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柴达木盆地昆特依盐湖可培养嗜盐细菌多样性研究
编辑人员丨1个月前
[目的]探究不同富集时间、培养盐度、稀释梯度、培养基等对氯化物型昆特依高盐盐湖可培养嗜盐细菌多样性的影响,确定嗜盐细菌的最佳分离培养条件,挖掘更多的环境嗜盐细菌资源.[方法]从昆特依盐湖中采集水泥混合样本,选取 7 种培养基和 10%、18%NaCl两个盐度,采用富集培养法、平板稀释涂布法和平板分区划线法分离嗜盐菌;通过 16S rRNA基因测序与BLAST序列比对确定菌株系统分类学地位.同时采用免培养Illumina MiSeq高通量测序技术分析昆特依盐湖细菌群落结构多样性特征.[结果]免培养昆特依盐湖样本中共鉴定到细菌 39 门 64 纲 101 目 219 科 703 属,其中假单胞菌门(Pseudomonadota)、厚壁菌门(Bacillota)、拟杆菌门(Bacteroidota)和放线菌门(Actinomycetota)为主要的优势菌门.根据菌落的大小、形态、颜色、光泽度、透明度、质地、隆起状态和边缘特征等,共分离出 436 株嗜盐菌,隶属于 3 门 3 纲 6 目 9 科 28 属 77 种,其中 16 株可能为潜在新种.3 门为厚壁菌门(Bacillota)、假单胞菌门(Pseudomonadota)和放线菌门(Actinomycetota),且均为免培养测序结果中的优势菌门.在属水平上,芽孢杆菌属(Bacillus)、盐单胞菌属(Halomonas)、喜盐芽孢杆菌属(Halobacillus)、枝芽孢菌属(Virgibacillus)和卤水杆菌属(Salicola)为优势菌属.肿块芽孢杆菌属(Tuberibacillus)、越南蔷薇菌属(Rossellomorea)和谷氨酸杆菌属(Glutamicibacter)是首次从盐湖中分离得到.18%NaCl分离得到的菌株数量明显少于 10%NaCl,且多样性较低,芽孢乳杆菌科(Sporolactobacillaceae)是该条件下分出的特有菌科.7 种培养基中,1/2 RCA培养基分离效果最好.最佳富集培养时间为 0、7 和 60 d,最佳样品稀释梯度为 10-2 和 10-3.[结论]从昆特依盐湖中共分离出嗜盐细菌 3 门 3 纲 6 目 9 科 28 属 77 种.应用多种培养基,设置不同盐度、富集培养时间和稀释梯度等可显著提升可培养嗜盐菌的多样性.
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编辑人员丨1个月前
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人乳头瘤病毒16/18感染与乳腺癌患者TLR4、STAT3、MCM7阳性率的关联
编辑人员丨2024/7/20
目的 探讨人乳头瘤病毒16/18(HPV16/18)感染与乳腺癌患者Toll样受体4(TLR4)、信号转导因素和转录激活因子3(STAT3)、微小染色体维持蛋白7(MCM7)阳性率的关联.方法 回顾性收集2021年12月-2023年7月运城市中心医院临猗分院和山西医科大学第一医院盐湖分院收治的乳腺癌患者124例作为研究组,根据HPV16/18感染情况分为感染组(59例)和未感染组(65例),另选取同期医院收治的127例良性乳腺疾病切除病变周围正常乳腺组织患者作为对照组;分析HPV16/18感染与患者临床病理特征的关系;采用免疫组织化学法检测组织TLR4、STAT3、MCM7阳性表达情况;比较两组组织TLR4、STAT3、MCM7阳性表达情况;比较两组组织TLR4、STAT3、MCM7阳性表达情况;采用Spearman法分析HPV16/18感染与乳腺癌患者TLR4、STAT3、MCM7阳性表达的相关性.结果 乳腺癌患者中HPV16/18感染与肿瘤分期、淋巴结转移有关(P<0.05);研究组组织TLR4、STAT3、MCM7阳性表达率均高于对照组(P<0.05);感染组组织TLR4、STAT3、MCM7阳性表达率均高于未感染组(P<0.05);Spearman相关性分析结果显示,TLR4、STAT3、MCM7阳性表达与乳腺癌患者HPV16/18感染呈正相关(r=0.703,0.739,0.752,P均<0.05).结论 乳腺癌患者中HPV16/18感染与肿瘤分期、淋巴结转移有关,且感染后TLR4、STAT3、MCM7阳性表达率升高,TLR4、STAT3、MCM7阳性表达与乳腺癌患者HPV16/18感染密切相关,且呈正相关.
