目的:探讨人乳头瘤病毒（HPV）16亚型感染的子宫颈鳞状细胞癌患者下生殖道菌群的分布及特征。方法:前瞻性横断面研究。选取2019年8月至2020年6月就诊于中国医学科学院肿瘤医院的6例HPV16单一型别阳性子宫颈鳞状细胞癌患者（子宫颈癌组），选取同期体检人群中液基薄层细胞学检查未见异常且HPV阴性6名健康女性为健康对照组。患者抗肿瘤治疗前、健康对照者体检时用无菌棉拭子采集子宫颈后穹窿处分泌物，采用高通量测序技术扩增细菌16S rRNA基因V1-V2高变区，分析菌群分布及特征。结果:子宫颈癌组和健康对照组年龄分别为（51±8）岁、（48±3）岁，差异无统计学意义（ t=0.63， P=0.540），两组均有孕产史，无吸烟史。α多样性分析结果显示，与健康对照组比较，子宫颈癌组sobs指数（ t=3.25， P=0.009）及chao指数（ t=2.91， P=0.016）均高，差异均有统计学意义；子宫颈癌组shannon指数高（ t=2.07， P=0.065），simpson指数低（ t=1.74， P=0.113），但差异均无统计学意义。采用基于bray-curtis距离的主坐标分析（PCoA）进行数据降维分析显示，子宫颈癌组与健康对照组间β多样性差异具有统计学意义（ R2=0.154， P=0.018）。门水平上，与健康对照组相比，子宫颈癌组厚壁菌门占比低（30.21%比68.28%），拟杆菌门占比略低（6.87%比8.11%），而放线菌门（26.91%比14.42%）及变形菌门（27.33%比0.67%）占比高。属水平上，与健康对照组相比，子宫颈癌组乳杆菌属及棒状菌属占比低，失去优势菌群，而红球菌属、克雷伯菌属、气球菌属等占比明显高，且子宫颈癌组菌群种类较健康对照组多。线性判别分析（LDA）显示，属水平上，红球菌属（LDA=5.04）、克雷伯菌属（LDA=4.71）、肠杆菌属（LDA=4.29）、罗尔斯通菌属（LDA=4.28）、苍白杆菌属（LDA=4.23）、韦荣球菌属（LDA=4.14）为子宫颈癌组特征菌群；门水平上，健康对照组厚壁菌门（LDA=5.23）可为标志性物种；种水平上，子宫颈癌组红球菌（ P=0.025）、罗尔斯通菌（ P=0.045）、韦荣氏球菌（ P=0.044）、卡氏伯克霍尔德菌（ P=0.045）、假单胞菌（ P=0.043）等均较健康对照组多，差异均有统计学意义。 结论:HPV16单一型别阳性子宫颈鳞状细胞癌患者下生殖道菌群多样性、丰富度较健康女性增加，乳杆菌属丰度下降；红球菌属、克雷伯菌属可作为其标志性下生殖道菌群，但仍需进一步验证。

