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人胚胎早期肠管液泡和再通的观察研究
编辑人员丨5天前
目的:观察人胚胎肠管再通过程中阻塞管腔内的胚胎液泡的形态及黏膜上皮的形成。方法:对4例孕9~10周人胚胎石蜡包埋和切片进行观察。所有标本均做矢状面连续切片(5 μm厚)和HE染色。3D HISTECH扫描切片并进行三维重建。结果:胚胎头臀径(crow-rump length,CRL)28 mm(孕9周)肠腔可见细小腔隙,管腔形状不规则,可见黏膜上皮化,液泡离心性融合,囊壁形成黏膜上皮层。胚胎CRL 36 mm(孕10周)肠腔腔隙进一步扩大,肠腔内液泡不断融合黏膜上皮,直到完成再通。结论:本研究演示了人胚胎肠管再通早期的液泡形态和结构。显示肠管胚胎期液泡囊壁通过单层上皮细胞的融合、扩张和向黏膜上皮演变,构成肠道黏膜上皮。暂时充盈期肠管液泡上皮细胞和间充质细胞之间应该存在上皮-间充质转换,两者在肠黏膜上皮化和再通过程中扮演着重要作用。
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编辑人员丨5天前
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补体C1q C链—骨肉瘤预后因子的生物信息学分析与验证
编辑人员丨5天前
目的:用生物信息学分析筛选骨肉瘤预后相关基因。方法:从Gene Expression Omnibus(GEO)下载GSE33382、GSE21257数据集。分析获得差异表达基因(DEGs)。对差异基因进行GO分析,构建蛋白互作网络。Cytoscape进一步筛选关键基因,对关键基因进行生存相关性分析。用临床样本验证关键基因与患者预后情况。两组间差异采用Student’s t检验。 结果:筛选下调基因43个,上调基因43个,GO分析发现差异基因主要富集在免疫应答、抗原处理和呈递、免疫反应、蛋白质加工和成熟等免疫相关过程。在分子功能中,主要参与细胞内主要组织相容性复合体(MHC)Ⅱ类受体活性、核糖体结构组成、信号和分子转导活性等。在细胞组成成分方面,主要与主要组织相容性复合体蛋白质复合物、裂解空泡、液泡、溶酶体、细胞膜、核糖体等细胞器的功能有关。筛选出10个关键基因:补体C1q A链(CIQA)、补体C1q B链(C1QB)、补体C1q C链(C1QC)、单核细胞分化抗原CD 14(CD14)、单核细胞分化抗原CD 74(CD74)、IgE受体Fc片段(FCER1G)、纤维蛋白原样蛋白2(FGL2)、组织相容性抗原(HLA-DRA)、整合素β2亚基(ITGB2)、酪氨酸激酶结合蛋白(TYROBP)。生存分析发现C1QC与骨肉瘤患者生存呈明显负相关。临床样本证实C1QC与肿瘤Enneking分期、转移显著相关( χ2=4.288和9.809, P<0.05),与患者生存时间呈明显负相关( χ2=5.175, P<0.05)。 结论:生物信息学分析是有效的筛查方法,C1QC是骨肉瘤预后相关因子。
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编辑人员丨5天前
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ATP6V1B2基因突变所致疾病及发病机制
编辑人员丨5天前
