 h、4 h、6 h、8 h,观察神经干细胞OGD的分化趋势,采用RT-PCR技术检测少突胶质细胞标志物CNP和MBP、星型胶质细胞标志物GFAP和S100B、神经元标志物RBFOX3、MAP2和TUBB3以及信号分子EPOR、CSF2RB、PBK的基因表达,并进行了Pearson相关性分析.结果 (1)OGD处理促进神经干细胞向少突胶质细胞方向分化,Cnp和Mbp表达呈升高趋势,复氧4 h Cnp显著升高.(2)OGD处理促进神经干细胞向星形胶质细胞方向分化,复氧2~8 h S100b显著升高,复氧2 h和6 h Gfap表达显著降低,复氧8 h表达显著增加.(3)OGD处理减少神经干细胞向神经元方向分化,Rbfox3以及Tubb3表达显著降低,复氧2 h和6 h最为显著.(4)Pbk在复氧1 h和8 h显著降低,Epor、Pbk与Cnp的表达呈正相关,Pbk与Mbp的表达呈正相关.结论 缺氧缺糖损伤显著促进神经干细胞向少突胶质细胞和星形胶质细胞新生,同时抑制向神经元方向的分化.EPOR以及PBK可能参与到脑缺血后神经干细胞向少突胶质细胞分化的调控过程,为进一步研究相关信号通路在缺血后神经再生中的调控机制提供了基础.
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编辑人员丨2023/8/5
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PDZ连接激酶,又一新的原癌基因
编辑人员丨2023/8/5
PDZ连接激酶(PBK)是一种丝-苏氨酸激酶,属于丝裂原活化蛋白激酶激酶(MAPKK)家族成员.PBK能调控细胞周期进程,促进细胞增殖.近年发现,其在乳腺癌、结肠癌、皮肤癌和前列腺癌等多种恶性肿瘤组织中均呈高表达,与多种癌症预后不良关联密切.PBK主要通过Wnt、PI3K/AKT/mTOR和MAPK等信号通路,调控肿瘤细胞有丝分裂,参与多种癌症的增殖、侵袭转移和耐药等,并受miR-216b-3p、miR-770-5p和miR-372-5p等多种microRNA调控.提示PBK可能作为又一新的原癌基因,有望成为抑癌药物新的分子靶点.
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编辑人员丨2023/8/5
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蛋白激酶Pbk在缺氧神经胶质细胞中的变化及与IGF-1的相关性
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨神经胶质细胞缺氧缺糖后不同时间点蛋白激酶Pbk的变化及与胰岛素样生长因子-1(insulin-like growth factors-1,IGF-1)的相关性.方法 培养BV2小胶质细胞、分离原代星形胶质细胞,制备氧糖剥夺(oxygen and glucose deprivation,OGD)模型,采用反转录聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)技术观察信号分子Pbk、组蛋白去乙酰化酶2(histone deacetylases 2,HDAC2)以及IGF-1在两种胶质细胞OGD处理1、3、6 h后的表达情况,并对信号分子和细胞因子进行了Pearson相关性分析.结果 随着OGD时间延长,Pbk的转录水平在小胶质细胞中先升后降,在星形胶质细胞中逐渐升高,组间差异有统计学意义(P<0.05).HDAC2的转录水平在小胶质细胞中逐渐下降,在星形胶质细胞中逐渐升高,组间差异有统计学意义(P<0.05).IGF-1的转录水平在小胶质细胞中逐渐下降,在星形胶质细胞中逐渐升高,组间差异有统计学意义(P<0.05).细胞缺氧缺糖后信号分子Pbk以及HDAC2在小胶质细胞和星形胶质细胞中的转录水平与IGF-1的转录水平均呈正相关关系(P<0.05).结论 缺血缺氧性损伤早期营养因子IGF-1在小胶质细胞中的分泌减少,在星形胶质细胞中的分泌增加,可能与Pbk/HDAC2/IGF-1这一通路激活相关.
