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基于杜洛克猪全基因组重测序的InDel分析及重要经济性状基因定位
编辑人员丨2周前
本研究利用选择信号分析方法在美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪中筛选与重要经济性状相关的候选基因.选取健康状态良好、饲养管理水平一致的成年美系杜洛克公猪33头、丹系杜洛克公猪11头,提取DNA并重测序,利用Fst&Pi的联合分析,保留候选区域,对注释基因进行GO功能和KEGG通路富集分析,进一步筛选与重要经济性状相关的相关候选基因.美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪的全基因组重测序平均测序深度在13×以上,测序数据平均效率为99.82%,Q30平均值分别为91.91%、91.93%,G+C含量分别在42.90%-43.83%和42.48%~43.55%,均表明本次测序数据质量较高.以5%为筛选阈值,关联Fst&Pi提取相关候选区域,采用选择性消除方法检测到相应的选择信号区域,美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪之间的Fst值为0.268,θπ比值分别为0.495和-1.415,Pi值分别为4.206和3.506.在美系杜洛克猪的选择性消除分析中有557个受选择区域,注释到1 323个基因;丹系杜洛克猪的选择性消除分析中有207个受选择区域,注释到338个基因.GO分析和KEGG通路富集分析发现,在美系和丹系杜洛克群体中初步筛选到ERLIN2、TMCO2、PITX2、SORCS3和SUFU等5个与精子发生、脂肪形成、生殖功能等性状相关的候选基因.在美系杜洛克猪中筛选到ATP1B1、LAMA4、EP300、ELOVL3、ECHS1、THEME5、PIP5K1A、PPT1、UBQLN1、1L2、CNTFR、ITGA10、SEC24D、MAP3K5 和 HSP90B1 等 15 个与肉质、脂肪合成与代谢、精子发生、生长发育、骨发生和饲料效率等性状相关的候选基因.在丹系杜洛克猪中筛选到PDIA3、CBLIN2、CYCS和CDH7等4个候选基因,分别与产奶量、肉质性状、骨骼肌、饲料效率相关;BMI1、LHX8、ELL3、CATSPER2和CSMD1等5个与繁殖性状相关的候选基因.本研究发现美系杜洛克猪群体和丹系杜洛克猪群体间存在较大的遗传分化,为进一步研究杜洛克公猪的遗传特性提供了基因组数据支撑.
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编辑人员丨2周前
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净制对乌梅质量的影响及乌梅肉质量标准的研究
编辑人员丨2024/4/27
目的:研究净制对乌梅质量的影响,完善乌梅肉质量标准.方法:首先采用蒸与润2种方法分别净制3批乌梅肉样品,比较其产率、浸出物以及枸橼酸含量差异,确定净制方法;根据确定的净制方法,对12批乌梅药材进行净制,比较乌梅肉和核中浸出物及枸橼酸含量差异,探讨净制对乌梅质量的影响.对21批乌梅肉饮片的外观性状、显微、薄层鉴别、水分、水溶性浸出物和枸橼酸含量分别按照药典要求进行测定,拟定乌梅肉质量标准限度.结果:蒸法与润法净制乌梅质量(产率、水分、枸橼酸及浸出物)无显著性差异,但蒸法所用时间为30 min,远短于润法润制过夜.乌梅肉的浸出物及枸橼酸的含量72.5%、33.1%远高于乌梅核17.9%、8.0%,二者存在极显著差异.乌梅肉的平均水分为(11.0±1.4)%;浸出物为(72.0±3.4)%;枸橼酸含量为(33.8±4.5)%.结论:乌梅净制可以去除非药用部位,提高枸橼酸及浸出物含量,具有科学道理,蒸法和润法2种净制方法均可行,蒸法更易操作.
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编辑人员丨2024/4/27
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河西走廊荒漠区不同功能类群植物叶片建成成本的比较
编辑人员丨2024/3/23
叶片建成成本(LCC)是构建单位质量或面积叶片投入能量成本的衡量指标,其差异与变化能够反映植物的能量利用策略和环境适应特征.该研究假设:不同功能类群的荒漠植物具有不同的叶片能量利用策略,从而有利于其适应干旱环境.为验证这一假设,该研究以河西走廊荒漠区主要荒漠植物为研究对象,比较了LCC在不同生态系统和不同植物功能类群之间的差异,分析了LCC和其他叶片性状之间的关系,以及LCC随环境因子的变化规律.结果表明:荒漠生态系统中植物单位质量的LCC显著低于森林、苔原和草地生态系统;在荒漠生态系统中,肉质植物单位质量LCC显著低于非肉质植物,而单位面积LCC在两种植物类群间无显著差异;叶片碳、氮含量,热值以及灰分含量与LCC之间的相关关系说明灰分含量是影响肉质植物和非肉质植物之间LCC差异的内在决定因素;环境因子对单位质量LCC空间变异的贡献非常有限(肉质植物:11.22%,非肉质植物:25.30%,所有植物:24.99%),并且6个环境因子中只有土壤电导率、年平均气温和年降水量表现出显著的独立贡献;肉质植物单位质量LCC随年平均气温的降低而减小,非肉质植物单位质量LCC随年降水量和年平均气温的降低而减小.该研究的结果表明,降低单位质量而非单位面积的LCC更加有利于植物适应干旱、高盐的荒漠生境.
