目的:探讨叉头盒蛋白P3(FOXP3)基因沉默后对人结肠癌细胞增殖、凋亡和侵袭等生物学行为的影响及其机制。方法:人结肠癌细胞(SW480细胞)购自美国典型培养物保藏中心。将SW480细胞分为FOXP3-小发夹核糖核酸(shRNA)组(转染FOXP3-shRNA)、NC-shRNA组(转染shRNA空载的慢病毒)及Control组(仅加入培养基处理)。噻唑蓝(MTT)法检测细胞增殖；流式细胞仪检测细胞凋亡；Transwell实验检测细胞侵袭；实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测FOXP3基因信使核糖核酸(mRNA)表达；蛋白质印迹法检测Wingless及int-1家族成员3A(Wnt3a)和β-连环蛋白(β-catenin)基因蛋白表达。两组间对比行 t检验，多组间比较采用单因素方差分析(组间比较采用SNK检验)。 结果:FOXP3-shRNA组人结肠癌细胞中FOXP3基因mRNA表达、24、48、72、96 h后吸光度值、侵袭率、Wnt3a和β-catenin蛋白表达显著低于NC-shRNA组和Control组细胞[FOXP3基因mRNA表达分别为0.11±0.04比0.98±0.05、1.05±0.07，24 h吸光度值分别为0.59±0.04比0.65±0.05、0.73±0.06，48 h吸光度值分别为0.67±0.05比0.86±0.06、0.95±0.07，72 h吸光度值分别为0.76±0.06比1.15±0.07、1.26±0.08，96 h吸光度值分别为0.87±0.06比1.34±0.08、1.45±0.09，侵袭率分别为(23.49±1.99)%比(10.38±2.56)%、(10.38±2.56)%，Wnt3a分别为0.22±0.04比0.76±0.05、0.78±0.06，β-catenin分别为0.31±0.03、0.84±0.06、0.87±0.07]，凋亡率显著高于NC-shRNA组和Control组细胞[分别为(23.49±1.99)%比(10.38±2.56)%、(10.38±2.56)%]，差异有统计学意义( F＝20.042、17.233、11.145、13.427、16.538、16.135、54.182、19.341、26.177、16.135， P<0.05)。 结论:FOXP3基因沉默后可显著抑制人结肠癌细胞增殖和侵袭并促进细胞凋亡，其机制可能与调控Wnt/β-catenin信号通路基因表达有关。

目的:基于微小核糖核酸(miRNA)-信使核糖核酸(mRNA)调控网络探讨重复经颅磁刺激(rTMS)促进缺血性脑卒中(IS)神经修复的潜在分子机制。方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载rTMS干预7 d后的IS大鼠皮质miRNA表达谱。使用R软件分析差异miRNAs，通过在线数据库预测其对应的下游mRNAs，构建miRNA-mRNA调控网络，筛选关键miRNAs。对靶基因进行功能富集分析，构建靶基因所编码的蛋白质相互作用网络，识别网络中的核心mRNAs。选取无特定病原体动物(SPF)级雄性Sprague-Dawley大鼠24只，按随机数字表法随机分为假手术组、模型组和磁刺激组，每组8只大鼠。模型组和磁刺激组制备IS大鼠模型，仅磁刺激组接受连续7 d的rTMS干预，其余2组不进行干预。采用改良神经功能评分(mNSS)于造模前和造模成功1 d、3 d、7 d后评价3组大鼠的神经功能缺损程度；于造模成功8 d后深度麻醉大鼠，取脑组织行苏木精-伊红和尼氏染色观察组织缺失情况和神经元形态，利用实时荧光定量聚合酶链反应验证差异基因在3组大鼠缺血侧皮质中的表达趋势。结果:共筛选出167个差异miRNAs和预测到25个mRNAs。富集分析表明，这些基因与细胞迁移的正向调节、神经营养因子受体信号通路的正向调节等生物学过程有关，涉及腺苷酸激活蛋白激酶、神经营养因子通路、大鼠肉瘤等信号通路。通过构建miRNA-mRNA调控网络，识别出miR-206-3p、miR-378a-3p、miR-107-3p、miR-92a-3p和miR-29b-3p共5个关键miRNAs；通过蛋白互作网络分析筛选出4个核心mRNAs，分别为整合素亚基β1、水通道蛋白4、脑源性神经生长因子(BDNF)、溶质载体家族2成员4。造模成功7 d后，磁刺激组的mNSS评分显著低于模型组同时间点( P<0.05)。与模型组相比，磁刺激大鼠右侧皮质的miR-206-3p表达明显降低( P<0.05)，BDNF表达则显著增高( P<0.05)。 结论:miR-206-3p-BDNF调控网络和相关作用途径在rTMS促进IS大鼠神经修复过程中发挥重要的作用。

