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FANCB基因半合子变异致多发畸形胎儿1例的分析
编辑人员丨1天前
目的:对1个产前肢体畸形合并心脏发育异常胎儿的家系进行研究,明确其遗传学病因,提高对 FANCB基因致病变异导致胎儿多发畸形遗传病因和机制的认识。 方法:选取2021年4月30日于山东省妇幼保健院就诊的1个产前超声提示胎儿发育异常的家系为研究对象。采集该家系相关临床资料,对胎儿进行全外显子组测序(WES),应用Sanger测序进行家系验证并分析候选变异致病性,对女性成员进行X染色体失活偏倚检测。结果:胎儿孕龄为11 +周,产前超声提示脑膜脑膨出、双侧桡骨缺失、唇裂可能、大动脉发育异常及单脐动脉。WES检测提示胎儿携带 FANCB基因c.1162del(p.Y388Tfs*7)半合子变异,Sanger测序验证该变异系母源遗传,根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)与ClinGen制订的相关指南,该变异判读为致病性变异(PVS1+PM2_Supporting+PP4)。X染色体失活偏倚检测提示孕妇及其母亲的X染色体均完全失活。 结论:FANCB基因c.1162del(p.Y388Tfs*7)半合子变异可能为本研究胎儿肢体畸形合并心脏发育异常的遗传学病因,该基因的致病变异类型与表型之间具有一定的对应关系。
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编辑人员丨1天前
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体细胞嵌合父亲传递致女性杜氏肌营养不良一例家系及遗传学分析
编辑人员丨1天前
报道1例父源嵌合体遗传的女性杜氏肌营养不良(DMD)家系及遗传学分析,先证者DMD基因未发现大片段缺失/重复,二代测序结果显示先证者存在DMD基因(NM_004006)c.4707C>A(p.C1569X)杂合突变,致病性分析为致病性突变。Sanger测序显示先证者父亲携带同一位点突变,父亲嵌合比例约为17.7%。特异性酶切检测显示先证者存在母源性X染色失活偏倚。X染色体隐性遗传病DMD可发生于女性,极少数可为父源遗传。女性患者需高度关注X染色体失活偏倚,可疑新生突变患者,不除外嵌合体携带,尤其是表型正常的父系嵌合体遗传,再生育需进行产前基因筛查。
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编辑人员丨1天前
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Xq22.1q22.3杂合性缺失一个家系的X染色体失活分析及产前诊断
编辑人员丨1天前
目的:分析1个Xq22.1q22.3杂合性缺失家系中女性X染色体失活(XCI)偏倚及逃逸情况与表型的相关性。方法:回顾性分析2021年11月10日于台州医院确诊的1个Xq22.1q22.3杂合性缺失家系的临床资料。对该家系胎儿羊水以及孕妇夫妇的外周血样进行G显带染色体分析和拷贝数变异测序(CNV-seq),结合甲基化敏感性限制性核酸内切酶 HpaⅡ消化前后PCR扩增雄性激素受体基因第1外显子CAG重复序列多态性的方法检测XCI。 结果:孕妇与胎儿的G显带核型均为46,X,del(X)(q22),CNV-seq检测结果均为seq[hg19]del(X)(q22.1q22.3) chrX:g.100460000_105740000del,提示X染色体q22.1q22区存在5.28 Mb的拷贝数缺失,孕妇丈夫未见明显异常。XCI分析提示孕妇与胎儿的X染色体的活性比均为0∶100,携带Xq22.1q22.3缺失的X染色体完全失活,胎儿的失活染色体源自母亲。结论:胎儿携带母源性失活的X染色体del(X)(q22),携带者的表型与异常的X染色体活性密切相关。通过家系XCI分析结合孕妇临床表型有助于预测Xq22.1q22.3杂合性缺失家系女性胎儿的临床表型及预后,为遗传咨询提供依据。
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编辑人员丨1天前
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基于家系数据合并X染色体失活的数量性状关联分析方法研究
编辑人员丨2023/8/5
目的 提出一种基于家系数据合并X染色体失活的数量性状关联分析方法,并与现有的用于常染色体的GEMMA方法进行比较.方法 对不同的X染色体失活程度 γ 分别建立线性混合模型,构造Wald检验统计量,并对相应的P值使用柯西分布进行合并,将该方法记为XACAT.在不同的失活模式设置下,模拟比较XACAT方法与GEM-MA方法的第一类错误率和检验效能,并将它们运用到行为抑制解除全基因组家系数据做进一步比较.结果 两种方法均能很好地控制第一类错误率.当γ等于1(随机失活)时,两种方法的检验效能很接近.当γ不等于1(偏倚失活)时,XACAT方法比GEMMA方法的检验效能高,且γ偏离1越远,XACAT方法的优势越明显.实例分析中,XACAT方法识别出两个有统计学意义的位点(rs12687163与rs12688347),GEMMA法未识别出有统计学意义的位点.结论 XACAT方法是一种检验效能较高、稳健的关联分析方法.
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编辑人员丨2023/8/5
