目的 两者之间通过两样本孟德尔随机化(2SMR)评估胃食管反流病(GERD)与阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)之间的因果关系,从GERD的治疗方案中寻找对OSA的有利药物以及可能的作用途径.方法 以 2SMR作为主要的分析方法,并运用多变量孟德尔随机化(MVMR)调整肥胖在两病之间的潜在影响.其次,通过DrugBank数据库检索了治疗GERD的抗反流药物靶点基因,并查询dbSNP 数据库确定了靶点基因的位点用以鉴定抗反流药的遗传工具,通过 2SMR分析得出与OSA风险相关的显著靶点基因.最后通过DAVID数据库对靶点基因进行京都基因(GO)和基因组百科全书(KEGG)途径通路富集分析.结果 遗传预测的 GERD 与 OSA 风险增加显著相关[OR= 1.43,95%CI=(1.33,1.54),P=5.29×10-22],MVMR分析表明,调整肥胖因素后本结果仍然稳健.最终获得了 BCHE、DRD2、GRM5、PTGER3 4 个显著基因,涉及尼扎替丁,溴必利,ADX10059,米索前列醇等药物,通过 KEGG 分析获得了 3 条通路.结论 GERD会增加OSA发病风险,抗反流药物靶点可以为治疗OSA的药物开发提供有用的遗传线索.

目的:利用生物信息学方法研究探讨肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)相关基因在子宫内膜癌(EC)的发生发展,发现新的EC肿瘤生物标志物,构建新的EC风险模型.方法:从公共数据库中获得EC患者的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集.在EC肿瘤和健康组织,检测组织和巨噬细胞中的差异表达基因(DEGs).采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)确定巨噬细胞相关的关键基因,通过多种算法筛选交叉基因,确定为新的EC生物标志物.根据这些生物标志物计算风险评分,从而将EC分为高风险组和低风险组.在单变量和多变量Cox分析中评估了风险评分和临床特征,为构建列线图提供了独立的预后因素.结果:发现805 个巨噬细胞DEGs、5691 个额外DEGs、733 个关键基因和43 个常见基因.筛选出FBP1、LTB、PTGER4、PARVG、CCR7 和HLA-DMB共 6 个生物标志物,构建了EC风险模型.确定了风险评分、年龄和肿瘤分期,生成了UCEC 直方图.结论:确定了六个与TAM相关的预后生物标志物,并构建了一个风险模型,可为子宫内膜癌的治疗和研究提供依据.

目的 探讨良恶性肺疾病组织中前列腺素E受体 4(PTGER4)基因甲基化水平及其诊断肺恶性肿瘤价值.方法 收集我院胸外科患者术后冰冻组织标本 174 例,根据病理结果分为肺腺癌组 60 例,鳞癌组 38 例,错构瘤组 17 例、良性疾病组31 例和肺正常组织组 28 例,收集临床基础资料,分别提取组织 DNA.PTGER4 基因甲基化水平检测采用甲基化敏感限制性内切酶-荧光定量PCR方法,根据PTGER4 基因与内参ACTB基因的循环阈值差异(ΔCt值)判断甲基化程度.结果 肺腺癌组、肺鳞癌组、良性疾病组、错构瘤组和肺正常组织组ΔCt值的中位数(四分位数)[M(P25,P75)]分别为 0.21(-0.67,1.20)、1.75(-0.04,4.10)、6.02(4.36,7.57)、7.17(5.72,8.78)和 4.61(3.65,5.10),根据ΔCt比较,肺腺癌和肺鳞癌组PTGER4 甲基化水平显著高于良性疾病组、错构瘤组和肺正常组织组(P＜0.05).肺腺癌甲基化水平显著高于肺鳞癌(P=0.044).ROC曲线分析显示,PTGER4 基因甲基化诊断总的肺癌的曲线下面积(AUC)、灵敏度和特异性分别为 0.923、79.6%和98.7%,诊断肺腺癌为 0.984、90.0%和 98.7%,鳞癌为 0.828、65.8%和 96.1%,腺癌AUC显著高于鳞癌(P＜0.05).肺癌患者PTGER4 基因甲基化水平与年龄、性别、吸烟、肿瘤标志物(CEA、NSE、CYFRA21-1、SCC)和肿瘤分期无显著性相关(P＞0.05).结论 肺恶性肿瘤组织中PTGER4 基因甲基化呈现特异性升高;PTGER4 基因甲基化对肺腺癌的诊断效能更高.

