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Leber先天性黑矇患者不同基因新突变与临床表型分析
编辑人员丨1周前
目的:明确3个Leber先天性黑矇(LCA)家系的致病基因突变,初步分析其基因型和临床表型的关系。方法:回顾性研究。2021年1~12月于宁夏回族自治区人民医院眼科检查确诊的4例LCA患者和7名家系成员纳入研究。4例患者来自3个无血缘关系家系。详细收集患者及家系成员临床资料。采集患者及家系成员外周静脉血,提取全基因组DNA。应用全基因组外显子测序技术进行致病基因突变检测,对可疑致病突变位点通过Sanger测序进行验证,通过蛋白质预测软件和保守性分析确定致病基因的突变位点,结合家系图与先证者进行共分离分析。结果:4例患者中,男性1例,女性3例;年龄4~18岁。眼球震颤3例;指压眼征伴夜视力差1例;全视野视网膜电图重度下降4例。所有患眼黄斑中心凹反光可见,周边视网膜未见明显异常。黄斑区椭圆体带隆起强反射信号1只眼;视网膜层间隐约可见弱反射信号2只眼;血管分支增多、周边视网膜无灌注区伴毛细血管渗漏1只眼;黄斑区环状强自身荧光4只眼。家系成员表型未见明显异常。基因检测结果显示,家系1先证者(Ⅱ-1)携带 PRPH2基因c.640T> A(p.C214S)(M1)纯合突变;家系2先证者(Ⅱ-2)携带 TULP1基因c.1256G>A(p.R419Q)(M2)、c.1A>C(p.M1L)(M3)复合杂合突变;家系3先证者(Ⅱ-1)及其妹妹(Ⅱ-2)携带 GUCY2D基因c.1943T>C(p.L648P)(M4)、c.380C>T(p.P127L)(M5)复合杂合突变。家系2先证者父母、姐姐(Ⅱ-1)及家系3先证者父母均为相应杂合变异携带者。其中,M1、M3、M4、M5为新发现突变。家系内基因型和疾病表型呈共分离。根据系谱及基因检测结果分析,3个家系均为常染色体隐性遗传。氨基酸保守性分析发现,M1、M2、M3、M4、M5在物种间具有高度保守性。生物信息学分析结果均为致病性变异。 结论:发现并证实 PRPH2基因M1、 TULP1基因M3和 GUCY2D基因M4、M5为LCA的新发现突变位点,扩大了LCA的突变位点和基因突变频谱;LCA具有发病年龄小、眼底表现各异及视力损害严重等特点。
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编辑人员丨1周前
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Leber先天性黑矇六家系临床表现和遗传分析
编辑人员丨1周前
目的:观察分析Leber先天性黑矇(LCA)致病基因类型及临床表型特征。方法:回顾性临床研究。基因检测确诊的LCA患者6例及其家系成员18名纳入研究。患者分别来自6个无血缘关系家系。采集所有受检者外周静脉血,提取全基因组DNA。应用包含463个致病基因的遗传眼病捕获芯片进行靶向捕获富集高通量测序,对 TULP1、 RPGRIP1、 GUCY2D基因致病突变位点进行Sanger测序验证;通过相关数据库和PubMed文献检索基因变异的致病性,通过蛋白质预测软件阐释其功能。 结果:6例患者中,男性3例,女性3例;年龄3~33岁。眼球震颤、指压眼征、畏光、夜盲5例;视网膜电图呈熄灭或近熄灭型3例;视网膜病变4例。基因检测结果显示,家系1、2、5患者分别存在 TULP1基因c.1318C> T (p.R440X)、c.1142T>G (p.V381G)复合杂合突变,c.1318C> T (p.R440X)纯合变异以及c.1153G> A (p.G385R)、c.1561C> T (p.P521S)复合杂合变异;家系3、6患者分别存在 RPGRIP1基因c.391delG (p.V131Sfs*39)、c.1468-2A> G (splicing)和c.715delA (p.K239Sfs*36)、c.1765C> T (p.Q589X)复合杂合变异;家系4患者存在 GUCY2D基因c.3177_3178delAC (p.R1060Rfs*11)纯合变异。父母均为相应杂合变异携带者。 TULP1基因c.1142T> G (p.V381G)、 RPGRIP1基因c.391delG (p.V131Sfs*39)、c.715delA (p.K239Sfs*36)及c.1765C> T (p.Q589X)和 GUCY2D基因c.3177_3178delAC (p.R1060Rfs*11)变异为致病性新变异。 TULP1基因产物蛋白381氨基酸位点在物种间具有高度保守性,蛋白质预测软件预测该变异为有害变异。 RPGRIP1基因c.391delG、c.715delA及c.1765C> T变异和 GUCY2D基因c.3177_3178delAC变异可导致各自的产物蛋白提前终止翻译,为致病性变异。 结论:TULP1、 RPGRIP1、 GUCY2D基因的相关致病性变异分别导致了本研究6个家系不同患者罹患LCA 15型、LCA 6型或LCA 1型。
