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小核仁RNA宿主基因4在胃癌中的预后价值及潜在作用机制
编辑人员丨1周前
目的:旨在探讨小核仁RNA宿主基因4(SNHG4)在胃癌组织中的表达、预后价值及可能作用机制。方法:运用UALCAN数据库分析SNHG4在胃癌中的表达情况;Kaplan-Meier Plotter数据库分析SNHG4与胃癌预后的关系;StarBase、Targetscan、microT-CDS数据库及Cytoscape软件构建SNHG4-miRNA-mRNA调控网络;DAVID数据库对SNHG4相关miRNA的靶基因进行生物学功能及通路分析。结果:SNHG4在胃癌组织中的表达明显高于正常组织( P=8.882E-16)。生存分析发现SNHG4高表达的胃癌患者总体生存时间少于低表达组( P=8.900E-05)。通过RNA调控网络的构建,发现在胃癌中hsa-let-7a-5p( P=1.02E-03)、hsa-miR-152-3p( P=4.51E-06)、hsa-miR-204-5p( P=6.68E-04)和hsa-miR-363-3p( P=8.06E-03)可作为SNHG4的结合位点。SNHG4作用于这4种miRNA进一步调控250个靶基因。对靶基因的GO注释及KEGG富集分析,发现这些靶基因在蛋白质磷酸化的调节、转录负调控、RNA聚合酶II启动子的转录等生物过程中发挥作用,且通过阻断或激活Wnt等信号通路参与胃癌的发生及发展。 结论:SNHG4可作为胃癌潜在的诊断性肿瘤标志物,判断胃癌预后情况,通过构建SNHG4-miRNA-mRNA调控网络,从分子水平研究胃癌的发病机制,为实验研究及临床研究提供明确方向。
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编辑人员丨1周前
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lncRNA SNHG12靶向抑制miR-495-3p进而调控PI3K/Akt信号通路对前列腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响
编辑人员丨1个月前
目的 探究长链非编码RNA(lncRNA)核仁小分子RNA宿主基因12(SNHG12)靶向抑制miR-495-3p/磷脂肌醇-3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路对前列腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响.方法 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测前列腺癌组织和细胞(LNCaP、C4-2、DU145)中SNHG12、miR-495-3p相对表达水平(将其中的DU145细胞分为si-NC组、si-SNHG12 组、si-SNHG12+anti-miR-NC 组、si-SNHG12+anti-miR-495-3p 组,4 组检测);双荧光素酶报告实验检测 SNHG12与miR-495-3p靶向关系;MTT法检测细胞增殖;Transwell检测细胞迁移和侵袭;蛋白免疫印迹法(Western blot)检测增殖细胞核抗原(PCNA)、N-钙黏蛋白(N-cadherin)、E-钙黏蛋白(E-cadherin)蛋白相对表达水平.结果 在前列腺癌组织和细胞(LNCaP、C4-2、DU145)中SNHG12相对表达水平明显升高,miR-495-3p相对表达水平明显降低(P<0.05);敲低SNHG12可降低DU145细胞活性、PCNA、N-cadherin蛋白相对表达水平,减少迁移及侵袭细胞数,增加E-cadherin蛋白相对表达水平(P<0.05);SNHG12可靶向负调控miR-495-3p,下调miR-495-3p可逆转敲低SNHG12对前列腺癌细胞增殖、迁移及侵袭的影响.与si-NC组相比,si-SNHG12组p-PI3K、p-Akt蛋白相对表达水平明显降低(P<0.05);与si-SNHG12+anti-miR-NC组相比,si-SNHG12+anti-miR-495-3p组p-PI3K、p-Akt蛋白相对表达水平明显增加(P<0.05).结论 lncRNA SNHG12可能通过靶向抑制miR-495-3p/PI3K/Akt信号通路促进前列腺癌细胞增殖、迁移和侵袭.
