目的:分析结肠癌与直肠癌患者肠道菌群的构成差异。方法:收集2018年7月至2019年1月于哈尔滨医科大学附属第二医院就诊的72例大肠癌患者粪便样本，将其分为结肠癌组和直肠癌组，均为36例。提取粪便样本DNA，并对其进行高通量测序。采用生物信息学方法分析两组患者肠道菌群多样性及菌群构成的差异，探讨差异菌群可能的促癌机制。结果:72例样本经过高通量测序，共获得原始序列2 356 560条，优质序列32 730条，样本序列平均长度主要集中在401~460 bp，对所有序列进行操作分类单元（OTU）物种分类学注释后，获得1 409个OTU。Alpha多样性分析结果提示，直肠癌组和结肠癌组Shannon指数分别为2.61±0.56和2.43±0.67，差异无统计学意义（ t=1.229， P=0.223）；Simpson指数分别为0.17±0.09和0.21±0.16，差异无统计学意义（ t=1.449， P=0.151）。组间差异分析和线性判别分析（LDA）显示：在门水平，厚壁菌门（Firmicutes）在直肠癌患者肠道中丰度更高（LDA值为4.67， P=0.014），变形菌门（Proteobacteria）在结肠癌患者肠道中更加富集（LDA值为4.49, P=0.042）；在纲水平，丙型杆菌（Gammaproteobacteria）丰度在结肠癌患者肠道中较高（LDA值为4.50， P=0.033），而Erysipelotrichia在直肠癌患者肠道中丰度更高（LDA值为3.50, P=0.035）；在目水平，Erysipelotrichales在直肠癌患者肠道中丰度更高（LDA值为3.50， P=0.035）；在科水平，紫单胞菌（Porphyromonadaceae）丰度在直肠癌患者肠道中更高（LDA值为3.97， P=0.033）。 结论:结肠癌与直肠癌患者肠道菌群构成存在明显差异，提示不同的菌群可能影响结肠癌和直肠癌的发展进程。

目的:探究东乡族2型糖尿病与健康人群肠道菌群的特点及差异。方法:收集2020年4月至2021年1月就诊于东乡县人民医院的东乡族2型糖尿病患者25例（T2DM组），同时选取28例体检健康的东乡族人群作为对照组（HC组），收集研究对象及HC组的新鲜粪便样本，通过对16S核糖体RNA（16S rRNA）基因V3+V4区扩增子测序的方法分析肠道菌群。初步了解东乡族T2DM组与HC组肠道微生物的构成特点及差异。结果:两组样本共检测出936个操作分类单元（OTU）数目，其中共同有OTU数目为633个。Alpha多样性分析中Shannon指数显著高于对照组，Simpson指数显著低于对照组，两组菌群多样性差异有统计学意义（ P<0.05）。使用置换多元方差分析比较两组β多样性，差异有统计学意义（ P<0.05）。在分类学门水平，T2DM组中厚壁菌门、放线菌门显著高于HC组（37.97%比22.89%、5.09%比2.08%），差异有统计学意义（ P<0.05）；而拟杆菌门丰度显著减少（T2DM组：68.00%，HC组：49.75%），差异有统计学意义（ P<0.05）。在属水平，发现20个菌属差异有统计学意义（ P <0.05），T2DM组中双歧杆菌属、大肠埃希-志贺菌属、Tyzzerella_4的丰度显著高于HC组，而Prevotella_9、罗氏菌属、Erysipelotrichaceae_UCG-003菌显著减少。 结论:东乡族T2DM组和健康人群肠道菌群组成存在显著差异，从而初步了解东乡族T2DM患者的肠道菌群特征，为今后治疗提供依据。

目的:对临床血液标本分离的细菌7712(＝CGMCC 1.17031＝NBRC 113783＝KCTC 15766)进行生物学特性和系统进化分析，明确其分类学地位。方法:观察菌株的培养特性并进行形态学、生理生化鉴定、基质辅助激光解吸电离子飞行时间质谱鉴定和基因组测序鉴定，并构建基因组发育树以分析其分类学位置。采用在线毒力基因数据库和抗生素抗性数据库，分别对分离株及近缘菌株进行基于全基因组的毒力基因和耐药基因的比较分析。结果:分离株7712为脲酶阳性的需氧革兰阴性非发酵菌，VITEK GN鉴定为人苍白杆菌。16S rRNA基因序列分析显示，分离株7712与苍白杆菌属及布鲁菌属均具有较高的序列一致性；而基于全基因系统发育分析显示，分离株7712与油葫芦苍白杆菌LCB8 T和嗜血苍白杆菌CCUG 38531 T聚类成一个分支，并与其他苍白杆菌属细菌和布鲁菌属聚类成一个大的分支。基因组亲缘性指数分析显示，分离株7712和油葫芦苍白杆菌LCB8 T的平均核苷酸一致性为98.22%，高于原核生物物种的鉴定阈值95%。分离株7712携带多种毒力基因和耐药基因，其中 OCH基因可能与头孢菌素耐药有关。 结论:确定了1例由油葫芦苍白杆菌引起的临床感染，丰富了苍白杆菌属生物多样性信息。