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编辑人员丨2024/7/20
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西藏扎布耶盐碱湖细菌的多样性与分离菌株的生长特性
编辑人员丨2024/4/6
[背景]扎布耶湖位于青藏高原地区,是以水体中富含高浓度CO32-、HCO3-和Na+为显著特性的盐碱湖,因其地理位置高寒、高海拔,人迹罕至,涉及该盐湖微生物的研究相对较少.[目的]系统探究湖水中细菌多样性和菌种资源等,发掘可利用的潜在菌种.[方法]采用Illumina测序 16S rRNA基因V3-V4 区分析扎布耶湖细菌的群落结构组成、物种多样性特征;采用纯培养筛选分离可培养细菌,明确分离菌株分类学地位、生长特性及产酸能力,同时测定分离菌株四氢嘧啶(ectoine)、吲哚乙酸(3-indoleacetic acid,IAA)和胞外聚合物(extracellular polymeric substances,EPS)的积聚量.[结果]Illumina测序明确分类地位的细菌有 21 门 44 纲 86 目 583 属,其中优势门类群是变形菌门(Proteobacteria,25.11%-67.60%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,4.84%-35.02%)和厚壁菌门(Firmicutes,1.24%-11.01%),优势属类群是克雷伯氏菌属(Klebsiella,0.01%-9.53%)、盐单胞菌属(Halomonas,0.54%-8.75%)、芽单胞菌属(Gemmatimonas,2.39%-6.00%)和腈基降解菌属(Nitriliruptor,1.27%-6.26%).纯培养法筛选获得嗜盐碱菌 38 株,其中芽孢杆菌属(Bacillus)23 株(60.53%)和盐单胞菌属(Halomonas)10 株(26.32%),菌株均具有耐盐碱和产酸能力(19.80%-29.68%).大多数菌株能积聚四氢嘧啶、IAA和EPS,产量范围分别为 1.36-175.59、0.27-8.69和 0.02-0.22 g/g.[结论]扎布耶湖细菌群落结构与其他地区盐碱湖相似,但存在大量未明确分类学地位的细菌,分离菌株多具有耐盐碱及产酸特性.此外,还发现 4 株高效生产四氢嘧啶、3 株生产吲哚乙酸和 3 株生产胞外聚合物的潜力菌株,为扎布耶盐湖微生物资源的开发利用奠定了基础.
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编辑人员丨2024/4/6
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理想CPR(iCPR):我们的差距与希望
编辑人员丨2023/8/6
心肺复苏(cardiopulmonary resuscitation,CPR)确立近60年来,相关的医学研究取得了很多进展,尤其近20年基于复苏科学领域的最新证据而达成的美国心脏协会“CPR和心血管急救指南”(即国际CPR指南)每隔5年更新1次,极大地促进了全球CPR的培训和普及.然而,一项对1951至2008年间数据的Meta分析显示院外心脏骤停(out-of-hospital cardiac arrest,OHCA)患者的总体出院存活率仍然很低,2008年前的30年内几乎没明显变化(7.6%)[1].北京市2012年OHCA患者神经功能良好的出院存活率仅1%(同期美国为8.3%) [2-3].但美国一些地方却能成倍增长(如盐湖城2008至2014年间为16%[4],明尼苏达州2005至2009年间为19%[5]).明尼苏达大学的Segal等[6]认为,这些增长主要归因于基于最新国际CPR指南的现有措施“集束化”救治,为此他在最近的Resuscitation杂志上提出了“理想CPR”(ideal CPR,iCPR)的概念.
