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2017—2020年度济宁市乙型流感病毒监测及 HA和 NA基因变异和进化分析
编辑人员丨5天前
目的:分析济宁市2017—2020年度乙型流感病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因变异情况及分子进化特征。方法:采集2017—2020年度济宁市哨点医院和流感暴发疫情病例咽拭子标本,进行核酸检测、病毒分离,选取20株乙型流感病毒代表毒株进行 HA和 NA基因测序,利用生物信息学软件构建进化树并分析分子进化特征。 结果:2017—2020年度共监测病例标本4 575例,流感病毒阳性842例,其中乙型流感病毒阳性398例,阳性率8.70%(398/4 575),占比47.27%(398/842)。2017—2020年度济宁分离的BV系和BY系流感病毒与疫苗株比, HA基因同源性分别为98.7%~98.8%、98.5%~99.1%。2018—2020年度BV系流感归属于Victoria clade 1A分支,2017—2018年度BY系流感归属于Yamagata clade 3分支。对抗原表位和耐药位点的变异情况进行了分析,发现多处抗原表位发生了变异,但未发现神经氨酸酶抑制剂耐药位点的变异。 结论:2017—2020年度济宁市BV系和BY系乙型流感病毒均发生了数个抗原位点变异,出现了抗原转变,可能是引起乙型流感暴发的原因。
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编辑人员丨5天前
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2010—2021年上海市闵行区流感样病例及病原学特征
编辑人员丨5天前
目的:了解2010—2021年上海市闵行区流感样病例(ILI)的流行病学特征及流感病毒的病原学动态变化趋势。方法:利用上海市闵行区2010年第1周—2021年第52周共12个监测年度间的流感监测哨点医院和流感网络实验室的监测数据进行统计分析。结果:2010—2021年上海市闵行区国家级流感监测哨点医院共报告122 903例ILI,年平均流感样病例百分比(ILI%)为0.94%,总体呈现上升趋势( P<0.001)。ILI中,0~4岁、5~14岁、15~24岁、25~59岁、≥60岁年龄组病例分别占4.35%、13.30%、14.30%、54.32%、13.73%。ILI%呈现明显的周期性,12月—次年2月为冬季高峰,7—9月为夏季高峰,2013年初的冬季高峰有所推延,2021年未出现明显就诊高峰。2010—2021年闵行区共检测ILI标本11 625份,流感病毒阳性率为20.92%(2 432/11 625),甲型流感病毒阳性率为12.83%(1 492/11 625),乙型流感病毒阳性率为8.09%(940/11 625),甲型流感的流行强度高于乙型流感。2010—2021年各型流感病毒的总体阳性率:甲型H3N2(1 051,9.04%)>甲型H1N1(441,3.79%)>乙型Victoria系(313,2.69%)>乙型Yamagata系(255,2.19%),2010—2019年间上海市闵行区甲型流感与乙型流感交替流行,且每种流行株大概持续半年时间被新流行株所替代,2020、2021年没有明显的规律性。2010—2019年报告的ILI数量和流感病毒阳性率的变化趋势基本一致,2020、2021年的变化趋势有明显差别。 结论:上海市闵行区流感呈现季节性流行,且各亚型流感病毒交替或混合成优势毒株流行,发病集中在冬季和夏季。COVID-19疫情防控期间流感流行强度下降,但伴随疫情防控逐渐常态化,流感流行呈明显上升趋势,故应继续加强流感的防控与监测,并及时对病毒变异情况进行分析。
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编辑人员丨5天前
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北京市2015—2020年流感流行季流感样病例和流感病原学分析
编辑人员丨5天前
目的:了解2015—2020年流感流行季北京市流感流行特征。方法:使用北京市2015—2020年流感样病例(influenza-like illness,ILI)和流感病原学监测数据,分析流感流行趋势和流感病毒流行特征。结果:2015年第27周至2020年第26周共涉及5个流感流行季,流感样病例百分比(percentage of influenza-like illness,ILI%)为1.58%。共检测ILI标本96 892件,流感病毒核酸阳性率为16.32%,其中A(H3N2)亚型6 474件(40.89%)、甲型H1N1 4 410件(27.86%)、乙型Victoria系3 290件(20.78%)、乙型Yamagata系1 597件(10.09%)。ILI周报告数、ILI%与流感病毒阳性率变化趋势基本一致( r=0.796, P<0.001; r=0.808, P<0.001)。2017—2018年和2018—2019年流行季活跃期较长。2017—2018、2018—2019年流行季ILI周报告数较高(49 628人次和71 555人次),核酸阳性率峰值较高(58.51%和57.08%)。 结论:2015—2020年北京市流感流行符合北半球流行特征,其中2017—2018和2018—2019流行季活跃期较长、流行水平较高,且各流行季优势毒株不同。
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编辑人员丨5天前
