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2016年淮南市外环境H7N9禽流感病毒基因组特征分析
编辑人员丨3天前
目的:分析淮南市2016年度外环境标本中H7N9禽流感病毒基因组特征。方法:采集活禽市场禽类粪便、笼具、台面或砧板、脱毛机、禽类饮水、污水等标本,选取H7N9、H9亚型PCR检测阳性标本( Ct值≤30),鸡胚分离培养后提取RNA,扩增8个基因节段进行基因序列测定、分子特征与进化分析。 结果:2016年150份淮南市外环境标本检出H7N9亚型46份、H9亚型71份、H5亚型38份;2份H7N9亚型分离成功。基因进化分析显示,淮南市2株H7N9禽流感毒株血凝素(hemagglutinin, HA)和神经氨酸酶(neuraminidase, NA)基因均处于长三角分支内,其余6个内部基因无明显地域分布聚类;HA氨基酸受体位点出现G186V、Q226L位点变异,NA茎区缺失了"QISNT"序列,R294K、E119V耐药位点没有发生突变;聚合酶发生PA基因I550L,PB1基因I368V,PB2基因I504V突变;NS1基因出现增强致病力的位点N205S、P42S改变;耐药相关位点出现M1基因N30D、T215A,M2基因S31N突变。结论:2016年淮南市活禽市场禽流感病毒高度流行,H7N9亚型感染人类的能力有所增强,M2离子通道抑制剂耐药,NA抑制剂仍为敏感有效药物。
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编辑人员丨3天前
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南平市禽类相关环境中禽流感病毒分布调查
编辑人员丨3天前
目的:为了解福建省禽类养殖业发达地区环境禽流感病毒的分布特征,对2021年12月至2023年12月地处山区的南平市禽类相关环境禽流感病毒分布开展调查。方法:采集2021年12月至2023年12月南平市禽类相关环境样本,运用实时荧光定量RT-PCR法进行甲型流感病毒核酸检测,对阳性样本进行H3、H5、H7、H9和H10亚型鉴定。应用SPSS 26.0软件分析不同时间、禽类相关场所、样本类型禽流感病毒的分布特征和差异性。结果:2021年12月至2023年12月,南平市禽类相关环境样本甲型流感病毒阳性率为49.16%(1 435/2 919),其中H3、H5、H9、H10亚型阳性率分别为0.72%(21/2 919)、9.42%(275/2 919)、33.20%(969/2 919)、0.89%(26/2 919),H7亚型未检出,混合型(含一种以上亚型)阳性率6.51%(190/2 919),未分型(甲型流感病毒检测阳性但H3/5/7/9/10均为阴性)阳性率11.58%(338/2 919)。甲型流感病毒阳性率高峰主要出现在秋冬季(9月至次年2月),活禽市场和屠宰场的甲型流感病毒、H9亚型、混合型以及未分型阳性率显著高于养殖场,禽饮用水、粪便样本的甲型流感病毒阳性率较高,阳性样本以H9亚型居多。结论:南平市禽类相关环境中禽流感病毒阳性率以秋冬季为高;病毒在禽饮用水和粪便样本中的阳性率更高,并且在活禽市场与屠宰场等多种禽类聚集的场所呈现更高的多样性。
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编辑人员丨3天前
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2017—2021年福建省外环境禽流感病毒监测
编辑人员丨3天前
目的:分析2017—2021年福建省外环境禽流感病毒流行特点,为禽流感防控、预测工作提供参考。方法:在福建省6地市监测点的4类禽类相关不同场所进行6类不同类型标本的采样,采用荧光定量PCR法对环境标本进行A型、H5、H7和H9亚型核酸检测,并采用流行病学方法对检测结果进行分析。结果:2017—2021年共采集6个监测点标本4 214份,其中A型禽流感病毒阳性率为41.53%(1 750份),H5、H7和H9亚型阳性率分别为2.33%(98份)、1.16%(49份)和23.16%(976份),H5+H7亚型阳性率为0.05%(2份),H5+H9亚型阳性率为1.83%(77份),H7+H9亚型阳性率为0.83%(35份),H5+H7+H9亚型阳性率为0.09%(4份),A型阳性未分型的阳性率为12.08%(509份)。不同检测场所和不同类型标本A型阳性率的差异具有统计学意义( χ2=517.57, P<0.001; χ2=51.58, P<0.001):城乡活禽市场的禽流感病毒阳性率最高(49.72%);不同类型标本中笼具表面擦拭标本(48.09%)、清洗禽类的污水(47.34%)和宰杀或摆放禽肉案板表面(45.66%)的阳性率较高。不同地区监测点的A型阳性率差异具有统计学意义( χ2=458.34, P<0.001):A型阳性率最高和最低的地市分别是三明市(56.00%)和漳州市(3.34%)。在时间分布方面,冬春季(11月至次年2月)和夏季(6~8月)的阳性率较高。 结论:福建省禽流感病毒总体阳性率较高,以H9亚型为主,应重点加强冬春季和夏季禽流感病毒的监测,加强对城乡活禽市场的监管力度。
