异基因造血干细胞移植（allo-HSCT）是治疗多种血液系统恶性肿瘤，尤其是白血病的重要手段。经allo-HSCT治疗后，白血病细胞的清除可通过供者淋巴细胞输注（DLI）完成，这是一种过继免疫疗法，可将正常供者来源的外周血淋巴细胞输注到患者体内以诱导移植物抗肿瘤（GVT）效应，继而促进移植后免疫系统的快速重建，清除患者体内残留的癌细胞 [ 1] 。随着预处理方案、移植物抗宿主病（GVHD）预防和支持治疗的改进，白血病移植相关死亡率得到有效降低，但肿瘤复发依然是allo-HSCT后死亡的首要原因。在恶性肿瘤中，染色体杂合性缺失（LOH）是一种常见的染色体畸变方式，表现为同源染色体上一个等位基因的部分或全部遗传物质发生丢失。研究表明，白血病复发的因素多样，人类白细胞抗原（HLA）杂合性缺失（简称为HLA loss）是其中一个重要的诱因。本文就HLA loss的发生发展、检测及其潜在的临床治疗策略的研究进展进行综述。

SAMD9与其旁系同源基因SAMD9L并排位于染色体7q21上，功能上有58%的相似性 [1]，均表达IFN和TNF-α，具有生长抑制因子的功效 [2]。SAMD9/9L突变与血细胞减少、骨髓衰竭、骨髓增生异常综合征（MDS）及免疫缺陷相关 [3,4]，遗传学检查上可表现伴或不伴有7号染色体单体或7染色体部分单体缺失（长臂缺失）（-7/7q-）的SAMD9/9L的错义突变或截断突变。SAMD9/9L在全血细胞减少中突变发生率为18.6% [5]，在MDS中突变发生率为8%~17% [6,7]。SAMD9/9L突变可通过等位基因丢失、回复突变或单亲二倍体（UPD）复制等对骨髓造血功能进行修正 [8,9]。SAMD9/9L突变所致疾病临床表现异质性强，目前治疗标准不统一，欧洲儿童骨髓异常增生综合征工作组（EWOG-MDS）建议，没有严重血细胞缺乏和不依赖输血的SAMD9/9L突变患者，可采用观察及等待策略；进展为髓系恶性肿瘤者及时行造血干细胞移植（HSCT）结果令人满意 [10]。本研究中，我们对我院儿科SAMD9/9L突变致儿童全血细胞减少5例患者的临床表现、实验室检查、治疗及转归进行描述。

目的:通过筛查1例歌舞伎面谱综合征（Kabuki syndrome，KS）患者的致病基因并分析其可能的致病机制，为KS的遗传咨询、产前筛查和产前诊断以及早期治疗提供依据。方法:纳入2020年12月就诊于武汉大学口腔医（学）院正颌与唇腭裂整形外科的1例16岁女性KS患者，收集患者及其家系成员的临床资料、外周肘静脉血样本，通过改良盐析法提取基因组DNA，全外显子组测序（whole-exome sequencing，WES）分析其致病基因，并采用Sanger测序验证。利用Alphafold2、AntheProt及DOG.2.0.1等生物信息学软件分析突变蛋白在三维结构、二级结构和理化性质方面的改变。此外，本研究基于人类基因突变数据库总结了KS患者中组蛋白甲基转移酶2D（histone-lysine N-methyltransferase 2D，KMT2D）基因突变的分布特点。结果:该患者表现为典型的KS特殊面容、先天性腭裂、第五指畸形、先天缺牙、肾发育不良和肾积水。WES结果显示该患者携带KMT2D基因新发双突变，即c.［1166A>C；1167dupC］（NM_003482），且二者位于同一等位基因上（顺式）；以上结果均经等位基因特异性PCR证实。生物信息学分析表明，与野生型KMT2D蛋白相比，突变蛋白p. Y389S、p.V390Rfs*26构象中增加了3个α-螺旋，减少了1个β-转角和1个β-折叠，丢失了C端FYRN、FYRC、SET、PostSET结构域。结论:本研究在KS患者中发现了KMT2D基因的新发双突变，且位于同一等位基因，扩大了KMT2D基因的突变谱，为KS的遗传易感性咨询、产前诊断以及早期治疗提供了证据。