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编辑人员丨1个月前
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LncRNA SNHG1在同型半胱氨酸致足细胞焦亡中的作用
编辑人员丨2024/3/30
目的 探讨lncRNA SNHG1在同型半胱氨酸诱导足细胞焦亡中的作用.方法 选取Cbs+/-小鼠随机分成2组,设置正常饮食组(ND)和高蛋氨酸饮食组(HMD),Western blot检测Caspase-1、Cleaved Caspase-1和NLRP3的蛋白表达水平.体外培养小鼠肾小球足细胞,设置对照组(Control,0 μmol/L Hcy)和同型半胱氨酸干预组(Hcy,80 μmol/L Hcy);足细胞转染慢病毒后设置lncSNHG1过表达阴性对照组(OE-NC)和lncSNHG1过表达组(OE-SNHG1);lncSNHG1过表达阴性对照+同型半胱氨酸干预组(OE-NC+ Hcy)和lncSNHG1过表达+同型半胱氨酸干预组(OE-SNHG1+Hcy),干预细胞48 h后,实时荧光定量PCR检测Hcy干预的足细胞中lncSNHG1表达水平;Western blot和免疫荧光技术检测足细胞中焦亡相关蛋白Caspase-1、Cleaved Caspase-1、NLRP3及GSDMD和GSDMD-N表达水平;ELISA检测足细胞中焦亡介导的炎症相关因子IL-1β和IL-18含量.结果 (1)动物实验中:与正常饮食组(ND)相比,高蛋氨酸饮食组(HMD)中焦亡相关蛋白Caspase-1、Cleaved Caspase-1和NLRP3及GSDMD、GSDMD-N表达水平增高;(2)细胞实验中:与对照组(Control)相比,同型半胱氨酸干预组(Hcy)中焦亡相关蛋白Caspase-1、Cleaved Caspase-1和NLRP3及GSDMD、GSDMD-N表达水平增高,焦亡介导炎症因子IL-1β和IL-18含量增高;(3)细胞实验中:与对照组(Control)相比,同型半胱氨酸干预组(Hcy)中lncSNHG1表达水平增高;足细胞转染lncSNHG1慢病毒后,与Control组及OE-NC组相比,OE-SNHG1组lncSNHG1表达水平增高;(4)细胞实验中:与OE-NC+ Hcy组相比,OE-SNHG1+Hcy组中焦亡相关蛋白Caspase-1、Cleaved Caspase-1和NLRP3及GSDMD、GSDMD-N表达水平增高,焦亡介导炎症因子IL-1β和IL-18含量增高.结论 lncRNA SNHG1在Hcy诱导的足细胞焦亡过程中起到促进作用.
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编辑人员丨2024/3/30
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老年COPD并发PI患者血清lncRNA SNHG16和SMAD4表达及其临床意义
编辑人员丨2024/3/2
目的 探讨老年慢性阻塞性肺病(COPD)并发肺部感染(PI)患者血清长链非编码RNA小核仁RNA宿主基因16(lncRNA SNHG16)和母亲抗生物皮肤生长因子同源物4(SMAD4)表达及其临床意义.方法 选取2021年1月至2023年1月该院收治的237例老年COPD患者为研究对象,将其中并发PI的117例患者归为并发组,120例未并发PI患者归为COPD组.采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测患者血清lncRNA SNHG16相对表达水平.采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测患者血清SMAD4水平.采用简化临床肺部感染评分(sCPIS)评价并发组患者PI程度.采用多因素Logistic回归分析模型分析老年COPD患者并发PI的影响因素;采用Spearman相关性分析老年COPD并发PI患者的血清lncRNA SNHG16相对表达水平、SMAD4水平与sCPIS之间的相关性;并通过受试者工作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA SNHG16相对表达水平、SMAD4水平对老年COPD患者并发PI的诊断价值.结果 并发组血清lncRNA SNHG16相对表达水平高于COPD组,但血清SMAD4水平低于COPD组(P<0.05).并发组年龄≥70岁、有吸烟史、并发糖尿病、COPD病程≥5年者占比及肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、干扰素-γ(INF-γ)水平均高于COPD组(P<0.05),1秒用力呼气量/用力肺活量(FEV1/FVC)、白细胞介素-10(IL-10)水平均低于COPD组(P<0.05).多因素Logistic回归分析模型结果表明,年龄≥70岁、并发糖尿病、COPD病程≥5年、高TNF-α水平、高INF-γ水平、高lncRNA SNHG16相对表达水平均是导致老年COPD患者并发PI的危险因素(P<0.05),高FEV1/FVC、高血清SMAD4水平、高IL-10水平是保护因素(P<0.05).Spearman相关性分析表示,血清ln-cRNA SNHG16相对表达水平与COPD并发PI患者的sCPIS呈正相关(r=0.505,P<0.001),SMAD4水平与sCPIS呈负相关(r=-0.550,P<0.001).血清lncRNA SNHG16相对表达水平、SMAD4水平联合诊断老年COPD患者并发PI的曲线下面积(AUC)均大于各项单独诊断(Z=2.416,P=0.016;Z=2.375,P= 0.018).结论 老年COPD并发PI患者血清lncRNA SNHG16相对表达水平上升,SMAD4水平下降,二者均为老年COPD患者并发PI的影响因素,均与患者PI程度相关,均对老年COPD患者并发PI具有诊断价值,且二者联合诊断效能更好.