目的:探讨长期高脂饮食对小鼠骨密度及肠道菌群的影响。方法:16只雄性C57BL/6小鼠分为对照组(NC组)及高脂组(HF组)。高脂喂养24周后，检测血糖、血脂等生化指标；取双侧股骨，运用显微计算机断层扫描术(micro-CT)分析骨微结构；16S rDNA测序技术检测小鼠肠道微生物构成变化。结果:与NC组相比，HF组小鼠血清总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)水平显著升高；micro-CT显示HF组小鼠骨小梁骨密度(Tb.BMD)减小、骨体积分数(BV/TV)减小、结构模型指数(SMI)增大、骨小梁数量(Tb.N)减少、骨小梁分离度(Tb.Sp)增加。高脂饮食对小鼠肠道菌群的多样性及丰度有显著影响。通过16S rDNA基因序列分析显示，在门分类学水平上，HF组的变形菌门较NC组相对丰度明显增加，厚壁菌门、疣微菌门、放线菌门较NC组相对丰度降低；在属分类学水平上，NC组中拟杆菌目S24-7_norank的相对丰度要明显高于HF组，多级物种差异判别分析(LEfSe)显示差异具有显著性；HF组中拟杆菌属、拟普雷沃氏菌属、脱硫弧菌属、另枝菌属、螺杆菌属的相对丰度高于NC组，其中另枝菌属、螺杆菌属具有显著性差异。结论:C57BL/6小鼠肠道菌群在长期高脂喂养后出现股骨骨小梁结构破坏，数量减少，骨密度降低，同时菌群构成发生显著变化。

食虫虻科(Asilidae)隶属于昆虫纲(Insecta)双翅目(Diptera)短角亚目(Brachycera)食虫虻总科(Asiloidea),其体色体型多样,复眼大,口器发达呈圆锥形,通常具爪垫,飞行速度快,个体发育为完全变态类型,经历卵、幼虫、蛹和成虫4个阶段.食虫虻幼虫和成虫以捕获其他昆虫甚至蜘蛛等节肢动物为食,成虫食性较杂,能捕食黄蜂、蝴蝶、蝗虫等多个类群昆虫,其中以捕食膜翅目(Hymenoptera)昆虫最多,捕捉猎物时注入神经毒素和蛋白水解酶的唾液,以麻醉并分解猎物的肌肉组织;幼虫生活在土壤内和腐烂的植物中,通常以其他昆虫的卵和幼虫为食,在生态系统中起着维持昆虫种群平衡的重要作用.食虫虻科呈世界性分布,全世界已知14亚科560属7 552种,分类学研究以Linnaeus 1758年最早建立虫虻属Asilus为研究起点,此后历经265年发展,研究手段从形态学到分子生物学逐渐深入,物种数量大幅增加(1758年研究初始仅记录11种),分类体系逐渐完善(1981年4亚科至2004年14亚科).中国目前记录10亚科62属236种,远低于世界已知种的10％,研究工作主要为种类调查和新种描述.食虫虻科系统发育,其科级阶元的单系性基本没有争议,但科内各亚科的单系性还有待进一步讨论,虫虻亚科(Asilinae)、毛虫虻亚科(Laphriinae)、细腹虫虻亚科(Leptogastrinae)、细芒虫虻亚科(Ommatiinae)、的单系性得到了较好的支持,但钩胫虫虻亚科(Dasypogoninae)、整额虫虻亚科(Tillobromatinae)、瘦芒虫虻亚科(Stenopogoninae)、室闭虫虻亚科(Willistonininae)、追虫虻亚科(Dioctriinae)、短喙虫虻亚科(Trigonomiminae)、窄额虫虻亚科(Stichopogoninae)和翅芽虫虻亚科(Brachyrhopalinae)亚科单系性亟待研究.世界食虫虻科分类研究取得丰硕成果,但尚存一些问题:缺乏高质量的系统性分类修订工作;主要类群间系统发育关系尚不明确;研究方法单一.今后应加强利用线粒体DNA、转录组、低覆盖等分子技术结合形态学重新构建系统发关系.中国地大物博、地貌多元,昆虫多样性十分丰富,但食虫虻研究工作起步晚,其本底资源和分布格局不清,亟待对中国食虫虻进行系统化整理和分类修订,结合分子技术对属及以上阶元探究系统发育关系,结合ArcGIS探究我国食虫虻地理分布格局,进一步探究该类群在生态系统中的作用和价值,提高我国食虫虻研究水平,为生产实践提供参考资料.