目的:探讨M?bius综合征(MBS)患者的临床特征及可能的遗传发病机制。方法:收集2013年3月至2024年4月首都医科大学附属北京同仁医院眼科中心的14例(28只眼)散发MBS患者的病例资料。其中，男性5例(10只眼)，女性9例(18只眼)；年龄1 ～ 9岁，平均年龄(4.0±0.7)岁。询问或检查并记录患者的性别、年龄、最佳矫正视力、眼球运动、眼前节和眼底、体格发育及颅神经眼眶磁共振成像(MRI)的情况。采集患者及核心家系成员外周静脉血、提取基因组脱氧核糖核酸(DNA)并在illumina平台行全外显子组测序。使用SAMtools和ANNOVAR软件对变异进行识别和注释，对频率数据库中频率低于1%的变异进行过滤。在此基础上，筛选新生突变基因以及≥2个以上患者共有的突变基因。使用R包的maftools和GenVisR软件包分别行共有基因突变特征分析并绘制景观图。年龄、最小分辨角对数(logMAR)视力以及每个样本携带的共有基因突变数量经Shapiro－Wilk检验符合正态分布，以±s表示。性别、单侧或双侧受累、全身发育异常、突变分类、突变类型、突变频谱及共有基因突变频率采用频数和百分比描述。使用R语言ClusterProfiler中的超几何检验进行基因本体(GO)富集分析，使用Benjamini－Hochberg方法进行多重假设检验校正并筛选显著富集的条目。结果:本研究9例(18只眼)患者的logMAR视力为0.56±0.12。双眼外转受限者有10例(20只眼)，占71.43%(10/14)；单眼外转受限者有4例(4只眼)，占28.57%(4/14)。双侧面瘫者有5例，占35.7%(5/14)；单侧面瘫者有9例，占64.3%(9/14)。伴其他全身发育异常的患者有9例，占64.29%(9/14)。双侧外展神经(CN6)发育不良者有11例，占78.57%(11/14)；单侧CN6发育不良者有3例，占21.43%(3/14)。双侧面神经(CN7)发育不良者有9例，占64.3%(9/14)，单侧CN7发育不良者有5例，占35.71%(5/14)。2例MBS患者发现致病候选基因丛状蛋白D1(PLXND1)新变异2个，分别为杂合错义变异c.C4207T、p.R1403W和剪切位点变异c.2937＋6 G>T。14例患者共筛选出新生突变基因8个，分别为肌联蛋白(TTN)、碳酸酐酶9(CA9)、中间丝相关蛋白(RPTN)、SET结合因子2(SBF2)、丝状肌动蛋白结合蛋白(AFDN)、突触囊泡糖蛋白2C(SV2C)、神经丝蛋白重链(NEFH)和膜金属内肽酶样蛋白1(MMEL1)。≥2个以上患者共有的突变基因总计796个，突变数量为1987个。最常见的突变分类是错义突变，数量为1382个，占69.55%；最多见的突变类型是单碱基替换变异，数量为1534个，占77.20%；最常见的突变频谱是胞嘧啶被替换为胸腺嘧啶，数量为804个，占52.41%。每个样本所携带共有基因突变数量为126～161个，平均(141.93±11.35)个。按照突变频率排名，前10位的共有基因分别为B黑色素瘤抗原家族成员2/3/4/5(BAGE2/3/4/5)、与内体分选复合物Ⅲ相关的钠耐受增加1(IST1)、TTN、高尔基体蛋白A6家族样蛋白2(GOLGA6L2)、NEFH、UBX结构域蛋白11(UBXN11)、二氢硫辛胺支链转酰基酶E2 (DBT)、羰基还原酶4(CBR4)、肌动蛋白相关蛋白3C(ACTR3C)和含V－Set免疫球蛋白域蛋白2(VSIG2)，频率分别为100%、93%、64%、64%、57%、50%、50%、50%、50%和43%。经GO数据库中的生物学过程数据库注释，在本研究全部MBS患者14例(28只眼)中发现的共有突变基因集的基因数量为701个，查询GO数据库获得背景基因集的基因数量为18 722个。