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玉米ZmNPR1基因的克隆及表达分析
编辑人员丨2023/8/6
该研究从玉米高抗自交系D863F中克隆了ZmNPR1基因(GenBank登录号为MH619241)的gDNA和cDNA序列,开放阅读框长1 866 bp,编码621个氨基酸,相对分子质量67.61 kD,等电点为5.46.系统进化树比对表明,玉米ZmNPR1蛋白和高粱SbNPR1蛋白的亲缘关系较近,相似性高达97%.实时荧光定量PCR结果表明,ZmNPR1在叶片中能够被水稻黑条矮缩病毒诱导并显著上调表达.同时ZmNPR1在玉米叶片、茎、根、雄穗、雌穗以及花丝中均有表达,在雌穗和叶片中的表达量较高.研究表明,ZmNPR1可能在玉米粗缩病抗病过程中起着重要作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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玉米粗缩病诱导下实时荧光定量PCR内参基因的选择
编辑人员丨2023/8/6
为了选择玉米粗缩病诱导下合适的内参基因,本研究选取ACT、GADPH、UBQ、TUB、CYP、EF1A和18共7个基因做为候选内参基因,以自交系郑58(感粗缩病)和D863F(高抗粗缩病)为材料,利用RT-qPCR技术检测这7个基因的表达情况.通过geNorm、NormFinder和BestKeeper软件对循环阈值(Ct)进行数据分析.结果 表明,两材料在玉米粗缩病诱导下UBQ和EF1A基因表达最为稳定,ACT和18S最不稳定.另外,选择玉米粗缩病相关基因ZmNPR1对候选内参基因进行进一步验证,发现不合适的内参基因确实影响结果的准确性.UBQ和EF1A这两个最优内参基因的筛选为玉米粗缩病诱导下功能基因的表达分析及抗病机制的研究奠定基础.
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编辑人员丨2023/8/6