目的:探讨1个家系的 HLA-B基因的碱基缺失情况。 方法:选取2022年4月就诊于广西柳州市人民医院的1例急性髓系白血病女性患者、丈夫和女儿作为研究对象，应用PCR-序列特异性寡核苷酸探针(PCR-SSOP)及PCR-直接测序法(PCR-SBT)对该家系进行人类白细胞抗原(HLA)常规检测。应用二代测序技术(NGS)对 HLA-B基因序列进行确认。 结果:患者及其女儿 HLA-B位点的PCR-SBT和PCR-SSOP结果不一致，PCR-SSOP结果分别为 HLA-B*35：01，40：02和 HLA-B*35：01，40：01，PCR-SBT结果则均提示与最接近的 HLA-B*35：01在第4外显子处有错配。NGS结果显示患者及其女儿 HLA-B*35：01第5内含子处有1段9 bp的碱基序列缺失。患者丈夫结果为 HLA-B*40：01，58：01，无异常。 结论:该家系 HLA-B基因第5内含子处的变异位于SBT检测的引物结合区，影响了PCR-SBT分型结果的准确性。

目的 本文以等位基因丢失为切入点,重点说明在亲子鉴定过程中出现等位基因丢失如何证明并解决.方法 本机构在进行亲子鉴定检测过程中,通过对20个染色体STR基因座进行PCR复合扩增,毛细管电泳后荧光检测,发现被检父与孩子仅在Penta E基因座上有不符合遗传规律现象.增加基因座进行检测,并验证被检父与孩子是否符合同一父系,判断其亲子关系.结果 两个试剂盒共39个基因座检测显示,仅Penta E基因座不符合遗传规律,且为6步突变,其峰面积与相邻基因座杂合子的单峰面积相近,考虑为等位基因丢失.更换试剂盒再次进行实验,验证了该案例的两个个体的Penta E基因座发生等位基因"19"丢失的情况.结论 等位基因丢失导致杂合子被误判为纯合子,影响累积亲权指数计算结果,可更换不同引物序列的检测试剂盒重新检测,以保证鉴定结果的准确性.

目的:研究长链非编码RNA(lncRNA)H19和胰岛素样生长因子2(IGF2)基因在乳腺癌组织中的表达水平,分析其印记状态.方法:采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测乳腺癌组织及癌旁组织中H19和IGF2 mRNA表达水平,分析H19和IGF2 mRNA在乳腺癌组织及癌旁组织中的表达差异,利用单核苷酸多态性(SNP)区分等位基因表达情况(纯合或杂合),基因组DNA中IGF2(Apa Ⅰ位点)或H19(Alu Ⅰ位点)为杂合则进行印记分析,确定H19和IGF2在乳腺癌组织中的印记状态,即印记保持(MOI)或印记丢失(LOI).分析乳腺癌组织中H19和IGF2表达与分子分型的关系.结果:RT-qPCR法检测,乳腺癌组织中H19和IGF2 mRNA表达水平高于癌旁组织(P＜0.01),H19 mRNA表达水平与IGF2 mRNA表达水平呈正相关关系(r=0.567,P＜0.01).不同分子分型乳腺癌患者癌组织中H19 mRNA表达水平均高于癌旁组织(P＜0.05或P＜0.01).H19和IGF2在乳腺癌组织中均存在LOI,IGF2的LOI发生率为36.7％,高于H19的LOI发生率(4.3％).RT-qPCR法检测,IGF2 LOI组乳腺癌组织中IGF2 mRNA表达水平明显高于IGF2 MOI组(P＜0.01).结论:乳腺癌组织中H19和IGF2 mRNA表达水平明显高于癌旁组织,IGF2的LOI发生率高于H19的LOI发生率,IGF2的LOI可能是乳腺癌发病的关键因素之一.

野生大豆(Glycine soja Sieb.& Zucc.)是栽培大豆(Glycine max[L.]Merr.)的近缘祖先种.在大豆驯化的过程中,栽培大豆丢失了大量的基因或等位变异,导致栽培大豆的遗传多样性降低,这严重限制了栽培大豆品种选育和改良的有效性与丰富性.我国野生大豆种质资源丰富,蕴藏着许多高蛋白含量、抗病虫、耐干旱、耐盐碱等方面的潜力基因,挖掘潜力基因并利用分子设计育种技术应用到现代的栽培大豆品种中,能够有效地拓宽栽培大豆的遗传多样性.本文综述了野生大豆的分布规律和形态特征、近年来在野生大豆中发掘的重要功能基因或位点,包括百粒重、开花期和成熟期、蛋白质和油分含量、抗病、抗虫、耐盐碱、耐干旱等重要农艺性状基因,并讨论这些重要基因或位点在未来栽培大豆育种中的应用潜力,以期为育种家培育和改良大豆新品种提供一种新的育种思路和策略.