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编辑人员丨1周前
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早发性严重视网膜营养不良一家系TULP1和CNGB1基因突变
编辑人员丨1周前
目的:确定早发性严重视网膜营养不良(EOSRD)一家系的致病基因突变。方法:回顾性临床研究。2018年8月于河南省立眼科医院检查确诊的一个汉族EOSRD家系中1例患者及3名家系成员纳入研究。详细采集患者病史后,对受试者行最佳矫正视力(BCVA )、裂隙灯显微镜联合前置镜、眼底彩色照相、频域光相干断层扫描(SD-OCT)及全视野视网膜电图(ff-ERG)检查。采集受试者外周静脉血5 ml,提取全基因组DNA。应用包含441个致病基因的遗传眼病捕获芯片进行靶向捕获富集高通量测序,对明确的致病突变位点进行Sanger测序验证;应用分析软件对突变位点进行生物信息学分析。结果:先证者女,6岁,于1岁以后出现双眼夜间视力差。双眼BCVA均为0.1。视盘颜色稍淡;视网膜血管管径稍变细,血管弓外视网膜可见广泛色素改变。SD-OCT检查可见双眼黄斑中心凹处外界膜、椭圆体带及嵌合体带结构欠清、断续;中心凹外可视区神经上皮外丛状层、外核层、外界膜、椭圆体带及嵌合体带逐渐消失,色素上皮层厚度欠均匀。ff-ERG检查,双眼视锥、视杆系统功能严重下降。基因检测结果显示,先证者Tubby样蛋白1 (TULP1)基因存在c.921C>A纯合突变,环核苷酸门控通道β1 (CNGB1)基因存在c.3121C>T、c.3488G>A复合杂合突变。氨基酸保守性分析结果显示,上述3个突变位点在多个物种中均高度保守。生物信息学分析结果显示,TULP1基因c.921C>A (p.Cys307*)在蛋白质保守区出现翻译终止,CNGB1基因c.3121C>T (p.Arg1041Trp)、c.3488G>A (p.Gly1163Glu)在蛋白质保守区出现氨基酸极性变化,导致蛋白质空间结构产生较大改变。结论:TULP1基因c.921C>A纯合突变、CNGB1基因c.3121C>T和c.3488G>A复合杂合突变为该EOSRD家系的突变位点。
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编辑人员丨1周前
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敲减TULP3对头颈鳞癌细胞生物学行为的影响
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨敲减TULP3对头颈鳞状细胞癌(HNSCC)细胞生物学行为的影响.方法 应用TCGA数据比较头颈鳞癌组织与癌旁组织中TULP3表达水平;体外培养人HNSCC细胞系HN4、HN6、CAL27、HSC3、SCC4及正常口腔上皮角质细胞HOK并应用Western Blot比较TULP3蛋白表达水平,免疫组化分析TULP3在HNSCC组织中表达情况.构建RNA干扰寡核苷酸si-TULP3及si-NC转染HN4、HN6,应用CCK-8实验、平板克隆形成实验、划痕愈合实验、Transwell侵袭实验检测敲减TULP3对HNSCC细胞增殖、侵袭、迁移能力的影响.实时定量逆转录PCR及Western Blot检测细胞周期及上皮间质转化(EMT)相关指标变化.构建HN6-shTULP3及HN6-shNC细胞株接种于裸鼠皮下,分析裸鼠移植瘤体积差异.结果 TCGA数据显示头颈鳞癌组织TULP3表达量显著高于癌旁组织(P<0.000 1);HN4、HN6、CAL27、HSC3细胞中TULP3蛋白表达量均高于HOK细胞,TULP3在HNSCC组织中呈阳性表达.HN4、HN6细胞转染si-TULP3后,增殖、侵袭、迁移能力明显弱于si-NC组.敲减 TULP3 后,HN4、HN6 细胞 CDK4、Cyclin D1、Cyclin D3、N-cadherin、ZEB2、Slug 蛋白表达水平下降,其中 CDK4、Slug 基因水平也下降(P<0.001);此外,β-catenin蛋白表达水平上升.敲减TULP3后裸鼠皮下移植瘤体积明显小于对照组(P<0.01).结论 敲减TULP3可以抑制HNSCC细胞系的增殖、侵袭及迁移能力,可能通过调控细胞周期及抑制EMT进程发挥作用.
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编辑人员丨2023/8/5
