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溶质载体家族41成员A3在胃癌组织的表达及其对胃癌细胞侵袭转移的影响
编辑人员丨4天前
目的:探究溶质载体家族41成员A3(SLC41A3)在胃癌(GC)组织的表达、临床预后价值以及其对肿瘤细胞侵袭和迁移能力的影响。方法:利用在线生物信息学数据库Oncomine、UALCAN和Kaplan-Meier Plotter探究SLC41A3 mRNA在GC组织中的表达及其与患者预后的关系;然后,分别利用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)和免疫组织化学(IHC)检测96例临床GC组织中SLC41A3 mRNA和蛋白的表达水平,并进一步分析SLC41A3蛋白表达水平与患者临床病理学特征和预后的相关性;最后,检测SLC41A3 mRNA在GC细胞中的表达水平及其对肿瘤细胞侵袭和迁移能力的影响。计量资料采用 t检验,计数资料采用 χ2检验,生存分析采用Log-rank检验和Cox单因素和多因素回归分析。 结果:Oncomine数据库分析显示SLC41A3 mRNA在GC组织中的表达量显著高于正常胃组织(DErrico: t=4.147, P<0.01;Cho: t=2.420, P<0.05;Chen: t=1.687, P<0.05)。UALCAN分析结果分析,SLC41A3 mRNA在GC中的表达与肿瘤分级、N分期和TNM分期相关(均 P<0.05)。Kaplan-Meier Plotter数据库显示,SLC41A3 mRNA高表达组的GC患者的总生存期(OS)明显短于低表达组[219175_s_at:风险比( HR)=1.86(1.53~2.27),Log-rank P<0.01;224931_at: HR=1.67(1.33~2.10),Log-rank P<0.01]。RT-qPCR和IHC结果证实,GC临床样本中SLC41A3 mRNA和蛋白的表达水平明显高于对应的癌旁组[RT-qPCR:3.768±0.196比1.397±0.089, t=11.000, P<0.01;IHC:(7.150±0.137)分比(3.910±0.083)分, t=20.210, P<0.01],且SLC41A3蛋白在GC中的表达与组织学分级( χ2=7.055, P<0.01)、T分期( χ2=4.018, P<0.05)、N分期( χ2=5.888, P<0.05)、TNM分期( χ2=8.114, P<0.01)、脉管侵犯( χ2=4.444, P<0.05)、神经侵犯( χ2=6.160, P<0.05)明显相关。进一步,Kaplan-Meier分析结果表明,与SLC41A3蛋白低表达比较,高表达组GC患者5年生存率明显低于低表达组(31.7%比61.1%,Log-rank P<0.01)。Cox多因素回归分析结果表明,SLC41A3蛋白高表达是影响GC患者OS的独立危险因素[ HR=1.984,95%可信区间( CI):1.102~3.436, P<0.05]。体外细胞实验结果表明,SLC41A3在GC细胞中的表达明显高于正常胃上皮细胞,过表达SLC41A3显著增强胃癌细胞的侵袭和迁移能力。 结论:SLC41A3高表达与GC的恶性进展和患者的不良预后密切相关。
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编辑人员丨4天前
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基于网络药理学及分子对接和基因芯片验证右美托咪定治疗脑缺血再灌注损伤的作用机制
编辑人员丨2周前
目的 基于生物信息学分析右美托咪定治疗脑缺血再灌注损伤的作用机制,结合分子对接和基因表达综合库(GEO)芯片验证明确核心基因.方法 采用PubChem和GeneCards筛选右美托咪定和脑缺血再灌注损伤交集靶点,建立蛋白相互作用(PPI)网络确定Hub基因,进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,最终采用分子对接和GEO芯片数据验证Hub基因.结果 右美托咪定和脑缺血再灌注损伤有 43 个交集靶点,PPI筛选得到41 个节点和 103条边的拓扑网络,Hub基因为5-羟色胺受体 2A(HTR2A)、阿片受体mu 1(OPRM1)、多巴胺受体D2(DRD2)、溶质载体家族 6 成员4(SLC6A4)、谷氨酸代谢型受体 5(GRM5)、细胞色素P450 家族2 亚家族C成员 19(CYP2C19)、溶质载体家族 6 成员3(SLC6A3)、核受体亚家族 3C组成员1(NR3C1)、糖原合成酶激酶 3β(GSK3β).GO和KEGG分析显示右美托咪定干预脑缺血再灌注损伤涉及254种生物学功能和58条信号通路.分子对接验证Hub基因均具有良好的亲和力,GSE23160芯片验证预测DRD2、GSK3β和NR3C1 具有差异性(P<0.05).结论 基于网络药理学及分子对接和基因芯片验证了右美托咪定通过多靶点、多生物学功能、多通路干预脑缺血再灌注损伤,并验证DRD2、GSK3β、NR3C1可能是核心基因,预测关键诊断基因和潜在治疗基因,为进一步研究奠定坚实基础.
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编辑人员丨2周前
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河北地区汉族心脑血管病患者ApoE和SLCO1B1基因多态性分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 分析河北地区汉族人群中心脑血管病患者ApoE和SLCO1B1基因多态性分布情况.方法 以2018年6月至2019年10月于河北医科大学第一医院神经内科和心内科就诊的4193例心脑血管病患者为研究对象,利用聚合酶链反应(PCR)-荧光探针技术定性检测其外周全血基因组中ApoE和SLCO1B1基因多态性分布情况,分析基因多态性分布特点,比较不同性别之间基因型分布差异.结果 4193例河北地区汉族心脑血管病患者的ApoE以及SLCO1B1基因多态性位点突变频率观察值符合Hardy-Weinberg遗传平衡;男女之间ApoE基因单核苷酸多态性位点388T>C、526C>T,以及SLCO1B1基因单核苷酸多态性位点388A>G、521T>C分布差异无统计学意义(P>0.05).在ApoE基因的6种表型中,ε3/ε3所占比例最大,为68.57%(2875/4193);其他表型ε3/e4、e2/ε3、ε2/ε4、e4/ε4、ε2/ε2占比依次为15.48%(649/4193)、12.81%(537/4193)、1.69%(71/4193)、0.98%(41/4193)和0.48%(20/4193);不同性别之间ApoE基因表型分布差异无统计学意义(P=0.223).SLCO1B1基因的7种表型中,*1b/*1b、*1a/*1b的占比较大,分别为39.57%(1659/4193)和31.05%(1302/4193),其他表型*1b/*15、*1a/*1a、*1a/*15、*15/*15、*1a/*5占比依次为14.31%(600/4193)、7.20%(302/4193)、6.42%(269/4193)、1.43%(60/4193)和0.02%(1/4193);不同性别之间SLCO1B1基因表型分布差异无统计学意义(P=0.078).结论 河北地区汉族人群中心脑血管病患者ApoE和SLCO1B1基因多态性分布不均匀,且ApoE和SLCO1B1基因多态性分布与性别无关.
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编辑人员丨2023/8/5