目的:明确龋病和牙周炎来源的唾液菌群在物种组成、功能及代谢产物上的特点，为寻找可用于临床判断龋病和牙周炎发生的生物标志物提供依据。方法:收集2022年3至6月就诊于第四军医大学口腔医学院牙体牙髓病科的10例高龋［龋失补牙数（decayed-missing-filled teeth，DMFT）≥6］患者［高龋（high caries，HC）组］，牙周科的10例Ⅱ期A级~Ⅲ期C级牙周炎患者［牙周炎（periodontitis group，PG）组］和10名口腔健康个体［健康对照（healthy individuals，HH）组］的唾液样本。采集受试者的人口学基线、口腔内龋、牙周健康情况等信息，利用宏基因组测序和液相色谱质谱联用检测样本内微生物及其代谢产物。对测序数据进行分析获得各组样本的微生物物种分类学组成、功能基因及代谢产物的信息。各组受试人群的口腔基本情况及唾液样本采集均由同一名牙体牙髓病科主治医师完成。结果:各组受试人群在年龄、性别等基线特征上差异均无统计学意义（ P>0.05）。HC组DMFT（9.0±1.7）显著高于HH组和PG组（均为0）（ F=243.00， P<0.001）。菌群分析显示，各组唾液菌群物种分类学组成在门水平均以变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和梭杆菌门为主。在属水平，则主要由链球菌属、奈瑟菌属、罗氏菌属、普雷沃菌属等成员组成。差异分析显示，与HH组相比，HC组和PG组在属、种水平的物种分类学组成差异均有统计学意义（ P<0.05）。在属水平，HC组和PG组相对丰度改变最显著的均为普雷沃菌属。而在种水平，HC组改变最显著的为苍白普雷沃菌；PG组改变最显著的为牙龈卟啉单胞菌。代谢产物分析显示，HC组共检出133种与HH组差异表达的代谢产物，其中差异最显著的代谢产物为3-羟基-1，5-二苯基戊烷-1-酮（ P=0.001）。在PG组中，共检测出102种与HH组差异表达的代谢产物，其中差异最显著的代谢产物为N1-乙酰精胺（ P=0.002）。HC组与PG组相比，代谢产物上差异最显著的代谢产物为D-氨基葡萄糖6-磷酸（ P=0.006）。菌群代谢功能分析显示，HC组菌群糖代谢相关的功能基因丰度最高，其次为HH组，PG组的糖代谢相关功能基因最低。此外，与HH组相比，PG组内ABC转运体和磷酸转移酶系统等涉及糖转运相关的功能基因的丰度显著降低（ P<0.05），在HC组中则显著升高（ P<0.05）。 结论:唾液菌群在龋病、牙周炎及健康人群中存在显著异质性，且菌群的糖代谢能力改变与龋病和牙周炎的发生存在一定关联。苍白普雷沃菌及3-羟基-1，5-二苯基戊烷-1-酮可能作为龋病的潜在生物标志物；而牙龈卟啉单胞菌及N1-乙酰精胺可能作为牙周炎的潜在生物标志物。

目的:探讨急性骨髓炎患儿脓液中的病原菌分离情况及耐药特征。方法:对2011年1月1日至2018年3月1日在浙江大学医学院附属儿童医院儿童住院的急性化脓性骨髓炎患儿进行回顾性研究，收集患儿的骨膜下脓液或骨髓液培养结果，细菌鉴定和药敏试验均采用梅里埃全自动细菌鉴定系统Vitek。结果:(1)共纳入104例患儿，60例（57.7%）为男性。65例（62.5%）患儿中分离出病原菌66株。其中金黄色葡萄球菌53株（51.0%）、大肠埃希菌3株（2.9%）、铜绿假单胞菌2株（1.9%）、肺炎链球菌2株（1.9%)、人苍白杆菌2株（1.9%)和其他细菌4株（3.8%）。39例（37.5%）脓液未培养到致病菌。⑵在病原菌阳性的患儿中金黄色葡萄球菌占81.5%，其中耐甲氧西林金黄色葡萄球菌占43.4%。金葡菌阳性患儿年龄明显大于非金葡菌感染者（ P=0.028），体重明显高于非金葡菌阳性者（ P=0.040），且金葡菌感染引起的急性化脓性骨髓炎具有更高的C-反应蛋白水平（ P=0.038）。⑶53例金黄色葡萄球菌的药敏结果显示100%的菌株对青霉素耐药，且仅56.6%的菌株对苯唑西林敏感。菌株对复方磺胺甲恶唑、四环素、克林霉素、红霉素的耐药率分别为11.3%、30.2%、67.9%、69.8%。菌株对呋喃妥因的敏感率为90.2%。所有的菌株对奎奴普汀/达福普汀、利奈唑胺、利福平、替加环素、左氧氟沙星、莫西沙星、环丙沙星和万古霉素敏感。69.8%菌株为耐三种及三种以上不同种类抗生素的多重耐药菌。 结论:金黄色葡萄球菌是引起儿童急性化脓性骨髓炎最常见的病原菌，其对苯唑西林和克林霉素的耐药率较高。提示临床上经验性静脉使用抗菌药物治疗急性骨髓炎患儿时，传统药物苯唑西林、克林霉素不宜作为首选药物。另外尚有39例（37.5%）脓液培养未检测到病原菌，其病原学有待进一步研究。