ATP6V1B2(ATPase H + transporting V1 subunit B2)基因突变可导致显性遗传性耳聋-甲发育不全(dominant deafness and onychodystrophy,DDOD,MIM124480)综合征和Zimmermann-Laband综合征2(ZLS2,MIM616455)。DDOD综合征的患者临床表现为先天性感音神经性耳聋和甲发育不良,最新研究表明患者还存在学习和认知问题。ZLS2综合征的患者表现为牙龈异常增生、甲发育不良和智力障碍,但是若突变位点偏向ATP6V1B2蛋白中心,则突出表现为智力障碍和癫痫,而没有明显的牙龈异常增生和甲发育不良。ATP6V1B2基因编码液泡型质子转运ATPase蛋白(vacuolar proton transporter ATPase,V-ATPase)V1结构域的中B2亚基,V-ATPase对维持细胞内和细胞器正常的酸碱环境至关重要。目前认为该基因的致病性变异所导致的V-ATPase功能障碍和溶酶体酸化异常可能是DDOD综合征和ZLS2发病的分子基础。对Atp6v1b2 c.1516C>T基因敲入小鼠的深入研究发现:Atp6v1b2 Arg506X / Arg506X的小鼠存在明显认知障碍,海马CA1区受损可能是其病理基础。B2亚基和E亚基的相互作用减弱可能是V-ATPase功能障碍的潜在分子机制。深入分析比较ATP6V1B2基因致病突变所导致的疾病表型,并对致病突变进行功能研究有着重要的意义。
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编辑人员丨5天前
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苹果TIPs亚家族成员鉴定与干旱胁迫响应分析
编辑人员丨1个月前
[目的]鉴定并分析苹果液泡膜内在蛋白(TIP)亚家族成员,探究该亚家族成员在苹果干旱胁迫下的表达模式,为研究苹果抗旱性基因资源挖掘和利用提供参考.[方法]通过生物信息学方法对苹果MdTIPs全基因组进行鉴定,分析其家族成员的理化性质、基因结构、保守基序、顺式作用元件、系统进化树等,并结合实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析其在干旱胁迫下不同器官中的表达模式.[结果]在苹果基因组中,共检索到13个MdTIP基因,大部分成员亚细胞定位预测在质膜上,分布于10条染色体上,且每条染色体定位有1~3个成员;该基因家族成员的启动子区域包含多种响应激素和逆境胁迫的应答元件;qRT-PCR显示,MdTIPs亚家族成员在根中除MdTIP1;1外其余均受上调表达,且MdTIP1;3和MdTIP1;4与对照相比,分别上调表达了 5.27倍和5.69倍,表明其是参与调控干旱胁迫的关键基因.[结论]鉴定并提供了 MdTIPs亚家族成员信息,10个MdTIPs亚家族成员在根、茎、叶中差异表达,12个亚家族成员在根中高表达.
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编辑人员丨1个月前
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植物类黄酮转运与积累机制的研究进展
编辑人员丨2024/7/20
类黄酮是植物次生代谢过程中产生的多酚类物质,在植物中广泛存在且功能多样.类黄酮的生物合成发生在内质网的细胞质侧,但最终积累在液泡腔内.因此,需要高效的类黄酮转运和积累系统将其从内质网转移至液泡内.几十年来,关于植物类黄酮转运有诸多研究.目前的研究结果表明,植物体内存在3种类黄酮转运机制,包括谷胱甘肽转移酶介导的转运及膜转运蛋白和囊泡介导的转运.该文综述了这3种转运机制以及近年来植物类黄酮转运研究进展,分析总结了3种不同但具有非排它性机制在功能上的协同作用.虽然类黄酮生物合成途径在许多物种中得到很好的表征,但是关于其转运研究仍相对缺乏.类黄酮修饰与转运的关系、转运蛋白对底物的特异性和偏好性及类黄酮转运的转录调控仍需深入探索,以更好地解析类黄酮在植物细胞中的转运和积累机制.