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编辑人员丨2024/3/2
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LncRNA SNHG4调控牙周膜干细胞成骨分化过程中的miR-152-3p
编辑人员丨2024/1/6
背景:研究表明长链非编码RNA核仁小RNA宿主基因4(LncRNA SNHG4)参与了多种炎症性疾病的进展,而关于LncRNA SNHG4对牙周炎治疗过程中人牙周膜干细胞成骨分化的影响尚不明确.目的:探讨LncRNA SNHG4通过调节miR-152-3p对人牙周膜干细胞成骨分化的影响.方法:从因正畸需要而拔除的前磨牙牙周膜组织中分离出人牙周膜干细胞,将其进行成骨诱导分化0,7,14 d后,qRT-PCR检测Runt相关转录因子2、骨钙素、LncRNA SNHG4及miR-152-3p表达.取第3代人牙周膜干细胞,将其分为NC组、pcDNA组、pcDNA-SNHG4组、inhibitor NC组、miR-152-3p inhibitor组、pcDNA-SNHG4+mimic NC组、pcDNA-SNHG4+miR-152-3p mimic组,qRT-PCR检测各组人牙周膜干细胞中LncRNA SNHG4、miR-152-3p表达,CCK-8法检测细胞增殖情况;比色法检测碱性磷酸酶活性;茜素红染色检测矿化结节形成情况;Western blot检测Runt相关转录因子2、骨钙素、碱性磷酸酶蛋白表达;双荧光素酶报告基因实验验证LncRNA SNHG4与miR-152-3p的关系.结果与结论:①与成骨诱导0 d比较,成骨诱导7,14 d后人牙周膜干细胞中Runt相关转录因子2、骨钙素、LncRNA SNHG4表达升高,miR-152-3p表达降低(P<0.05);②过表达LncRNA SNHG4或抑制miR-152-3p均可提高人牙周膜干细胞的增殖能力及碱性磷酸酶活性、矿化结节形成量和Runt相关转录因子2、骨钙素、碱性磷酸酶的蛋白表达(P<0.05);miR-152-3p mimic减弱了过表达LncRNA SNHG4对人牙周膜干细胞成骨分化的促进作用;LncRNA SNHG4与miR-152-3p存在靶向关系;③结果表明,过表达LncRNA SNHG4可能通过抑制miR-152-3p促进人牙周膜干细胞成骨分化.
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编辑人员丨2024/1/6
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缺血性脑卒中患者血清LncRNA SNHG8的表达及临床意义
编辑人员丨2023/10/28
目的 探讨长链非编码RNA小核仁RNA宿主基因8(long non-coding RNA small nucleolar RNA host gene 8,LncRNA SNHG8)在缺血性脑卒中(ischemic stroke,IS)患者血清中的表达水平及临床意义.方法 选择2019年5月~2021年12月在河北北方学院附属第一医院神经内科住院的IS患者115例作为研究对象(IS组),根据入院时国立卫生研究院卒中量表评分(national institute of health stroke scale,NIHSS)对患者进行神经功能损伤评分,将患者分为轻度组(NIHSS评分≤4 分,n=39)、中度组(4 分<NIHSS评分≤20 分,n=35)和重度组(NIHSS评分>20 分,n=41),另选取同期在该院体检人员 120 例作为对照组.采用实时荧光定量PCR(real time fluorescent quantitative PCR,qRT-PCR)法检测血清LncRNA SNHG8 表达水平;Spearman相关性分析IS患者血清LncRNA SNHG8 与NIHSS评分的相关性;受试者工作特征(receiver operating characteristic curve,ROC)曲线分析血清LncRNA SNHG8 表达水平对IS的诊断价值.结果 IS组血清总胆固醇(total cholesterol,TC)(5.26±1.21 mmol/L)和低密度脂蛋白-胆固醇(low-density lipoprotein cholesterol,LDL-C)(2.23±0.53 mmol/L)水平高于对照组(4.35±1.43 mmol/L,1.51±0.65 mmol/L),差异具有统计学意义(t=5.255,9.284,均P<0.001);血清高密度脂蛋白-胆固醇(high-density lipoprotein cholesterol,HDL-C)(1.39±0.41 mmol/L)及LncRNA SNHG8(0.78±0.11)表达水平低于对照组(1.72±0.36 mmol/L,1.05±0.15),差异具有统计学意义(t=6.564,15.680,均P<0.001);轻、中、重度组患者血清LncRNA SNHG8 表达水平分别为0.85±0.10,0.77±0.09 和 0.71±0.08,三组间比较差异有统计学意义(F=24.173,P<0.001);IS患者血清LncRNA SNHG8 与NIHSS评分呈负相关性(r=-0.501,P<0.001);血清LncRNA SNHG8 表达水平评估IS患者的ROC曲线下面积为 0.873(95%CI:0.823~0.913),最佳截断值 0.89,敏感度和特异度分别为 85.22%,73.33%;IS患者在入院24 h内、治疗 1周后、治疗 2周后血清LncRNA SNHG8 表达水平为 0.78±0.11,0.85±0.09 和0.93±0.08,表达水平依次升高,差异有统计学意义(F=73.064,P<0.001).结论 LncRNA SNHG8 在IS患者血清中表达水平降低,与患者病情严重程度有关,可能成为IS诊断与病情评估的标志物.