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编辑人员丨2023/8/6
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2015年青海省某高原盐湖企业制取高纯优质碳酸锂职业病危害调查
编辑人员丨2023/8/6
目的 了解2015年青海省某高原盐湖企业高纯优质碳酸锂生产装置职业病危害因素分布情况,提出可行性防护对策,为同类企业职业病防治提供依据.方法 依据《工业企业设计卫生标准》等职业卫生标准和规范,采用职业卫生现场调查等方法对该生产工艺进行调查与评价.结果 工作场所空气中粉尘和毒物时间加权平均浓度(TWA)符合职业接触限值;2个检测点碳酸锂粉尘和矽尘超限倍数超标,合格率为71.4%;各岗位工种接触噪声40 h等效声级均小于85 dB(A).结论 该企业职业病危害因素主要为碳酸锂粉尘和矽尘,需加强防护设施及酸碱输送管道的维护检修,避免跑、冒、滴、漏现象发生,确保防护有效.
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编辑人员丨2023/8/6
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运城市盐湖区2012-2016年肺结核病患者痰涂片结果分析
编辑人员丨2023/8/6
结核病是由结核分枝杆菌引起, 主要经呼吸道传播的慢性传染病,严重危害着人类健康,是我国需要控制的重大传染病之一.在结核病控制工作中,抗酸杆菌痰涂片镜检对于发现传染源,确定诊断、制定化疗方案、考核疗效、防治效果具有重要意义[1]. 为了解和掌握盐湖区结核病患者痰检结果情况,为预防和控制结核病传播提供参考依据,对盐湖区2012—2016年结核病抗酸杆菌痰涂片镜检结果分析报告如下.
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编辑人员丨2023/8/6
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叠前宽角度反演方法在周返地区盐湖盆地储层预测中的应用
编辑人员丨2023/8/6
周返地区盐湖盆地发育复杂的盐韵律地层,储层密度可以对该区砂岩储层进行识别,但该区砂岩储层与非储层之间密度差异小,传统基于Aki-Richards近似公式的叠前密度反演结果精度低,无法满足对该区储层预测的要求.本文将精确Zoeppritz方程直接代入广义线性反演误差泛函,推导新的宽角度叠前反演公式,以克服近似公式对大角度叠前地震信号无法正确利用的缺点,进而提高反演结果的精度.对合成地震数据和工区实际数据的反演结果表明,该方法对密度反演结果的精度明显优于近似公式,满足周返地区盐湖盆地岩性油藏的高精度预测.
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编辑人员丨2023/8/6
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新疆巴里坤、七角井和台特玛盐湖沉积物中免培养放线菌群落组成与离子成分分析
编辑人员丨2023/8/6
[背景]新型病原微生物层出不穷,放线菌作为最重要的抗生素生产菌仍受制于纯培养困难和菌种资源不足,而对于盐湖沉积物中的丰富放线菌资源却鲜有报道.[目的]探索巴里坤、七角井和台特玛盐湖沉积物放线菌群落结构及其多样性,分析盐湖沉积物中化学离子成分对放线菌群落的影响.[方法]每个盐湖采集5份样品并混合,使用SDS-CTAB抽提法提取总DNA,使用放线菌特异性引物进行PCR扩增并构建16S rRNA基因文库,每个样品随机挑选220个克隆子,经过Hae Ⅲ酶切筛选后对阳性克隆子进行测序分析;对每个样品的8种主要化学离子进行检测,并将沉积物化学离子成分与放线菌群落进行关联性分析.[结果]获得的381个克隆序列属于143个操作分类单元(Operational taxonomic Unit,OTU),聚类结果显示从3个盐湖中共探测到37个放线菌属(台特玛盐湖:24;巴里坤盐湖:16;七角井盐湖:14).3个盐湖共有的放线菌属为Aciditerrimonas、Aquihabitans、Demequina、Dietzia、Ilumatobacter和Amycolatopsis.从放线菌群落结构上看,台特玛盐湖与其他两湖差异性很大,巴里坤盐湖与七角井盐湖群落相似性更高,巴里坤、七角井和台特玛盐湖未知放线菌的组成分别为47.59%、53.07%和51.53%.利用RDA (Redundancy analysis)分析盐湖沉积物化学离子与放线菌群落的关联性,结果显示与Na+、Cl-和K+相比,Mg2+、Ca2+、SO42-、HCO3-和CO32-与盐湖放线菌类群的相关关系要更加紧密.[结论]3个盐湖中具有丰富的放线菌多样性,包含大量的未知放线菌.盐湖沉积物不同的化学离子成分影响着各自独特的放线菌群落,可为开发新的盐湖放线菌资源提供依据.
