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单精子测序技术在植入前胚胎染色体结构异常遗传学检测中区分罗氏易位携带者的应用
编辑人员丨1周前
目的:探讨单精子测序技术在植入前胚胎结构异常遗传学检测中区分携带者的应用价值.方法:针对1 例罗氏易位携带者45,XY,der(13;14)(q10;q10)应用单精子分离结合单精子测序技术完成单倍型的构建,用机械制动法分离20 份单精子样本并进行全基因组扩增(WGA),再利用ASA基因芯片对WGA产物进行全基因组183 708个单核苷酸多态性(SNP)位点检测,通过CNV测序检测出与易位相关且可作为单体型推断的单精子,推断亲本正常及携带罗氏易位的染色体单倍型.将 3 份胚胎滋养层细胞活检样本作为对象,在完成全基因组扩增后,通过高通量测序进行检测,判断胚胎携带易位染色体的情况,选取可用囊胚进行移植,于孕 18 周抽取羊水样本,确认胎儿是否携带致病变异.结果:通过单精子测序共筛选出6 037个SNP位点,挑选出30 个可区分正常与易位单体型位点成功构建单体型,植入前单体型分析提示 3 枚胚胎均为不携带罗氏易位染色体的整倍体胚胎,妊娠中期羊水基因检测证实胎儿核型为46,XN,未携带罗氏易位染色体.结论:对于男性罗氏易位携带者,可通过单精子测序筛选SNP位点构建单体型,用于区分正常和罗氏易位携带者胚胎,为胚胎植入前染色体结构遗传学检测胚胎选择提供依据.
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编辑人员丨1周前
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高通量基因测序检测染色体拷贝数变异与染色体核型分析在产前诊断中联合应用的价值
编辑人员丨1周前
目的:探讨高通量基因测序检测染色体拷贝数变异(copy number variation sequencing, CNV-seq)与染色体核型分析在产前诊断中联合应用价值。方法:收集2016年1月至2018年12月在枣庄市妇幼保健院进行产前诊断的905例羊水标本的G显带核型分析和CNV-seq结果,并对CNV-seq提示可疑致病性或临床意义未明的拷贝数变异(copy number variants, CNVs)进行变异来源的亲本分析。结果:除罗氏易位引起的染色体数目异常外,CNV-seq对G显带核型分析确诊的70例染色体数目异常,9例染色体嵌合体异常和7例染色体非平衡性结构异常均成功确诊并且额外多发现10例致病性明确的染色体微缺失/微重复。CNV-seq与G显带核型联合使用能将染色体异常阳性率从11.27%(102/905)提高到12.38%(112/905)。对33例存在可疑致病性CNVs或临床意义未明CNVs (variats of uncertain significance, VUS)胎儿样本的亲本验证分析表明,81.82% (27/33)的胎儿可疑致病性CNVs或VUS源于父母遗传,仅有18.18% (6/33)源于新发变异。结论:CNV-seq与G显带核型联合使用能多发现1.11%的致病性明确CNVs,可以有效减少G显带核型分析无法检测的染色体微缺失/微重复综合征缺陷儿的出生。同时,对可疑致病性CNVs和VUS进行父母亲本家系验证有助于确定CNVs的来源和遗传咨询。
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编辑人员丨1周前
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母源性平衡易位致14号染色体长臂部分三体伴父源性罗氏易位胎儿1例
编辑人员丨1周前
年龄为34岁,G 5P 0,因"孕17周血清学筛查提示21三体临界风险,超声检查未见胎儿异常"于2020年5月13日至我院就诊。曾于孕70 + d发生胚胎停育3次,孕40 + d发生自然流产1次,流产物均未进行检测。夫妇双方表型及智力均正常,否认近亲结婚与家族遗传病史。外周血染色体分析孕妇核型为46,XX,t(10;14)(q26.3;q32.1)(图1A),其丈夫为45,XY,rob(13;14)(q10;q10)(图1B)。孕18周时通过羊膜腔穿刺术采集胎儿羊水进行染色体核型分析,结果为45,X?,der(10),t(10;14)(q26.3;q32.1)mat,rob(13;14)(q10;q10)pat(图1C),提示胎儿10号染色体长臂的衍生片段源自14号染色体q32.11q32.33片段的重复;拷贝数变异测序(copy number variation sequencing,CNV-seq)结果为14q32.11q32.33(90280000_107300000)×3,提示胎儿染色体14q32.11q32.33区存在17.02 Mb重复(图2)。本研究通过了医院医学伦理委员会的审查(KS-2018-KY-36),夫妇双方均签署了临床研究知情同意书。
