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鸡卵清提取液诱导293T细胞高表达tRFs&tiRNAs分子及细胞功能验证
编辑人员丨2023/8/5
tRNA源性片段(tRNA-derived fragments,tRFs)和tRNA源性应激诱导RNAs(tRNA-derived stress-induced RNAs,tiRNAs)是tRNAs的衍生片段,属于短的非编码RNA家族,通过转录、翻译、信号通路等途径参与复杂的生物反应.该文旨在验证鸡卵清提取液诱导293T细胞后升高的3个tRFs&tiRNAs分子的细胞功能.将293T细胞加于6孔板中,3个孔加普通培养基,3个孔加50%鸡卵清提取液的培养基,共培养3天.对照组3个样本和诱导组3个样本进行高通量测序检测tRFs&tiRNAs分子在两组中的差异表达.经检测验证诱导后的细胞有3个tRFs&tiRNAs分子稳定升高.这3个分子上调表达有统计学意义.合成这3个分子转染293T细胞,WB检测多能因子OCT4和NANOG的变化,定量PCR检测多能基因OCT4和NANOG的变化和端粒的相对表达量,流式检测多能因子OCT4和NANOG的变化.同时检测这3个分子转染293T细胞后细胞增殖、细胞凋亡和细胞周期的变化情况.结果 表明,3个分子转染293T细胞后,WB检测到多能因子OCT4和NANOG表达对比未转染细胞明显升高,定量PCR检测多能基因OCT4和NANOG相对表达量对比未转染细胞明显升高,端粒对比未转染细胞明显增长.流式检测到多能因子OCT4和NANOG阳性表达细胞对比未转染细胞明显增多.这3个分子转染293T细胞后细胞活性增强,细胞凋亡减少,细胞周期也发生了一定的改变.该研究证明了这3个分子过表达可促进293T细胞多能因子OCT4和NANOG表达升高,促进端粒增长,使细胞年轻化.同时这3个分子过表达可使细胞活性增强,细胞凋亡减少.
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编辑人员丨2023/8/5
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tRNA衍生片段的鉴定及对靶分子的调节机制
编辑人员丨2023/8/5
随着测序技术的发展和对tRNA衍生小分子(tRNA-derived small RNA,tsRNAs)的深入研究,越来越多的tsRNAs及其功能在各物种中被鉴定.tsRNAs根据切割位点的不同可分为tRNA衍生片段(tRNA-derived fragment,tRF)和 tRNA 应激诱导 RNA(tRNA-derived stress-induced RNA,tiRNA),其中tRF是一类具有调节功能的非编码RNA.为了加深对tRF的研究,近年来一些基于测序数据的tRF鉴定方法和相关数据库不断涌现,前者主要包括Telonis等人的算法和tDRmapper方法,后者主要有tRFdb、tRF2Cancer和MINTbase等.同时这两者为tRF的深入研究提供了更有效的工具.大量的研究表明,tRF主要以类似miRNA的方式对RNA、DNA及蛋白质进行调节,但也存在特异的作用方式.随着对这三者的深入研究,研究人员发现tRF在人类疾病的各种生物过程中也扮演着重要的角色,例如可以作为生物标志物.因此本文主要对tRF的鉴定方法、数据库、对靶分子的调节机制及其与人类疾病的关系作一综述.
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编辑人员丨2023/8/5
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核糖核酸酶A家族典型成员在肿瘤发生中的作用
编辑人员丨2023/8/5
人体中核糖核酸酶A(ribonuclease A,RNase A)家族包含8个典型成员(RNase 1至RNase 8).已有研究显示,除RNase 8外,该家族其它典型成员影响了胰腺癌、结直肠癌、膀胱癌、乳腺癌和皮肤癌等多种肿瘤的发生发展.在肿瘤发生过程中,特定RNase表达量及糖基化修饰会发生显著改变,是肿瘤诊断的潜在标志物;它们能以多种机制参与肿瘤发生、生长和转移等过程,有望成为肿瘤治疗的靶点;而部分成员则具有杀伤肿瘤细胞、抑制肿瘤发展的功能,存在临床开发成肿瘤治疗药物的可能.具体而言,RNase 1通过核糖核酸酶活性依赖的细胞毒性和细胞外RNA降解功能,发挥直接杀伤肿瘤细胞或降低局部炎症而抑制肿瘤生长的作用;RNase 1还能结合并激活促红细胞生成素,产生肝细胞癌受体相互作用蛋白A4(erythropoietin-producing hepatocellular carcinoma re-ceptor-interacting protein A4,EphA4)信号通路,促进乳腺癌的发生.RNase 2和RNase 3是嗜酸性粒细胞颗粒蛋白质的重要成分,依赖于阳离子性及核糖核酸酶活性在抗肿瘤免疫防御中发挥重要作用.RNase 4和RNase 5则通过诱导血管生成、加快肿瘤细胞增殖和抑制肿瘤细胞凋亡等方式,促进肿瘤发生发展.其中RNase 5发挥作用的分子机制包括促进47 S前体rRNA转录和激活促肿瘤生长的信号通路,以及产生tRNA衍生的应激诱导的RNA(tRNA-derived stress-induced RNA,tiR-NA)等.虽然RNase 6和RNase 7与肿瘤的发生存在相关性,但其具体作用及机制的研究仍较少.本文总结了 RNase A家族典型成员与肿瘤的相关性和作用机制,并对其临床应用前景进行了展望,以期为肿瘤治疗药物的开发提供新思路.
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编辑人员丨2023/8/5
