胃肠道是人体内菌群的储存库。肠道菌群与人体构成共生关系，不仅参与营养物质代谢、机体免疫系统的发育和肠道屏障功能等正常生理过程，也与人体的多种疾病发生进展特别是胃肠道肿瘤的发病密切相关。同时肠道菌群影响着肿瘤的放疗、化疗和免疫治疗的疗效和毒副反应。随着基因测序技术和生物信息学的发展和普及化，探索肠道菌群与胃肠道肿瘤发生发展及治疗的关系是近年来的研究热点并为胃肠道肿瘤的预防和诊治提供新的方法和思路。

医学微生态学是研究人体内共生微生物群与其宿主相互关系的生命科学。肺炎链球菌是健康人鼻咽部定植的主要菌之一，但同时又是条件致病菌，是引起肺炎、菌血症、脑膜炎、鼻窦炎和中耳炎的常见致病菌。既往认识肺炎链球菌疾病，从致病菌的角度出发，并不全面。而从肺炎链球菌作为定植菌的角度，去探讨肺炎链球菌的定植、感染致病及其防治策略，将有助于临床医师更全面和深入地了解肺炎链球菌疾病。

目的:创伤和危重症可能影响微生物群。许多关于危重症微生物群的研究局限于单一身体部位或时间点，并受先前存在疾病的影响。本研究报道既往体健儿童发生严重创伤性脑损伤(traumatic brain injury，TBI)后微生物群的时间和空间变化。设计:研究人员于入院72 h内收集患儿口腔、直肠和皮肤拭子标本，之后每周采集两次至患儿离开PICU。采用16S rRNA基因扩增测序法分析样本。择期门诊手术患儿为对照组。采用Phyloseq进行α和β多样性比较，采用微生物组组成分析法预测群落丰度差异。场所:5家4级监护PICU。对象:因严重TBI需要放置颅内压监测装置的18岁以下患儿。干预措施:无。测量方法与主要结果:共分析来自23例TBI患儿和35例对照组儿童的327份样本。TBI组和对照组患儿初始口腔( F＝3.275 6， R2＝0.053 5， P＝0.012)和直肠( F＝3.070 2， R2＝0.064 9， P＝0.007)微生物群落组成不同。TBI患儿直肠标本中瘤胃球菌科、拟杆菌科和毛螺菌科的共生菌减少，葡萄球菌科菌增多( P<0.05)。探索性分析发现，抗生素暴露、气管插管和感染与TBI组和对照组患儿组间直肠和口腔微生物群差异增大有关，而肠内营养则与差异缩小有关( P<0.05)。 结论:严重TBI患儿微生物群变化特点为共生细菌早期减少、位置特异性丧失，以及潜在致病菌增多。需要更多研究来确定这些变化对临床预后的影响。

目的:探讨不同宫颈病变女性阴道菌群的特征变化及菌群间的相互关系。方法:选取2018年1—6月于山西医科大学第二医院就诊、经病理学确诊宫颈病变的女性，其中正常宫颈(NC)41例，低度宫颈上皮内瘤样变(CIN 1)39例，高度宫颈上皮内瘤样变(CIN 2/3)37例，宫颈鳞状细胞癌(SCC)15例。应用16S rDNA测序技术对阴道分泌物中的阴道菌群进行检测，采用共生网络分析菌群间的Spearman相关关系。结果:NC、CIN 1和CIN 2/3患者优势菌均为乳酸杆菌属[构成比分别为79.4%(1 869 598/2 354 098)、63.6%(1 536 466/2 415 100)和58.3%(1 342 896/2 301 536)]，嗜胨菌属[20.4%(246 072/1 205 154)]为SCC患者的优势菌。随着宫颈病变的加重，阴道菌群多样性呈升高趋势(Shannon指数 F＝6.39， P＝0.001；Simpson指数 F＝3.95， P＝0.012)，乳酸杆菌属构成比逐渐降低，嗜胨菌属、纤毛菌属、普雷沃菌属等厌氧菌构成比逐渐增加，特征菌(LDA分值>3.5)由乳酸杆菌属演变为以嗜胨菌属、拟杆菌属、卟啉单胞菌属等为代表的厌氧菌。选取相对丰度居前10位、Spearman相关系数>0.4且 P<0.05的菌属经共生网络分析，结果显示，在不同阶段宫颈病变组中，普雷沃菌属、嗜胨菌属、卟啉单胞菌属、厌氧球菌属、纤毛菌属、奇异菌属、加德纳菌属、链球菌属等厌氧菌属之间呈正相关，而乳酸杆菌属与多种厌氧菌属呈负相关，尤其在CIN 1患者中阴道菌群间关系最为复杂，在SCC患者中仅嗜胨菌属与乳酸杆菌呈负相关。 结论:阴道菌群多样性增加、菌群间相互关系改变与宫颈病变密切相关，嗜胨菌属对宫颈病变的诊断及预测预警具有重要意义。

乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤，是全球女性健康的主要负担。乳腺癌的形成是复杂的、受多因素影响的，包括遗传、饮食、环境、激素水平等等。多年来，人们一直认为乳腺组织部位是无菌的，而最近却发现该部位存在局部微生物群。与此同时，越来越多的证据表明共生微生物（也称为微生物区系）在乳腺癌的发生进展中起着重要的作用。作为人体内菌群密度最高、数量最多的肠道与乳腺组织部位菌群和乳腺癌的发生进展是否具有相关性，本文就肠道及乳腺组织中共生微生物的研究现状，探讨共生微生物与乳腺癌之间的关系。

神经系统自身免疫性疾病是以自体免疫细胞和免疫因子等攻击神经系统为主要发病机制的自身免疫性疾病。肠道菌群是一个与宿主互利共生的微环境，在维持宿主机体内环境稳态及保持免疫系统成熟方面发挥关键作用。越来越多的结果证实了脑-肠轴的存在，揭示了肠道菌群与神经系统之间双向调节的关系。文章就肠道菌群与常见神经系统自身免疫性疾病的相关性及其可能的发病机制进行总结，以期为该类疾病提供新的治疗靶点和思路。

随着16S rRNA测序技术及宏基因组学的发展，研究证实子宫腔内有微生物菌群的定植。以乳酸杆菌为子宫内膜主导微生物群的患者行辅助生殖技术助孕后的种植率、临床妊娠率较高，妊娠结局较好。子宫内膜微生物在胚胎着床、妊娠维持中的作用机制尚不清楚。目前认为可能机制为其参与子宫内膜免疫调节、直接与子宫内膜相互作用调节炎症因子表达，进而影响子宫内膜蜕膜化过程及胚胎种植；子宫内膜共生微生物竞争抑制保持稳态。本文就宫腔微生物来源、组成成分、对辅助生殖技术妊娠结局的影响及其影响机制等方面的研究进展进行综述，旨在为今后研究子宫内膜微生物对胚胎种植中的作用提供新的思路。

共生的肠道菌群被称为人体第二个基因库，在不同时期呈现不同结构和功能特点。肠道菌群失调及其代谢产物的紊乱会影响人体能量代谢、免疫调节和消化吸收等生理过程，进而影响宿主性腺功能。最近研究发现肠道菌群失衡与男性不育有直接关系，但这一因素在临床上常被忽略。本文简要介绍了成年男性肠道菌群和精子形成的过程，以及肠道菌群通过介导内毒素血症、炎症反应，下调精子生成相关基因表达影响生精的潜在机制。这不仅为研究男性不育症发生机制开辟了新的领域，而且为此前所谓的病因不明的特发性男性不育症的临床诊治提供了新的方向和选择。

微生物作为共生生物与宿主人体构成微生态系统，在生命活动中发挥着重要作用。随着对人体微生态学研究的深入，近年来不断有相关基础研究在临床实践的转化应用型研究。本文从微生态学理论出发，以人体全生命周期为视角，探讨微生态系统的建立与衍变，与衰老、疾病的关系及其干预内容与效果。从研究角度出发，探索其与护理学科的内在联系，为微生态学在护理领域的应用提供理论依据和实践基础。

肠道共生菌与宿主的肠道屏障结构与功能调节、免疫系统的发育及功能等多种生理过程有关.占人类肠道菌群总数的1％～4％的嗜黏蛋白艾克曼菌(Akk)可通过分解黏蛋白定植在肠道黏膜表面的黏液层中,可调节消化系统、内分泌系统、神经系统等系统的多种疾病的发生发展.相较于Akk活菌及胞外囊泡,Akk中的活性蛋白质具有易生产、储存及运输的特点.随着基因组学、蛋白质组学等生物信息学相关技术的进步,Akk中活性蛋白质的鉴定、分离、合成技术发展迅猛,我们综述了 Akk中活性蛋白质的生理作用及其鉴定与合成方法,以期为Akk的生理作用机制研究及临床应用转化提供帮助.