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编辑人员丨1周前
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基于二代测序的植入前遗传学检测在71例染色体易位家系中的应用
编辑人员丨1周前
目的:探讨基于二代测序(next generation sequencing,NGS)的植入前遗传学检测(preimplantation genetic test,PGT)对于染色体易位携带者实现正常生育的意义。方法:对71对染色体易位携带夫妇(60例为平衡易位,11例为罗氏易位)行PGT周期的超促排卵和卵母细胞浆内单精子注射,培养至囊胚阶段,活检囊胚滋养外胚层细胞行全基因组扩增(whole genome amplification,WGA),用NGS技术对扩增产物进行基因组序列分析,选择正常或平衡胎胚植入,并对检测结果和胚胎着床、妊娠情况进行分析。结果:71对夫妇共进行92个周期,活检胚胎303枚,301枚囊胚活检成功,成功诊断胚胎287个,诊断成功率为95.3%(287/301),获得可供移植的整倍体胚胎共85个,其中18个周期无可用胚胎,周期取消率19.5%。平衡易位组获得整倍体胚胎67个,罗氏易位组获得整倍体胚胎18个,PGT后胚胎着床率分别为89.3%(42/47)和88.8%(8/9),早期流产率分别为25.5%(12/47)和22.2%(2/9),继续妊娠率+活产率分别为63.8%(30/47)和66.6%(6/9),产前诊断结果与PGT结果一致。结论:基于NGS的PGT可准确的对胚胎进行染色体病诊断,避免反复流产和非意愿性终止妊娠,并获得理想的临床妊娠率。
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编辑人员丨1周前
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一例易与罗氏易位混淆的t(14;21)(p13;q21)染色体平衡易位
编辑人员丨1周前
患者 女,31岁,孕2产0,2018年9月孕50天人工流产一次,后未避孕,未孕。2020年3月外院造影示左侧输卵管通畅,右侧输卵管远端阻塞。2020年11月在外院接受试管婴儿治疗,妊娠70余天流产。流产组织检测示21号染色体长臂部分重复[dup(21)(q21.1-q22.3)(27.68 Mb)(20 438 130-48 119 895)]。进一步检查夫妇双方核型,患者为46,XX,der(14;21)(q10;q10),+mar[97]/45,XX,der(14;21)(q10;q10)[3],其丈夫核型未见异常。
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编辑人员丨1周前
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CNV-seq联合染色体核型分析在NT增厚胎儿遗传学诊断中的应用价值
编辑人员丨1周前
目的:探讨基因组拷贝数变异测序(copy number variation sequencing, CNV-seq)技术和染色体核型分析在颈项透明层(nuchal translucency,NT)增厚胎儿中的临床应用价值,分析胎儿NT增厚与染色体异常的关系。方法:收集2021年1月至2022年12月在海口市妇幼保健院进行CNV-seq检测及核型分析的106例NT增厚胎儿的资料,根据胎儿NT厚度分为2.5~3.4 mm组(n=50),3.5~4.4 mm组(n=34),≥4.5 mm组(n=22),根据产前诊断指征分为孤立性NT增厚组(n=69)和非孤立性NT增厚组(n=37)。采用 χ2检验或Fisher精确概率法对染色体异常分布情况及检出率进行分析。比较CNV-seq检测和染色体核型分析的遗传学诊断结果,随访妊娠结局。 结果:106例NT增厚胎儿,核型分析的染色体异常检出率为29.25%(31/106),其中染色体非整倍体18例,性染色体异常4例,染色体结构异常9例。CNV-seq的染色体异常检出率为42.45%(45/106),其中染色体非整倍体19例,性染色体异常4例,染色体结构异常22例;致病性CNV为31.13%,可能致病性CNV为2.83%,临床意义未明CNV为8.49%。CNV-seq对染色体异常检出率随NT值的增加而增加,差异有统计学意义( P=0.005)。核型分析和CNV-seq在非孤立性NT增厚胎儿染色体异常的检出率均明显高于孤立性NT增厚胎儿(均 P<0.001)。核型正常的NT增厚胎儿,CNV-seq检出染色体异常14例;核型分析发现的罗氏易位型21-三体1例和平衡易位1例,CNV-seq则未能检出。CNV-seq联合核型分析对胎儿染色体异常的检出率高于染色体核型分析( P=0.023)。 结论:CNV-seq联合染色体核型分析能有效提高胎儿染色体异常的检出率,更有利于产前遗传学诊断。
