目的:对活禽市场环境中检出的3份H5N6亚型禽流感病毒（avian influenza virus，AIV）标本进行测序鉴定和基因特征分析，为预防人感染H5N6亚型AIV提供依据。方法:通过实时荧光定量PCR确定病毒型别，采用二代测序方法对病毒血凝素（hemagglutinin，HA）和神经氨酸酶（neuraminidase，NA）基因序列进行测序。使用NCBI中BLAST模块进行比对，用Mega7.0软件构建进化树并进行基因特征分析。结果:3份H5亚型阳性标本经测序鉴定为H5N6亚型AIV，属于Clade2.3.4.4支系。病毒的HA蛋白存在6个连续碱性氨基酸（LRERRRKRGL，其中R，K为碱性氨基酸）；病毒HA蛋白的受体结合位点238~240位氨基酸是QRG（氨基酸排序以H3-HA为准），受体特征为禽源；NA蛋白第69~73位点氨基酸未出现茎缺失。结论:环境中3份H5亚型AIV核酸阳性病毒鉴定为新型H5N6亚型AIV，属于高致病AIV，但具有不容易感染人的受体结合特征。活禽市场中持续存在H5N6病毒，对人类健康和公共卫生存在威胁，需要继续加强监测。

目的:分析淮南市2016年度外环境标本中H7N9禽流感病毒基因组特征。方法:采集活禽市场禽类粪便、笼具、台面或砧板、脱毛机、禽类饮水、污水等标本，选取H7N9、H9亚型PCR检测阳性标本( Ct值≤30)，鸡胚分离培养后提取RNA，扩增8个基因节段进行基因序列测定、分子特征与进化分析。 结果:2016年150份淮南市外环境标本检出H7N9亚型46份、H9亚型71份、H5亚型38份；2份H7N9亚型分离成功。基因进化分析显示，淮南市2株H7N9禽流感毒株血凝素(hemagglutinin, HA)和神经氨酸酶(neuraminidase, NA)基因均处于长三角分支内，其余6个内部基因无明显地域分布聚类；HA氨基酸受体位点出现G186V、Q226L位点变异，NA茎区缺失了"QISNT"序列，R294K、E119V耐药位点没有发生突变；聚合酶发生PA基因I550L，PB1基因I368V，PB2基因I504V突变；NS1基因出现增强致病力的位点N205S、P42S改变；耐药相关位点出现M1基因N30D、T215A，M2基因S31N突变。结论:2016年淮南市活禽市场禽流感病毒高度流行，H7N9亚型感染人类的能力有所增强，M2离子通道抑制剂耐药，NA抑制剂仍为敏感有效药物。

目的:分析甘肃省首例人感染H7N9禽流感病例流行病学特征，为H7N9禽流感防控提供科学依据。方法:采用流行病学调查方法调查甘肃省首例人感染H7N9禽流感病例的发病和就诊经过、可能感染来源、传播途径及暴露因素等，并排查密切接触者实施健康医学观察，同时开展外环境采样检测和疫点消毒。结果:甘肃省确诊的首例人感染H7N9禽流感本地感染病例为82岁男性，城市居民，2017年3月29日因发热、全身乏力前往私人诊所就诊，4月3日到酒泉市医院就诊，有在检出H7N9病毒核酸的活禽销售店附近活动史，咽拭子检测H7N9禽流感病毒核酸阳性；该病例经治疗于发病17 d后治愈出院；9名密切接触者实施为期7 d的医学健康观察，未出现健康异常；强化监测全市共报告流感样病例和不明原因肺炎357例，H7N9禽流感病毒核酸阳性2例。酒泉市发现的3例H7N9病例均有活禽市场暴露史，其中1例死亡。结论:暴露于出现H7N9禽流感病毒的外环境是人感染H7N9主要危险因素，需要加强散养家禽和活禽市场管理；外环境禽流感监测对人感染H7N9禽流感防控具有重要的预警作用。

目的:为了解福建省禽类养殖业发达地区环境禽流感病毒的分布特征，对2021年12月至2023年12月地处山区的南平市禽类相关环境禽流感病毒分布开展调查。方法:采集2021年12月至2023年12月南平市禽类相关环境样本，运用实时荧光定量RT-PCR法进行甲型流感病毒核酸检测，对阳性样本进行H3、H5、H7、H9和H10亚型鉴定。应用SPSS 26.0软件分析不同时间、禽类相关场所、样本类型禽流感病毒的分布特征和差异性。结果:2021年12月至2023年12月，南平市禽类相关环境样本甲型流感病毒阳性率为49.16%(1 435/2 919)，其中H3、H5、H9、H10亚型阳性率分别为0.72%(21/2 919)、9.42%(275/2 919)、33.20%(969/2 919)、0.89%(26/2 919)，H7亚型未检出，混合型(含一种以上亚型)阳性率6.51%(190/2 919)，未分型(甲型流感病毒检测阳性但H3/5/7/9/10均为阴性)阳性率11.58%(338/2 919)。甲型流感病毒阳性率高峰主要出现在秋冬季(9月至次年2月)，活禽市场和屠宰场的甲型流感病毒、H9亚型、混合型以及未分型阳性率显著高于养殖场，禽饮用水、粪便样本的甲型流感病毒阳性率较高，阳性样本以H9亚型居多。结论:南平市禽类相关环境中禽流感病毒阳性率以秋冬季为高；病毒在禽饮用水和粪便样本中的阳性率更高，并且在活禽市场与屠宰场等多种禽类聚集的场所呈现更高的多样性。