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编辑人员丨3天前
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2023年河南省外环境H7N9禽流感病毒的基因组序列分析
编辑人员丨3天前
目的:分析活禽市场相关环境中检出的H7N9禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)的遗传进化和分子特征。方法:采集禽类粪便、污水,以及脱毛机和案板擦拭拭子等标本,实时荧光定量PCR鉴定甲型流感病毒和H7N9亚型。对于H7N9阳性标本以甲型流感病毒通用引物扩增病毒全基因组并测序,利用BLAST和MEGA X软件进行序列比对、系统进化和分子特征分析。结果:2023年2月采集于许昌市活禽市场的7份外环境标本中检出4份H7N9 AIV阳性,3份H7N9 AIV阳性标本测序成功,其各基因核苷酸一致性较高(98.37%~100.00%)。BLAST分析显示主要与我国2020—2021年国内禽中分离的H7N9毒株一致性最高。遗传进化分析显示3株病毒株聚在同一分支,与最近环境分离株相聚较近,而与最近人/禽感染病毒株关系较远。通过与各时期的代表性病毒株序列比对发现,本研究检出的病毒株呈禽高致病性,裂解位点处插入了4个氨基酸KRAA,病毒株血凝素受体结合位点为QSG,属于禽结合受体,血凝素出现G186I位点突变。聚合酶碱性蛋白2未出现哺乳动物适应性E627K突变。未检测到与神经氨酸酶抑制剂(奥司他韦)和聚合酶酸性蛋白抑制剂(巴洛沙韦)耐药相关的R292K和I38T位点突变,提示病毒对上述药物敏感性未降低。M2蛋白出现S31N突变,提示对烷胺类药物耐药。结论:从活禽市场检出的3株H7N9病毒株呈禽高致病性,与既往感染人/禽代表株相比,未明显增加人受体结合力、哺乳动物致病性、病毒传播力和耐药相关分子位点。
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编辑人员丨3天前
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2013-2022年湖南省人感染H9N2禽流感病例及外环境H9亚型禽流感病毒监测分析
编辑人员丨2周前
目的 通过分析2013-2022年湖南省人感染H9N2禽流感病例的流行病学和临床特征,以及外环境H9亚型禽流感病毒污染情况,为人感染H9N2禽流感防控提供科学依据.方法 通过中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统或突发公共卫生事件信息报告管理系统收集2013-2022年湖南省人感染H9N2禽流感病例、病例报告卡和疫情现场调查处置报告,收集病例临床资料和流行病学信息;2013-2022年分别对采集湖南省城乡活禽市场、规模养殖场(户)、家禽散养户、家禽屠宰加工厂和野生禽鸟栖息地5类场所外环境标本,运用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-PCR)进行禽流感病毒检测,对病例信息、外环境标本禽流感病毒核酸检测等数据进行统计分析.结果 2013-2022年湖南省累计报告人感染H9N2禽流感14例,均为散发轻症病例,病例均通过流感样病例(ILI)常规监测发现.病例主要为儿童,中位年龄3.5岁(P25=1.4,P75=9.8),涉及湖南省9个市(自治州)的11个县(区);13例病例出现发热,最高体温中位数为39.0(P25=38.0,P75=39.5)℃;57.00%的病例有禽类或活禽市场、加工烹饪宰杀禽类暴露史(8/14).2013-2022年湖南省共采集并检测外环境禽流感标本39 225份,A型禽流感病毒阳性率为40.79%(15 998/39 225),其中H9阳性率为23.46%(9 201/39 225).H9阳性率呈现逐年上升趋势(趋势x2=231.460,P<0.001).不同监测场所H9阳性率差异具有统计学意义(x2=1142.460,P<0.001),活禽市场H9阳性率最高(26.28%);不同标本类型H9阳性率差异有统计学意义(x2=1241.060,P<0.001),清洗禽类污水标本H9阳性率最高(31.06%).结论 湖南省人感染H9N2禽流感疫情全省散发,局部地区较为集中.活禽交易市场和禽类污水中H9亚型污染较严重,禽类和活禽市场是人感染禽流感病毒的主要来源.因此,需做好人群和外环境禽流感的监测和防控,加强各类涉禽场所的外环境消毒,烹饪宰杀禽类相关工作人员需做好个人防护.