比较不同通路的注释基因在此两个基因集中分布的差异，将其概率值按照升序排列，显著富集的通路依次为调控小谷氨酰胺转肽酶介导的信号转导、基于微管的运动、轴突发生、眼形态发生、通过质－膜粘附分子的细胞间粘附、肌动球蛋白结构组装、肌原纤维的组装及微管束的合成，其概率值依次为0.0002、0.004、0.004、0.004、0.004、0.004、0.011及0.011。结论:MBS患者的临床表型异质性较强，多数患者伴随有除面瘫和眼球外转受限以外的多发先天畸形。基于全外显子组测序的生物信息学分析结果提示参与神经发育和轴突生长过程的多个基因和生物学过程可能与MBS发病相关，进一步揭示了遗传因素在MBS发病中的作用。

目的:对穿心莲糖苷水解酶(ApGH)基因进行克隆、生物信息学分析、原核表达和相对表达量分析.方法:取穿心莲新鲜叶片,提取RNA并反转录为互补脱氧核糖核酸(cDNA)作为模板,以穿心莲转录组中筛选到的糖苷水解酶ApGH基因开放阅读框(ORF)设计特异性引物,进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,经测序后获得的基因序列利用生物信息学软件预测基因编码蛋白特征,构建原核表达载体在大肠埃希菌中诱导表达目的蛋白质,并利用实时荧光定量PCR分析ApGH基因的表达模式.结果:克隆所得ApGH基因的ORF全长 1734 bp,编码 577个氨基酸(GenBank登录号:OR887606).ApGH为稳定亲水蛋白质,无信号肽和跨膜结构域,属于糖苷水解酶家族;系统进化分析表明,ApGH归属于GH1 家族.将ApGH基因构建到原核表达载体HIS-MBP-pET28a上,在大肠埃希菌Transetta(DE3)中成功表达出重组蛋白质.实时荧光定量PCR检测结果表明,ApGH基因在叶中表达量最高,茎和根中表达量较低.结论:克隆得到穿心莲ApGH基因并对其蛋白质序列特征进行了系统分析,证明其在大肠埃希菌中成功表达重组蛋白质,且主要在穿心莲叶中表达.研究结果为进一步探索穿心莲糖苷水解酶的催化功能提供了依据.

目的 明确瞬时受体电位香草醛亚家族1(transient receptor potential vanilloid 1,TRPV1)在肝细胞性肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达及与预后的关系,探讨其对HCC细胞生物学行为的影响.方法 利用癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)、基因型组织表达(genotype-tissue expression,GTEx)及基因表达综合数据库(gene expression omni-bus,GEO)验证TRPV1在HCC中的表达及与预后的关系.通过CCK-8实验、划痕实验、Tran-swell 实验、流式细胞术检测TRPV1对HCC细胞增殖、迁移、侵袭和细胞周期的影响,蛋白质印迹法(western blot,WB)检测细胞周期调节蛋白激酶4(cyclin-dependent kinase 4,CDK4)、细胞周期素依赖激酶6(cyclin-dependent kinase 6,CDK6)的表达,裸鼠皮下成瘤实验检测肿瘤增殖能力.最后,构建TRPV1共表达网络并进行富集分析.结果 TCGA、GTEx和GEO数据库中,TRPV1在HCC组织中表达水平均下调(均P＜0.001),且与患者总生存时间更短有关(P=0.032),受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积为0.91.过表达TRPV1可抑制HCC细胞增殖、迁移和侵袭能力,阻滞细胞周期进展,CDK4和CDK6蛋白表达水平下降(均P＜0.05),敲低TRPV1则相反(均P＜0.05).稳定过表达TRPV1后裸鼠皮下瘤体体积减小(P=0.015),质量减轻(P=0.033),Ki-67蛋白阳性表达水平下调(P=0.010).TRPV1共表达基因主要参与核糖核酸(ribonucleic acid,RNA)剪接、细胞周期蛋白结合、细胞增殖等过程.结论 TRPV1抑制了 HCC细胞的增殖、迁移和侵袭能力,并阻滞细胞周期的进程,在HCC中发挥抑癌作用,为HCC预后分析、治疗提供了新方向.