目的 探讨抗性淀粉(RS)对T2DM肥胖大鼠肠道菌群及代谢的影响.方法 将Wistar大鼠分为正常对照(NC)组、模型组(Mod)、阿卡波糖干预组(Aca)、RS干预组(RS),每组各8只,连续给药8周后检测TC、TG、HDL-C、LDL-C,计算Lee's指数、胰岛素敏感性指数(HOMA-IS)、胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)、胰岛β细胞功能指数(HOMA-β)及炎症因子、葡萄糖耐量曲线下面积,ELISA法检测血清TNF-α、IL-6、脂多糖(LPS),HE染色观察肝组织脂肪变性情况.收集各组粪便进行16SrDNA测序,采用物种组成分析、Alpha多样性分析、物种差异分析、Beta多样性分析等方法分析肠道菌群结构和数量.结果 Mod、Aca、RS组Lee's指数高于NC组(P<0.05).与NC组比较,Mod、Aca、RS 组TC、TG、LDL-C、HDL-C、FIns、HOMA-IR、TNF-α、IL-6、LPS 升高(P<0.05),HOMA-IS、HOMA-β降低(P<0.05).与Mod组比较,Aca、RS组TC、TG、LDL-C、HDL-C、FIns、HOMA-IR、TNF-α、IL-6、LPS降低(P<0.05),HOMA-IS、HOMA-β升高(P<0.05).与Aca组比较,RS组IL-6 升高(P<0.05),LDL-C、HDL-C降低(P<0.05).16SrDNA测序结果显示,Aca、RS组增加操作分类学单元总数,提高大鼠肠道菌群多样性与均匀度,在门和属水平上,Aca、RS组菌群组成结构、丰度与NC组接近,物种差异性小.结论 RS可调节T2DM肥胖大鼠糖脂代谢,改善IR,提高肠道微生物多样性,调节肠道菌群结构,维持肠道健康.

[目的]探究不同富集时间、培养盐度、稀释梯度、培养基等对氯化物型昆特依高盐盐湖可培养嗜盐细菌多样性的影响,确定嗜盐细菌的最佳分离培养条件,挖掘更多的环境嗜盐细菌资源.[方法]从昆特依盐湖中采集水泥混合样本,选取 7 种培养基和 10%、18%NaCl两个盐度,采用富集培养法、平板稀释涂布法和平板分区划线法分离嗜盐菌;通过 16S rRNA基因测序与BLAST序列比对确定菌株系统分类学地位.同时采用免培养Illumina MiSeq高通量测序技术分析昆特依盐湖细菌群落结构多样性特征.[结果]免培养昆特依盐湖样本中共鉴定到细菌 39 门 64 纲 101 目 219 科 703 属,其中假单胞菌门(Pseudomonadota)、厚壁菌门(Bacillota)、拟杆菌门(Bacteroidota)和放线菌门(Actinomycetota)为主要的优势菌门.根据菌落的大小、形态、颜色、光泽度、透明度、质地、隆起状态和边缘特征等,共分离出 436 株嗜盐菌,隶属于 3 门 3 纲 6 目 9 科 28 属 77 种,其中 16 株可能为潜在新种.3 门为厚壁菌门(Bacillota)、假单胞菌门(Pseudomonadota)和放线菌门(Actinomycetota),且均为免培养测序结果中的优势菌门.在属水平上,芽孢杆菌属(Bacillus)、盐单胞菌属(Halomonas)、喜盐芽孢杆菌属(Halobacillus)、枝芽孢菌属(Virgibacillus)和卤水杆菌属(Salicola)为优势菌属.肿块芽孢杆菌属(Tuberibacillus)、越南蔷薇菌属(Rossellomorea)和谷氨酸杆菌属(Glutamicibacter)是首次从盐湖中分离得到.18%NaCl分离得到的菌株数量明显少于 10%NaCl,且多样性较低,芽孢乳杆菌科(Sporolactobacillaceae)是该条件下分出的特有菌科.7 种培养基中,1/2 RCA培养基分离效果最好.最佳富集培养时间为 0、7 和 60 d,最佳样品稀释梯度为 10-2 和 10-3.[结论]从昆特依盐湖中共分离出嗜盐细菌 3 门 3 纲 6 目 9 科 28 属 77 种.应用多种培养基,设置不同盐度、富集培养时间和稀释梯度等可显著提升可培养嗜盐菌的多样性.