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编辑人员丨2024/7/20
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'曼赛龙柚'种子不同发育期高温耐性研究
编辑人员丨2024/7/6
全球变暖导致极端高温频发,植物种子不可避免地置身于高温胁迫环境之中.为探究种子高温耐性的生理基础,该文以中间型种子'曼赛龙柚'(Citrus maxima'Mansailong')为实验材料,对不同发育阶段的种子进行高温处理,并同步检测各个发育时期种子的形态变化、可溶性蛋白和热稳定蛋白含量以及细胞超显微结构的变化.结果表明:(1)在花后23周到49周的整个发育过程中,种子含水量明显降低,鲜重显著增加,干重与鲜重的百分比也有明显的提高,这些指标均是在花后31周前后快速变化,到花后41周趋于稳定.(2)种子在花后29周获得完全的成苗能力和初步的高温耐性,此后高温耐性逐渐增加,并在花后37~49周之间快速提高.与种子高温耐性的变化相似,种子中可溶性蛋白和热稳定蛋白含量在花后23~49周均呈连续升高趋势,相关性分析表明在整个发育过程中这两者的积累与种子的高温耐性呈显著正相关.(3)超显微结构观察发现,随着种子的发育,线粒体逐渐减少,胚轴细胞体积逐渐变小,细胞中脂质体逐渐增多并且排列趋于规则,同时液泡由小变大且后期的液泡中充斥着黑色絮状物.综上所述,'曼赛龙柚'种子在花后41周达到生理成熟,没有明显的成熟脱水过程;其高温耐性是在发育过程中获得并逐渐提高,直到种子发育的后期;种子中可溶性蛋白和热稳定蛋白含量的增加及细胞超显微结构的变化对种子高温耐性的发育具有重要贡献.
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编辑人员丨2024/7/6
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葡萄TST基因家族鉴定及表达分析
编辑人员丨2024/5/18
[目的]液泡膜糖转运蛋白(TST或者TMT)是植物发育过程中发挥重要作用的一种糖转运蛋白.研究旨为探究TST基因家族在葡萄生长发育中的作用,并进一步为阐明TST基因功能提供坚实的基础.[方法]通过同源分析法从葡萄基因组中鉴定出13个TST基因,对基因的结构和编码蛋白质进行生物信息学分析;用qRT-PCR技术分析'鄞红'葡萄发育过程中不同组织的TST表达水平,并对不同时期葡萄果肉中可溶性糖含量进行相关性分析.[结果]TST基因家族分布在6条染色体上,存在3对片段重复和3对串联重复基因;根据系统发育将其分为3个亚家族,各亚家族成员结构相似;TST基因含有大量与激素、光和胁迫响应相关的顺式作用元件;TST家族蛋白质由a-螺旋和无规则卷曲组成,各亚族蛋白模型相似;VvTST在不同组织中均有表达,并存在时空表达特异性;相关性分析发现,葡萄果肉中 4 个 VvTST 基因(VIT_18s0001g12560、VIT_18s0122g00850、VIT_04s0023g01860 和VIT_03s0038g03940)的表达水平与其中可溶性糖的积累呈现相似变化趋势.[结论]VvTST可能对葡萄果肉中可溶性糖积累起到至关重要的作用.
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编辑人员丨2024/5/18
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不同铝浓度处理下马尾松体内铝的分配特征
编辑人员丨2024/5/11
有毒金属离子在植物组织中的分布和亚细胞水平的定位与植物对金属离子的耐受性密切相关.为探究铝进入马尾松体内后在亚细胞水平下的分布情况,该研究分别设置0、0.5、1.0、2.0 mmol·L-14个铝浓度,通过盆栽试验研究不同铝浓度下马尾松的生长状况及亚细胞水平下铝的分配特征.结果表明:(1)低浓度铝(0.5 mmol·L-1)显著促进马尾松的生长(P<0.05),随铝浓度的升高(≥1.0 mmol·L-1),马尾松根系生长和根尖细胞活力均受到抑制.(2)相较于茎叶,进入马尾松体内的铝主要沉积在根系中(P<0.05),但随着铝浓度的增加,茎叶中的铝含量也开始增加.(3)亚细胞水平下,不同铝浓度影响了铝在细胞壁和液泡中的分配比例.当铝浓度为1.0 mmol·L-1及以下时,铝在根系和茎叶的细胞壁和液泡中的比例均较高,两者间铝含量差异不显著;而高铝浓度下(2.0 mmol·L-1),铝则主要沉积在细胞壁上,根系、茎叶的细胞壁铝含量分别占比55%和70%.相较而言,各铝浓度处理下细胞器和细胞质中的铝含量均维持在较低水平,这降低了铝对细胞功能的影响.综上认为,马尾松可以通过调整体内铝的分配来适应铝胁迫,这为后续从细胞及分子层面进一步阐明马尾松对铝环境的适应机制奠定了理论基础.