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杭州地区2014—2019年乙型流感病毒HA和NA基因遗传进化分析
编辑人员丨5天前
目的:研究2014—2019年杭州地区乙型流感病毒的流行情况以及血凝素基因(HA)和神经氨酸酶基因(NA)的遗传进化特征。方法:收集2014年10月—2019年9月间杭州地区流感样病例10 481例,用实时RT-PCR法检测乙型流感病毒,同时选取部分乙型流感病毒阳性样本,用特异性引物扩增HA和NA基因,进行基因测序并分析其遗传进化特征。结果:发现自2014年以来,杭州地区每年都有乙型流感病毒的流行。其中5~14岁年龄段人群发病率最高。2014—2019年,杭州地区流行的Victoria系乙型流感病毒都属于V1A进化簇,而Yamagata系乙型流感病毒都属于Y3进化簇。HA和NA基因的序列一致性分别为94.67%~100.00%和97.13%~100.00%,并在多个抗原位点发生了改变,同时出现了重排株。结论:乙型流感病毒在杭州地区流感流行中影响显著。2014—2019年,杭州地区乙型流感病毒出现了抗原变异和基因重排,流行株和疫苗株之间存在不匹配的情况,但目前并未发现耐药株的出现和流行。
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编辑人员丨5天前
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2017—2021年贵州省乙型流感病毒遗传进化分析
编辑人员丨5天前
目的:了解贵州省乙型流感病毒BY系和BV系毒株 HA和 NA基因分子进化特征,为流感的科学防控提供依据。 方法:统计贵州省2017—2021年流感各型别阳性比例,提取乙型流感病毒核酸,RT-PCR扩增 HA和 NA基因,进行序列测定14株,并从GISAID获取83株序列,对合计97株乙型流感病毒的序列进行同源性、遗传进化和氨基酸位点变异分析。 结果:贵州省存在甲型、BY系和BV系流感病毒的流行,BV系为优势流行型别;BY系流感病毒 HA和 NA基因与参考疫苗株B/PHUKET/3073/2013相比同源性分别为98.7%~99.4%和98.4%~99.6%,BV系毒株与参考疫苗株B/Colorado/06/2017相比分别为98.3%~99.3%和98.9%~99.6%;贵州省BY系毒株主要属于Y3遗传群, HA基因处于Y3-H1~2两个分支, NA基因处于Y3-N1~3三个分支,发现3株Y3系内重配株;BV系毒株主要属于V1A-2遗传群, HA基因处于V1A-2 H1~4四个分支, NA基因处于V1A-2 N1~5五个分支,发现20株V1A-2系内重配株,未发现系间重配株;关键氨基酸位点变异分析显示抗原决定簇区域位点Y3遗传群无突变,V1A-2遗传群4个主要的抗原决定簇均存在点突变且190螺旋存在移码突变,耐药位点均未发生突变。 结论:贵州省流感流行型别多样,乙型流感病毒与疫苗株同源性差异在增大, HA和 NA基因已进化出不同分支,基因序列存在多种形式的突变,存在系内重配株和新的变种,应持续加强乙型流感病毒的监测研究。
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编辑人员丨5天前
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2011-2019年中国B型流感季节性、年龄特征和疫苗匹配度分析
编辑人员丨5天前
目的:分析2011-2019年中国B型流感的季节性、年龄分布以及与疫苗的匹配程度,为今后B型流感的监测和疾病负担评价、四价流感疫苗应用、免疫策略制定提供证据。方法:利用全国流感监测网络2011年第14周至2019年第13周的流行病学和病原学监测数据,绘制热图、进行描述性统计,分析B型流感季节性和年龄分布特征。利用流感周报公布的抗原性分析结果,分析B型流感流行株与疫苗毒株的匹配情况。结果:2011-2019年中国B型流感呈现明显的季节性特征,在6个冬春季和A型共同流行,且B/Victoria和B/Yamagata系交替流行,部分南方地区在个别年度出现B型2个系共同流行。B型流感的年龄分布呈双峰,2个系的病毒均在5~15岁组阳性率最高,10岁为峰值;B/Victoria系病毒在25~35岁组为次高峰;B/Yamagata系病毒在55~65岁组为次高峰。B型流感流行株在2015-2016、2017-2018年度与三价流感疫苗所含B型系别不匹配,在2011-2012、2012-2013、2013-2014、2014-2015、2016-2017年度与疫苗所含B型系别匹配,2018-2019年度与疫苗所含B型系别匹配但抗原性中等程度匹配,交叉反应性低。结论:中国B型流感主要在冬春季流行,强度低于A型流感,不同系病毒的年龄分布存在差异,B型流感流行株与疫苗株多个季节不匹配,需持续开展B型流感的监测和疾病负担评价,完善疫苗免疫策略,提高流感疫苗接种率,降低流感对高危人群的危害。
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编辑人员丨5天前
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2014—2021年深圳市流感暴发疫情流行特征分析
编辑人员丨5天前