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编辑人员丨2023/8/6
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硝尔库勒湖可培养放线菌多样性及其功能酶和抗细菌活性
编辑人员丨2023/8/6
[目的]认识和了解硝尔库勒湖可培养放线菌的多样性、功能酶和抗细菌活性特点,为今后的开发和利用奠定基础.[方法]应用可培养技术和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析硝尔库勒盐湖沉积物中放线菌的多样性.常规方法检测样品成分因子,并筛选了嗜盐放线菌的蛋白酶、淀粉酶和酯酶活性;抑菌圈法检测放线菌新种的抗细菌活性.[结果]分离获得了51个OTUs,分属于24个不同的属,其中15个OTUs代表了放线菌新种;链霉菌属是优势菌属,占全部分离菌株数量的16.25%.硝尔库勒湖放线菌类群数量一定程度上受样品成分因子的协同影响.代表新种的菌株展示了良好的功能酶活性和抗细菌活性,其中代表链霉菌新种的菌株XHU5011不仅具有多种酶活性,而且具有强大的抗金黄葡萄球菌、耻垢分枝杆菌和荧光假单胞菌的能力,具有很好的开发潜能.[结论]硝尔库勒盐湖中存在丰富的可培养放线菌多样性,潜藏着大量的放线菌新资源,并且具有很好的功能酶和天然产物挖掘潜力.
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编辑人员丨2023/8/6
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基于高通量测序的花马盐湖原核微生物及其耐盐基因
编辑人员丨2023/8/6
[目的]揭示陕北花马盐湖沉积物原核微生物群落组成,并分析其潜在的耐盐功能基因.[方法]构建盐湖沉积物宏基因组16S rRNA文库和fosmid文库,利用Illumina HiSeq高通量测序及生物信息技术分析细菌古菌群落组成和耐盐菌株(5-5)外源宏基因组的潜在耐盐基因.[结果]获得1 8978条有效的16S rRNA序列,共5221个OTUs,包括23个门,155个属,其中广古菌门(Euryarchaeota)和变形菌门(Proteobacteria)为优势菌门,盐杆状菌属(Halorhabdus)、盐红菌属(Halorubrum)及假单胞菌属(Pseudomonas)等16个属为优势属,以及嗜盐单胞菌属(Halomonas)、冷弯菌属(Psychroflexus)及不动细菌属(Acinetobacter)等139个属为非优势属.从4126个fosmid文库菌株中筛选出37株耐盐菌株,其中菌株5-5、2E4和2F4对不同浓度的NaC1、CuSO4、ZnSO4及CdSO4具有耐受性,从5-5的外源宏基因组序列中获得61个Unigene,其中12个Unigene的同源基因编码的蛋白质如无机焦磷酸酶、转座酶、亚碲酸钾抗性蛋白及钙调蛋白等广泛参与其他生物的耐盐逆境.[结论]盐湖沉积物中蕴藏着丰富多样的细菌古菌类群以及潜在耐盐功能基因资源.
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编辑人员丨2023/8/6