克罗恩病(Crohn's disease,CD)是一种由多个基因共同参与的胃肠道慢性炎性肉芽肿性疾病.本文对近年来CD的相关基因NOD2/CARD15、ATG16L1、IRGM、IL-23/TH17信号通路、PTGER4、IBD5基因位点、PTPN2的研究进展进行总结.通过检索PUBMED及CNKI数据库,以"克罗恩病、相关的基因、发病机制"为关键词,以CD的相关的基因和其致病机制、相关基因在CD中的作用及临床意义、CD相关基因位点临床治疗效果为纳入标准,检索了2000年1月至2017年8月的相关文献.发现 NOD2/CARD15、ATG16L1、IRGM、IL-23/TH17信号通路、PTGER4、IBD5基因位点、PTPN2等基因与CD的遗传易感性密切相关.这些基因与CD的临床表现、治疗效果和患者生存率等相关,为CD今后发病机制的研究,及相关基因靶向的治疗奠定了理论基础.

炎症性肠病(IBD)主要包括克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)两种类型,发病机制尚不明确,遗传因素起着重要作用.PTGER4编码产生前列腺素E2(PGE2)受体的EP4亚基,其危险等位基因能增加EP4表达,后者与PGE2结合发挥PGE2在胃肠道的稳态和促炎作用.目前已报道的与IBD易感性有关的PTGER4多态性位点有rs4495224、rs7720838、rs17234657、rs4613763等,这些位点多态性与UC或CD的发病有关,但在不同国家地区研究结论不一致.多数研究认为PTGER4基因突变与CD易感性独立相关,未发现PTGER4基因与IBD其他易感基因如NOD2、IL23R、SLC22A4/5、NELL1之间有相互作用.但在德国CD人群中,PTGER4基因的rs4495224和rs7720838位点多态性与ATG16L1基因突变位点有异位显性关系.

目的 研究前列腺素E受体4(PTGER4)基因rs4495224和rs7720838多态性与广西壮族、汉族人群炎症性肠病(IBD)易感性及其临床特征的关系.方法 选取壮族99例[溃疡性结肠炎(UC)患者59例,克罗恩病(CD)患者40例]、汉族113例(UC患者69例,CD患者44例)IBD患者、健康对照者190例(壮族90例,汉族100例),使用PCR直接测序法进行基因分型,计算各位点的基因型频率、等位基因频率以及其与UC、CD临床特征的关联性.结果 各位点中汉族CD组的突变基因型频率、等位基因频率均高于正常对照组,结果差异有统计学意义(P<0.05),汉族UC组、壮族UC组、CD组与正常对照组比较差异无统计学意义(P>0.05).汉族CD组中的不同病变部位、疾病活动性、有无并发症中各位点基因型频率、等位基因频率分布无统计学意义(P>0.05).结论 PTGER4基因rs4495224和rs7720838位点多态性可能与广西汉族人群CD的易感性相关.

目的 检测计算机断层扫描(CT)提示的肺结节患者,血浆游离无细胞DNA的矮小同源盒2(SHOX2)基因和前列腺素E受体4基因(PTGER4)甲基化,探讨其对肺结节性质判定的意义.方法 抽取患者静脉血10 mL,提取血浆游离DNA后用重亚硫酸盐转化,采用实时荧光定量PCR扩增,将有效的Ct值输入专用的判读软件进行分析,得出SHOX2和PTGER4基因甲基化情况.运用免疫组织化学技术对活检诊断的肺恶性肿瘤进行组织学分型.结果 57例患者进行血浆游离DNA的SHOX2和PTGER4基因甲基化检测,阳性22例,阴性35例;57例中CT肺结节31例,其中19例基因甲基化检测为阳性;CT炎症16例中有3例基因检测为阳性;CT显示正常或磨玻璃的10例,结果均为阴性.不同CT表现下血浆游离DNA的SHOX2和PTGER4基因甲基化有显著差异,CT显示肺结节的阳性率最高(61.3％).CT显示肺结节经病理诊断肺癌20例,其中18例基因甲基化检测为阳性,阳性率为90％,其余良性病变中仅有1例检测阳性.血浆游离DNA的SHOX2和PTGER4基因甲基化在肺良、恶性病变中有显著差异.肺鳞癌、小细胞癌的SHOX2和PTGER4基因甲基化阳性率100％,腺癌为75％.结论 检测血浆游离DNA的SHOX2和PTGER4基因甲基化在肺癌早期诊断中具有一定价值,结合CT的影像特征,对肺结节患者性质的判定有良好的辅助诊断作用.