目的:研究2017—2018年佛山市活禽交易市场禽流感病毒检出率、混合流行情况和基因变异分析，评估活禽市场禽流感的潜在风险。方法:采用荧光PCR检测2017年4月至2018年3月间1 440份活禽交易市场环境监测标本，对部分H9N2阳性标本进行血凝素（hemagglutinin，HA）全长测序，结合采集时间、采集地点、标本种类和基因进化情况综合分析。结果:1 440份标本中甲型流感阳性422份。阳性标本中检出H9N2单独阳性标本213份（213/422，50.47%），混合阳性标本38份（38/422，9.00%）。H5N6单独阳性标本44份（44/422，10.43%），混合阳性标本26份（26/422，6.16%）。H7N9单独阳性标本4份（4/422，0.95%），混合阳性标本16份（16/422，3.79%）。来自外环境标本混合阳性检出率明显高于来自活禽标本（14.7% vs 1.75%， x2=20.10， P<0.01），零售市场混合阳性检出率高于批发市场但无明显差异（13.46% vs 8.18%， x2=1.97， P=0.1602）。9株测序的H9N2标本HA基因序列与国内疫苗株共同处于h9.4.2亚分支上。 结论:H9N2亚型禽流感病毒在佛山市活禽市场中存在比例较高，是与其他禽流感病毒混合感染率最高的亚型，后期应重点监测。

目的:了解人感染H3N8禽流感病例的流行病学特征和临床特征及其病原的分子生物学特征，为人感染H3N8禽流感防控提供科学依据。方法:采用流行病学调查方法对长沙市2022年5月1例人感染H3N8禽流感病例的可疑暴露史、感染途径、发病及就诊经过，以及密切接触者、可疑暴露者等涉疫重点人员进行现场调查，并进行描述性分析；采用核酸检测和基因测序技术，进行病原学检测和基因特征分析。结果:病例发病前6 d有活禽交易市场暴露史，在活禽交易市场、活禽来源批发市场均检测出禽流感H3、N8亚型阳性。深度基因测序显示，病毒对哺乳动物发生适应性突变，对烷胺类药物敏感性降低，未检测到神经氨酸酶抑制剂类药物和聚合酶抑制剂类药物相关的耐药性突变。结论:病例暴露于被H3N8禽流感病毒污染的活禽交易市场环境而感染，未发现人际间传播。

目的:对活禽市场家禽中分离的H5N6禽流感病毒(avian influenza virus, AIVs)进行遗传进化和分子特征分析。方法:2018年12月于乌鲁木齐市活禽市场采集家禽双腔拭子和环境样本，通过接种鸡胚、血凝试验和RT-PCR等方法分离鉴定AIVs，以甲型流感病毒通用引物扩增病毒全基因组并测序，利用BLAST、Clustal W、MEGA-X和DNAStar等软件进行序列比对、系统进化和分子特征分析。结果:从家禽样品中分离到6株H5N6亚型AIVs，其各基因之间的一致性较高(99.4%～100.0%)，为同一来源。BLAST分析显示除 NP基因与苏州家禽中分离的H5N6毒株一致性最高(99.7%)，其余7个基因片段均与2017—2018年广东环境中分离的H5N6毒株一致性最高，在99.0%～100.0%之间。遗传进化分析显示分离株的 HA属于Clade2.3.4.4.C分支， HA、 NA、 PB1、 PA、 NP、 MP这6个基因均与2018年自华东地区水貂中分离的H5N6病毒株聚在同一分支， PB2和 NS均与2017—2018年于广东环境中分离的H5N6病毒株聚在一起。分离株HA的裂解位点含多个连续的碱性氨基酸，为高致病性AIV， HA的S137A和T160A突变可增强病毒与人源受体SAα2，6-Gal的结合。另外， NA茎部缺失、 PB2的L89V、G309D、R477G、I495V、I504V、D391E和A661E以及 NS1的P42S、D92E和80～84位氨基酸缺失等突变均可增强病毒对哺乳动物的毒力和致病力。 结论:分离的6株高致病性H5N6 AIVs与2017—2018年分离自华东地区水貂和广东环境的H5N6 AIVs的遗传关系较近，存在的多个突变可增强病毒对哺乳动物的致病性，存在较大的公共卫生风险。