目的:建立一种实时荧光定量PCR方法检测与鉴定人苍白杆菌（ Ochrobactrum anthropi， O.anthropi）及布鲁氏菌，并应用于临床样本的检测。 方法:从美国国立生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information，NCBI）网站GenBank数据库下载苍白杆菌属和与苍白杆菌属相邻近属种菌株的16S核糖体RNA（16S ribosomal RNA，16S rRNA）基因核苷酸序列。使用MEGA 5.1软件构建系统发育树；应用DNAstar（V7.1）软件设计引物及探针，建立检测与鉴定 O.anthropi的实时荧光定量PCR方法，验证方法的灵敏性和特异性，并应用该方法检测牧区临床患者血液样本中 O.anthropi感染情况。 结果:共从NCBI网站下载苍白杆菌属17个种37株、与苍白杆菌属相邻近的布鲁氏菌属8个种15株菌株的16S rRNA基因核苷酸序列。16S rRNA基因系统发育树分析发现， O.anthropi与苍白杆菌属 O.cytisi、 O.lupini、 O.tritici种菌株具有高度同源性（相似性均为100.0%），与布鲁氏菌属8个种菌株的相似性为99.1%，与其他13个种苍白杆菌属菌株的相似性为84.5% ~ 98.6%。成功建立了实时荧光定量PCR检测方法（巢氏PCR），检测 O.anthropi标准菌株DNA，单一实时荧光定量PCR最低检测限为3.67 fg核酸DNA，循环阈值（cycle threshold，CT）= 36.40，巢式PCR检测CT = 14.67；且未检出布鲁氏菌属等非苍白杆菌属菌株。对126份临床患者血液样本进行检测， O.anthropi的检出率为17.46%（22/126）。 结论:建立了实时荧光定量PCR方法检测 O.anthropi，该方法具有较高的灵敏性和较强的特异性，可用于 O.anthropi与布鲁氏菌的鉴定及临床样本检测。

目的:对临床血液标本分离的细菌7712(＝CGMCC 1.17031＝NBRC 113783＝KCTC 15766)进行生物学特性和系统进化分析，明确其分类学地位。方法:观察菌株的培养特性并进行形态学、生理生化鉴定、基质辅助激光解吸电离子飞行时间质谱鉴定和基因组测序鉴定，并构建基因组发育树以分析其分类学位置。采用在线毒力基因数据库和抗生素抗性数据库，分别对分离株及近缘菌株进行基于全基因组的毒力基因和耐药基因的比较分析。结果:分离株7712为脲酶阳性的需氧革兰阴性非发酵菌，VITEK GN鉴定为人苍白杆菌。16S rRNA基因序列分析显示，分离株7712与苍白杆菌属及布鲁菌属均具有较高的序列一致性；而基于全基因系统发育分析显示，分离株7712与油葫芦苍白杆菌LCB8 T和嗜血苍白杆菌CCUG 38531 T聚类成一个分支，并与其他苍白杆菌属细菌和布鲁菌属聚类成一个大的分支。基因组亲缘性指数分析显示，分离株7712和油葫芦苍白杆菌LCB8 T的平均核苷酸一致性为98.22%，高于原核生物物种的鉴定阈值95%。分离株7712携带多种毒力基因和耐药基因，其中 OCH基因可能与头孢菌素耐药有关。 结论:确定了1例由油葫芦苍白杆菌引起的临床感染，丰富了苍白杆菌属生物多样性信息。

1例9岁男童以面色苍白、脐周疼痛起病，辅助检查提示贫血， 13C呼气试验阳性，胃镜可见炎症、溃疡，结合病理形态、免疫组织化学、PCR检测诊断儿童胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤；予抗幽门螺杆菌治疗仍有肿瘤病灶存在，予以化疗，预后良好。该病儿童少见，抗幽门螺杆菌治疗后无好转时需考虑此病，病理、免疫组织化学及PCR检查可明确诊断，低剂量化疗预后好。