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编辑人员丨2023/10/28
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长链非编码SNHG1/miR-145/ADAM17轴在椎间盘髓核退变中的作用及其调控机制
编辑人员丨2023/9/23
目的:研究长链非编码RNA小核仁RNA宿主基因1(SNHG1)、miR-145及解整合素-金属蛋白酶 17(ADAM17)在椎间盘退变(IDD)组织中的表达,探讨SNHG1调控miR-145/ADAM17轴对椎间盘髓核细胞退变的影响及机制.方法:采用qRT-PCR、免疫印迹检测30例IDD患者经手术摘除的髓核组织SNHG1、miR-145与ADAM17的表达;双荧光素酶报告基因、RNA免疫共沉淀等确定SNHG1、miR-145与ADAM17的关系;白介素(IL)-1β诱导髓核细胞建立细胞退化模型,SNHG1 siRNA或miR-145模拟物等转染后,CCK-8、流式细胞术等检测细胞增殖、凋亡以及相关分子指标的变化.结果:相比于对照髓核组织,IDD髓核组织中SNHG1与ADAM17表达上调,miR-145表达下调,均与Pfirrmann分级显著相关.SNHG1可通过海绵作用靶向miR-145,miR-145也可靶向ADAM17的3'-非编码区(3'-UTR)抑制ADAM17蛋白表达.SNHG1沉默逆转了IL-1β诱导的髓核细胞凋亡及基质酶(基质金属蛋白酶13、ADAMTS4)合成,上调了collagenⅡ和aggrecan表达;而SNHG1过表达增强了IL-1β诱导的上述效应.结论:SNHG1调控miR-145/ADAM17分子轴,促进髓核细胞凋亡和细胞外基质降解,参与椎间盘退变的发展变化.
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编辑人员丨2023/9/23
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长链非编码RNA SNHG1促进肺癌细胞增殖
编辑人员丨2023/8/6
近年来,大量证据表明长链非编码RNA (long non-coding RNAs,lncRNAs)在肿瘤发生发展中发挥重要的作用.本研究通过生物信息学预测发现,核仁小分子RNA宿主基因1(small nucleolar RNA host gene 1,SNHG1)无蛋白质编码功能,且主要定位于细胞质.qRT-PCR结果显示,SNHG1在肺癌细胞中的表达量显著高于正常肺上皮细胞.在肺癌细胞NCI-H1299中,敲低SNHG1发现,该细胞增殖能力明显下降;在正常肺上皮细胞BEAS-2B中,过表达SNHG1可显著促进该细胞的增殖能力.深入研究发现,SNHG1可上调CDK4和下调p27kip1在蛋白质水平的表达,而对其mRNA水平表达量无影响.此外,在肺癌临床组织中也发现SNHG1高表达,且高表达的SNHG1与肺癌瘤体大小、TNM分期和远端转移正相关,而与患者年龄及吸烟史无关.综上所述,SNHG1在肺癌中高表达,通过上调CDK4和下调p27kip1推进肺癌进程.