目的:分析2017—2021年福建省外环境禽流感病毒流行特点，为禽流感防控、预测工作提供参考。方法:在福建省6地市监测点的4类禽类相关不同场所进行6类不同类型标本的采样，采用荧光定量PCR法对环境标本进行A型、H5、H7和H9亚型核酸检测，并采用流行病学方法对检测结果进行分析。结果:2017—2021年共采集6个监测点标本4 214份，其中A型禽流感病毒阳性率为41.53%(1 750份)，H5、H7和H9亚型阳性率分别为2.33%(98份)、1.16%(49份)和23.16%(976份)，H5+H7亚型阳性率为0.05%(2份)，H5+H9亚型阳性率为1.83%(77份)，H7+H9亚型阳性率为0.83%(35份)，H5+H7+H9亚型阳性率为0.09%(4份)，A型阳性未分型的阳性率为12.08%(509份)。不同检测场所和不同类型标本A型阳性率的差异具有统计学意义( χ2＝517.57, P<0.001; χ2＝51.58, P<0.001)：城乡活禽市场的禽流感病毒阳性率最高(49.72%)；不同类型标本中笼具表面擦拭标本(48.09%)、清洗禽类的污水(47.34%)和宰杀或摆放禽肉案板表面(45.66%)的阳性率较高。不同地区监测点的A型阳性率差异具有统计学意义( χ2＝458.34, P<0.001)：A型阳性率最高和最低的地市分别是三明市(56.00%)和漳州市(3.34%)。在时间分布方面，冬春季(11月至次年2月)和夏季(6~8月)的阳性率较高。 结论:福建省禽流感病毒总体阳性率较高，以H9亚型为主，应重点加强冬春季和夏季禽流感病毒的监测，加强对城乡活禽市场的监管力度。

目的:分析活禽市场相关环境中检出的H7N9禽流感病毒(avian influenza virus，AIV)的遗传进化和分子特征。方法:采集禽类粪便、污水，以及脱毛机和案板擦拭拭子等标本，实时荧光定量PCR鉴定甲型流感病毒和H7N9亚型。对于H7N9阳性标本以甲型流感病毒通用引物扩增病毒全基因组并测序，利用BLAST和MEGA X软件进行序列比对、系统进化和分子特征分析。结果:2023年2月采集于许昌市活禽市场的7份外环境标本中检出4份H7N9 AIV阳性，3份H7N9 AIV阳性标本测序成功，其各基因核苷酸一致性较高(98.37%～100.00%)。BLAST分析显示主要与我国2020—2021年国内禽中分离的H7N9毒株一致性最高。遗传进化分析显示3株病毒株聚在同一分支，与最近环境分离株相聚较近，而与最近人/禽感染病毒株关系较远。通过与各时期的代表性病毒株序列比对发现，本研究检出的病毒株呈禽高致病性，裂解位点处插入了4个氨基酸KRAA，病毒株血凝素受体结合位点为QSG，属于禽结合受体，血凝素出现G186I位点突变。聚合酶碱性蛋白2未出现哺乳动物适应性E627K突变。未检测到与神经氨酸酶抑制剂(奥司他韦)和聚合酶酸性蛋白抑制剂(巴洛沙韦)耐药相关的R292K和I38T位点突变，提示病毒对上述药物敏感性未降低。M2蛋白出现S31N突变，提示对烷胺类药物耐药。结论:从活禽市场检出的3株H7N9病毒株呈禽高致病性，与既往感染人/禽代表株相比，未明显增加人受体结合力、哺乳动物致病性、病毒传播力和耐药相关分子位点。

目的:了解贵州省H9N2亚型禽流感病毒(avian influenza virus，AIV)的流行与遗传变异情况，为AIV的防控提供依据。方法:统计2018年10月—2019年3月贵州省活禽市场外环境AIV检出情况，对选取的H9N2亚型AIV进行基因组的提取、血凝素(hemagglutinin, HA)基因的RT-PCR扩增与测序，并对获得的 HA基因序列进行同源性、遗传进化和关键位点变异分析。 结果:贵州省活禽市场外环境AIV检出率为52.2%，H9N2占阳性的83.7%。H9N2亚型AIV HA基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为91.6%～100.0%和91.0%～100.0%，均属于Y280亚系，G57基因型；与致病性相关的裂解位点序列均为PSRSSRGLF和LSRSSRGLF，符合低致病性AIV的分子特征；与宿主特异性相关的受体结合关键位点存在H191N、E198T/A和Q234L三个位点的突变，具有人样受体结合特征；与毒力相关的糖基化位点均具有7个，其中因突变218位点均存在一个糖基化位点缺失，313位点均存在一个增加。与人感染毒株相比关键位点未发生重要突变。 结论:贵州省活禽市场外环境AIV检出率较高，污染较严重，且以H9N2为优势流行亚型；H9N2亚型AIV均属于Y280亚系，G57基因型，为低致病性AIV，毒株遗传差异在增大，关键氨基酸位点存在变异，具有感染人的风险，故应加强监测该病毒的分子遗传变异情况。