At present, there is no reliable biomarker for the diagnosis of traumatic brain injury (TBI). Studies have shown that extracellular vesicles released by damaged cells into biological fluids can be used as potential biomarkers for diagnosis of TBI and evaluation of TBI severity. We hypothesize that the genetic profile of salivary extracellular vesicles in patients with head trauma differs from that in uninjured subjects. Findings from this hypothesis would help investigate the severity of TBI. This study included 19 subjects, consisting of seven healthy controls who denied history of head trauma, six patients diagnosed with concussion injury from an outpatient concussion clinic, and six patients with TBI who received treatment in the emergency department within 24 hours after injury. Real-time PCR analysis of salivary extracellular vesicles in partic-ipants was performed using TaqMan Human Inflammation array. Gene expression analysis revealed nine upregulated genes in emergency department patients (LOX5, ANXA3, CASP1, IL2RG, ITGAM, ITGB2, LTA4H, MAPK14, and TNFRSF1A) and 13 upregulated genes in concussion clinic patients compared with healthy participants (ADRB1, ADRB2, BDKRB1, HRH1, HRH2, LTB4R2, LTB4R, PTAFR, CYSLTR1, CES1, KLK1, MC2R, and PTGER3). Each patient group had a unique profile. Comparison between groups showed that 15 inflammation-related genes had significant expression change. Our results indicate that in-flammation biomarkers can be used for diagnosis of TBI and evaluation of disease severity. This study was approved by the Institutional Review Board on December 18, 2015 (approval No. 0078-12) and on June 9, 2016 (approval No. 4093-16).

目的 探讨前列腺素E2受体4(PTGER4)在视网膜母细胞瘤( Rb)组织中的表达及临床意义.方法 收集本院2012年1月至2016年12月病理确诊且临床资料完整的Rb组织67例及同期正常视网膜组织21例,采用实时定量PCR和免疫组化检测PTGER4在上述组织中的表达水平,分析PTGER4表达与Rb临床病理特征(年龄、性别、侧别、IIRC分期、病理分化和视神经浸润)的关系.结果 67例Rb组织中的PTGER4 mRNA水平和阳性表达率分别为2. 653±1. 056和56. 7%(38／67),均高于正常视网膜组织的1. 027±0. 346和28. 6%(6／21),差异有统计学意义(P＜0. 05). Rb组织中PTGER4表达与年龄、性别和侧别无关,而与IIRC分期、病理分化和视神经浸润有关,其中临床分期较晚、低未分化及视神经浸润对应组织中PTGER4 mRNA水平和阳性表达率均较高(P＜0. 05).结论 PTGER4在Rb组织中表达升高,且与Rb的临床分期、病理分化及视神经浸润有关,PTGER4可作为判断RB浸润及病情评估的潜在指标.

目的 基于网络药理学探讨射干-麻黄治疗哮喘的机制.方法 收集刘小虹教授门诊病例,并使用古今医案云平台分析得出最常用射干-麻黄药对,利用TCMSP、Drug bank、TTD等数据库查找射干-麻黄药对化合物及治疗哮喘的作用靶点,通过Draw Venn Diagram软件取化合物靶点与哮喘靶点交集,使用String 11.0平台分析蛋白相互作用网络,最后进行GO分析和KEGG通路分析.结果 共有40个化合物作用于15个哮喘靶点,主要涉及PTGER3、CHRM4、SERPINE1、ADRA2C等;GO分析主要涉及IL-4和IL-13信号传导、钙信号通路等;KEGG信号通路共8条,包括神经活性配体-受体相互作用、调节脂肪细胞中的脂肪分解、cAMP信号通路、HIF-1信号通路等.结论 射干-麻黄通过调节IL-4和IL-13信号传导、钙信号通路、cAMP信号通路、HIF-1信号通路等通路,从而起到治疗哮喘的作用.