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编辑人员丨2024/3/23
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3个南亚热带季风常绿阔叶林群落主要性状特征比较
编辑人员丨2023/8/6
以南亚热带地区保存相对完好的鼎湖山?大岭山?白云山的季风常绿阔叶林为研究对象, 分析比较了各群落的生活型谱?Raukiaer 叶特征?群落果实类型和植物观赏特性等主要性状特征.结果表明, 这3 个群落以高位芽植物占绝对优势, 单叶?革质?全缘?中叶比例较高; 3 个群落由于演替时间的不同, 生活型谱有所差异, 鼎湖山云南银柴—香楠群落内中高位芽植物数量最多, 大岭山华润楠—慧竹群落以中高位芽和小高位芽植物为优势, 而白云山荷木—九节群落中小高位芽植物为优势; 不同叶特征植物比例也有所不同, 鼎湖山云南银柴—香楠群落中具中型叶?纸质叶等中生植物特征比例高于其他两个群落; 3 个群落中肉质果植物占优势, 果实以被动扩散为主; 3 个群落中在花?果?叶和其它部位(根?茎及树型姿态)具有一定的观赏价值植物分别有69?56?41 和34 种.在这些结果的基础上可以对南亚热带地带性城市森林群落建设提出适当建议.
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编辑人员丨2023/8/6
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两种体色大鳞鲃鱼的肌肉营养成分分析与品质评价
编辑人员丨2023/8/6
大鳞鲃(Barbus capito)隶属鲤科、鲃亚科、鲃属鱼类,原产于乌兹别克斯坦的阿姆河,为该国的濒危、野生种.大鳞鲃鱼具有生长速度快、肉质好、耐盐碱、食性广、抗逆性强等优良性状.目前苏北养殖的大鳞鲃为 F3 代,体色主要有黑灰色和黄色两种,两种体色鱼的生长速度和性成熟年龄有差异[1].大鳞鲃是大型经济鱼类,商品鱼2 龄是消费者餐桌的美味佳肴.本研究对 2 龄鱼进行研究,为其营养价值的评定、种质标准建立和人工配合饲料养殖提供科学依据.
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编辑人员丨2023/8/6
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可乐猪ApoA5基因多态性及其对肉质性状的遗传效应分析
编辑人员丨2023/8/6
根据GenBank中报道的猪apoA 5基因序列设计2对引物,应用PCR技术从可乐猪肌肉组织基因组中扩增出了apoA 5基因第三外显子的特异片段,采用直接测序法对apoA 5基因进行单核甘酸多态性检测,并分析该基因与可乐猪12项肉质性状的关联性,结果表明:在可乐猪apoA5基因第三外显子上共检测到3个SNPs-突变位点:A226G、G535C、和C1514T,其中A226G和G535C突变发生在编码区内,没有引起氨基酸的改变,为沉默突变.c1514T突变发生在3'-UTR,x2检验表明,发现的3个多态位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(p>0.05).A226位点为低度多态,其余两个突变位点均为中度多态.最小二乘分析显示,apoA5基因第三外显子226位点AA基因型个体的肌内脂肪显著高于AG基因型个体(p<0.05),535位点GG基因型个体的肉色显著高于CC和GC型个体(p<0.05),1514多态位点与可乐猪肉质性状没有显著关系(p>0.05).
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编辑人员丨2023/8/6
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滩羊微卫星标记多态性及与体尺性状关联分析
编辑人员丨2023/8/6
滩羊是我国特有的蒙古羊品种,肉质鲜美但生长缓慢.通过筛选的29个高多态性微卫星标记,对宁夏盐池滩羊种羊场基础母羊群体用随机抽样法检测了96个成年个体,测量了体重和体尺数据,分析了其微卫星标记遗传多样性、群体遗传结构及分子标记与表型的相关关系.结果显示,微卫星标记平均等位基因数9.5,平均有效等位基因数4.5,平均期望杂合度0.72,平均观测杂合度0.64,平均多态信息含量0.69;滩羊基础母羊群体保持了丰富的遗传多样性;关联分析结果显示MAF33与滩羊的体高、胸深显著相关,BMS1788与荐高、胸围显著相关,而BL41、BMS835、BOVILS56、MAF33和BMS500与管围极显著关联.这些标记对未来滩羊的分子辅助育种有所帮助.
