对治疗痿病的古籍验方和名医验案进行挖掘,获得中医治疗痿病的核心组方,并加以筛选与评价,为中医优势病种的新药开发提供示范.通过检索治疗痿病的古籍验方和名医验案中所含方药,建立痿病方药数据库,利用中医传承计算平台对古籍验方和名医验案的用药规律进行挖掘分析;基于网络稳健性中药药效预测平台计算获得古籍验方和名医验案核心组方的干扰分值.在此基础上,将古籍验方、名医验案、计算分析的结果进行综合评判,最终确定聚类获得的核心组方的开发优先等级.结果显示,古籍验方和名医验案用药多倾向于补虚、活血化瘀、清热和解表类,尤以温性和甘味药为主,主要归属脾、肝、肾经.古籍验方和名医验案聚类分析获得的核心组方通过网络稳健性分析显示,古籍验方组合1对疾病网络的扰动作用最强,综合评价显示具有最优的开发潜力.中医治疗痿病均重视脾、肝、肾、肺的调理,补虚的同时辅以清热、活血化瘀和解表类药物,获得的古籍验方组合1提示具有最优的潜在开发价值,形成的"古籍验方-名医验案-计算分析"整合策略可用于中药新药候选处方的筛选.

目的 探究我国老年人的网络社交现况,并分析网络社交对老年人抑郁症状的影响.方法 选取2018年中国健康与养老追踪调查数据中≥60岁老年人抑郁症状和网络社交相关资料,采用多因素Logistic回归模型分析网络社交对老年人抑郁症状的影响,并采用倾向性评分匹配(Propensity Score Matching,PSM)对网络社交的健康效应进行稳健性检验和异质性分析.结果 本次调查对象共纳入4994人,网络社交的老年人占总人数的10.69％,有抑郁症状的老年人占比为26.47％.多因素回归结果显示,在控制其他变量的情况下,与无网络社交的老年人相比,有网络社交的老年人出现抑郁症状的可能性更低(OR=0.581,95％CI:0.426～0.793,P＜0.05).1∶1匹配分析结果显示,网络社交能改善老年人的抑郁症状(ATT=-0.066,P＜0.05).异质性分析结果显示,网络社交对农村老年人抑郁症状具有改善作用(ATT=-0.083,P＜0.05),对城市老年人抑郁症状改善并无统计学意义(ATT=-0.052,P＞0.05).采用1∶4匹配(ATT=-0.048,P＜0.05)与核匹配(ATT=-0.052,P＜0.05)后,网络社交的健康效应结果依然稳健.结论 网络社交有利于改善老年人的抑郁症状,且农村居民可能是网络社交健康效应发挥作用的主要人群.政府和企业在社交软件开发的过程中,要重视数字产品适老化改造,兼顾城乡差异,注重数字公平.

全球气候变化和人类活动影响对沿海生态系统造成了巨大压力,而建立海洋保护区网络被认为是应对这双重压力的重要手段.为了保护东海丰富的生物资源,我国自20世纪末已建立了多个保护区,但目前生物多样性以及连通性的研究不足以有效支撑东海生物多样性保护与可持续发展.为此,本研究选取了东海城洲岛国家级海洋公园(城洲岛)、深沪湾海底古森林遗迹国家级自然保护区(深沪湾)、湄洲岛国家级海洋公园(湄洲岛)、平潭综合实验区海坛湾国家级海洋公园(平潭岛)、洞头国家级海洋公园(洞头岛)和玉环国家级海洋公园(玉环)6个国家级海洋保护区,在保护区内近岸海域采集不同季节的eDNA样品并测量水环境参数,通过对鱼类群落组成分析预测保护区间的生物多样性及其潜在连通性.在采集到的71个样品中,共获得了5,069,193条序列,包括46,309个分子操作分类单元(molecular operational taxonomic units,MOTUs),其中保护区内共享MOTUs的丰度占比基本都超过40％.虽然不同保护区间环境参数存在显著差异,但是生物多样性指数和群落组成差异性检验显示不同保护区间鱼类组成不存在显著差异(P＞0.05),仅存在季节差异.高占比的共享MOTUs以及无显著空间分化的群落组成可能意味着这些保护区间存在较强的连通性,具备建立海洋保护区网络的潜力.对保护区生态网络结构的进一步分析表明,不同保护区的生态网络存在差异,洞头岛、玉环、深沪湾保护区的网络结构较为稳健,而湄洲岛和平潭岛保护区则相反,这表明不同保护区的保护效果存在一定差异,这可能与保护区的面积和管理有关.本研究不仅为东海近岸群落连通性研究提供了参考,同时也为东海保护区的管理和建设提供直接支撑.