目的:对2014—2021年深圳市流感暴发疫情流行特征进行分析,为流感防控提供参考。方法:收集全市2014—2021年的流感暴发疫情资料进行分析。结果:2014—2021年深圳市共报告1 581起流感暴发疫情。发病总人数为14 427人,平均罹患率为12.2%。流感疫情报告最多的月份是12月和3月,分别为405起(占25.6%)和267(占16.9%)起。冬季(704起,占44.5%)和春季(533起,占33.7%)是流感疫情的高发季节。1 581起流感疫情分别由乙型Victoria系(468起,29.6%),A(H3N2)亚型(401起,25.4%),乙型Yamgata系(364起,23.0%),甲型H1N1亚型(303起,19.2%)和混合感染(45起,2.8%)引起。乙型流感引起疫情(占52.6%)多于甲型流感(占44.6%)(χ 2=20.743, P<0.01)。 结论:2014—2021年深圳市流感疫情的高发季节是冬季和春季,乙型流感引起的疫情起数多于甲型流感。
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编辑人员丨5天前
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Yamagata系乙型流感病毒血凝素蛋白单克隆抗体制备及双抗体夹心ELISA检测方法的建立
编辑人员丨5天前
目的:制备Yamagata系乙型流感病毒血凝素蛋白(hemagglutinin,HA)的特异性单克隆抗体,建立检测Yamagata系乙型流感病毒的双抗体夹心ELISA方法。方法:用Yamagata系乙型流感病毒(B/Phuket/3073/2013)抗原免疫BALB/c小鼠,取免疫小鼠脾细胞与骨髓瘤SP2/0细胞进行融合,通过4次有限稀释获得阳性杂交瘤细胞并建株。将单克隆抗体1F7和2H6分别作为捕获抗体和检测抗体,建立一种检测Yamagata系乙型流感病毒的双抗体夹心ELISA法。结果:该方法中捕获抗体1F7在96孔板的包被量为40 ng/孔,检测抗体2H6工作浓度为100 ng/孔;该方法仅能与Yamagata系乙型流感病毒发生反应,具有较强特异性。灵敏度分析显示,该方法对病毒尿囊液和病毒纯化HA蛋白最低检测值分别为2 -1 HAU/100 μL和1.22 ng/mL,具有较高灵敏度。重复性试验表明,该方法批内和批间重复性变异系数均小于5%。 结论:本研究建立的ELISA方法特异性强、灵敏度高、重复性好,为Yamagata系乙型流感病毒快速诊断及定量检测提供技术支持。
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编辑人员丨5天前
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北京市2021年乙型Victoria系流感病毒流行特征与血凝素基因变异分析
编辑人员丨5天前
目的:掌握2021年北京市流感流行特征及乙型Victoria系(简称BV)流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)基因、抗原性变异情况,为北京市流感防控提供科学依据。方法:对北京市2021年1—11月流感病原学监测结果进行统计分析,并随机抽取15株BV流感病毒,通过HA基因扩增测序,分析其基因变异和进化特征。结果:研究期间共收集流感样病例样本16 097份,其中核酸检测阳性208份,经型别鉴定BV流感病毒205份(98.56%)、乙型Yamagata(简称BY)系流感病毒3份(1.44%)。15株BV流感病毒HA基因序列与疫苗株B/Washington/02/2019相比,核苷酸相似度为98.39%~98.75%,氨基酸相似度为97.86%~98.40%。基因进化分析显示15株BV流感病毒均分布于Clade1A.3a2分支,与疫苗株相比存在多位点变异。15株BV流感病毒有11个糖基化位点。1株(6.6%)为疫苗株的低反应株。结论:2021年北京市监测到的流感病毒中BV流感病毒占绝对优势,其HA基因位点多处发生变异,提示对该亚型变异的持续监测至关重要,为制定流感防控策略提供科学依据。
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编辑人员丨5天前
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2018年甘肃省10岁以下儿童流感病毒和呼吸道合胞病毒感染特征
编辑人员丨5天前
目的:为了解甘肃省2018年10岁以下儿童中门诊流感样(influenza-like illnes,ILI)病例中流感病毒(influenza virus,Flu)、呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)的病原学特点及流行特征,为Flu、RSV疾病的诊断治疗及防控提供依据。方法:选取甘肃省19家国家级流感监测哨点医院ILI病例咽拭子标本共8 559份,用实时荧光PCR检测流感病毒,对其中的3 436份,用RT-PCR法对RSV检测。结果:Flu阳性934份,阳性率10.91%,其中甲型H1N1阳性431例、H3N2阳性70例、乙型428例、甲型H1N1和乙型混合5例;RSV阳性320份,阳性率9.31%。14个市州之间Flu、RSV检测阳性率差异存在统计学意义( χ2=56.99,Р<0.01; χ2=263.34,Р<0.01)。流感1月份为最高峰,阳性率为50.70%,乙型B/Yamagata系(占53.53%)和甲型H1N1(占39.93%)同时流行。RSV的流行高峰在2~4月,阳性率达13.98%,5岁以下儿童RSV阳性率10.11%,高于5岁及以上儿童RSV的阳性率6.94%.具有统计学意义( χ2=7.67,Р<0.01)。 结论:10岁以下儿童ILI就诊病例中RSV和Flu是主要的病原,每年冬春季节存在流行高峰,建议加强RSV的监测。
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编辑人员丨5天前