目的 研究间充质干细胞来源外泌体微小核糖核酸-3614-5p(miR-3614-5p)对模型大鼠先兆子痫(preeclampsia,PE)进展的调节作用及相关机制.方法 将36只SD大鼠(24只雌性和12只雄性)以雌雄比例2∶1合笼饲养自然受孕.24只妊娠大鼠随机分为假手术组(sham组)、PE模型组(PE组)和外泌体miR-3614-5p组(PE+exo组),每组8只.PE组通过皮下注射100 mg/kg的NG-硝基-L-精氨酸甲酯建立大鼠PE模型;PE+exo组构建PE模型,同时在第14天腹腔注射160 μg/ml的外泌体悬液(0.5 ml/只/天),连续6天,实验持续21天;sham组则给予等量生理盐水.在妊娠第0,7,14和21天测量血压和尿蛋白浓度.RT-qPCR检测miR-3614-5p水平及B细胞淋巴瘤病-2(Bcl-2)、Bcl相关X蛋白(Bax)的mRNA水平;ELISA检测Caspase-3活性、活性氧(ROS)水平及丙二醛(MDA)、谷胱甘肽(GSH)和亚铁离子(Fe2+)含量;Western blot检测谷胱甘肽过氧化物酶4(GPX4)和溶质载体家族7成员11(SLC7A11)蛋白水平.结果 与sham组大鼠相比,PE组大鼠的胎盘组织(0.43±0.05 vs 1.01±0.07)和外周血(0.51±0.07 vs 1.01±0.12)中miR-3614-5p表达显著下调,差异具有统计学意义(t=19.070,10.180,均P＜0.01).与上清液相比,源自MSCs的外泌体中miR-3614-5p显著富集.与sham组相比,PE组大鼠第21天的舒张压(175.43±6.02 mmHg vs 113.26±5.11 mmHg)、收缩压(123.57±5.63 mmHg vs 82.63±5.26 mmHg)及尿蛋白含量(175.48±13.21 mg/ml vs 67.65±5.76 mg/ml)显著升高(t=22.606,16.440,23.168,均 P＜0.01);与 PE 组相比,PE+exo 组舒张压(124.57±5.33 mmHg vs 175.43±6.02 mmHg)、收缩压(89.76±3.88 mmHg vs 123.57±5.63 mmHg)及尿蛋白含量(97.69±7.23 mg/ml vs 175.48±13.21 mg/ml)显著降低,差异具有统计学意义(t=18.493,13.577,16.713,均P＜0.01).与sham组相比,PE 组大鼠胎盘组织中 Caspase-3 活性(238.56％±13.22％vs 100.12％±5.93％)、Bax 水平(3.18±0.71 vs 1.01±0.11)、ROS 水平(387.65％±25.98％vs 100.51％±5.89％)、MDA 含量(33.21±3.17 nmol/mg vs 14.83±2.69 nmol/mg)和 Fe2+浓度(38.77±6.53 nmol/ml vs 17.51±3.15 nmol/ml)显著升高,而 Bcl-2 水平(0.47±0.08vs 1.01±0.12)、GSH 含量(4.12±1.22 nmol/mg vs 9.76±0.93 nmol/mg)、GPX4 蛋白(0.48±0.06 vs 1.01±0.24)和 SLC7A11 蛋白(0.51±0.11 vs 1.01±0.11)水平则显著降低(t=6.459～32.863,均P＜0.01);与PE组相比,PE+exo组胎盘组织中Caspase-3活性(117.35％±8.67％vs 