目的:研究二代测序技术(NGS)检测深圳地区随机健康无关汉族人群HLA-DRB1、DQB1、DQA1、DRB3、DRB4、DRB5、DPA1、DPB1等位基因多态性的精确性,探讨HLA-DRB1等位基因丢失的原因及室内关键质控体系建立策略.方法:采用MiSeqDxTM NGS平台对1 012例样本完成HLA-Ⅱ类等位基因分型.对质控体系软件提示的疑难样本和HLA-DRB1纯合子样本采用PCR-SSOP法或PCR-SBT法进行确认.结果:检出HLA-DRB1、DRB3、DRB4、DRB5、DQA1、DQB1、DPA1、DPB1等位基因分别有45、7、5、7、17、21、10、27 种.常见等位基因(频率＞10％)有 HLA-DRB1*09:01(17.09％)、15:01(10.72％);DRB3*02:02(25.99％)、03:01(10.18％);DRB4*01:03(36.46％);DRB5*01:01(15.42％);DQA1*01:02(20.01％)、03:02(17.19％);DQB1*03:01(19.47％)、03:03(17.98％)、05:02(11.66％)、06:01(10.67％);DPA1*02:02(54.45％)、01:03(31.18％);DPB1*05:01(39.13％)、02:01(16.90％).HLA-DRB1 和DQB1位点基因频率与中国常见及确认的HLA等位基因表(CWD2.4)进行统计学比较,差异无统计学意义(x2=12.68,P＞0.05).对NGS检出的94例HLA-DRB1纯合子样本采用PCR-SSOP法进行复检,检出HLA-DRB1位点漏检等位基因1例,通过SBT法确认为漏检DRB1*04:03等位基因,为此建立了本实验室室内质控体系.检出新等位基因2例,获WHO HLA系统因素命名委员会命名.结论:基于NGS-HLA分型方案的HLA分型结果,模棱两可结果比率更低.HLA-Ⅱ类等位基因在深圳地区无关健康供者汉族人群中存在遗传多态性.在临床组织相容性试验中独立使用NGS方法存在局限性,需要内部质量控制策略来防范偶发的等位基因丢失事件.

1 案例资料1.1 样本来源全部样本来源于2013年~2015年广东省妇幼保健院法医物证司法鉴定所受理的亲子鉴定案例,共6 700例.签署知情同意书后,采集受检者外周静脉EDTA抗凝血2mL、头发、羊水等用于鉴定分析.

目的 探索乳腺癌术后应用芳香化酶抑制剂(AIs)引起的骨代谢异常与ERα基因rs9340799、rs2234693位点单核苷酸多态性(SNPs)之间的相关性.方法 将2015年10月—2017年4月期间在我院门诊及住院治疗的116名乳腺癌术后接受AIs治疗(≤2年)的患者行ERα基因rs9340799、rs2234693位点测序并比较各基因亚型的腰椎、股骨的骨密度(BMD)值以及T值之间的关系.结果 ERα基因rs9340799位点3个亚型(A/A、A/G、G/G)患者的腰椎BMD值比较具有统计学差异(P<0.05).A/A、A/G基因型患者的腰椎BMD值均高于G/G基因型患者(P<0.05);ERα基因rs2234693位点的3个基因亚型(T/T、C/T、C/C)患者的腰椎BMD值比较具有统计学差异(P<0.05),T/T、C/T基因型患者的腰椎BMD均高于C/C基因型患者(P<0.05).但两位点各基因亚型患者的股骨BMD值、腰椎T值、股骨T值组间比较均无统计学差异(P>0.05).结论 芳香化酶抑制剂相关骨丢失(AIBL)的发生可能与 ERα 基因表型相关.ERα 基因 rs9340799与rs2234693位点中,C、G等位基因可能是发生AIBL的易感型基因.