为了全面理解虎耳草(Saxifraga stolonifera)的种内多样性,探讨种下分类的可能性,为资源保护及创新利用提供参考,对全国43个虎耳草居群的33个性状进行观察记录,通过数量性状变异和质量性状多样性分析、相关性分析、主成分分析和聚类分析等方法探讨该种的表型性状多样性.结果表明:(1)数量性状变异系数为0.05～0.67,质量性状多样性指数为0.19～1.39,居群间斑纹分布式样和叶色多样性水平高,匍匐茎分枝数和叶长宽比分别为最不稳定和最稳定的性状.(2)数量性状和导出性状变异系数普遍较大、质量性状的多样性指数普遍较高及各主成分的贡献率较分散,因此不宜仅仅依靠形态特征对该种进行种下分类.(3)虎耳草居群间各性状相关性存在差异,叶长和叶宽、下长花瓣长和下短花瓣长、下长花瓣宽和下短花瓣宽等性状相关性显著.(4)基于形态聚类结果可将国产虎耳草分为3个分支,并表现出一定的地域性,其中分支I由8个西南居群、2个华东居群和3个西北居群组成;分支Ⅱ由4个华东居群、4个华中居群、4个西南居群和1个西北居群组成,这一类表型的虎耳草分布广泛;分支Ⅲ由10个华中居群、6个西南居群和1个华东居群组成.

[目的]文章旨在探讨山东昆嵛山地衣的物种多样性,进一步明确其物种组成和分布.[方法]综合运用形态学、解剖学、化学成分分析和基于ITS序列的分子系统学分析等手段对采自该区域的地衣进行分类研究.[结果]发现3个中国新记录种,即哈氏癞屑衣(Lepraria harrisiana Lendemer)、尼氏绒枝(Leprocaulon nicholsiae Lendemer E.Tripp)、鳞棕衣[Brownliella kobeana(Nyl.)S.Y.Kondr.,K?rnefelt,A.Thell,Elix,Jung Kim,A.S.Kondr.& Hur],该文对这3个中国新记录种进行详细描述,并提供了地衣体形态特征图片.研究标本保存于山东师范大学植物标本室(SDNU).[结论]昆嵛山地衣物种丰富度较高.

为了探寻羌活种子不同休眠阶段内生菌的群落结构组成和差异性,利用Illumina Miseq平台分别对羌活种子不同休眠状态(形态生理双重休眠状态(GSA)、形态休眠解除状态(GSB)、生理休眠解除状态(GSC))细菌微生物16S V5+V7区域和真菌微生物ITS1-IF区域的扩增片段进行高通量测序,结合生物信息学进行分析.内生细菌的多样性较内生真菌丰富.内生菌群落种类在门水平上类似;在属水平上,从GSA到GSB阶段,内生菌群落组成发生变化,从GSB到GSC阶段,内生菌群落种类相似.通过Alpha多样性分析发现,从GSA到GSB再到GSC阶段,内生细菌群落多样性显著增大后直到种子生理休眠解除变化不变,而内生真菌群落多样性在种子整个休眠解除过程中变化不大.内生细菌群落结构从GSA到GSB再到GSC阶段均发生了显著性变化,而内生真菌群落结构从GSA到GSB发生显著变化后直到种子生理休眠解除,群落结构变化不大.LEfSe分析发现内生细菌共有37个差异丰富的分类学分支(a=0.01,LDA≥2.0),内生真菌则无.本研究明确了羌活种子不同休眠状态内生菌群落结构组成和差异性,丰富了羌活种子内生菌资源信息,对进一步研究利用微生物方法促进羌活种子休眠解除技术具有一定的指导意义.