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编辑人员丨2023/8/6
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甘肃小苏干湖盐沼湿地盐地风毛菊叶形态-光合生理特征对淹水的响应
编辑人员丨2023/8/6
盐沼湿地植物叶片功能性状对淹水的响应分析,有助于探究植物叶片可塑性机制与光合生理特征间的内在关联性,对深入理解盐沼湿地植物的生境抗逆性策略具有重要意义.根据小苏干湖湖水泛滥区静水持留时间长短分别设置:轻度淹水区(静水持留30-90天)、中度淹水区(静水持留90-150天)、重度淹水区(静水持留150-210天)3个试验样地,以盐地风毛菊(Saussur ea salsa)为研究对象,研究了小苏干湖盐沼湿地盐地风毛菊叶片功能性状对淹水的响应.结果 表明:随着静水持留时间的增加,轻度淹水区盐地风毛菊形态上采用小比叶面积(SLA)的肉质化小叶模式,光合生理上具有高实际光合效率(Y(Ⅱ))和低调节性能量耗散的量子产额(Y(NPQ))的协同变异;重度淹水区盐地风毛菊形态和光合生理上则采用与轻度淹水区完全相反的协同变异策略;在3个样地中,SLA与Y(Ⅱ)、光化学淬灭(QP)和Y(NPQ)间均呈极显著相关关系;叶绿素a含量和叶绿素b含量与调节性能量耗散的量子产额(Y(NO))均呈显著正相关关系.小苏干湖湖水泛滥区静水时空演变格局影响下,盐地风毛菊种群通过改变叶面积、叶厚度和SLA等叶片形态特征,适时调整叶片Y(Ⅱ)和Y(NPQ)等光合生理特征,实现植物叶片光合碳同化产物的收支平衡,表现出对水盐异质性环境较强的耐受性,反映了盐沼湿地植物在极端生存环境下的叶片可塑性和抗逆性机制.
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编辑人员丨2023/8/6
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嘉峪关草湖湿地植物功能群组成及其性状对不同生境的响应
编辑人员丨2023/8/6
植物功能群与生境的关系是生态学研究的重要内容,对于揭示植物的环境适应机制、群落构建机制、预测植被变化等具有重要意义.为研究局域尺度上干旱区湿地、沙漠、戈壁等生态系统功能群的环境适应机制,在嘉峪关草湖国家湿地公园内,基于植物功能性状数据,研究了荒漠区不同生境条件下的功能群组成和功能性状特性.结果 表明:随着生境条件的改变,土壤含水量、含盐量、容重、pH值等土壤性质发生显著变化;植物的功能群组成和功能性状会发生适应性的变化,沼泽湿地生境内植被的功能性状以克隆、C4光合途径、根茎型等特征为主,盐沼湿地以叶片被蜡、叶茎肉质、CS策略等特征为主,沙丘生境以叶片具毛、风播、具增厚或增长的根、一年生、CR策略等特征为主,荒漠戈壁以叶片少、具增厚或增长的根、虫媒、地上芽等特征为主.局域尺度上,生境异质性尤其是土壤条件的异质性是影响植物群落组成和植物功能性状变化的重要环境因子.
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编辑人员丨2023/8/6
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苏姜猪OLR1基因多态性及其与肉质性状的关联分析
编辑人员丨2023/8/5
探讨OLR1基因在苏姜猪群内的遗传多态性,以及该基因多态对苏姜猪猪肉质性状的影响.采用PCR-RFLP技术检测OLR1基因在苏姜猪试验群体中的PstⅠ酶切遗传多态性,运用单因素方差分析方法分析了该多态位点对苏姜猪肉质性状的影响.结果发现,苏姜猪试验群体OLR1基因内含子5区域内发现一个PstⅠ酶切多态性,检测到CC、CD和DD三种基因型,多态信息含量呈现中度多态性.CC型与DD型个体的肌肉失水率、大理石纹间的差异达到显著水平(P<0.05),CD型个体用色差仪测得的b值显著高于DD型(P<0.05).因此,检测到的OLR1基因PCR-RFLP-PstⅠ多态性与大理石纹等肉质性状存在着显著的相关关系,可以作为肉质性状候选基因在苏姜猪的持续选育中加以应用.
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编辑人员丨2023/8/5