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编辑人员丨2023/8/5
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PDZ连接激酶诱导自噬对肺癌细胞顺铂化疗敏感性的影响研究
编辑人员丨2023/8/5
目的:探究PDZ连接激酶(PBK)对肺癌细胞顺铂化疗敏感性的作用及其相关的作用机制。方法:A549细胞用顺铂处理或者是转染si-NC、si-PBK、si-亲嗜性病毒整合位点-1 (EVI1)、oe-NC和oe-EVI1。RT-qPCR检测人肺癌细胞株A549、HCC827、NCI-H1299和人正常肺上皮细胞BEAS-2B中EVI1和PBK mRNA表达;Western blot检测细胞中EVI1、PBK、Beclin1、p62和微管相关蛋白1轻链3 (LC3B)蛋白表达;CCK-8检测细胞活力;EdU实验检测细胞增殖;Transwell实验检测细胞迁移和侵袭;ChIP-PCR实验检测细胞中EVI1和PBK启动子区域的结合。多组间比较采用单因素方差分析,组间两两比较(EVI1及PBK表达情况只比较HCC827组与BEAS-2B组、NCI-H1299组与BEAS-2B组、A549组与BEAS-2B组)采用LSD-t检验。si-NC组和si-EVI1、oe-NC组和oe-EVI1组PBK的表达情况采用独立样本t检验进行比较。结果:与BEAS-2B细胞相比,HCC827、NCI-H1299和A549细胞中EVI1和PBK mRNA表达以及蛋白表达均升高,差异具有统计学意义(P均< 0.05)。与空白对照组相比,顺铂组和顺铂+si-NC组细胞中EVI1和PBK mRNA表达以及蛋白表达均升高,Beclin1和LC3Ⅱ/ LC3Ⅰ蛋白表达(0.15±0.01比0.36±0.02、0.34±0.02) (1.32±0.11比4.16±0.21、4.04±0.15)均升高,差异具有统计学意义(P均< 0.05);与空白对照组相比,顺铂组、顺铂+si-NC组及顺铂+si-PBK组细胞24、48、72 h细胞活力降低,EdU阳性细胞率[(42.71±2.56)﹪比(30.25±1.91)﹪、(28.90±2.51)﹪]、迁移数[(133.67±6.51)个比(72.00±4.00)个、(70.00±2.65)个]、侵袭数[(81.00±4.00)个比(43.00±3.00)个、(42.00±3.00)个]、p62蛋白表达(0.65±0.03比0.22±0.02、0.23±0.01)均降低,差异具有统计学意义(P均< 0.05)。与顺铂组和顺铂+si-NC组相比,顺铂+si-PBK组细胞中PBK mRNA和蛋白表达降低,24、48、72 h细胞活力降低,EdU阳性细胞率[(30.25±1.91)﹪比(28.90±2.51)﹪、(22.25±1.97)﹪]、迁移数[(72.00±4.00)个、(70.00±2.65)个比(34.00±3.00)个]、侵袭数[(43.00±3.00)个、(42.00±3.00)个比(21.33± 2.52)个]、Beclin1和LC3Ⅱ/ LC3Ⅰ蛋白表达(0.36±0.02、0.34±0.02比0.25±0.02) (4.16±0.21、4.04±0.15比2.45±0.22)均降低,差异具有统计学意义(P均< 0.05);p62蛋白表达(0.22±0.02、0.23±0.01比0.46±0.02)升高,差异具有统计学意义(P < 0.05)。EVI1通过直接与PBK启动子区域结合,与si-NC组相比,si-EVI1组细胞中EVI1 mRNA和蛋白表达降低,PBK mRNA和蛋白表达降低,差异具有统计学意义(P均< 0.05);与oe-NC组相比,oe-EVI1组细胞中EVI1和PBK mRNA和蛋白表达升高,差异具有统计学意义(P均< 0.05)。结论:受EVI1调节的PBK可能通过促进自噬抑制肺癌细胞对顺铂的化疗敏感性。
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编辑人员丨2023/8/5