目的 研究我国中医医院服务效率的动态变化情况和空间关联特征,为提高中医医院服务效率和优化资源配置提供参考.方法 收集 2012 年-2021 年我国 30 个省(自治区、直辖市)中医医院相关数据,运用超效率 SBM模型测算服务效率,使用社会网络分析法探析空间网络特征,采用 QAP 方法探究空间网络结构的形成机制.结果 2012 年-2021 年我国中医医院服务效率均值为 0.54,年均降幅为 1.70%.2012 年-2021 年网络密度全国均值为0.319,网络效率全国均值为 0.589,网络等级全国均值为 0.204,度数中心度、接近中心度、中介中心度的全国均值分别为 39.77、65.01、2.15.重庆、上海、江苏、北京、天津、广东和福建处于空间网络的核心地位.人均地区生产总值差异和老年抚养比差异会强化中医医院服务效率空间关联关系.结论 我国中医医院服务效率水平有待提升,省际间差异明显.中医医院服务效率空间网络具有较高的通达性和稳健性,等级结构不显著,整体均衡性较差且关联强度较低.人均地区生产总值和老年抚养比有助于中医医院服务效率空间网络的形成并产生空间溢出效应.

目的 本文深入探讨了江苏卫生健康云影像平台在健康医疗大数据安全管理领域的实践经验,旨在为推动健康医疗大数据行业的稳健发展提供有价值的参考.方法 通过采用多维度的分析框架,对江苏卫生健康云影像平台在合规安全、基础设施安全、网络安全、数据安全、应用安全等多个维度进行研究.同时,深入探索了该平台在数据采集、处理、服务等多个流转环节中如何实施有效的安全管理措施,以确保数据的完整性与安全性.结果 通过系统性的研究,江苏卫生健康云影像平台在安全管理方面积累了丰富的实践经验,明确了构建一个完善且成熟的全生命周期安全保障服务体系,是确保健康医疗大数据在更大范围内实现整体安全和持续安全的关键.结论 基于以上研究,健康医疗行业应以数据全生命周期管理为基石,构建一个全面、动态且安全可控的体系,从而有效推动整个医疗行业的持续、健康发展.

物种-资源利用网络可以呈现不同物种在资源利用上的竞争、共享以及分化,可为从资源利用角度解释群落的物种多样性提供新的视角.昆虫群落一方面由群落内种间对资源的利用方式决定,也受寄主植物生态特征的影响.通过寄主生态特征解释物种-资源利用网络指标将深入揭示昆虫群落的组织模式和多样性决定机制.本研究采集榕属(Ficus)18种榕树的榕小蜂群落,构建每种榕树上的榕小蜂-榕果资源利用网络,分析网络指标间的关系.我们重点关注了群落物种数(物种多样性)和群落稳健度指标与其他网络指标间的关系,并比较不同寄主特征(传粉模式、生活型、繁育系统)对榕小蜂物种数以及榕小蜂-榕果资源利用网络指标的影响.结果显示,18种榕树上共收集到隶属于5科28属173种榕小蜂.榕小蜂群落物种数与网络的连接度呈负相关,与分化度呈显著的正相关;网络稳健度与物种数无显著相关关系,但与连接度、加权嵌套性、互作Shannon多样性、分布重叠度呈显著正相关关系,而与互作专化度、分化度呈显著负相关.与雌雄异株榕树相比,雌雄同株榕树的榕小蜂资源利用的互作专化度高,种间分布重叠度小,分化度高(资源利用分化高),所以雌雄同株榕树比雌雄异株榕树上榕小蜂物种数多.本研究支持资源利用的特异性和分化促进了榕小蜂物种多样性,支持竞争导致的资源利用分化在促进近缘种多样化过程中发挥重要作用.群落对资源丢失的稳健度与群落的物种数无关,但是与物种的资源共享程度(由连接度、分布重叠度表示)正相关.此外,繁育系统间榕小蜂物种数的差异可能与雌雄异株榕树繁殖功能的分化和专化以及对非传粉榕小蜂产卵的防御能力有关.

目的:运用生物信息学分析方法挖掘参与心肌缺血再灌注损伤(MIRI)的关键基因.方法:首先,从数据库中下载大鼠MIRI相关数据集GSE122020、E-MEXP-2098和E-GEOD-4105.其次,一方面利用微阵列数据线性模型(limma)包筛选各数据集中的差异表达基因(DEGs),再用稳健排序整合(RRA)方法筛选稳健DEGs;另一方面,利用替代变量分析(SVA)包将各数据集合并为1个数据集,再利用limma包筛选合并DEGs;将2种渠道的DEGs取交集获取共同DEGs.接着,构建共同DEGs的蛋白相互作用(PPI)网络,利用最大邻域组件密度(DMNC)算法筛选关键基因,并绘制关键基因的受试者工作特征(ROC)曲线,以评价其诊断效能.然后,构建MIRI大鼠模型,检测关键基因的mRNA和蛋白表达情况;并对关键基因参与MIRI的研究开展文献回顾分析.最后,对关键基因开展基因集富集分析(GSEA),进一步揭示其介导MIRI可能的机制.结果:共鉴定出143个稳健DEGs,48个合并DEGs,两者取交集后,获得48个共同DEGs.在共同DEGs的PPI网络中,共筛选出了5个关键基因,即MYC原癌基因bHLH转录因子(MYC)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、血红素加氧酶1(HMOX1)、胱天蛋白酶3(CASP3)和尿激酶型纤溶酶原激活物受体(PLAUR).这些关键基因的ROC曲线下面积均大于0.8.在MIRI大鼠心肌组织中MYC、PTGS2、CASP3和PLAUR的mRNA和蛋白高表达,而HMOX1的mRNA和蛋白表达无显著差异.回顾文献,5个关键基因中仅PLAUR未被报道参与MIRI.PLAUR的GSEA结果显示,PLAUR的功能富集主要集中在NOD样受体信号通路、P53信号通路、Toll样受体信号通路、细胞凋亡和脂肪酸代谢等途径.结论:MYC、PTGS2、CASP3、HMOX1和PLAUR参与了MIRI的病理过程.PLAUR为潜在的关键基因,其可能通过调控NOD样受体信号通路、P53信号通路、Toll样受体信号通路、细胞凋亡和脂肪酸代谢等途径介导MIRI,结果可为进一步探讨MIRI的分子机制和治疗靶点提供参考.