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编辑人员丨2周前
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2013-2022年江西省H7亚型禽流感外环境监测及感染病例分析
编辑人员丨2024/3/23
目的 了解江西省H7亚型禽流感病毒外环境动态分布情况及人群感染特征,为科学防控禽流感疫情提供依据.方法 系统收集2013-2022年江西省外环境禽流感监测信息和人感染H7亚型禽流感病例资料,采用描述性流行病学方法进行分析.结果 2013-2022年共采集外环境标本15 535份,H7亚型阳性率为1.85%(287/15 535).自2014年起连续9年均检出阳性标本,年阳性率整体呈下降趋势(x2趋势=2.168,P=0.231).赣州市、南昌市和九江市外环境H7亚型阳性率较高,分别为2.96%、2.77%、2.66%,不同地区阳性率差异存在统计学意义(x2=70.145,P<0.001).阳性率检出高峰主要在冬春季,占比64.11%,不同季度阳性率差异存在统计学意义(x2=69.280,P<0.001).不同标本类型阳性率差异存在统计学意义(x2=16.948,P=0.005).2013-2022年江西省共报告52例H7亚型禽流感病例,职业以农民、离退人员和务工人员为主,45岁以上病例占76.92%.发病时间主要在冬春季,76.92%病例有明确的禽类暴露史.不同月份H7N9禽流感发病数与H7亚型阳性率水平无明显相关(Spearman系数=0.515,P=0.087).结论 江西省外环境H7亚型阳性率虽较低,但人群感染风险仍存,应持续开展病原学监测和采取综合性的防控措施,降低人群感染的潜在风险.
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编辑人员丨2024/3/23
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安徽省安庆市涉禽外环境禽流感病毒监测分析
编辑人员丨2024/2/3
[目的]了解安徽省安庆市涉禽外环境中禽流感病毒污染情况,为预防控制人感染动物源性流感提供科学依据.[方法]采用单纯随机抽样方法,抽取安徽省安庆市10个县(市、区)共28家农贸市场/养殖场作为监测点.连续6周采集禽类粪便等相关标本.采用实时荧光定量聚合酶链反应法检测甲型流感病毒核酸,对阳性标本再进行H5、H7、H9亚型禽流感病毒核酸检测.[结果]共采样426份,检测阳性113份,阳性率为26.53%.其中H9亚型104份,占92.04%.主城区和非主城区阳性率的差异无统计学意义(χ2<0.01,P>0.05).不同周次采集的标本阳性率的差异无统计学意义(χ2=7.57,P>0.05),但第3周与其他周次采集的标本阳性率的差异有统计学意义(χ2= 6.89,P<0.05).不同采样场所中,养殖场阳性率最高,为46.67%.不同来源标本中,禽类笼具表面擦拭标本阳性率最高,为34.78%.[结论]安庆市涉禽外环境中存在禽流感病毒.应加强监测和风险评估,降低外环境中病毒含量,减少人感染动物源性流感的风险.