238.56％±13.22％)、Bax 水 平(1.13±0.45 vs 3.18±0.71)、ROS 水平(128.73％±14.37％vs 387.65％±25.98％)、MDA 含量(18.13±3.89 nmol/mg vs 33.21±3.17 nmol/mg)和 Fe2+浓度(19.05±3.45 nmol/ml vs 38.77±6.53 nmol/ml)显著降低,而 Bcl-2 水平(1.04±0.11 vs 0.47±0.08),GSH 含量(7.86±1.07 nmol/mg vs 4.12±1.22 nmol/mg),GPX4 蛋白(0.98±0.14 vs 0.48±0.06)和 SLC7A11 蛋白(1.11±0.09 vs 0.51±0.11)水平则显著升高,差异具有统计学意义(t=6.093～29.633,均P＜0.01).结论 miR-3614-5p在PE模型大鼠的胎盘组织和外周血中显著下调.MSCs来源的外泌体miR-3614-5p通过抑制铁死亡改善大鼠的PE进展.MSCs来源的外泌体miR-3614-5p可能是PE治疗的一个新的潜在的生物标志物.

[目的]研究环形 RNA circ_0120051对心肌成纤维细胞的纤维化表型的调控作用和机制.[方法]通过实时萤光定量PCR(RT-qPCR)检测健康器官捐献者(n=24)与心力衰竭(HF)病人(n=21)心肌标本中 circ_0120051及其宿主基因溶质载体家族8成员A1(SLC8A1)的表达水平.核糖核酸外切酶(RNase R)消化实验鉴定circ_0120051的RNA稳定性.RT-qPCR检测circ_0120051在人心肌细胞AC16中的核质分布情况.利用腺病毒在C57BL/6乳小鼠心肌成纤维细胞(mCFs)中过表达circ_0120051,通过RT-qPCR和Western blot检测过表达circ_0120051对mCFs中纤维化相关基因表达的影响,利用细胞划痕实验检测对mCFs迁移能力的影响.通过RNA免疫共沉淀技术(RIP)验证circ_0120051与miR-144-3p间的结合作用,利用双萤光素酶报告基因实验鉴定miR-144-3p与靶基因异柠檬酸脱氢酶2(Idh2)3'-UTR的结合位点.[结果]Circ_0120051在心衰病人心肌中表达显著增加,而其宿主基因SLC8A1表达无显著差异.Circ_0120051主要定位于人心肌细胞的胞质中.RNase R消化实验证实circ_0120051相对于线性SLC8A1 mRNA具有典型的环状RNA稳定性.过表达circ_0120051可抑制mCFs中纤维化相关基因表达和mCFs的迁移能力.RIP实验证实circ_0120051与miR-144-3p之间具有明显结合作用.在mCFs中转染miR-144-3p可促进纤维化相关基因的表达,并有效逆转circ_0120051对mCFs纤维化表型的抑制作用.双萤光素酶报告基因实验证实miR-144-3p与Idh2的3'-UTR存在结合作用.miR-144-3p可在转录水平抑制mCFs中Idh2表达,而过表达circ_0120051可增加mCFs中IDH2表达.在mCFs中转染miR-144-3p和Idh2的小干扰RNA(siRNA),可一致性地逆转circ_0120051对纤维化相关基因表达和mCFs迁移的抑制作用.[结论]Circ_0120051通过特异结合miR-144-3p并增加其靶基因IDH2表达来发挥抑制mCFs纤维化表型的作用.