提出一种通过代谢差异分析抑制新型冠状病毒(SARS-CoV-2)复制进程的靶点预测方法.该方法基于肺宿主细胞的基因表达数据,重建病毒入侵后宿主细胞代谢系统发生变化的部分网络模型,并通过单基因敲除和细胞毒性测试识别候选靶点.此外,分析抗病毒靶点对目前已知的多种SARS-CoV-2变体的稳健性.结果表明,D-丙氨酸是影响SARS-CoV-2复制的关键代谢物,且适用于当前所有的SARS-CoV-2变体.调控D-丙氨酸的基因PLPBP是主要的基因靶点.本文方法具有通用性,适用于现有病毒及宿主细胞,为应对病毒性疾病提供新思路.

背景:生物信息学领域的快速发展为骨关节炎的诊断提供了新的方法.人工神经网络具有强大的数据计算能力和分类能力,研究表明其在诊断疾病方面表现出了较好的性能.目的:旨在使用人工神经网络建立一种新的骨关节炎诊断预测模型,并通过外部数据集验证其在骨关节炎中的诊断价值.方法:通过GEO数据库搜索下载符合要求的骨关节炎相关数据集,将其分为Train组与Test组.对Train组的基因表达矩阵进行差异分析,筛选差异表达基因.对差异基因进行GO、KEGG富集分析;通过Lasso回归模型、支持向量机模型、随机森林树模型从差异基因中进一步鉴定骨关节炎关键基因.随后使用R软件"neuralnet"包构建基于人工神经网络的骨关节炎诊断模型,5折交叉验证评估模型表现;使用Test组中2个独立的数据集来验证其诊断效果.结果与结论:通过差异分析共得到90个与骨关节炎相关的差异基因,其中33个下调,57个上调.GO富集分析显示其生物过程主要参与白细胞介导的免疫、骨髓白细胞迁移、趋化因子产生等过程;KEGG富集显示差异基因主要富集在类风湿关节炎、白细胞介素17信号通路、破骨细胞分化等通路.通过3种机器学习方法筛选并取交集后共得到5个诊断骨关节炎的关键基因,分别为HMGB2、GADD45A、SLC19A2、TPPP3、FOLR2.Train组中5个关键基因建立的人工神经网络模型显示其准确率为96.36%,曲线下面积(AUC)为0.997,对神经网络模型的5折交叉验证表明其平均AUC＞0.9,具有一定的稳健性;Test组中2个独立的数据集结果显示其AUC分别为0.814和0.788.提示:建立的人工神经网络骨关节炎诊断模型具有一定的诊断价值.

目的:整合网络药理学方法阐释四神丸治糖尿病肾病的潜在机制.方法:从中药系统药理学数据库与分析平台、中药分子机制的生物信息学分析数据库、Swiss Target Prediction、STITCH和ChEMBL数据库检索四神丸的药物成分及对应靶点.利用DisGeNET、GeneCards和CTD数据库识别糖尿病肾病的疾病基因;在GEO数据库获取糖尿病肾病的数据集,利用limma包和RRA方法筛选稳健差异表达基因,整合疾病数据得到疾病靶点.构建韦恩图,得到复合靶点.然后,基于STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,根据拓扑学参数筛选四神丸治疗糖尿病肾病的核心靶点.通过Cytoscape软件构建成分-靶点网络和成分-靶点-通路网络.利用DAVID数据库对复合靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.最后,分子对接模拟验证主要活性成分与核心靶标之间的结合力.结果:筛选出有效成分121个,有效成分作用靶点542个,有关糖尿病肾病的靶点3 832个.四神丸治疗糖尿病肾病的枢纽基因集为蛋白激酶B1、肿瘤坏死因子、白细胞介素1β等.活性成分为油酸、亚油酸、二氢吴茱萸卡品碱、吴茱萸酰胺等.分子对接模拟显示,核心活性化合物与枢纽基因具有较高的结合活性.结论:四神丸是通过多成分、多靶点和多途径发挥对糖尿病肾病的治疗作用,且作用机制集中体现在晚期糖基化终末产物(AGE)-AGE受体信号通路、TNF信号通路等通路上.