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编辑人员丨1周前
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等位基因映射识别技术在胚胎植入前遗传学检测中的应用
编辑人员丨1周前
目的:探讨在胚胎植入前遗传学检测(preimplantation genetic testing,PGT)中,等位基因映射识别技术(mapping allele with resolved carrier status,MaReCs)对于鉴别染色体平衡易位携带者胚胎易位携带状态的价值。方法:采用MaReCs技术对25例相互易位和15例罗氏易位携带者的囊胚进行检测,经过遗传咨询后择期移植可移植的囊胚,孕16~20周行羊水穿刺检查胎儿染色体,比较MaReCs检测与羊水检查结果的一致性。结果:相互易位组和罗氏易位组囊胚的染色体拷贝数变异(copy number variations,CNVs)的正常率差异无统计学意义(28.6% vs. 32.0 %, P>0.05);分别有12例(48%)相互易位和8例(53.3%)罗氏易位携带者获得了胚胎易位携带状态的结果。已妊娠的11例羊水穿刺检测结果均与MaReCs结果一致。 结论:MaReCs是一种区分平衡易位携带者胚胎易位携带状态的可靠方法,可帮助一定比例的携带者选择完全正常的胚胎移植,减少平衡易位向子代的传递。
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编辑人员丨1周前
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亲代平衡易位携带者的性别对胚胎染色体的影响
编辑人员丨1周前
目的:探讨平衡易位携带者的性别对胚胎染色体的影响。方法:回顾性分析235对一方携带相互易位夫妇(1163枚胚胎)和70对一方携带罗氏易位夫妇(351枚胚胎)共1514枚囊胚,经二代测序技术行植入前染色体结构重排遗传学检测。结果:在调整了女方年龄、抗苗勒管激素、卵巢刺激方案、Gn用量等混杂因素后,携带相互易位及罗氏易位的女性发生胚胎染色体异常的风险分别较男性携带者增加0.41倍[ OR(95% CI),1.41(1.06,1.87), P<0.05]和1.02倍[ OR(95% CI),2.02(1.20,3.40), P<0.01]。按女性年龄分层后显示,>30岁的女性相互易位携带者和25 ~ 30岁的女性罗氏易位携带者,发生胚胎染色体异常的风险较男性携带者分别增加0.67倍[ OR(95% CI),1.67(1.10,2.56), P<0.05]和1.06倍[ OR(95% CI),2.06(1.02,4.15), P<0.05]。 结论:女性平衡易位携带者较男性具有更高风险形成染色体异常的胚胎,此外其年龄可能也是潜在的风险因素。
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编辑人员丨1周前
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同时携带平衡易位和罗氏易位衍生染色体的胎儿一例
编辑人员丨1周前
孕妇 29岁,孕1产0,因丈夫同时携带染色体平衡易位和罗氏易位行胚胎植入前结构重排遗传学检测(preimplantation genetic testing: structural rearrangement,PGT-SR)。植入未见染色体拷贝数异常的胚胎后,于孕20周就诊于我院。本研究通过了我院伦理委员会审查(202201247)。在签署知情同意书后,常规进行羊膜腔穿刺,抽取羊水分别进行细胞原位培养和单核苷酸多态性微阵列分析(single nucleotide polymorphism array,SNP-array)。胎儿SNP-array分析未见明显异常。羊水细胞G显带分析提示胎儿为平衡易位合并罗氏易位衍生染色体携带者。其母亲核型未见异常,父亲为45,XY,t(3;13)(q26.2;q21.3),der(13;14)(q10;q10)(图1)。胎儿的染色体核型如图2所示,结合其父亲的染色体核型,根据2020版人类细胞基因组学国际命名体制(International System for Human Cytogenetic Nomenc, ISCN 2020)确定胎儿的染色体核型为45,XN,der(3)t(3;13)(q26.2;q21.3)dpat,der(13;14)(q10;q10)t(3;13)dpat。
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编辑人员丨1周前
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12号衍生染色体伴罗氏易位一例
编辑人员丨1周前
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编辑人员丨1周前