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编辑人员丨2024/2/3
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三峡库区不同阶段蓄水前后江面江岸冬季鸟类动态
编辑人员丨2023/8/6
2003 ~ 2013年的隆冬季节(2011年除外),对三峡库区长江主河道的重庆朝天门港-秭归茅坪港江段(全程约618.30km)和12条一级支流(合计调查河道长度约619.49km),以及2个湖泊(长寿湖65.5 km2,大洪湖30 km2;调查年份2000 ~ 2013年,2003和2011年除外),进行了水禽及傍水栖息鸟类的监测调查.观察统计到鸟类76种,隶属8目14科39属,其中国家Ⅰ级重点保护野生动物1种,Ⅱ级重点保护野生动物3种.鉴于不同类群鸟类对环境变化的反应差别较大,将观察到的与水域生境密切相关的鸟类分为游禽类(32种)、鸥类(6种)、涉禽类(23种)、傍水栖息鸟类(13种)和空中傍水栖息鸟类[2种,以崖沙燕(Riparia riparia)为主体]等5种类型,并对各类群鸟类在三峡水库不同工程阶段蓄水高程前后的数量分布状况进行对比分析.结果显示,长江主河道中的游禽类在蓄水139m高程前后数量波动幅度不大,蓄水156m高程后表现出增长趋势,并且趋向于尾水点集中分布,直至最终蓄水目标175m高程后的第5个冬季(2013年1月)数量猛增到最高,与蓄水139m水位线前后的2个冬季(2003年1月和2004年1月)数量相比,增幅分别达171.83%和179.91%;然而2个湖泊中的游禽数值却表现出下降趋势,蓄水175 m高程后5个冬季(2008 ~ 2013年)与2000年冬季数值相比,降幅达52.96% ~ 83.29%;大多数支流河道中的游禽数量呈现波动幅度不大或是明显下降趋势,只有乌江和小江这2条支流河道中的游禽数量呈现出增长趋势,并且小江中的游禽数量一度表现出“爆发式”增长现象后又大幅回落(2012 ~ 2013年),可能与水质富营养化程度的变化相关.涉禽类在长江主河道中的分布格局类似于游禽类(偏向于上游),其数量分别在蓄水139m高程和156m高程后的第1个冬季出现峰值,蓄水前后的其他年份数量差别不大;多数支流河道中涉禽类分布数量不高,只有嘉陵江、乌江、小江、大宁河与梅溪河的涉禽数量较多且数值波动明显.傍水栖息型鸟类总体数量在蓄水前后出现急剧变动,数量下降明显,个别鸟种甚至消失不见.空中傍水栖息型鸟类蓄水之后在长江主河道数量锐减,在大多数支流河道中几乎绝迹.鸥类主要分布在长江主河道,其数量在不同阶段蓄水初期出现峰值,至最终蓄水目标175m后的第5个冬季其数量趋于接近蓄水之前.
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编辑人员丨2023/8/6
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长沙市2117份外环境标本禽流感病毒监测结果分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 了解长沙市活禽市场外环境中禽流感病毒的污染情况,为长沙市禽流感疫情风险评估与防控提供理论依据.方法 采用实时荧光定量PCR法对2014年1月-2017年3月长沙市9个区县疾控中心采集的2 117份活禽市场监测样本,进行甲型流感病毒(Influenza A virus,Flu A)、H5、H7、H9核酸检测,结果使用SPSS19.0进行分析.结果 2117份标本中禽流感FluA阳性率为73.45%,各年均有H5,H7,H9亚型和混合感染检出.四个季度中以第四季度样本FluA阳性率最高(82.74%).宰杀或摆放禽肉案板表面的擦拭标本、禽类饮水、清洗禽类污水、笼具表面擦拭标本、粪便和其他标本的FluA阳性率从高到低依次为87.14%、75.32%、74.88%、38.18%、29.41%、8.33%,不同类型标本阳性率差异有统计学意义(x2=104.582,P<0.05).非中心城区与中心城区标本FluA阳性率差异有统计学意义(x2=11.958,P<0.05).结论 长沙活禽市场外环境标本常年存在H5,H7,H9亚型,冬季为禽流感高发季节,禽类宰杀环节污染程度高,相关部门应加大监管力度,从源头上加强防控和治理禽流感的传播.
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编辑人员丨2023/8/6
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淄博市人感染H7N9禽流感病例调查及环境因素监测
编辑人员丨2023/8/6
目的 对淄博市2017年确诊的2例人感染H7N9禽流感疫情进行现场调查,探讨感染来源和传播方式,为H7N9禽流感疫情防控提供参考.方法 应用现场流行病学方法对2例病例的发病就诊经过、密切接触者进行调查分析,采集病例、密切接触者及相关活禽市场标本,开展流感病毒核酸检测,同期在全市开展活禽市场摸底调查和外环境监测工作.结果 2例病例均发生在沂源县,首发病例5月28日发病,第2例病例6月7日发病,病例之间无流行病学关联,2例病例均有活禽市场暴露或宰杀活禽史.在沂源县采集外环境标本125份,未检出H7N9病毒核酸阳性标本.在其余7个区县采集活禽市场标本140份,在3个区县检出H7N9病毒核酸阳性标本7份.对病例采取隔离治疗、密切接触者医学观察、疫点终末消毒、强化监测、停止活禽交易等措施后,疫情得到有效控制.结论 2例人感染H7N9禽流感病例发病与禽类间接触史有关,活禽市场休市不能完全控制疫情发展,要加强对跨地区活禽调运监管,控制疫情传播.
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编辑人员丨2023/8/6