报告1例由金黄色葡萄球菌引起的化脓性肩锁关节炎。患者无明显诱因出现右肩部肿痛、活动受限，通过病史、体格检查、影像学检查和局部组织细菌培养确诊为金黄色葡萄球菌感染，经手术及抗感染后治愈。通过文献复习，检索并分析了57篇文献的95例化脓性肩锁关节炎，金黄色葡萄球菌感染26例（27%），其中明确耐甲氧西林金黄色葡萄球菌3例、甲氧西林敏感的金黄色葡萄球菌2例、耐甲氧西林表皮葡萄菌1例）；链球菌13例（14%）；特殊病原体6例（6%），包括副流感嗜血杆菌2例、念珠菌1例、人苍白杆菌1例、鸟分枝杆菌1例、多杀性巴氏杆菌1例；未明确报告具体感染病原体50例（53%）。化脓性肩锁关节炎具有早期诊断困难、病情进展迅速、破坏性强的特点，MRI和超声对诊断有较高的特异性和敏感性，且超声可辅助获取关节液送检。尽早明确病原菌是该病的治疗关键，在未明确病原菌前需谨慎使用抗生素，确诊后应及时抗感染治疗，必要时手术清创，大多数患者在积极、规范治疗后可获得满意而确切的治疗效果。

9岁8月龄患儿因“腹痛3个月，胸痛伴面色苍白1 d”入院，临床表现为反复腹痛，胸痛伴面色苍白。胃镜示胃溃疡（性质待定），胃窦黏膜病理考虑非霍奇金淋巴瘤。胃窦免疫组织化学符合弥漫性大B细胞淋巴瘤，生发中心B细胞型。经化疗和抗幽门螺杆菌等治疗，患儿腹痛，贫血症状明显缓解。

目的:探讨先天性结核病（congenital tuberculosis，CTB）的临床特点，提高对该病的认识。方法:回顾性分析2016年6月至2021年2月山西省儿童医院新生儿内科收治的CTB患儿临床资料，分析其临床特点、诊疗情况及预后。结果:共纳入7例CTB患儿，其中4例母亲因输卵管阻塞经体外受精胚胎移植术受孕，2例母亲确诊为输卵管结核。7例患儿中男1例，女6例；早产儿6例，足月儿1例；发病日龄中位数18 d（7~30 d）。发热7例，呼吸急促、反应差6例，呼吸暂停5例，咳嗽3例，面色苍白、双肺湿啰音各1例，肝肿大6例，脾肿大3例，淋巴结肿大1例。胸部X线检查有斑片状渗出影3例，粟粒影并渗出影2例，斑片影、双肺纹理增多模糊各1例。痰抗酸杆菌涂片声门部和深部痰标本阳性率高于口咽部标本；7例痰结核分枝杆菌DNA测定均阳性。1例经有创呼吸支持治疗1 d自动出院后死亡；2例治疗后明显好转，携氧出院后抗结核治疗1~2个月，因肺部病变重呼吸衰竭死亡；存活4例中1例治愈，3例明显好转。结论:输卵管结核不孕症妇女经体外受精胚胎移植术受孕可能是新生儿患CTB的主要原因；特异性检查首选痰抗酸杆菌涂片、痰聚合酶链反应结核分枝杆菌DNA测定；痰结核分枝杆菌及耐药基因检查可指导临床用药；声门部或深部痰标本可提高检查阳性率。

石油降解菌在各种有害环境因素作用下会进入活的非可培养(viable but non-culturable,VBNC)状态,从而影响其生长及石油降解率.为了研究有害环境因素对石油降解菌生长及石油降解率的影响,采用分光光度法、荧光染色-激光共聚焦显微镜观测 H2O2 胁迫下苍白杆菌(Ochrobactrum sp.)JP1 细胞的生长及VBNC状态形成情况.结果表明,不同浓度H2O2 对其生长有一定抑制作用,当培养液中H2O2 浓度为 75.0 mmol/L时,可有效抑制苍白杆菌JP1 生长,处理12h后苍白杆菌JP1 进入VBNC状态.VBNC状态的苍白杆菌JP1 细胞缩小变成球体,周质间隙增大;在适宜条件下,VBNC状态苍白杆菌JP1 能够复苏为可培养状态,添加丙酮酸钠能够促进VBNC状态细菌细胞的复苏.复苏后的苍白杆菌RJP1 具有良好的环境适应性和石油降解能力,为石油污染生物修复的菌种筛选及应用提供了新的策略.