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基于UPLC-Q-Exactive Orbitrap MS和网络药理学研究银甲片治疗盆腔炎的有效成分及作用机制
编辑人员丨2024/8/17
目的:研究银甲片治疗盆腔炎的有效成分及作用机制.方法:利用超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱法(UPLC-Q-Exactive Orbitrap MS),结合文献与对照品比对鉴定银甲片的化学成分.将化学成分和盆腔炎疾病的交集靶点导入String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;通过DAVID数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;采用Cytoscape 3.9.1 软件构建药材-成分-靶点-通路可视化图;利用Maestro 11.9 软件进行分子对接.结果:从银甲片中共鉴定 58 个化学成分,包含黄酮类、有机酸类、萜类、生物碱类.PPI分析得到类固醇受体辅激活因子(SRC)、热休克蛋白 90α家族A类成员 1(HSP90AA1)、磷脂酰肌醇 3-激酶调节亚基 1(PIK3R1)、信号转导和转录激活因子 3(STAT3)、丝裂原活化蛋白激酶 3(MAPK3)5 个核心靶点;KEGG 结果显示银甲片主要通过磷脂酰肌醇 3-激酶-蛋白激酶 B(PI3K-Akt)、MAPK 等通路发挥作用.分子对接结果表明,木犀草苷、山柰酚、木犀草素、香叶木素等成分与 SRC、HSP90AA1、PIK3R1 等 5 个核心靶点的对接构象稳定.结论:银甲片可能通过木犀草苷、山柰酚、木犀草素、香叶木素、芹菜素等活性成分调控PI3K-Akt、MAPK等通路发挥治疗盆腔炎作用.
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编辑人员丨2024/8/17
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蛋白质糖基化修饰的非变性构象分辨质谱研究进展
编辑人员丨2024/3/23
糖基化是蛋白质最重要的翻译后修饰之一,能够调控蛋白质的电荷态、结构及分子间相互作用等,进而影响其功能.糖基化的高度异质性导致传统的结构解析方法很难对糖蛋白进行全面表征.随着分析技术的发展,质谱在糖蛋白结构解析中发挥了重要作用.蛋白质组学质谱技术可在多肽水平上对复杂、低丰度蛋白质糖基化修饰的化学组成与位点信息进行鉴定.非变性质谱技术(native mass spectrometry,nMS)则直接在完整蛋白水平上揭示聚糖异质性及其对蛋白高级结构和相互作用的调控效应.作为结构质谱的代表性技术,基于离子淌度的nMS受益于离子淌度仪的构象分辨能力和构象去折叠功能,能够在非变性质谱的基础上提供离子的三维动态结构信息,为异构体结构快速鉴定提供不可替代的解决方案.本文重点介绍了两种新兴离子淌度质谱技术,即非变性动态构象分辨质谱技术和糖型分辨结构质谱技术,并以3种常见蛋白体系为例,介绍其在糖蛋白构象研究领域的最新进展.
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编辑人员丨2024/3/23
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引入含氟砌块对天然产物母核5-色酮骨架的构效解析
编辑人员丨2023/8/5
目的 将极强电负性的氟原子引入2-羟基-2-三氟甲基-3-噻吩-5-色酮C23 H21 BrF3 NO3 S的芳香性结构,获得高脂溶性、高稳定的化合物.方法 以对溴基苯甲醛、达咪酮、4,4,4-三氟-1-(噻吩-2-基)丁烷-1,3-二酮和醋酸铵为原料,少量的乙醇作溶剂,多组分一锅法合成目标化合物.核磁共振谱(1 H-NMR和13C-NMR)、红外光谱(IR)、高分辨质谱(HRMS)和X射线单晶衍射确证目标化合物的结构,并分析该结构的各平面角度.结果 获得目标产物,即2-羟基-7,7-二甲基-3-(噻吩-2-羰基)-4-(对溴苯基)-2-(三氟甲基)-3,4,7,8-四氢-5(6H)-色酮.产物结构经核磁、红外和高分辨质谱确证.单晶X射线衍射分析显示,该产物的晶体结构属正交晶系,空间群Pbc a.采用直接法解析该晶体结构,全矩阵最小二乘法修正的原子参数显示,最终的偏离因子为R=0.0464,w R=0.1133.该分子结构中新构筑的吡啶环为半椅式构象.结论 本研究通过多组分反应将三氟甲基高效且便捷地引入到色酮骨架.
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编辑人员丨2023/8/5
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灰树花活性多糖构效关系研究进展
编辑人员丨2023/8/5
灰树花是一种珍贵的食药用菌,具有降血糖、抗肿瘤、免疫调节和抗病毒等多种生物活性.灰树花多糖是其主要的活性成分,多糖的生物活性与多糖的结构密切相关.本文综述了从20世纪80年代起国内外已报道的灰树花活性多糖的结构表征.部分研究认为多糖的降血糖活性可能与β-1,6-葡聚糖主链化学结构相关,而灰树花多糖结构为β-1,6主链或β-1,3主链葡聚糖时具有较好的抗肿瘤活性.然而多糖结构异常复杂,精细结构的解析困难,导致目前灰树花多糖结构表征一般止步于单糖组成、分子量、糖苷键类型、分支结构和粗略分子链构象,但二维核磁(two dimensional nuclear magnetic resonance,2D-NMR)和高分辨质谱联用等技术的发展将有助于解开灰树花多糖构效关系,并为灰树花活性多糖的开发利用提供理论依据.
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编辑人员丨2023/8/5
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16α-羟基泼尼松龙的合成及结构确证
编辑人员丨2023/8/5
目的 优化16α-羟基泼尼松龙的合成工艺,并对其结构进行确证.方法 以泼尼松龙为原料,经环化、水解、异丁酸酐酯化、β-消除、氧化、酯交换得到16α-羟基泼尼松龙;通过1H-NMR、13C-NMR、DEPT-90/135、1H-1H COSY、HSQC、HMBC和NOESY等核磁共振谱确认目标化合物的分子结构,明确其C、H归属;制备并测定目标化合物单晶结构,进一步确证其立体构型,明确16位羟基构象.结果 与结论16α-羟基泼尼松龙反应总收率约为40%,其结构经核磁、高分辨质谱、XRD等确证.该工艺具有原料易得、反应条件温和等优点,更具应用价值.
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编辑人员丨2023/8/5