目的:探讨非小细胞肺癌(NSCLC)组织驱动蛋白超家族成员2A(KIF2A)、驱动蛋白超家族成员2C(KIF2C)、驱动蛋白超家族成员20A(KIF20A)信使核糖核酸(mRNA)表达与临床病理特征和预后的关系.方法:选择2016年9月至2019年9月天津医科大学总医院手术切除的NSCLC患者106例,取其癌组织及其对应的癌旁组织,应用荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测组织中KIF2A、KIF2C、KIF20AmRNA表达,分析其与临床病理特征的关系.应用Pearson相关性分析NSCLC组织中KIF2A、KIF2C、KIF20A mRNA表达间的关系.随访3年,应用Kaplan-Meier生存曲线分析KIF2A、KIF2C、KIF20A mRNA表达与患者预后关系.结果:NSCLC癌组织中KIF2A、KIF2C、KIF20A mRNA表达水平显著高于癌旁组织(P＜0.05).低分化、淋巴结转移、临床分期Ⅲ A期NSCLC癌组织中KIF2A、KIF2C、KIF20A mRNA表达水平显著高于中高分化、无淋巴结转移及临床分期Ⅰ、Ⅱ期NSCLC癌组织(P＜0.05).Pearson相关分析显示,NSCLC癌组织中KIF2A mRNA表达与KIF2CmRNA、KIF20A mRNA表达呈正相关,KIF2C mRNA表达与KIF20A mRNA表达呈正相关(P＜0.05).Kaplan-Meier法分析显示KIF2A mRNA低表达组、KIF2C mRNA低表达组、KIF20A mRNA低表达组3年生存率分别为(84.78％,86.27％,81.48％)显著高于KIF2A mRNA高表达组、KIF2C mRNA 高表达组、KIF20A mRNA 高表达组(59.62％,55.32％,59.09％)(P＜0.05).结论:KIF2A、KIF2C、KIF20A mRNA 在NSCLC组织中存在高表达,且与低分化、淋巴结转移、临床分期及预后有关.

目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)序列相似家族83成员A-反义核糖核酸1(FAM83A-AS1)在视网膜母细胞瘤(RB)细胞中的作用及其潜在的分子机制.方法 体外培养RB细胞,将Vector、pcDNA-FAM83A-AS1、NC-siRNA、FAM83A-AS1-siRNA分别转染至细胞中(依次为pcDNA-FAm83A-AS1组、NC-siRNA组、FAm83A-AS1-siRNA组),检测RB细胞中FAM83A-AS1的表达、RB细胞增殖能力、凋亡率.生物信息学方法和双荧光素酶报告基因实验预测和验证FAM83A-AS1与miR-150以及miR-150与高迁移率族蛋白A2(HMGA2)的靶向关系.RT-qPCR检测RB细胞中miR-150、HMGA2 mRNA的表达;Western blot检测RB细胞中HMGA2蛋白的表达;MTT实验和流式细胞术检测转染后RB细胞增殖和凋亡能力.结果 pcDNA-FAM83A-AS1 组细胞中FAM83A-AS1 的表达显著高于Vector组,低于NC-siRNA组(P<0.05).pcDNA-FAM83A-AS1组较Vector组的细胞增殖能力显著升高,细胞凋亡率显著降低(P<0.05).FAM83A-AS1-siRNA组较NC-siRNA组的细胞增殖能力显著降低,细胞凋亡率显著升高(P<0.05).miR-150 mimic可显著抑制RB细胞增殖能力,促进细胞凋亡.而pcDNA-HMGA2可显著逆转miR-150 mimic对RB细胞增殖和凋亡的作用.结论 敲低lncRNA FAM83A-AS1通过调控miR-150/HMGA2轴抑制RB细胞增殖,促进细胞凋亡.

寡腺苷酸合成酶(Oligoadenylate synthetase,OAS)家族蛋白是典型的抗病毒蛋白,其家族成员寡腺苷酸合成酶1～3(OAS1～3)和寡腺苷酸合成酶样蛋白(Oligonucleotide synthase-like protein synthetase,OASL)在抗病毒天然免疫应答中发挥着重要作用.病毒感染机体后,细胞分泌的干扰素(Interferon,IFN)会诱导寡腺苷酸合成酶家族蛋白合成,其可通过核糖核酸酶L(RNase L)依赖途径和非依赖途径发挥抗病毒作用.本综述主要讨论寡腺苷酸合成酶家族蛋白的抗病毒机制与抗病毒临床应用的相关研究进展.