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编辑人员丨2024/5/11
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血清circVMA21水平对脓毒症患者预后评估的价值
编辑人员丨2024/4/27
目的 探讨血清环状RNA液泡ATP酶组装因子(circVMA21)水平对脓毒症患者预后评估的价值.方法 将2020年7月至2022年12月该院收治的200例脓毒症患者纳入研究作为脓毒症组.对患者进行随访,根据脓毒症患者治疗后28 d是否存活将患者分为预后良好组(128例)和预后不良组(72例).另外,选取200例同期本院收治的普通感染患者作为对照组.收集所有纳入研究者的临床资料,用实时荧光定量PCR(qPCR)检测血清circVMA21水平,Spearman法分析circVMA21与序贯性器官衰竭评估(SOFA)评分、急性生理学及慢性健康状况评分系统Ⅱ(APACHEⅡ)评分的相关性.采用受试者工作特征(ROC)曲线分析circV-MA21对脓毒症患者预后不良的预测价值,Kaplan-Meier法分析circVMA21与脓毒症患者生存预后的关系,Logistic回归分析脓毒症患者预后的影响因素.结果 与对照组比较,脓毒症组血清circVMA21水平降低,差异有统计学意义(P<0.05).脓毒症患者血清circVMA21水平与SOFA评分、APACHEⅡ评分均呈负相关(r=-0.553、-0.543,P<0.05).与预后良好组比较,预后不良组circVMA21水平降低,差异有统计学意义(P<0.05).预后不良组肌酸激酶同工酶(CK-MB)、心肌肌钙蛋白I(cTnI)、超敏C-反应蛋白(hs-CRP)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞计数(WBC)、中性粒细胞计数(NEU)、SOFA评分、APACHEⅡ评分高于预后良好组,差异有统计学意义(P<0.05).ROC曲线分析显示,circVMA21的曲线下面积(AUC)为0.848(95%CI:0.793~0.902),截断值为0.55,灵敏度为83.30%,特异度为78.90%,约登指数为0.622.Kaplan-Meier法分析显示,circVMA21>0.55与circVMA21≤0.55患者生存预后比较,差异有统计学意义(Log-rank x2=5.138,P=0.023).多因素Logistic回归结果显示,APACHEⅡ评分是脓毒症患者预后不良的危险因素,cir-cVMA21为预后良好的保护因素(P<0.05).结论 脓毒症患者血清circVMA21水平降低,血清circVMA21是脓毒症患者预后良好的保护因素,可作为评估脓毒症患者预后的生物标志物.
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编辑人员丨2024/4/27
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酿酒酵母细胞器区室化合成化学品的研究进展
编辑人员丨2024/3/30
公认食品安全的酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)是合成生物学中被广泛研究的底盘细胞,常作为生产高值或大宗化学品的微生物细胞工厂.近年来,通过各种代谢工程改造策略,已有大量化学品的合成途径在酿酒酵母中建立并优化,且部分化学品具备了产业化价值.作为真核生物,酿酒酵母具有完整的细胞内膜系统及其组成的复杂细胞器区室,而这些细胞器区室往往含有某些化学品合成所必需的较高浓度前体底物(如线粒体中的乙酰辅酶A),或更加充足的酶、辅因子、能量等,可为目标产物的生物合成提供更适宜的物理、化学环境,但同时不同细胞器的结构特点有时也成为特定化合物合成的障碍.为此,研究人员在深入分析不同细胞器自身特点的基础上,结合目标化学品合成途径与细胞器之间的适配度,对细胞器开展了大量针对性改造工作以提高产物合成效率.本文详细综述了酿酒酵母中线粒体、过氧化物酶体、高尔基体、内质网、脂滴和液泡等细胞器的途径改造及优化策略,以及利用细胞器区室化合成化学品的研究进展,并对目前存在的困难和挑战以及未来研究方向进行了总结与展望.
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编辑人员丨2024/3/30