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编辑人员丨2023/8/6
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长链非编码RNA NR2F2-AS1在人上皮性卵巢癌中的表达
编辑人员丨2023/8/6
目的:分析长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA) NR2F2(chicken ovalbumin upstream promoter-transcription factor Ⅱ, 又称nuclear receptor subfamily 2 group F member 2)反义核糖核酸1(NR2F2-antisense RNA 1,NR2F2-AS1)在人上皮性卵巢癌中的表达.方法:利用Aligent Human lncRNA基因芯片检测3对卵巢癌组织及其对应癌旁组织中lncRNA和mRNA的表达,筛选出差异表达的lncRNA和mRNA.应用实时荧光定量PCR检测22例卵巢癌组织和10例良性卵巢囊肿组织中lncRNA NR2F2-AS1、核仁小RNA宿主基因4(small nucleolar RNA host gene 4,SNHG4)、LOC101927905和OVE5-21006的表达.将靶向NR2F2-AS1的siRNA转染卵巢癌SKOV3细胞后,应用实时荧光定量PCR检测NR2F2-AS1反义基因NR2F2的表达.结果:3对卵巢癌组织及其对应癌旁组织的基因芯片检测共筛选出33 403条差异表达的lncRNA和20 351条差异表达的mRNA.卵巢癌组织中NR2F2-AS1的表达水平明显低于良性卵巢囊肿组织(P=0.003 5).并且,Ⅰ~Ⅱ期卵巢癌组织中NR2F2-AS1的表达水平低于Ⅲ~Ⅳ期卵巢癌组织(P=0.042 2).靶向NR2F2-AS1的siRNA转染SKOV3细胞后,NR2F2mRNA的表达水平被明显下调(P=0.049 5).结论:上皮性卵巢癌组织中lncRNA表达谱与相应癌旁组织有较大差异.NR2F2-AS1在卵巢癌组织中表达下调,并且与卵巢癌患者的病理分期有关.抑制卵巢癌SKOV3细胞中NR2F2-AS1的表达后,其反义基因NR2F2的表达水平也下降.
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编辑人员丨2023/8/6
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SNHG16通过Wnt/β-catenin信号通路促进肝细胞癌细胞增殖和迁移
编辑人员丨2023/8/6
目的:检测长链非编码RNA小核仁RNA宿主基因16 (small nucleolar RNA host gene 16,SNHG16) 在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)组织及细胞中的表达情况,探讨SNHG16表达调控对HCC细胞增殖和迁移的影响及其分子机制.方法:采用实时荧光定量PCR法检测38例HCC患者的肝癌及癌旁组织,以及4种肝癌细胞株和正常肝细胞株中SNHG16的表达水平.分析SNHG16表达与HCC患者临床病理特征的关系.将SNHG16过表达或SNHG16-shRNA重组慢病毒分别感染肝癌Hep-3B或SK-Hep-1细胞,采用实时荧光定量PCR法验证细胞中SNHG16表达被调控后,采用CCK-8和Transwell小室法分别检测肝癌细胞增殖和迁移能力的变化,并采用蛋白质印迹法检测细胞中Wnt/β-catenin信号通路关键蛋白表达的变化.通过裸鼠成瘤实验检测SNHG16表达调控对裸鼠体内肝癌细胞成瘤能力的影响.结果:HCC组织和细胞中SNHG16表达水平分别高于癌旁组织和正常肝细胞(P<0.001,P<0.05),而且HCC组织中SNHG16表达与肿瘤大小(P<0.01)、TNM分期(P<0.01)和谷丙转氨酶表达水平(P<0.05)密切相关.感染SNHG16过表达重组慢病毒后的Hep-3B细胞中SNHG16表达明显上调(P<0.001),细胞增殖和迁移能力明显增强(P值均<0.01),而且细胞中c-myc和β-catenin表达明显上调(P值均<0.01).感染SNHG16-shRNA重组慢病毒后的SK-Hep-1细胞中SNHG16表达明显下调(P<0.001),细胞增殖和迁移能力明显减弱(P值均< 0.001),而且细胞中c-myc和β-catenin表达明显下调(P<0.05,P<0.01).另外,SNHG16过表达的Hep-3B细胞在裸鼠体内的成瘤能力明显增强(P<0.01),而SNHG16被敲低的SK-Hep-1细胞在裸鼠体内的成瘤能力明显减弱(P<0.05).结论:SNHG16在HCC组织和细胞系中表达水平升高,并可能通过Wnt/β-catenin信号通路促进肝癌细胞的增殖和迁移.
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编辑人员丨2023/8/6
